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DATABASE GENBANK [online] 25 April 2006 (2006-04-25), XP003033125, retrieved from NCBI Database accession no. XM_755086
JIANG T.Y.: "Studies on the construction of the P450 reductase gene replacement vector for the optimization of the engineered artemisinin producing yeast, A006-20", CHINESE MASTER'S THESES FULL-TEXT DATABASE BASIC SCIENCES, no. 7, 15 July 2009 (2009-07-15), CNKI, BEIJING, CHINA, pages 50 - 54, XP008168081
北京三高永信知识产权代理有限责任公司 (CN)
权 利 要 求 书 1、 一种糖基水解酶, 其特征在于, 所述糖基水解酶的氨基酸序列包括 SEQ ID NO: 2所示序列的至少 30%—致性的氨基酸序列; 优选包括具有 SEQ ID NO: 2至少 40%—致性的氨基酸序列; 更优选包括具有 SEQ ID NO: 2至少 50%—致性的氨基酸序列; 进一步优选包括具有 SEQ ID NO: 2至少 60%—致性的氨基酸序列; 进一步优选包括具有 SEQ ID NO: 2至少 70%—致性的氨基酸序列; 进一步优选包括具有 SEQ ID NO: 2至少 80%—致性的氨基酸序列; 进一步优选包括具有 SEQ ID NO: 2至少 90%—致性的氨基酸序列; 进一步优选包括具有 SEQ ID NO: 2至少 95%—致性的氨基酸序列; 或所述 7-木糖紫杉烷糖基水解酶的氨基酸序列是 SEQ ID NO: 2的氨基酸序列经 过一个或几个氨基酸残基的取代、 缺失或添加且具有与 SEQ ID NO: 2的氨基酸 残基序列相同活性的由 SEQ ID NO: 2衍生的蛋白质。 2、 一种编码权利要求 1所述糖基水解酶的核苷酸序列。 3、根据权利要求 2所述的核苷酸序列,其特征在于,所述的核苷酸序列具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3至少 30%—致性的核苷酸序列; 优选包括具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3至少 40%—致性的核苷酸 序列; 更优选包括具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3至少 50%—致性的核苷 酸序列; 进一步优选包括具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3至少 60%—致性的 核苷酸序列; 进一步优选包括具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3至少 70%—致性的 核苷酸序列; 进一步优选包括具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3至少 80%—致性的 核苷酸序列; 进一步优选包括具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3至少 90%—致性的 核苷酸序列。 进一步优选包括具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3至少 95%—致性的 核苷酸序列。 或来自丝状真菌的基因, 其与 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3所示的 DNA的全部或部分, 或与和 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3所示序列互补的 DNA的全部或部分在严格条件下杂交, 并且编码具有水解 7-木糖紫杉烷木糖基 活性的蛋白质。 4、 一种含有权利要求 2〜3所述核苷酸序列的重组质粒。 5、 一种含有权利要求 2-3所述核苷酸序列的宿主细胞。 6、 根据权利要求 5所述的宿主细胞, 其特征在于, 所述宿主细胞可以是能够产 生包括 SEQ ID NO:2所示序列的至少 30%—致性的氨基酸序列的同源产生菌, 或者是异源宿主细胞。 7、 根据权利要求 6的宿主细胞, 其特征在于, 所述的宿主细胞的宿主生物选自 细菌、 放线菌、 酵母菌、 丝状真菌、 植物细胞或动物细胞。 8、 根据权利要求 7的宿主细胞, 其特征在于, 所述的细菌选自大肠埃希氏菌属 (.Escherichia species ) 芽胞杆菌属 (Bacillus species ) ; 所述的放线菌选自链霉菌属 i Stfeptomyces species) ; 所述的酵母菌选自酵母菌属(^cc/Mramyce species )、毕赤酵母菌属 Pichia species ) 裂殖酉孝母菌属 ( Schizosaccharomyce species) ; 所述的丝状真菌选自曲霉属 ί Aspergillus species ) 木霉属 Trichode画 species ) 青霉属 (Penicillium species ) 口蘑属 ( Tricholoma species ) 香 属 (.Lentinula species ) 伞菌属 (.Agaricus species) ; 所述的植物细胞选自双子叶植物 (dicotyledon) ; 所述的动物细胞选自昆虫细胞。 9、根据权利要求 8的宿主细胞,其特征在于,所述的大肠埃希氏菌属( ¾C^n'r/7/« species) 优选大肠杆菌 (E. coif); 所述的芽胞杆菌属 (B d//^ species) 优选枯草芽孢杆菌 B. subtilis ; 所述的链霉菌属 ( reptomyci^ species) 优选变铅青链霉菌 (S. Uvidans); 所述的酵母菌属 Sacchammyce species ) 优选酉良酒酵母 ( Saccharomyce cerevisiae); 所述的毕赤酵母菌属 (/¾/ώ species) 优选巴斯德毕赤酵母 P. pastori 所述的裂殖酵母菌属 Schizosacchawmyce species ) 优选粟酒裂殖酵母 (Schizo saccharomyce pombe); 所述的曲霉属 (Aspergillus species) 优选黑曲霉 (A niger), 米曲霉 (A. oryzae 构巢曲霉 (Λ. 所述的木霉属 iTrichode species) 优选里氏木霉 T. reeseO, 绿色木霉 ( T. viride ); 所述的青霉属 画 species)优选产黄青霉 〃 画 chrysogenum); 所述的口蘑属 ( Tricholoma species ) 优选口蘑 ( Trichoderma mongolicum ); 所述的香菇属 (Z^w .//< species) 优选香菇 L. edodes 所述的伞菌属 (Agaricus species) 优选双孢蘑 (Agaricus bisporus); 所述的双子叶植物 (dicotyledon) 优选拟南芥 iArabidopsis thaliana 所述的昆虫细胞优选草地贪夜蛾 iSpodoptera frugiperda) S 细胞。 10、 权利要求 1 的糖基水解酶在水解底物去除木糖基和 /或水解去除葡萄糖基中 的应用。 11、权利要求 5-9的宿主细胞在水解底物去除木糖基和 /或水解去除葡萄糖基中的 应用。 12、 根据权利要求 11所述的应用, 其特征在于, 所述的底物为糖苷化合物。 13、 根据权利要求 12所述的应用, 其特征在于, 所述的糖苷化合物选自含有木 糖残基的化合物或含有葡萄糖残基的化合物。 14、 根据权利要求 13所述的应用, 其特征在于, 所述的含有木糖残基的化合物 选自紫杉烷木糖苷类化合物。 15、 根据权利要求 14所述的应用, 其特征在于, 所述的含有紫杉烷木糖苷类化 合物选自 7-木糖紫杉烷类化合物。 16、 根据权利要求 15所述的应用, 其特征在于, 所述的所述的 7-木糖紫杉烷类 化合物选自: 7-木糖紫杉醇、 7 -木糖 -10-去乙酰紫杉醇、 7-木糖三尖杉宁碱、 7—木糖 -10-去乙酰三尖杉宁碱、 7-木糖紫杉醇 C、 7—木糖 -10-去乙酰紫杉醇 C、 7-木糖巴卡亭 III、 7 -木糖 -10-去乙酰巴卡亭 III。 17、 根据权利要求 10〜16所述的应用, 其特征在于, 所述的 7-木糖紫杉烷糖基 水解酶水解去除木糖基后得到的产物为 7-羟基紫杉烷类化合物, 选自 紫杉醇、 10-去乙酰紫杉醇、 三尖杉宁碱、 10-去乙酰三尖杉宁碱、 紫杉醇 C、 10-去乙酰紫杉醇 C、 巴卡亭 III、 10-去乙酰巴卡亭 III。 、 根据权利要求 15所述的应用, 其特征在于, 所述的 7-木糖紫杉烷原料选自 带有木糖基的紫杉烷类的混合物。 、 根据权利要求 18所述的应用, 其特征在于, 所述的紫杉烷类的混合物选自 红豆杉属 (K∞«)植物组织, 红豆杉属植物细胞培养物, 或者是能够产生 7- 木糖紫杉烷类化合物的微生物细胞培养物。 、 根据权利要求 19所述的应用, 其特征在于, 所述的红豆杉属植物选自欧洲 红豆杉 (7: baccata 短叶红豆杉 (T. brevifolia , 喜马拉雅红豆杉 (T. waUic iana), 曼地亚红豆杉 media)、 中国红豆杉 T. chinensis 、 云南红 ϋ杉 (T. yunnanensis) ^ 以及东北红 ϋ杉 (T. cuspidate) 、 权利要求 19所述的应用, 其特征在于, 所述的红豆杉属 (Τ 植物组织 选自其根、 针叶、 树皮或整个苗木。 、 根据权利要求 10所述的应用, 其特征在于, 所述的 7-木糖紫杉烷糖基水解 酶在进行水解反应时的溶剂选自: 水、 甲醇、 乙醇、 乙酸乙酯、 丙酮、 正己 烷、 氯仿、 二氯甲烷、 Ν,Ν-二甲基甲酰胺 (DMF)或二甲基亚砜(DMSO) 。 、 权利要求 1 的糖基水解酶在改善面包特性, 改善动物伺料特性, 生产 D-木 糖, 或再生纸脱墨中的应用。 、 权利要求 1 的糖基水解酶与纤维素酶和 /或半纤维素酶合用, 水解木质纤维 获取单糖的应用。 |
本发明涉及一种新型的糖基水解酶 (GH)、 该酶的氨基酸序列及编码该酶的 核苷酸序列。 具体讲, 该酶具有 β-木糖苷酶 -β-葡萄糖苷酶活性, 并且能专一性 地从 7-木糖紫杉烷类化合物上水解去除木糖基, 本发明涉及编码该 7-木糖紫杉 烷糖基水解酶的核苷酸序列、 该酶的氨基酸序列以及该酶或者该酶产生菌的 应 用。 背景技术 紫杉醇 (Taxol®, Paclitaxel) 主要由红豆杉属植物产生, 作为二十世纪 90年 代抗癌药的重要成就之一, 自问世以来, 其独特的抗肿瘤机制和显著的抗肿瘤活 †生令世人嘱目 ( Kingston DGI, et al. The taxane diterpenoids. In: Herz W, et al. eds. Progress in the chemistry of organic natural products. New York: Springer- Verlag, 1993, 161-165 )。它可以与微管蛋白结合, 促进微管蛋白的聚合并抑制其解聚, 阻 止细胞有丝分裂过程中纺锤丝的形成, 使细胞停滞于 G2/M期(Horwitz SB. Taxol (paclitaxel): mechanisms of action. Ann Oncol. 1994a, 5 Suppl.)。 目前紫杉醇在临床 上被用作乳腺癌、 卵巢癌和非小细胞肺癌等的一线药物。对头颈 部癌症、 黑色素 瘤、 结肠癌以及由 HIV引起的卡波济肉瘤也有较好的疗效。
紫杉醇在红豆杉植株中含量很低,即使是含量 最高的部位树皮中也只有万分 之二左右 (美国专利 US 6028206 ) 。 一颗生长百年的红豆杉老树可得到大约 3公 斤树皮,从中可制取 300毫克左右的紫杉醇 (Horwitz, SB. How to make taxol from scratch. Nature 1994b, 367: 593-594 ) , 因此, 从树皮中每提取 1公斤紫杉醇需要 大约 3000棵大树, 而满足 1例病人的用药量相当于毁掉 3〜4棵百年老树。 有一种 替代方法是从欧洲红豆杉 Taxus baccata L. ) 等的枝叶中提取含量较高的 10-去 乙酰巴卡亭 ΠΙ (含量可达 0.1%左右), 以此为原料半合成紫杉醇或其结构类似物 多西紫杉醇 (taxotere) , 后者的活性比紫杉醇稍强, 水溶性也高于紫杉醇 [Denis JN, et al. A highly efficient, practical approach to natural taxol. J Am Chem Soc. 1988. 1 10(17):5917-5919; Horwitz RI. Studies with RP 56976 (Taxotere): A semisynthet- ic analogue of taxol. J Nat Cancer Inst. 1991 , 83(4):288-291 ; 美国专利 US
4814470]。灌木型红豆杉杂交种的苗圃栽培也 认为是已知的解决紫杉醇来源最 简易、 资源可再生、 成本最低廉的方法。
除了含量极低的紫杉醇以外,还从红豆杉树皮 中分离到具有紫杉醇母核结构 的 C-7 木糖紫杉烷类化合物 (紫杉烷木糖苷), 包括 7-木糖 -10-去乙酰紫杉醇 ( 7-P-xylosyl- 10-deacytyltaxol, XDT )、 7-木糖 -10-去乙酰三尖杉宁碱 ( 7-P-xylosyl- 10-deacetylcepholomanine, XDC )、 7-木糖 -10-去乙酰紫杉醇 C ( 7-P-xylosyl-l O-deacytyltaxol C, XDTC ) 等, 其中, 7-木糖 -10-去乙酰紫杉醇 ( 7-P-xylosyl- 10-deacytyltaxol, XDT) 的含量最为丰富 (Senilh V, et al. Mise en evidence de nouveaux analogues du taxol extraits de Taxus boccata. Nat Prod. 1984, 47: 131-137; Rao KV. Taxol and related taxanes. I. Taxanes of Taxus brevifolia bark. Pharm Res. 1993, 10:521-524)。例如, XDT、 XDC、 XDTC的收率可以分别达到: 0.5%, 0.02% and 0.0075% (欧洲专利 EP0905130B1 )。 这些 7-木糖紫杉烷类化合 物可以用化学方法 (美国专利 US 6028206; 欧洲专利 EP 1298128B1 ) 或生物方 法 (美国专利 US 5700669; 中国专利 CN申请号 No.200610046296.6; 中国专利 CN 申请号 No.200710012698.9 )水解去除其上的木糖基, 产生相应的 7-羟基紫 杉烷,后者可被用于化学半合成紫杉醇或多西 紫杉醇, 以提高红豆杉资源利用率 和缓解红豆杉资源的供求矛盾。但比较而言, 化学方法存在某些不足, 如相对较 低的收率、 较为复杂的反应过程以及环境污染等, 而生物方法则符合环保理念。
美国及欧洲专利 (US5700669A; EP0668360B1 ) 及发表的相关论文(Hanson RL, et al. Enzymatic hydrolysis of 7-xylosyltaxanes by xylosidase from Moraxella sp. Biotechnol Appl Biochem 1997, 26: 153-158 ) 公开了利用细菌 Moraxella sp.(ATCC55475) Bacillus macerans (ATCC55476) Bacillus circulans (55477) 禾口 Micrococcus sp.(ATCC55478) 将 C-7木糖紫杉烷转化为 C-7羟基紫杉烷的水解方 法, 其中, Mora;ce//fl sp.的转化能力最强, 在 2ml细胞悬浮液中加入 0.5 mg 7-木 糖 -10-去乙酰紫杉醇 (XDT ) (湿细胞 91.5 mg/ml; XDT 0.25 mg/ml) , 28。C、 12 rpm条件下极向 (end-over-end) 混合 21小时, 用甲醇终止反应、 HPLC检测, 没有看到 XDT剩余, 产物 DT的产率为 0.23mg/ml。 中国专利 (申请号 200610046296.6 ) 及发表的相关论文 (Hao DC, α/. Bacterial diversity of Taxus rhizosphere: culture-independent and culture-dependent approaches. FEMS Microbiol Lett 2008, 284:204-212 ) 公开了利用放线菌 Leifsonia shinshuensis DICP 16 (CCTCC No. M 206026) 将 C-7木糖紫杉烷转化为 C-7羟基 紫杉烷的水解方法。 利用类似于上述美国专利的培养及转化条件, 在 2 ml 菌体 悬浮液中加入 1 mg XDT, 在 30 ° C 、 120 rpm条件下反应 21小时后用 2 ml甲 醇终止反应, HPLC测得反应液中无 XDT残留, 产生 0.4 mg/ml DT。 在另一个 试验中, 2ml 反应液中湿细胞浓度为 231.58mg/ml, 7-木糖 -10-去乙酰巴卡亭 III 以不同浓度 ( 0.5, 0.9,1.95, 3.1 , 4.4, 5.2, 和 6.75 mg/ml) 分别加入, 在 31 °C 、 120 rpm条件下反应 40 h以上, 10-去乙酰巴卡亭 III的收率在底物浓度为 1.95 mg/ml时达至 lj最高 ( Hao DC, et al. Bacterial diversity of Taxus rhizosphere: culture-independent and culture-dependent approaches. FEMS Microbiol Lett 2008, 284:204-212 ) 。
另一份中国专利 (申请号 200710012698.9 ) 公开了放线菌纤维化纤维单孢 菌 Cellulosimicwbium cellulans, XZ-5CCTCC No. M 207130)、 水解酶及其在紫 杉烷转化方面的用途: 将 10 ml XDT (浓度为 5 mg/ml)加入到 90 ml粗酶液 ( 100 ml培养液加入 1 ml 30 °C培养 2天的纤维化纤维单孢菌种子液, 150 rpm, 30 °C 摇瓶培养 5天, 离心收集上清即为粗酶液), 50 rpm, 30 °C下反应 20小时, 产 生 40mg DT。
总的来看,上述生物方法在水解 7-木糖紫杉烷方面均有潜在的应用价值,但 由于现存技术中的细胞酶量普遍偏低、底物在 水中的溶解度不高等因素, 导致产 率不高, 难以满足规模化工业生产的要求。 有一些 β-木糖苷酶已从真菌和其他生物中分离得到 [Tuohy MG, et al. The xylan-degrading enzyme system of Talaromyces emersonii: novel enzymes with activity against aryl beta-D-xylosides and unsubstituted xylans. Biochem J. 1993, 290 (Pt 2):515-523; Golubev AM, et al. Purification, crystallization and preliminary X-ray study of β-xylosidase from Trichoderma reesei. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2000, 56 (Pt 8): 1058— 1060; Pan I, et al. Effective extraction and purifi- two-phase partitioning. Enzyme Microb Technol. 2001 , 28 (2-3): 196-201 ; Rizzatti ACS, et al. Purification and properties of a thermostable extracellular β-D-xylosidase produced by a thermotolerant Aspergillus phoenicis. J Ind Microbiol BiotechnoL 2001 , 26(3): 156-160; Saha BC. Purification and characterization of an extracellular β-xylosidase from a newly isolated Fusarium verticillioides. J Ind Microbiol Biotechnol 2001 , 27 (4):241-245; Gargouri M, et al. Fungus be- ta-glycosidases:immobilization and use in alkyl-beta-glycoside synthesis. J Mol Catal B: Enzym. 2004, 29, Issues 1-6:89-94; Lama L, et al. Purification and characterization of thermostable xylanase and β-xylosidase by the thermophilic bacterium Bacillus thermantarcticus . Res Microbiol 2004,155(4):283-289; Belfaquih N & Penninckx MJ. A bifunctional β-xylosidase-xylose isomerase from Streptomyces sp. EC 10. Enzyme Microb Technol 2000, 27(1-2): 114-121] , 还成功克隆并鉴定了一些 β-木糖 苷酶基因 (如几种真菌来源的 β-木糖苷酶基因) [Margolles-Clark E, Cloning of genes encoding alpha-L-arabinofliranosidase and beta-xylosidase from Trichoder- ma reesei by expression in Saccharomyces cerevisiae. Appl Environ Microbiol. 1996, 62(10):3840-3846.; van Peij 顺, et al. β-Xylosidase activity, encoded by xlnD, is essential for complete hydrolysis of xylan by Aspergillus niger but not for induction of the xylanolytic enzyme spectrum. Eur J Biochem. 1997, 245 (1): 164-173; Perez-Gonzalez JA, et al. Molecular cloning and transcriptional regulation of the Aspergillus nidulans xlnD gene encoding a β-xylosidase. Appl Environ Microbiol. 1998, 64(4): 1412-1419; Kitamoto N, et al. Sequence analysis, overexpression, and anti- sense inhibition of a β-xylosidase gene, xylA, from Aspergillus oryzae KBN616. Appl Environ Microbiol. 1999, 65(l):20-24; Berrin JG, et al. High-level production of recombinant fungal endo-β- 1 ,4-xylanase in the methylotrophic yeast Pichia pastoris. Protein Expr Purif. 2000, 19(1): 179-187; Reen FJ, et al. Molecular characterisation and expression analysis of the first hemicellulase gene (bxll) encoding β-xylosidase from the thermophilic fungus Talaromyces emersonii. Biochem Biophys Res Commun. 2003, 305(3):579-585; Kurakake M, et al. Characteristics of transxylosylation by beta-xylosidase from Aspergillus awamori 4. Biochim Biophys Acta. 2005, 1726(3):272-279; Wakiyama M, et al. Purification and properties of an extracellular β-Xylosidase from Aspergillus japonicus and sequence analysis of the encoding gene. J Biosci Bioeng. 2008, 106(4):398-404] o 然而, 所有这些 β-木糖苷酶(天然的或重 组的) 尚未见到能专一性水解 7-木糖紫杉烷, 因此有理由认为, 迄今为止能够对 7-木糖紫杉烷类化合物具有专一性催化活性的 β-木糖苷酶的基因尚未见到克隆, 更谈不上对其进行功能分析。 事实上, 有许多商品化的木糖苷酶、木聚糖酶和其 他的糖苷酶根本不具备从 7-木糖紫杉烷上水解去除木糖基的能力 (Hanson RL, et al. Enzymatic hydrolysis of 7-xylosyltaxanes by xylosidase from Moraxella sp. Bio- technol Appl Biochem 1997, 26: 153-158)。 发明内容
鉴于现有技术中存在的上述问题, 本发明的目的是提供一种新型的、 高效 的、 能专一性地水解 7-木糖紫杉烷木糖基的水解酶, 及其基因序列。
为解决上述技术问题, 本发明的发明人进行了潜心的研究。首先, 从具有专 一性 β-木糖苷酶活性、能够转化 7-木糖紫杉烷为 7-羟基紫杉烷的真菌 Μ95.33中 纯化专一性的 7-木糖紫杉烷糖基水解酶 (GH), 对纯化的酶进行 LC-MS/MS De novo 测序, 得到一些寡肽的氨基酸序列。 根据这些寡肽的氨基酸序列设计出一 系列简并引物, 通过巢式 PCR、 RACE和 Genome Walking等分子生物学技术克 隆该酶的 cDNA及其结构基因。 将编码该酶的开放阅读框 (open reading frame, 0RF )之 cDNA片段与适当表达载体连接, 构建重组质粒, 后者被导入相应的宿 主细胞,如生长快并能进行高密度发酵的毕赤 酵母。重组菌能够高效催化 7-木糖 紫杉烷的糖基水解反应,产生 7-羟基紫杉烷。发明人还发现该酶是一种双功 酶, 能水解去除葡萄糖苷上的葡萄糖残基。
该核苷酸序列与 GenBank中已注册的所有核苷酸序列几乎没有同 性, 最为 接近者也多为假定蛋白基因序列, 且两者的覆盖率仅 3〜7%; 由其核苷酸序列推 定的氨基酸序列与玉蜀黍黑粉菌 stilago maydis ) 的假定蛋白序列 (GenBank accession: XP_760179 )最为接近, 可比较范围内两者的一致性为 43%, 相似性为 59%。 本发明包含了如下的发明:
提供了一种新的 7-木糖紫杉烷糖基水解酶, 代号为 Lx≠- P l。 本发明的第二发明目的在于提供编码该酶的核 苷酸序列。
本发明的第三发明目的在于提供含有该核苷酸 序列的重组质粒。
本发明的第四发明目的在于提供含有该重组质 粒或该核苷酸序列的宿主细 胞。
本发明的第五发明目的在于提供该酶的应用。 为了实现本发明之目的, 采用的技术方案为:
本发明提供一种 7-木糖紫杉烷的糖基水解酶 (一种双功能的 β-木糖苷酶 -β- 葡萄糖苷酶), 该酶代号为 LXYL-P1。 所述 7-木糖紫杉烷糖基水解酶(LXYL-P1 )的氨基酸序列包括 SEQ ID NO: 2所示序列的至少 30%—致性的氨基酸序列;
优选包括具有 SEQ ID NO:2至少 40%—致性的氨基酸序列;
更优选包括具有 SEQ ID NO:2至少 50%—致性的氨基酸序列;
进一步优选包括具有 SEQ ID NO:2至少 60%—致性的氨基酸序列; 进一步优选包括具有 SEQ ID NO:2至少 70%—致性的氨基酸序列; 进一步优选包括具有 SEQ ID NO:2至少 80%—致性的氨基酸序列; 进一步优选包括具有 SEQ ID NO:2至少 90%—致性的氨基酸序列。
进一步优选包括具有 SEQ ID NO:2至少 95%—致性的氨基酸序列。 或者是 SEQ ID NO: 2的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的 代、 缺 失或添加且具有与 SEQ ID NO: 2的氨基酸残基序列相同活性的由 SEQ ID NO: 2 衍生的蛋白质。 本发明还提供了一种编码所述 7-木糖紫杉烷糖基水解酶 (LXYL-P1 ) 的核 苷酸序列或编码基因,代号为 L^/-W,其核苷酸序列具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3所示的核苷酸序列的至少至少 30%—致性的核苷酸序列;
优选包括具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3至少 40%—致性的核苷酸 序列;
更优选包括具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3至少 50%—致性的核苷 酸序列;
进一步优选包括具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3至少 60%—致性的 核苷酸序列;
进一步优选包括具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3至少 70%—致性的 核苷酸序列;
进一步优选包括具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3至少 80%—致性的 核苷酸序列;
进一步优选包括具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3至少 90%—致性的 核苷酸序列。
进一步优选包括具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3至少 95%—致性的 核苷酸序列。
来自丝状真菌的基因, 其与 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3所示的 DNA 的全部或部分, 或与和 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3所示序列互补的 DNA 的全部或部分在严格条件下杂交,并且编码具 有水解 7-木糖紫杉烷木糖基活性的 蛋白质。 本发明还提供含有该核苷酸序列、 编码 L^/-/^的重组质粒, 该质粒能够 被导入到适当宿主细胞中。 本发明还提供适当的宿主细胞,该宿主细胞可 携带 L /-/^基因序列, 该基 因序列具有 SEQ ID NO: 1或者 SEQ ID NO: 3所示的至少 30%—致性的核苷酸序 列。其宿主生物可以是所述肽(LXYL-P1 )的同源产生菌, 该肽具有 SEQ ID NO:
2所示的至少 30%—致性的氨基酸序列, 也可以是异源宿主细胞。
适宜的宿主生物选自细菌、 放线菌、 酵母菌、 丝状真菌、 植物细胞或动物细 胞。
优选的细菌选自大肠埃希氏菌属 ( Escherichia species ) 芽胞杆菌属 ( Bacillus species );
优选的放线菌选自链霉菌属 ( Streptomyces species);
优选的酵母菌选自酵母菌属(^cc/Mramyce species )、毕赤酵母菌属 Pichia species ) 裂殖酉孝母菌属 (.Schizosacchawmyce species);
优选的丝状真菌选自曲霉属 Aspergillus species )、 木霉属 iTrichoderma species ) 青霉属 .Penicillium species ) 口蘑属 ( Tricholoma species ) 香 属 .Lentinula species ) 伞菌属 (Agaricus species);
优选的植物细胞选自双子叶植物 (dicotyledon);
动物细胞选自昆虫细胞。 优选的大肠埃希氏菌属 (Escherichia species) 优选大肠杆菌 (E. coli ; 优选的芽胞杆菌属 (Bad/Zi^ species) 优选枯草芽孢杆菌 B. subtilis ', 优选的链霉菌属 (Streptomyces species) 优选变铅青链霉菌 (S. lividans); 优选的酉孝母菌属 ( Saccharomyce species ) 优选酿酒酉孝母 ( Saccharomyce cerevisiae);
优选的毕赤酵母菌属 (ΑΆ species) 优选巴斯德毕赤酵母 P. pastoris)', 优选的裂殖酵母菌属 chizosaccharomyce species ) 优选粟酒裂殖酵母 (Schizosacchawmyce pombe);
优选的曲霉属 Aspergillus species) 优选黑曲霉 (A. niger), 米曲霉 (A. oryz e ) 构巢曲霉 (A. nidulans);
优选的木霉属 Trichoderma species) 优选里氏木霉 (T. ef 绿色木霉 ( T. viride );
优选的青霉属 (Pem'd〃 画 species)优选产黄青霉 (Pem'd〃 画 chrysogenum); 优选的口蘑属 ( Tricholoma species )优选口蘑 ( Trichoderma mongolicum) 优选的香菇属 entirmla species) 优选香菇 (L. edodes ;
优选的伞菌属 (.Agaricus species) 优选双孢蘑 (Agaricus bisporus); 优选的双子叶植物 (dicotyledon) 优选拟南芥 (Ambidopsis thaliana ;
优选的昆虫细胞优选草地贪夜蛾 Spodopterafmgiperda S 细胞。 本发明还提供了本发明的核苷酸序列、 本发明的 7-木糖紫杉烷糖基水解酶, 以及含有本发明核苷酸序列的宿主细胞的应用 。 具体而言, 所述的应用如下, 使用本领域常规的方法将该 DNA转化合适的 宿主细胞, 转化后的重组细胞, 通过其产生的重组酶, 水解各种底物, 特别是糖 苷化合物。
优选的作为底物的糖苷化合物选自含有木糖残 基的化合物或含有葡萄糖残 基的化合物; 即本发明的应用为从这类糖苷化合物上水解去 除木糖基和 /或葡萄 糖基。
优选的含有木糖残基的化合物选自紫杉烷木糖 苷类化合物; 所述的底物优 选含 7-木糖残基的紫杉烷类化合物, δΡ, 7-木糖紫杉烷, 可以是天然形成的、 或 是非天然产生的, 如化学或生物合成的、 或半合成的。
本发明的 7-木糖紫杉烷糖基水解酶的应用优选是用于 7-木糖紫杉烷的生物 转化或生物催化制备 7-羟基紫杉烷。
作为底物 7-木糖紫杉烷包括但不限于如下化合物: 7-木糖 -10-去乙酰紫杉 醇、 7-木糖 -10-去乙酰三尖杉宁碱、 7-木糖 -10-去乙酰紫杉醇 (:、 7-木糖 -10-去 乙酰巴卡亭 I I I、 7-木糖紫杉醇、 7-木糖三尖杉宁碱、 7-木糖紫杉醇 (:、 7-木糖 巴卡亭 Π Ι ; 水解去除木糖基后得到的产物包括但不限于: 10-去乙酰紫杉醇、 10-去乙酰三尖杉宁碱、 10-去乙酰紫杉醇 (:、 10-去乙酰巴卡亭 I I I、 紫杉醇、 三 尖杉宁碱、 紫杉醇 (:、 巴卡亭 I I I。
这些底物单独或彼此混合或与其他紫杉烷相混 合。
所述的底物也可选自含木糖残基的紫杉烷类化 合物的混合物,这类混合物包 括但不限于红豆杉属 ( T 植物组织, 优选的红豆杉属植物选自欧洲红豆杉
( T. baccata) , 短叶红豆杉 T. brevifolic 、 喜马拉雅红豆杉 T. wallichiana 曼地亚红豆杉(7: m ")、中国红豆杉(7: cfe '腦^ )、云南红豆杉(7: y醒匿 ';?)、 以及东北红豆杉 (7: cuspidate , 或者是这些植物的细胞培养物, 或者是能够产 生 7-木糖紫杉烷类化合物的微生物细胞培养物。 这里所述的植物组织包括植物 的根、 针叶、 树皮以及整个苗木。 本发明提供的方法中制备的紫杉醇或其类似物 (产物), 以及所用的 C-7-木 糖紫杉烷原料 (底物), 其结构特征如通式 I所示。 = Xylose
通式 I 化
7 -木糖 -10-去
10-
7-
-木糖 -lo-去乙酰
10-去乙酰
7-木糖
7-木糖 -10-去乙酰巴卡亭 III, XDB Xylose 676
H H
10-去乙酰巴卡亭 III, DB H 544
7-木糖巴卡亭 III, XB Xylose 718
H Ac 巴卡亭 III H 586
注: Ph为苯基, Bz为苯甲酰基, Ac为乙酰基 溶解底物的溶剂可以选自: 水、 甲醇、 乙醇、 乙酸乙酷 丙酮、 正己烷、 氯 仿、 二氯甲烷、 Ν,Ν-二甲基甲酰胺 (DMF ) 、 二甲基亚砜 (DMSO )。
本发明的应用还包括将本发明的糖基水解酶用 于改善面包特性,改善动物伺 料特性, 生产 D-木糖用于制造木糖醇, 和再生纸脱墨等。 本发明的糖基水解酶 还可与纤维素酶 ( ce ll u l ases )及半纤维素酶 ( hemicellulases )等合用, 水解木质 纤维获取单糖进而制备乙醇、丁醇等生物燃料 。本发明的糖基水解酶还可从其它 糖苷类化合物上释放出生物活性分子, 应用于医药领域。
本发明还提供了一种紫杉醇及其类似物的生物 转化制备方法:以 7-木糖紫杉 烷为原料,利用含有本发明基因序列的宿主细 胞或其产生的酶水解除去原料上的 木糖基, 得到紫杉醇或其类似物。优选的宿主细胞为口 蘑科的真菌或重组菌, 更 优选的为毕赤酵母属的巴斯德毕赤酵母 (简称毕赤酵母)。 总而言之,本发明的双功能的糖基水解酶,其 氨基酸序列包括 SEQ ID NO: 2 所示序列的至少 30%—致性的氨基酸序列, 能被用于从 7-木糖紫杉烷或其他糖 苷化合物上去除木糖或葡萄糖。 本发明亦涉及含有上述核苷酸序列的重组质粒 、 以及含有上述核苷酸序列的宿主细胞。本发明 还涉及 7-木糖紫杉烷糖基水解酶或 含有 7-木糖紫杉烷糖基水解酶的宿主细胞在水解去 木糖基和 /或水解去除葡萄 糖基方面的应用。 本发明提供的一种能明确其氨基酸序列的双功 能的 β-木糖苷酶 -β-葡萄糖苷 酶—— 7-木糖紫杉烷糖基水解酶, 系由一种口蘑科(Tricholomareceae)真菌香菇 (Lentinula edodes M95.33 ) 或由含有该酶编码基因的重组细胞产生, 可位于细 胞内或分泌到细胞外, 用于转化 7-木糖紫杉烷为紫杉醇或其类似物。 本发明的编码该糖基水解酶的核苷酸序列,包 括完整的开放阅读框架(0RF) 可以用来构建各种不同类型的重组表达质粒, 后者被转移到原来的真菌或其他真 菌宿主、 或者被转移到原核细胞 (包括大肠杆菌、 放线菌)、 植物细胞和动物细 胞等宿主细胞,由于该糖基水解酶基因的表达 可以使这些宿主获得水解 7-木糖紫 杉烷为 7-羟基紫杉烷的能力。 重组的宿主还可以用于其他含糖化合物的生物 转 化。
本发明的应用还包括将本发明的糖基水解酶用 于改善面包特性,改善动物伺 料特性, 生产 D-木糖进而用于制造木糖醇, 和再生纸脱墨等。 本发明的糖基水 解酶还可与纤维素酶 (cellulases )及半纤维素酶 (hemicellulases)等合用, 水解 木质纤维获取单糖进而制备乙醇、丁醇等生物 燃料。本发明的糖基水解酶还可从 其它糖苷类化合物上释放出生物活性分子, 应用于医药领域。 有益技术效果 本发明首次克隆并异源表达了能专一性地催化 7-木糖紫杉烷为 7-羟基紫杉 烷的糖基水解酶的基因, 制备出具有该酶活性的生物工程菌, 为大规模制备 7- 羟基紫杉烷提供了新的、 有效的途径。 术语和简称
CDS是指一个基因中编码蛋白的序列, 从起始密码子到终止密码子。
附图说明
图 1. 真菌 M95.33蛋白提取物中 β-木糖苷酶 -β-葡萄糖苷酶的 Phenyl Sepharose 疏水柱层析 (A) 和 XDT转化的薄层层析 (TLC) ( B)。
A: PI , LXYL-P1的活性洗脱峰; P2, LXYL-P2的活性洗脱峰。 横坐标为 不同流份 (不同分部收集管序号), 纵坐标为 A405 (405nm) 时的吸光值
B: 1, XDT (对照); 2, DT (对照); 3 , LXYL-P1生物转化 XDT; 4. LXYL-P2 生物转化 XDT。 图 2. LXYL-P1的 SDS-PAGE电泳图。 1, 蛋白质分子量标记; 2, LXYL-P1还原 处理; 3, LXYL-P1非还原处理。箭头表示用于 LC-MS/MS分析的蛋白条带。 图 3. 重组酵母菌落 PCR鉴定琼脂糖凝胶电泳。 M, 分子量标记; 1, 重组菌 GS115-9K (对照, 转入 pPIC9K ) ; 2, 重组菌 GS115-9K-P1-2 (转入 pPIC9K-Pl-2); 3, 重组质粒 pPIC9K-Pl-2 (对照)。 图 4. 重组菌 GS115-9K-P1-2和 GS115-9K (对照) β-木糖苷酶活性的比较。 图 5. 重组菌 GS115-9K-P1-2转化 XDT的 HPLC分析。 Α,转化前; Β,转化后。 图 6. 重组菌 GS115-3.5K-P1-2转化 7-木糖紫杉烷混合物的 HPLC分析。, A为混 合底物(对照); B为导入空载体的重组酵母 +混合底物(对照); C为导入 Lxyl-pl 基因的重组菌 +混合底物。 1、2、3分别代表 7-木糖 -10-去乙酰三尖杉宁碱(XDC)、 7-木糖 -10-去乙酰紫杉醇 (XDT)、 7-木糖 -10-去乙酰紫杉醇 C (XDTC) ; 1'、 2' 和 3'分别为各自对应的 7-羟基紫杉烷产物 10-去乙酰三尖杉宁碱 (DC) 、 10-去 乙酰紫杉醇 (DT)、 10-去乙酰紫杉醇 C (DTC) 。 图 7. 重组菌 GS115-3.5K-P1-2转化 7-木糖 -10-去乙酰巴卡亭 III的 HPLC分析 (保 留时间为 2min的溶剂峰在 XDT之前)。 图 8. PCR扩增过程示意如图。 具体实施方式
本发明通过下列实施例予以进一步阐明, 这些实施例是仅用于说明性的, 而不是 以任何方式限制本发明权利要求的范围。 实施例 1: 香菇 P-木糖苷酶 -P-葡萄糖苷酶 ( LXYL-P1) 的纯化 真菌 M95.33的培养: 从培养好的菌种斜面挑取约 lcm 2 见方的菌苔, 接种到 100 ml无菌的麦麸液体培养基中 [麦麸培养基成分, 每升含: 麦麸 50.00g (加适 量水, 煮沸 30min, 过滤去渣), 蛋白胨 20.00g, KH 2 P0 4 1.50g, MgSO 4 0.75g, 自然 pH〜6.3], 25〜26。C、 160 rpm摇瓶培养 6-8d。
糖基水解酶的分离纯化与分析: 过滤收集菌丝, 加入液氮研磨后, 按照 3〜5 倍体积加入 50 mM Tris-HCl (pH8.0) 蛋白裂解液, 冰浴超声处理 5min (130 W, 10 秒 /次, 间隔 10秒)。 离心 (12000rpm, lOmin) 后收集上清为粗酶液,用于进 一步分离纯化。
以对硝基苯基 -β-D-木糖苷 (PNP-Xyl)作为特异性生色底物对有 β-木糖苷酶 活性的蛋白进行跟踪。一个酶单位定义为在 50 °C, pH5.0, 以 PNP-Xyl 为底物, 1 min内催化产生 1 nmol对硝基酚所需要的酶量。
DEAE Sepharose FF阴离子交换柱(1.6 cmX20 cm), 用 Tris-HCl 缓冲液(50 mM, pH8.0)平衡, 将上述粗酶液(80〜90ml/次)上柱, 用含有 0、 0.1、 0.25 和 2.0 MNaCl的 50 mM Tris-HCl 缓冲液 (pH 8.0) 阶段梯度洗脱 (流速 2ml/min), 收集有酶活性的 0.1〜0.25 M NaCl洗脱组分并加入 1 M (NH 4 ) 2 S0 4 用于下一步层 析。
Phenyl Sepharose疏水柱(1.6 cmX20 cm)用含有 1 M (NH 4 ) 2 S0 4 的(50 mM, pH8.0)平衡, 将上一步洗脱组分上柱, 用含有 1.0〜0M(NH 4 ) 2 SO 4 的 Tris-HCl 缓 冲液(50mM, pH8.0)线性梯度洗脱(流速 2ml/min), 收集有活性的酶活组分, 用 Tris-HCl 缓冲液 (50mM, pH8.0) 透析。
透析后的溶液上 DEAE Sepharose FF 阴离子交换柱 [1.6 cmX20 cm, 用 Tris-HCl 缓冲液 (50 mM, pH 8.0) 平衡], 用含有 0.1〜0.25 M NaCl 的 Tris-HCl 缓冲液(50mM, pH8.0)线性梯度洗脱(流速 2ml/min), 收集酶活最高的组分, 浓縮后上 Sephacryl S200 HR分子筛层析柱 [1.6 cmX60 cm,用含有 0.1M NaCl 的 Tris-HCl缓冲液 (50 mM, pH8.0)平衡], 用含有 0.1 M NaCl的 Tris-HCl缓冲 液 (50mM, pH8.0)洗脱 (流速 2ml/min), 收集酶活最高的组分, 最终得到纯 化的酶。 以上纯化过程可归纳为:
真菌 M95.33培养
液氮研磨菌丝、 裂解得总蛋白提取液
DEAE Sepharose FF阴离子交换柱
(1.6x20cm), 阶段洗脱收集 0.1~0.25 M
NaCl洗脱组分
Phenyl Sepharose疏水柱
(1.6x20cm), 1.0-0 M (NH4)2S04
线性洗脱
DEAE Sepharose FF阴离子交换柱
(1.6x20cm), 0.1-0.25 M NaCl
线性洗脱
Sephacryl S200 HR分子筛
( 1.6 cmx60 cm)
SDS PAGE检测 · <—
PI的各个阶段纯化结果归纳于表 1。
寸 0 表 1 :
体积 总蛋白 总活力 比活力 回收率 纯化倍数 纯化步骤
( ml) ( mg) (U) (U/ mg) (%)
粗酶液 510 527.8 4099550.9 7767.2 100 1
DEAE Sepharose
225 91.8 1384245.0 15078.9 33.77 1.94 FF
Phenyl Sepharose 120 8.27 1103753.3 133464.7
DEAE
Sephacryl S200
3 0.048 161373.8 3361954.7
HR 用 Phenyl Sepharose疏水柱线性梯度洗脱时得到两个独立的 具有 β-木糖苷酶 活性的峰, 分别命名为 LXYL-P 1 (或 P 1 )和 LXYL-P2 (或 P2 )。 P 1和 P2均能 水解 7-木糖 -10-去乙酰紫杉醇(XDT)为 10-去乙酰紫杉醇(DT) (如图 1所示)。 其中, 在图 1中, A. 为层析得到的酶活峰; B.为 Pl、 P2酶活样品对底物 XDT 转化的薄层层析 (TLC)。 B中的 1为 XDT对照品, 2为 DT对照品, 3为 P1 转化 XDT, 4为 P2转化 XDT。 后经 LC-MS/MS De novo测序结果分析, 推定 P1与 P2具有相同的氨基酸残基序列, 但为不同的糖基化类型。
实施例 2: LXYL-Pl (或 PI ) 蛋白水解不同糖苷类底物的特异性实验:
除了具有 β-木糖苷酶活性, 尤其是具有水解 7-木糖紫杉烷的活性以外, LXYL-P1 (或 P1 ) 对其他糖苷化合物的特异性也进行了试验: 选取 4种生色底 物:
对硝基苯基 -β-D-葡萄糖苷( p-Nitrophenyl-beta-D-glucopyranoside, PNP-Glc )、 对硝基苯基 -β-D-半乳糖苷 ( p-Nitrophenyl-P-D-galactopyranoside, PNP-Gal )、 对硝基苯基 -α-L-阿拉伯糖苷 (p-Nitrophenyl a-L-arabinopyranoside, PNP-Ara) 禾口
对硝基苯基 -β-D-木糖苷 ( -Nitrophenyl beta-D-xylopyranoside , PNP-Xyl) (对 昭、),,
均用 50 mM的醋酸缓冲液配制成 5 mM、 pH 5.0的溶液。
取实施例 1得到的 25 μΐ纯化的 P1蛋白稀释液, 加 100 μΐ生色底物, 50 °C,
20 min , 用 2 ml 饱和硼酸钠溶液终止反应, 在 405 nm 处检测对硝基苯酚 (p-nitrophenol ) 释放情况 (吸光值)。 结果显示: P1 蛋白能水解 PNP-Glc 和
PNP-Xyl, 不能水解 PNP-Gal和 PNP-Ara, 结果见表 2。
表 2:
底物 OD 4Q5 值 相对活力 (%对照:) p- ■nitrophenyl-P-D-xylopyranoside (PNP-Xyl) 0.745 100 p- ■nitrophenyl-P-D-glucopyranoside (PNP-Glc) 1.615 217 p- ■nitrophenyl-P-D-galactopyranoside (PNP-Gal) 0.000 0 p- ■nitrophenyl-a-L-arabinopyranoside (PNP-Ara) 0.000 0 实施例 3: 糖基水解酶 LXYL-P1编码基因 (Lx_)½ ) 的克隆
将实施例 1得到的 LXYL-P1经 SDS-PAGE电泳 (见附图 2 ) 后, 回收样品 经还原处理、 表观分子量在 110 KDa处的电泳条带, 进行 LC-MS/MS分析, 挑 选 5个峰值最高的肽段进行 De novo测序, 获得 5个肽段的氨基酸残基序列, 分 别为:
1. LPWTWGK
2. QSGSLPLQHPQR
3. HWLAYEQETSR
4. DLPVGDSAWTYPPR
5. TLTPLEALQK (其中 I 禾 B L无法区分, K和 Q无法区分) 应用生物信息学手段对这 5个肽段所处的相对位置进行评估, 确定了其在 LXYL-P1上的前后顺序为: 3, 2, 5, 1, 4。 根据肽段 3和 5分别设计上、 下游 简并引物:
3F1 : CTTGCGTACGAGCARGARAC
3F2: CACTGGCTTGCGTAYGARCA
3F3: CACTGGCTTGCNTAYG
5R1: AGCCTCCAGTGGCGTNAGNGT
5R2: CTGCAGAGCCTCCAGNGGNGT
5R3: TTCTGCAGAGCCTCNAGNGG
以真菌 M95.33总 R A为模板, 应用上述简并引物进行 nest-PCR扩增。 PCR产 物经证实含有肽段 3, 2和 5编码序列后, 再利用 RACE技术向两端扩增得到包 含上述 5个肽段编码区的 cDNA片段, 该片段含有 2412bp的开放阅读框(Open Reading Frame, ORF,或称为 CDS, 命名为 Lxyl-pJ ),编码 803个氨基酸。该 cDNA 序列 SEQ ID NO : 3及其编码的氨基酸序列 SEQ ID NO : 2如附录所示。 其 PCR扩 增过程如图 8所示:
根据此 cDNA序列设计特异性引物, 以真菌 M95.33基因组 DNA为模板, 进行 PCR扩增和染色体步移 (Genome Walking) , 获得 LXYL-P1的结构基因序 列 ( G-lxyl-pl 。 在基因组水平, 该基因含有 19个外显子和 18个内含子, 从起 始密码子 ATG到终止密码子 TGA共有 3608bp, 其核苷酸序列 SEQ ID NO : 1如 附录所示。 实施例 4: 重组质粒的构建和重组酵母菌的筛选
将实施例 3得到的 P1编码区的 ORF CLxyl-pl ) 通过 PCR方法在其 5'-、 3'- 端分别引入 ΛίβΒ I和 Not I酶切位点, ΛίοΒ VNot I双酶切后将其连接到同样用 SnaB Ι/Λ¾ I双酶切的毕赤酵母表达载体 pPIC9K (分泌型表达载体)或 pPIC3.5K (非分泌型表达载体) 上, 形成重组表达质粒 pPIC9K-Pl-2 或 pPIC3.5K-Pl-2。 重组质粒通过 Sac l单酶切线性化, 电转入毕赤酵母 GS115感受态细胞, 同时, 以空载体 PPIC9K或 pPIC3.5K用同样方法电转入毕赤酵母 GS115感受态细胞作 为对照。 将转化后的酵母细胞涂布到 MD平板 [每升含: 葡萄糖 20.00g, 无氨基 酵母氮源 (YNB ) 13.40g, 生物素 0.4mg, 琼脂 15.00g]上, 28 °C培养 2〜3天后 挑取单菌落接种到 YPD-Geneticin®抗性平板上 (每升含: 酵母提取物 10.00g, 蛋白胨 20.00g, 葡萄糖 20.00g, 琼脂 15.00g, 抗生素 G418 ≤4.00g), 继续培养 2〜3 天后筛选抗性菌落, 并对抗性菌落进行菌落 PCR 鉴定。 以 pPIC9K 和 PPIC9K-P1-2的转化子为例 (附图 3 ) :
PCR引物分别与 PPIC9K载体上克隆位点两侧的 序列相匹配: 正向: 5' GACTGGTTCCAATTGACAAGC 3';
反向: 5' GGCAAATGGCATTCTGACATCC 3'。
空载体 pPIC9K转化菌株扩增出 492bp的片段, 而重组质粒 pPIC9K_Pl_2及 其转化菌株均能扩增出 2910bp的片段。 其中, 图 3中 1为导入空载体 pPIC9K 的重组酵母基因组对照扩增结果; 2为导入 pPIC9K-Pl-2的重组酵母基因组扩增 结果; 3为 pPIC9K-Pl-2重组质粒对照扩增结果。
用于培养重组酵母菌的种子和发酵培养基分别 为 BMGY (每升含: 酵母提取 物 10.00g,蛋白胨 20.00g,磷酸钾缓冲液 100 mM, pH 6.0,甘油 10ml)和 BMMY (用 10ml甲醇代替 BMGY中的 10ml甘油作为碳源) 培养基。 将筛选到的抗性 菌株接种到 10 ml种子培养基中, 30 °C, 220 rpm培养 18 h,离心洗涤菌体 2次, 并将菌体转入 50 ml发酵培养基, 30 °C, 220 rpm培养, 每隔 24 h补加 1 %的甲 醇诱导重组蛋白的表达, 定时取样观察重组菌的酶活力。菌体经蒸馏水 离心洗涤 两遍后用同样体积蒸馏水悬浮, 取 50 μΐ悬浮液加入 100 μΐ 5 mM PNP-Xyl, 30〜55 °C反应 20 min, 可见到重组菌具有水解底物 PNP-Xyl的能力, 而转入空 载体的对照菌没有酶活性 (见附图 4), 另外, 重组菌的发酵液上清部分尚未检 测到明显活性, 说明重组酶主要位于细胞内。 实施例 5: 重组酵母菌水解 7-木糖 -10-去乙酰紫杉醇(XDT)
将实施例 4得到的重组酵母菌 GS115-9K-P1-2 (分泌型表达重组质粒转化 子)按照实施例 4的方法诱导培养 5天, 离心收集并洗涤细胞, 直接或冷干后用 pH 3.5- 7.5的 50mM醋酸盐缓冲液或磷酸盐缓冲液悬浮细胞(65 mg湿细胞 / ml, 或 16 mg干细胞 / ml), 作为水解反应液。 在 20 ml菌体反应液中加入 0.5 ml的 7-木糖 -10-去乙酰紫杉醇(XDT)溶液, 至 XDT终浓度为 0.625 mg/ml, 30-55 °C 水浴, 往返震荡 12 h。
反应结束后用乙酸乙酯萃取, 经 TLC分析底物已完全转化, HPLC [条件: 色谱柱: Agilent Eclipse XDB-C18 (4.6x 150 mm, 5 μηι),流动相:乙睛 (38 %〜52%), 流速: 1 ml/min, 柱温: 28 °C, 检测波长: 230 nm] 分析萃取物中底物 XDT和 产物 DT含量, 转化率为 98.80 %。
重组酵母菌水解 XDT反应结果的 HPLC分析如图 5所示,其中 A为转化前, B为转化后。 实施例 6: 重组酵母菌水解 7-木糖紫杉烷混合物
将实施例 4得到的重组酵母菌 GS115-3.5K-P1-2 (非分泌型表达重组质粒转 化子)进行如下生物转化反应, 转化底物为 7-木糖紫杉烷混合物, 主要成分含量 为: 7-木糖 -10-去乙酰紫杉醇 62.12 %, 7-木糖 -10-去乙酰三尖杉宁碱 12.75%, 7- 木糖 -10-去乙酰紫杉醇 C 17.04%, 其它成分约占 8.09%。
重组菌培养方法同实施例 5。 在 200 ml重组菌反应液中加入 16 ml浓度为
100 mg/ml 的 7-木糖紫杉烷混合物, 至 7-木糖紫杉烷混合物终浓度为 8 mg/ml (过饱和状态)。 以导入空载体的重组酵母作为阴性对照。 30〜55 °C、 磁力搅拌 混合 24 ho反应结束后按照实施例 5的方法用 HPLC分析转化体系中底物和产物 含量 (附图 6), 转化率分别为: 7-木糖 -10-去乙酰紫杉醇 (XDT) 92.45%, 7-木 糖 -10-去乙酰三尖杉宁碱 (XDC) 93.60%, 7-木糖 -10-去乙酰紫杉醇 C (XDTC) 92.00% 三种主要产物的产率分别为: 10-去乙酰紫杉醇 (DT) 3.27 mg/ml, 10- 去乙酰三尖杉宁碱 (DC) 0.74 mg/ml, 10-去乙酰紫杉醇 C (DTC) 0.92 mg/ml, 三者之和为 4.93 mg/ml; 而对照则不具备上述活性 (附图 6)。
附图 6中, A为混合底物(对照); B为导入空载体的重组酵母 +混合底物(对 照); C为导入 Lxyl-pl基因的重组菌 +混合底物。 1为 7-木糖 -10-去乙酰三尖杉宁 碱; 2为 7-木糖 -10-去乙酰紫杉醇; 3为 7-木糖 -10-去乙酰紫杉醇 C; 1'、 2'和 3' 分别为对应的 7-羟基紫杉烷产物。 实施例 7: 重组酵母菌水解 7-木糖巴卡亭 III (XDB)
菌株同实施例 6, 底物为 7-木糖 -10-去乙酰巴卡亭 I I I (XDB)。 在 1.5 ml菌 体反应液中含有 16mg干细胞 /ml, 8 mg XDB/ml, 30〜55°C水浴,往返震荡 24 h。
HPLC分析结果显示: XDB 的转化率为 86.54%, 10-去乙酰巴卡亭 III (DB ) 的 产率为 5.57 mg/ml (附图 7)。
Next Patent: HANDOVER PROCESSING METHOD AND RELAY NODE