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Patent Searching and Data


Title:
COTTON ZINC FINGER PROTEIN (CZF5) AND CODING GENE AND USE THEREOF
Document Type and Number:
WIPO Patent Application WO/2014/082285
Kind Code:
A1
Abstract:
Provided are a zinc finger protein (Czf5) from cotton and the coding gene thereof, and the use thereof in the incubation of transgenic plants with increased drought resistance.

Inventors:
CUI HONGZHI (CN)
LIANG YUANJIN (CN)
TIAN DACUI (CN)
Application Number:
PCT/CN2012/085628
Publication Date:
June 05, 2014
Filing Date:
November 30, 2012
Export Citation:
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Assignee:
BIOCENTURY TRANSGENE CHINA CO (CN)
International Classes:
C12N15/29; A01H5/00; C07K14/415; C12N1/21; C12N15/63
Foreign References:
CN102703467A2012-10-03
CN101182520A2008-05-21
CN102659934A2012-09-12
US7977535B22011-07-12
Other References:
LI, GANG ET AL.: "Two cotton Cys2/His2-type zinc-finger proteins, GhDi 19-1 and GhDi19-2, are involved in plant response to salt/drought stress and abscisic acid signalling", PLANT MOL BIOL, vol. 74, 2010, pages 437 - 452
DATABASE GENBANK 6 August 2009 (2009-08-06), XP002533895, accession no. P-002533895
Attorney, Agent or Firm:
PEKSUNG INTELLECTUAL PROPERTY LTD. (CN)
北京北翔知识产权代理有限公司 (CN)
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Claims:
权 利 要 求 书

1. 棉花的一个锌指蛋白的编码基因, 被命名为 GhCzf5, 其核苷酸序列如 SEQ ID NO: 2所示。

2. 一种重组表达载体,其含有权利要求 1所述的基因并且所述基因的核苷酸序列 与所述表达载体的表达控制序列可操作地连接。

3. 权利要求 2所述的载体, 其为附图 2所示的 rd29A-GhCzf5-2300载体。

4. 一种重组细胞,其含有权利要求 1所述的基因或者权利要求 2或 3所述的重组 表达载体; 优选地, 所述重组细胞为重组农杆菌细胞。

5. 一种改善植物抗旱性的方法, 包括: 将权利要求 1所述的基因或者权利要求 2 或 3所述的重组表达载体导入植物或植物组织并使所述基因表达; 优选地, 所述植物 是烟草。

6. 一种制备转基因植物的方法, 包括: 在有效产生植物的条件下培养含有权利要 求 1所述的基因或者权利要求 2或 3所述的重组表达载体的植物或植物组织。

7. 权利要求 6所述的方法, 其中所述植物是烟草。

8. 权利要求 1所述的基因、权利要求 2或 3所述的重组表达载体或者权利要求 4 所述的重组细胞用于改善植物抗旱性以及用于植物育种的用途。

9. 权利要求 8所述的用途, 其中所述植物是烟草。

10. 权利要求 1所述的基因编码的蛋白, 其序列如 SEQ ID NO: 1所示。

Description:
一种棉花锌指蛋白 (Czf5) 及其编码基因与应用

技术领域 本发明涉及植物蛋白及其编码基因与应用, 特别是涉及一个来源于棉花的锌指蛋 白 (Czf5 ) 及其编码基因, 以及其在培育抗旱性提高的转基因植物中的应 用。 背景技术 非生物胁迫,如干旱、盐渍、 极端温度、 化学污染和氧损伤等能够对植物的生长发 育造成严重的危害,对作物产量造成极大损失 。其中干旱对作物产量的影响,在诸多自 然逆境中占首位,其危害相当于其它灾害之和 是许多地区是农业发展的瓶颈。据统计, 世界干旱、 半干旱地区占陆地面积的 34%; 我国干旱、 半干旱地区约占国土面积的 52%,年受旱面积达 200— 270万公顷,全国灌溉区每年缺水约 30亿立方米,因缺水而少 收粮食 350— 400亿公斤; 特别是我国主要产粮区如华北、 东北和西北,是我国缺水最 严重的地区,春旱频繁达到十年九遇。

由于植物的耐胁迫性大多属于数量性状,现有 利用的种质资源匮乏,采用常规育 种技术改良植物胁迫耐性的难度相当大,培育 真正的耐胁迫品种就尤为困难。近年来, 随着对植物抗逆分子机理研究的不断深入和分 子生物学技术的迅猛发展, 抗逆研究已 经从生理水平深入到分子水平,促进了植物抗 基因工程的发展。当植物在受到胁迫时 会产生相应的应答反应, 来降低或消除给植株带来的危害。 植物的这种应答反应是一 个涉及多基因、 多信号途径、 多基因产物的复杂过程。 这些基因及其表达产物可以分 为 3 类: (1 ) 参与信号级联放大系统和转录控制的基因及产 物; (2) 直接对保护生 物膜和蛋白质起作用的基因及其表达产物; (3 )与水和离子的摄入和转运相关的蛋白 质。 近年来, 通过转基因技术提高植物对胁迫耐受能力的研 究, 以及对胁迫具有耐受 能力的农作物、 旱生植物和盐生植物的研究都取得了显著的成 果, 对胁迫相关基因和 信号转导系统也有了更进一步的了解 (Liu Q. 1998. Two transcription factors, DREB1 and DREB2, with an EREBP/AP2 DNA binding domain, separate two cellular signal transduction pathways in drought- and low temperature-responsive gene expression, respectively, in Arabidopsis. Plant Cell, 10: 1391-1406; KANG JY. 2002. Arabidopsis basic leucine zipper proteins that mediate stress-responsive abscisic acid signaling. Plant Cell, 14: 343-357; ABE H. 2003. Arabidopsis AtMYC2 (bHLH) and AtMYB2 (MYB) function as l transcriptional activators in abscisic acid signaling. Plant Cell, 15: 63-78. )。

但就目前的研究状况而言,由于其机制十分复 ,许多植物对逆境下的生物化学和 生理学上的响应机制仍有待深入研究。在抗逆 应答基因的功能及表达调控方面的研究 将对植物抗逆相关的信号传递途径及信号传递 网络系统的研究提供重要的基础。 发明内容 本发明人利用 SSH (抑制差减杂交) 与 RACE ( cDNA末端快速扩增) 相结合的 方法克隆出了棉花的一个锌指蛋白(本文命名 为 Czf5 )的编码基因, 并测定了其 DNA 序列。 并且发现通过转基因将其导入植株后, 可明显改善转基因植株的抗旱性, 而且 这些性状可稳定遗传。

本发明第一方面提供棉花的一个锌指蛋白 Czf5 的编码基因 (本文命名为

GhCzf5 ), 其序列为 SEQ ID NO: 2。

本发明第二方面提供一种重组表达载体, 其含有本发明第一方面所述的基因并且 所述基因的核苷酸序列与所述表达载体的表达 控制序列可操作地连接; 优选地, 所述 载体为附图 2所示的 rd29A-Gh Czf5-2300载体。

本发明第三方面提供一种重组细胞, 其含有本发明第一方面所述的基因或者本发 明第二方面所述的重组表达载体; 优选地, 所述重组细胞为重组农杆菌细胞。

本发明第四方面提供一种改善植物抗旱性的方 法, 包括: 将本发明第一方面所述 基因或者本发明第二方面所述的重组表达载体 导入植物或植物组织并使所述基因表 达; 优选地, 所述植物是烟草。

本发明第五方面提供一种制备转基因植物的方 法, 包括: 在有效产生植物的条件 下培养含有本发明第一方面所述基因或者本发 明第二方面所述的重组表达载体的植 物或植物组织; 优选地, 所述植物是烟草。

本发明第六方面提供本发明第一方面所述的基 因、本发明第二方面所述的重组表 达载体或者本发明第三方面所述的重组细胞用 于改善植物抗旱性以及用于植物育种 的用途; 优选地, 所述植物是烟草。

本发明第七方面提供本发明第一方面所述的基 因编码的蛋白质, 其氨基酸序列如 SEQ ID N0: 1所示。 附图说明 图 1是 GhCzf5的植物表达载体 (rd29A-GhCzf5-2300;)的构建流程。 图 2是 GhCzf5的植物表达载体 Crd29A-GhCzf5-2300)的质粒图。

图 3是对照烟草和转基因烟草的抗旱性生长情况 CK (左):对照烟草; T1D1 (中) 和 T1D8 (右): 转基因烟草株系。

图 4是耐干旱和不耐干旱 T1代转基因烟草植株在转录水平上的验证结果 M为 Marker, 1-8为耐干旱的 T1代转基因烟草植株, 9一 12为不耐干旱的 T1代转基因烟 草植株。

具体实施方式 提供以下实施例, 以方便本领域技术人员更好地理解本发明。 所述实施例仅出于 示例性目的, 并非意在限制本发明的范围。 实施例 1 干旱胁迫下棉花 SSH文库构建:

具体方法为:

利用 Clontech公司的 PCR-select TM cDNA Subtraction Kit 所示的方法通过抑制差 减杂交方法构建差减文库。 在实验过程中以干旱处理的棉花幼苗的叶片中 提取的 mRNA 作为样本 (tester), 以未处理的棉花幼苗的叶片中提取的 mRNA 作为对照 ( driver)。 具体步骤简述如下:

(1) 供试材料:

非洲棉 (国家棉花中期库, 获取单位中国棉花研究所, 统一编号: ZM-06838)播 种到灭过菌的蛭石上, 在 25°C、 光周期 16h/8h (光强 2000— 3000 Lx) 条件下培养, 每周浇 1/2MS培养基 (含有 9.39 mMKN0 3 , 0.625 mM KH 2 P0 4 , 10.3 mMNH 4 N0 3 , 0.75 mMMgSO 4 , 1.5 mMCaCl 2 , 50 μΜΚΙ, 100 μΜΗ 3 ΒΟ 3 , 100 MMnSO 4 , 30 μΜ ZnS0 4 , 1 μΜΝα 2 Μο0 4 , 0.1 μΜ CoCl 2 , 100 μΜ Na 2 EDTA, 100 MFeSO 4 ) —次。 当 苗株高达 25— 30cm时用于实验。

(2) 材料处理:

将供试幼苗分为 2组, 每组 4盆, 每盆 1株。 第一组为对照组, 在 25°C、 光周期 16h/8h (光强 2000— 3000 Lx) 条件下培养, 正常浇灌。 第二组为干旱处理组, 25°C、 光周期 16h/8h (光强 2000— 3000 Lx) 条件下培养, 停止浇灌, 处理 10天, 处理完毕 后及时剪取两组幼苗顶端 1/3的叶片, 用液氮迅速冷冻后, 于 -70°C冰箱中保存。

(3) 总 RNA提取:

分别取对照组和干旱处理组的棉花叶片 0.5 g, 用植物 RNA提取试剂盒 (购自 invitrogen) 提取棉花叶片的总 RNA。 用 HITACHI公司的紫外分光光度计 U-2001测 定总 RNA在 260 nm和 280 nm的吸光度值, OD 26Q /OD 28Q 比值为 1.8— 2.0,表明总 RNA 纯度较高,用 1.0%的琼脂糖凝胶电泳检测总 RNA的完整性, 28S条带的亮度约为 18S 条带的 2倍, 表明 RNA的完整性良好。 使用 Qiagen公司的 Oligotex mRNA纯化试剂 盒 (purification of polyA+ RNA from total RNA)分离 mRNA。

( 4 ) 抑制差减杂交:

按 Clontech公司的 PCR-select TM cDNA Subtraction Kit试剂盒所示的方法进行抑制 差减杂交。应用 Clontech 的 PCR-Select cDNA Subtraction Kits 差减杂交试剂盒, 先将 Driver mRNA和 Tester mRNA分别反转录, 得到双链 cDNA, 再以 2 Tester cDNA和 2 ig Driver cDNA作为起始材料进行差减杂交。 在 37°C水浴下分别将 Tester cDNA和 Driver cDNA用 Rsa I 酶切 1.5 h, 然后将酶切后的 Tester cDNA分成两等份, 连接上 不同的接头, 而 Driver cDNA不连接头。 两种连有不同接头的 Tester cDNA分别与过 量的 Driver混合, 进行第一次正向差减杂交。 将两种第一次差减杂交的产物混合, 再 与新鲜变性的 Driver cDNA进行第二次正向差减杂交,通过两次抑制性 PCR扩增差异 表达的片段,使其得到富集。

( 5 ) cDNA差减文库的构建与初步筛选、 克隆、 鉴定

依照 pGEM-T Easy试剂盒的程序,将所述正向差减杂交 cDNA片段的第二次 PCR 产物 (使用 QIAquick PCR Purification Kit纯化, 购自 Qiagen) 与 pGEM-T Easy (购自 Promega试剂盒)载体连接, 其具体步骤如下: 用 200 μΐ PCR管依次加入下列成分: 纯化的正向差减杂交 cDNA片段的第二次 PCR产物 3 μ1, 2><Τ4连接酶缓冲液 5 μ1, pGEM-T Easy载体 1 μ1, T4 DNA连接酶 1 μ1, 于 4°C连接过夜。取 10 μΐ连接反应产 物,加入到 100 μΐ感受态大肠杆菌 JM109(购自 TAKARA)中,冰浴 30 min、 热休克 60 秒、 冰浴 2 min,另力口 250 μΐ LB培养液(含有 1% Tryptone (购自 OXOID ) , 0.5% Yeast Extract (购自 OXOID ) , 1% NaCl (购自国药)) 置 37°C水浴中, 以 225 rpm振荡培养 30 min,取 200 μΐ 菌液接种于含 50 g/ml 氨苄青霉素的 LB (同上) /X-gal/IPTG ( X-gal/IPTG购自 TAKARA)培养板上, 37°C培育 18 h。 计数培养板中直径 > 1 mm的 清晰白色及蓝色菌落数,随机挑取 540个白色菌落 (编号: Gh-D2-001至 Gh-D2-540)。 将所有白色克隆接种于含有 50 μ § /ιη1氨苄青霉素的 LB 液体培养基的 96孔细胞培养 板 (CORNING)中, 37°C培养过夜后加甘油至终浓度 20%, 于 -80°C保存备用。 以巢式 PCR 引物 Primer 1和 Primer 2R ( Clontech公司的 PCR-select TM cDNA Subtraction Kit 试剂盒自带) 进行菌液 PCR 扩增, 得到 452个阳性克隆,然后将所有阳性克隆送英潍 捷基 (上海) 贸易有限公司测序。 (6) 差异克隆的 cDNA测序分析:

将 DNA测序结果去除载体和不明确序列及冗余的 cDNA后, 共得到 405个有效 EST(unigene)。

' :施例 2 棉花锌指蛋白基因 GhCzf5的克隆

克隆子 Gh-D2-196去掉冗余 DNA后, 序列为 SEQIDNo: 3, 序列分析表明该序 列编码的蛋白属于锌指蛋白, 本文将 SEQ ID No: 3 对应的全长编码基因命名为 GhCzfS, 其对应的蛋白命名为 Czf5。

SEQ ID Xo: 3

_ :GAT'J I A CA^CG^: AGTCAACC G AGCATGA TG TCAGTTIGC CT'H G二 ί_ r ^Ai^OA ^ A CA A3A C AACC :: ; ! CT^C GTCA T TGTTTCA: AASSTATSC —

_8_ C :J :G TC !GCCTAC TC H AG G A A TT T ii TT TTCCAT

GhCzf5全长编码基因的克隆

根据已经获得的 SEQ ID No: 3, 设计如下两条特异性引物, 作为 3'RACE的 5, 端特异性引物。

GhCzfo GSP1: SEQ ID NO: I:

GhCzfo GSP2: SEQ ID NO: .5:

实验歩骤按试剂盒说明书操作 ( 3, RACE System for Rapid Amplification of cDNA Ends试剂盒购自 invitrogen公司)。

ffl SEQ ID NO: 4与 3'端引物 AUAP (试剂盒自带), 以 mRNA逆转录的 cDNA 为模板进行第一轮 PCR扩增。 具体歩骤如下:

50 μΐ PCR反应体系: 5 μΐ ΙΟχΕχ Buffer, 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP、 2.0 μΐ mRNA反 转^的 cDNA、 1.0 μΐ Ex Taq (购自 TAKARA)、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 4和 AUAP 各 2.0 μ1、 以及 35 μΐ双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5 min, 33个循环(94 °C 变 性 30 s, 58。C退火 30 s, 72 °C 延伸 lmin), 72 °C 延伸 10 min。

所得的 PCR产物用双蒸水稀释 50倍后取 2.0 μΐ作为模板,用 SEQ ID NO: 5与 3' 替换页 (细则第 26条) 端引物 AUAP进行第 轮 PCR扩增, 具体步骤如下:

50 μΐ PCR反;、 V:体系: 5 μΐ ΙΟχΕχ Buffer ^ 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP、 2.0 μΐ稀释的第一 轮 PCR产物、 1.0 l Ex Taq、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 5和 AUAP各 2.0 μ1、 以及 35 μΐ双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5 min, 33个循环 ( 94'C 变性 30 s, 58°C退 火 30 s, 72°C 延伸 l min), 72°C 延伸 10 min。回收第二次 PCR产物中片段约为 500bp 的条带 (Gel Extraction Kit购 β OMEGA), 并将其连接于 pGEM-T Easy Vector, 然后 转化到大肠杆脔 JM109(具体方法同上),随机挑取 10个白色菌落接种于含有 50 g/mL 氨苄青霉素的 LB液体培养基中, 37°C培养过夜后加 th油至终浓度 20%, -80°C保存备 用。 用 SEQ ID NO: 5与 3'端引物 AUAP进行脔液 PCR 扩增, 得到 9个阳性克隆, 将 其屮 4个阳性克降送至英潍捷基(上海) 贸易有限公司测序测序,获得该基因的 cDNA 的 3'端。

根据己经获得的 GhCzf5基因片段,设计如下三条特异性引物,作 为 5'RACE的 3' 端特异性引物。

GhCzfS GSP3: SEQ ID NO : 6:

GAftAAT TCC GCA CTCAC AA

GhCzfS GSP I : SEQ ID NO : 7:

TT GCAGC AGAG GTT C TG

GhCzfS GSP5: SEQ ID NO: 8:

GCA GT ACA TT AATAGT TC 实验步骤按试剂 说明书操作 (5' RACE System for Rapid Amplification of cDNA Ends试剂盒购自 invitrogen公司)。

用 SEQ ID NO: 7与 5'通用引物 AAP (试剂盒自带), 以 mRNA逆转录的 cDNA (反转录引物 SEQ ID NO: 6 ) 为模板进行第一轮 PCR扩增, 具体步骤如下:

50 μΐ PCR反应体系: 5 μΐ 10><Ex Buffer, 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP、 2.0 μΐ mRNA反转 录的 cDNA、 1.0 μΙ Εχ Taq (购自 TAKARA)、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 7和 AAP各 2.0 μ1、 以及 35 μΐ双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5 min, 33个循环 ( 94'C 变 性 30 s, 55 'C退火 30 s, 72 °C 延伸 lmin), 72 "C 延伸 10 min。

所得的 PCR产物用双蒸水稀释 50倍后取 2.0 μΐ作为模板,用 SEQ ID NO: 8与 3' 端引物 AUAP进行第二轮 PCR扩增, 具体步骤如 卜':

50 μΐ PCR反应休系: 5 μΐ ΙΟχΕχ Buffer, 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP、 2.0 μΐ稀释的第一

6

替换页 (细则第 26条) 轮 PCR产物、 1.0 μΐ Ex Taq、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 8和 AUAP各 2.0 μ1、 以及 35 μΐ的双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5min, 33个循环 ( 94°C 变性 30 s, 58°C 退火 30s, 72 °C 延伸 1 min), 72 °C 延伸 10 min。 回收第二次 PCR产物中片段约为

H H

500bp的条 H带(Gel Extraction Kit购自 OMEGA), 并将其连接于 pGEM-T Easy Vector,

: '

转化到 JM109(具体方法同上),随机挑取 10个白色菌落接种于含有 50 μ /ηι1氨苄青霉

H

i」 ■

素的 LB 液体培养基-V '中,37°C培养过夜后加甘油至终浓度 20%,-80'C保存备用。用 SEQ IDNO : 8与 3'端引物AUAP进行菌液PCR 扩增 (反应体系及反应条件同上) , 得到

H H

9个阳性克隆,选取其中 4个; (:!克隆送至英潍捷基(上海)贸易有限公司 序测序,获得该 基闘 cDNA的 5'端。

F

所得的 5'RACE产物克隆测序后,将其与 3'RACE产物测序结果以及 SEQ ID No: 3序列迸行拼接。 获得 GhCzf5全长 cDNA序列 SEQ ID No: 9:

SEQ ID NO: 9:

了 T AA'STCT^ AG C ATC AG AGGASCG _ TCTTGGTAAA T CATAT^TA T3 TTAAA53 CAIiJiTT GA

- A ATTATC G -::: C^ CCT CGTl'C ^ C :: C:.:'TCCT::C

- - ATCAT. T S C ACC CGG A CATTGA AATC CTG

_ ¾ _ ^「 " 1 c■? GA AGT ACA T A AGA TT "C GA'^CAS : A^ G^ T AAC G A^CA. T ACTGTT A ; GITTGC T A GAGATTAAC GCT GTC TG CGGT^A C G

AA CATTGGA ATGTCACA G : C T TTT C ::'― G-:C A.:'TT7T QGT AG GT CSGA A TT?

A TACAG : TA T : QT A A GT TTT AAA AAAC GAT'S CGC^C 一 ·"_; -ACCCI GA'S ATGTGGT:¾ G?TT ? TT^

'': ':― CTGAAGTTGT ATG. ?CATC CACTTA GTT

■■'― - AT '■_」;_- TTTTCGA-TA GTGSAAT AA AATCTGCT A

―:;- AG TGTTG T GT^ AAT T ATAATGT A

n

::4. T A.TTTTTT AT -iC-TATTI:: TT CAATTTA TTTAAAAA AAAAAAAAAA

:■ _ 根据 SEQ ID NO:9序列设计一对引物如下: GhCzfo: 3EQ ID NO: 10:

AT^ GT.:CC TCAASCCT C A

GhCzfS: SEQ ID XO: U:

一 -—— ' —一

7

替换页 (细则第 26条) 通过 SEQ ID NO: 10和 SEQ ID NO: 11来克隆 GhCzf5全长编码基因。 采用 TaKaRa的 PrimeSTAR HS DNA聚合酶, 以棉花的 cDNA为模板进行 PCR 反应。 50 l PCR反应体系: 10 ^ 5xPS Buffer、 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP、 2.0 μΐ cDNA, 1.0 μΐ PrimeSTAR, 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 10和 SEQ ID NO: 11各 2.0 μ1、 以及 30 μΐ双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5 min, 33个循环 (94°C 变性 30 s, 58°C退 火 30 s, 72 °C 延伸 lmin), 72 °C 延伸 10min。

PCR扩增产物加 A尾: PCR产物中加入 2.5倍体积的无水乙醇, -20°C放置 10分 钟,离心,去上清,晾干,然后用 21 μΐ双蒸水溶解。然后向其中加入 2.5 μΐ ΙΟχΕχ Buffer, 0.5 μΐ 5 mM的 dATP、 2.5 μΐ ΙΟχΕχ Taq。 反应条件: 70'C反应 30分钟。 将得到的约 500bp的 DNA片段回收 (Omega回收试剂盒), 并将其连接至 pGEM T-easy载体上, 然后转化 JM109(方法同上), 随机挑取 10个白色菌落接种于含有 50 g/mL氨苄青霉 素的 LB 液体培养基中,37'C培养过夜后加甘油至终浓 20%,-80°C保存备用。用 SEQ ID NO: 10与 SEQ ID NO: 11进行菌液 PCR 扩增 (反应休系及反应条件同上),得到 Ί 个阳性克隆,选取其中 4个阳性克隆送至英潍捷基 (上海) 贸易有限公司测序,序列为 SEQ ID NO: 2, 其编码的蛋白质的氨基酸序列为 SEQ ID NO: 1。

Czf5蛋白的氨基酸序列: SEQ ID NO: 1

G1SSLPAPS EGVLCVLLVK

TALSISMVK

"HLSSSSSSS SSSSSS3SSS

SSSPSS LIZ IPAVSFDISI

GNA SYIKEF RS MPST YD

AVCS SQFEH DCSVCLTRFH:

PESEIKRLS GHLFHKVCLS

ir" ϊ^. i* >― >

GhCzf5编码基因的核苷酸序列: SEQ ID NO: 2

8 替换页 (细则第 26条) 丄 TATG GIACT CT GGTAAAC . ^ A^ TTT CCAIAT TAT G -"IAAAGG ATAATT SAT CAAT C TCA CATTAT GT 丄::丄 AT:: AT TCT CC TCCTC: JTC T CC TC rCCT CT CCTCGTCA C A-OATCAT A i-Si ZZKICh ZQC CAT CCG A T T AT7GAA ATCCCI-S»:5S AT ATTCGA: A CAGCATC 二 4_ G:iTAATG:TG iTA'JTCACAC TAAAGAGTT CG G AGGA TGCCAT GAC C GGTACGAT

30 _ ί.3ΰ ΑΙ3¾ G GS AGT A A CGiAGCAT GA T T CAG TT CCTGAC TAGGTTCGAG 3€1 C A AAT A^ A^AITAA : TT T:C G: GGTCAT^ T CACAAG T A7 CTTG:SAA 2^ AA TGGTTGA AC ATTG JAA TGTCACATGC CCTCTTTGCA GGAACG TCT :5CTSCCC5AA

46_ : CTA TTTG ^ GA

实施例 3 GhCzf5基因植物表达载体构建

选择植物双元表达载体 pCAMBIA2300 (购自北京鼎国昌盛生物技术有限责任公 司) 作为植物表达载体, 用 Pnos启动子替换 ΝΡΤΠ基因含双增强子的 35S启动子, 以降低 NPTII蛋白在植物中的表达。 选择诱导型的 M29A启动子及终止子 Tnos分别 作为 GhCzf5基因的启动子和终止子。

用引物 SEQIDNO:12和 SEQ ID NO: 13以植物表达载体 pBI121 (购自北京华夏 远洋科技有限公司) 为模板扩增 Pnos, 采用 TaKaRa的 PrimeSTAR HS DNA聚合酶。 50μ1ΡΟ 反应体系: 10 μΐ 5xPS Buffer、 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP、 1.0 μΐ ρΒΙ12Κ 1.0 μΐ PrimeSTAR, 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 12和 SEQ ID NO: 13各 2.0 μ1、 以及 31 μ1双 蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5min, 33个循环( 94°C 变性 30s, 56°C退火 30 s, 72 °C 延伸 30 s), 72'C 延伸 10 min。 通过 EcoRI、 Bglll酶切将所得的 PCR产物 连接到 pCAMBIA2300 (promega, T4连接酶盒)获得 pCAMBIA2300-l。

SEQ ID XO: 12 :

GCACG TTCATACAAATGGACGAACGGAT SEQ ID NO: 13:

ATCCAGATCTAGATCCGGTGCAGATTATTTG

用引物 SEQ ID NO: 14和 SEQ ID NO: 15以 pBI121为模板扩增 Tnos,采用 TaKaRa 的 PrimeSTAR HS DNA聚合酶。 50 μΐ PCR反应体系: 10 μΐ 5^PS Buffer. 3 μΐ 2.5 mM 的 dNTP、 1.0 μΐ pBI12 1.0 μΐ PrimeSTAR, 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 14和 SEQ ID 1^0: 15各2.(^1、 以及 31 μΐ双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5 min, 33个循环 (94°C 变性 30s, 58°C退火 30 s, 72 °C 延伸 30 s), 72 °C 延伸 10 min。 通过 Sacl、 EcoRl酶切将所得的 PCR产物连接(promega T4 连接酶盒 )到 pCAMBIA2300-l获得 pCAMBIA2300-2

替换页 (细则第 26条) SEQ ID -、 Ό: 11:

AAG (H AATTTCCCCGATCGI TCAAA

SEQ ID NO: 15:

TCA^ f CAGTGAATTCCCGATCTAGTA

用引物 SEQ ID NO: 16 禾 H SEQ ID NO: 17 以拟南芥 (哥伦比亚型 , 购自 www.arabidopsis.org ) DNA为校板扩增拟南芥 rd29A启动了- (参考 Zeng J., et al. 2002, Preparation of total DNA from "recalcitrant plant taxa", Acta Bot. Sin., 44(6): 694-697中 的方法提取拟南芥 DNA)。 ¾用 TaKaRa的 PrimeSTAR HS DNA聚合酶。 50 μΐ PCR反 v:体系: 10 μΐ 5 xPS Buffer 3 μΐ 2.5 mM 的 dNTP、 1.0 μΐ 拟南芥 DNA、 1 .0 μΐ PrimeSTAR > 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 16禾卩 SEQ ID NO: 17各 2.0 μ1、 以及 31 μΐ双 蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5 min, 33个循环 (94°C 变性 30 s, 58 °C退火 30 s, 72 °C 延伸 30 s), 72 V 延伸 10 min。 通过 HindIII、 Pstl酶切将所得的 PCR产物连 接 (连接方法同上) 到 pCAMBIA2300-2获得 pCAMBIA2300-3。

SEQ ID NO: 16:

ACTAAGCTTCCTTCTTGACATCATTC TTTTA SEQ ID NO: 17:

丁 GAr7( UCCAAAGATTTTTTTCTTTCCAATAG

用引物 SEQ ID NO: 18和 SEQ ID NO: 19扩增 GhCzf5编码基因的全长序列 (模 板. ¾施例 2所获得 GhCzf5全长编码基因), 采用 TaKaRa的 PrimeSTAR HS DNA聚

^嗨。 50 μΐ PCR 反应体系: 10 μΐ 5 xPS Buffer , 3 μΐ 2.5 mM 的 dNTP、 1 .0 μΐ GhCzf5-pGEM 1 .0 μΐ PrimeSTAR, 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 18和 SEQ ID NO: 19

^ 2 0 μΙ、 以及 3 1 μΐ双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5 min, 33个循环(94°C 变 性 30 s, 58 °C退火 30 s, 72 °C 延伸 2min), 72 "C 延伸〗 0 min。 通过 Pstl、 Sacl酶切 将所得的 PCR 产物连接 (连接方法问上) 到 pCAMBIA2300-3, 获得植物表达载休 rd29A- GhCzf5-2300。

SEQ ID NO: 18: 丁 GAr/¾t^i(i ATGGGT C T AAGTCT C CA

SEQ ID NO: 19:

kAGGAGCTC T A CAAAAG TAGSCCGGAT C STC

实施例 4 rd29A-GhCzf5-2300表达载体转化农杆菌

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替换页 (细则第 26条) 农杆菌 LBA4404 (购自 Biovector Science Lab,Inc) 感受态细胞的制备: 提前 1-2 天将农杆菌 LBA4404在含 50 g/ml利福平和 50 g/ml链霉素的 LB固体培养基上划 线接种, 28 °C培养 1至 2天。 挑取单菌落接种于 5 ml含 50 μ § /ιη1利福平和 50 μ § /ιη1 链霉素的 LB液体培养基中, 28 °C下摇动培养过夜 (约 12-16 h)至 OD 6 。。值为 0.4, 形成 种子菌液。 取 5 ml活化后的菌液 (1 :20的比例) 接种于 100 ml含 50 μ § /ιη1利福平和 50 μ § /ιη1链霉素的 LB液体培养基中, 28 °C摇动培养 2-2.5 h至 OD 6QQ =0.8。 冰浴菌液 10 min, 每隔 3 min摇匀一次, 令所述细菌均匀进入休眠状态。 于 4°C下 4000 g离心 10 min, 弃上清液; 加入一定量冰预冷的 10%甘油重悬浮菌体, 4°C下 4000 g离心 10 min, 收集沉淀; 用并预冷的 10%甘油重复洗 3-4次; 然后加入适量冰浴预冷的 10% 甘油重新悬浮细菌沉淀, 以 40 μΐ/管将其分装, 于 -70°C保存备用。

转化农杆菌: 在冰上融化所述的感受态细胞, 往 40 μΐ的感受态细胞中加入 1 μΐ 的质粒, 混匀后冰浴约 10 min。 将感受态细胞和 DNA的混合物用移液枪转移到冰预 冷的电击杯 (购自 bio-md) 中, 轻敲使悬浮液到达电击杯底部, 注意不要有气泡。 将 所述电击杯放到电击室的滑道上, 推动滑道将电击杯放至电击室基座电极处。 使用 0.1cm规格的电击杯的时候, MicroPulser (购自 bio-rad) 的程序设置为 "Agr", 电击一 次。 立即取出电击杯, 加入 28 °C预热的 LB培养基。 快速而轻柔的用移液枪将细胞打 匀。 将悬浮液转入 1.5 ml的离心管, 在 28 °C, 225 rpm摇动培养 1 h。 取 100— 200 μΐ 的菌液涂布于相应的抗性筛选培养基平板上 (LB固体培养基, 含 50 μ § /ιη1利福平、 50 g/ml链霉素、 50 g/ml卡那霉素), 28 °C培养。 实施例 5 利用农杆菌介导的转化法获得转基因烟草

用 75%酒精浸泡烟草种子 (国家烟草中期库, 获取单位: 中国农科院烟草所, 库 编号 I5A00660 ) 30 s, 然后用灭菌双蒸水洗两次。 再用 0.1%升汞浸泡 8 min, 然后用 灭菌双蒸水洗两次, 完成表面灭菌。 将表面灭菌的烟草种子置于 MS固体培养基 (含 有 18.78 mM KN0 3 1.25 mM KH 2 P0 4 、 20.6 mM H 4 N0 3 1.5 mM MgS0 4 、 3.0 mM CaCl 2 、 50 μΜ ΚΙ、 100 μΜ Η 3 ΒΟ 3 、 100 M MnSO 4 、 30 M ZnSO 4 、 1 μΜ Να 2 Μο0 4 0.1 μΜ CoCl 2 100 μΜ Na 2 EDTA 100 μΜ FeS0 4 、 7.4 g/1琼月旨、 30 g/l蔗糖) 上于无 菌条件下发芽, 制备无菌苗。 取无菌苗叶片剪成 5 mmx5 mm大小的叶盘, 用处于对 数生长期的含表达载体 rd29A-GhCzf5-2300的农杆菌浸染叶盘 10 min, 吸干菌液, 在 黑暗条件下共培养 2天 (MS固体培养基)。 将叶片转到分化固体培养基 (MS+1 mg/1 细胞分裂素 (BA) +0.1 mg/1萘乙酸 (NAA) +50 mg/1卡那霉素 +500 mg/1头孢霉素) 上, 每天用 2000 Lx的光照 16h, 培养 45天左右, 待芽长大后切下转移到生根培养基 (MS+50 mg/l卡那霉素 +500 mg/l头孢霉素)中培养 30天左右, 待根系发达后将小苗 转入仅加有 500 mg/1头孢霉素的 MS培养基上进行编号保存。

剪取获得的转基因烟草植株的叶片, 提取 DNA (同实施例 3中拟南芥 DNA提取 方法),用 SEQ ID NO: 10和 SEQ ID NO: 11进行 PCR扩增鉴定(50 μΙ ΡΟ 反应体系: 5 μΐ ΙΟ Εχ Buffer 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP、 2.0 μΐ DNA、 1.0 μΐ Ex Taq、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 10和 SEQ ID NO: 11各 2.0 μ1、 以及 35 μΐ双蒸水。 PCR反应条件: 94°C 预变性 5 min, 33个循环 (94°C 变性 30 s, 58°C退火 30 s, 72 °C 延伸 2 min), 72 °C 延伸 10 min), 将 PCR鉴定为阳性植株编号为 T0D1-T0D20并保存。 实施例 6 过表达 GhCzf5转基因烟草 T1代植株的抗旱模拟实验

灭过菌的蛭石用 1/2MS培养基浸透。 T0D1-T0D20转基因烟草及对照烟草种子分 别播种在蛭石上, 每盆播种 15颗种子, 25 °C、 10小时光培养 /14小时暗培养循环。 每 5天浇一次 1/2MS, 培养 25天之后, 每盆保留大小较一致的 4-5棵苗用于干旱实验, 转基因烟草、对照烟草干旱 14天 (不浇水), 25 °C、 10小时光培养 /14小时暗培养循环。 T1代转基因植株 (T0代转基因植株的种子长成的植株) 的抗旱性鉴定表明, 对照植 株都萎蔫严重, 而 T1D1、 T1D8、 T1D10、 T1D13、 T1D17 五个株系共 23棵烟草中 有 18棵能够正常生长, 表现出明显的耐旱性(见图 3, 以 T1D1、 T1D8为例, T1D10、 T1D13、 T1D17的结果与 T1D1、 T1D8类似, 在此未示出)。 实施例 7 在转录水平上验证 Czf5蛋白表达 实施例 6中 18棵能够在干旱条件下正常生长的 1\代转基因植株中随机选取 8棵, 实施例 6中 5棵不能在干旱条件下正常生长的 1\代转基因植株中随机选取 4棵, 各 剪取干旱 14天的叶片 0.05 g, 用植物 RNA提取试剂盒(invitrogen)提取总 RNA。 紫 外分光光度测定总 RNA在 260 nm和 280 nm的吸光度值, 计算各个 RNA浓度。 依照 invitrogen反转录试齐 Ll盒 Superscript III Reverse Transcriptase所示方法进行反转录 ( 1 总 RNA作为模板,反转录引物 SEQ ID NO: 11 )。通过 SEQ ID NO: 10和 SEQ ID NO: 11扩增 GhCzf5, 检测 Czf5蛋白相对表达情况。 采用 TaKaRa的 PrimeSTAR HS DNA 聚合酶, 以反转录的 cDNA为模板进行 PCR反应。 50 μ1 ΡΟ 反应体系: 10 μΐ 5xPS Buffer, 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP, 2.0 μΐ cDNA, 1.0 μΐ PrimeSTAR、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 10和 SEQ ID NO: 11各 2.0 μ1, 以及 30 μΐ的双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变 性 5 min, 29个循环 (94°C 变性 30 s, 58°C退火 30 s, 72 °C 延伸 lmin), 72 °C 延 伸 10 min。产物电泳结果如图 4所示: M为 DNA Ladder Marker (DL2000,购自深圳瑞 真生物技术有限公司), 1-8为正常生长植株, 9-12为不能正常生长植株。 图中所示条 带大小与 GhCzf5的大小一致。结果表明正常生长植株中 GhCzf5的转录较强, 不能正 常生长植株中没有 GhCzf5转录或转录很弱。 本领域技术人员可以理解的是本发明也适用于 特定描述之外的变化和调整, 并且 本发明包括所有的这种变化和调整。发明人要 求落入下文权利要求范围和精神内的修 改和改变的权利。