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Patent Searching and Data


Title:
PROTEINS FUNCTIONALISED WITH THE [ReCl(CO)3(ryca] COMPLEX, METHOD FOR OBTAINING SAME AND USE IN INFRARED DETECTION
Document Type and Number:
WIPO Patent Application WO/2019/097101
Kind Code:
A1
Abstract:
The present invention describes a new method for functionalising proteins by incorporating a metal fragment of high-performance rhenium, thus producing coordinated iminopyridines having three carbonyl groups in the fac position which provide bands arising from the stretching of the CO bond in the infrared (IR) spectrum in an area where the proteins show no signal, thereby allowing a very interesting use from the perspective of the detection of molecules of biological interest.

Inventors:
ÁLVAREZ MIGUEL LUCÍA (ES)
BARBERO SAN JUAN HÉCTOR (ES)
GARCÍA RODRÍGUEZ RAÚL (ES)
ÁLVAREZ GONZÁLEZ CELEDONIO MANUEL (ES)
MIGUEL SAN JOSÉ DANIEL (ES)
MARTÍN ALVAREZ JOSÉ MIGUEL (ES)
Application Number:
PCT/ES2018/070735
Publication Date:
May 23, 2019
Filing Date:
November 14, 2018
Export Citation:
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Assignee:
UNIV VALLADOLID (ES)
International Classes:
A61K51/04; C07F13/00; C07K14/765; G01N33/52; G01N33/68
Other References:
COSTA, R. ET AL.: "The synthesis of biologically relevant conjugates of Re(CO)3 using pyridine-2-carboxaldehyde", JOURNAL OF ORGANOMETALLIC CHEMISTRY, vol. 734, 24 October 2012 (2012-10-24) - 15 June 2013 (2013-06-15), pages 25 - 31, XP028582082
ALVAREZ, C.M ET AL.: "Iminopyridine complexes of Manganese, Rhenium and Molybdenum derived from amino ester methylserine and peptides Gly-Gly, Gly-Val, and Gly-Gly-Gly: self-assembly of the peptide chains", INORGANIC CHEMISTRY, vol. 51, no. 5, 13 February 2012 (2012-02-13) - 5 March 2012 (2012-03-05), pages 2984 - 2996, XP055609939
MHASKE, G. ET AL.: "Aquamedicated, microwave assisted, synthesis of Schiff bases and their biological evaluation", INTERNATIONAL JOURNAL OF INNOVATIVE RESEARCH IN SCIENCE , ENGINEERING AND TECHNOLOGY, vol. 3, no. 1, January 2014 (2014-01-01), pages 8156 - 8162, XP055609940
CHANAWANNO, K. ET AL.: "Facile rhenium-peptide conjugate synthesis using a one-pot derived Re(CO)3 reagent", DALTON TRANSACTIONS, vol. 45, no. 11, 28 January 2016 (2016-01-28) - 21 March 2016 (2016-03-21), pages 4729 - 4735, XP055609941
CHANAWANNO, K. ET AL.: "Facile solid phase peptide synthesis with a Re-lysine conjugate generated via a one-pot procedure", DALTON TRANSACTIONS, vol. 43, no. 30, 20 May 2014 (2014-05-20) - 14 August 2014 (2014-08-14), pages 11452 - 11455, XP055609945
HOSTACHY, S.: "Rhenium tricarbonyl complexes for the labelling and multimodal imaging of peptides and proteins", TESIS DOCTORAL- THÈSE DE DOCTORAT DE L’UNIVERSITÉ PIERRE ET MARIE CURIE, 12 October 2015 (2015-10-12), pages 4 - 21, XP055609947
Attorney, Agent or Firm:
PONS ARIÑO, Ángel (ES)
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Claims:
REIVINDICACIONES

1. Compuesto de fórmula I

caracterizado por que P’ es una proteína modificada como resultado de la reacción de Schiff entre al menos un grupo amino de la proteína de partida y el ligando 2-piridincarboxaldehído (pyca) del complejo [ReCI(CO)3(pyca)], donde la proteína de partida comprende al menos una Usina; y n es un número entero de entre 1 y el número de Usinas contenidas en la proteína de partida.

2. Compuesto según la reivindicación 1 , donde la proteína de partida se selecciona de entre proteína de albúmina de suero bovino, fosfoinositida-3-quinasa, proteína quinasa B, diana de rapamicina en células de mamífero complejo 1 , proteína 9 de unión al retinoblastoma, factor Inducible por Hipoxia-1 , acetilcolinesterasa, receptores de N-metil-D-aspartato, beta-secretasa 1 , y alpha-secretasas. 3. Compuesto según cualquiera de las reivindicaciones anteriores, donde proteína de partida es la proteína albúmina de suero bovino.

4. Compuesto según la reivindicación 3, donde n comprende valores enteros comprendidos en el intervalo de entre 1 y 60.

5. Método de obtención del compuesto de fórmula I, que comprende la reacción de Schiff entre al menos un grupo amino de la proteína de partida y el ligando 2- piridincarboxaldehído (pyca) del complejo [ReCI(CO)3(pyca)], donde la proteína de partida comprende al menos una Usina.

6. Método según la reivindicación 5, donde la reacción de Schiff se lleva a cabo en tetrahidrofurano, a una temperatura de entre 20-30°C, y durante un tiempo de entre 1 y 1920 horas.

7. Método según la reivindicación 5, donde la reacción de Schiff se lleva a cabo en un medio acuoso, a una temperatura de entre 35°C-40°C, y durante un tiempo de entre 1 y 4 horas.

8. Método según la reivindicación 7, donde la reacción se lleva a cabo mediante irradiación por microondas.

9. Método según cualquiera de las reivindicaciones 5 a 8, caracterizado por que comprende una etapa de purificación posterior a la reacción de Schiff por lavados con un disolvente halogenado y secado final del sólido resultante.

10. Método para la detección de proteínas en una muestra que comprenden la obtención del compuesto de fórmula I de acuerdo con las reivindicaciones 1 a 4 y la posterior medición mediante espectroscopia infrarroja.

11. Uso del complejo [ReCI(CO)3(pyca)], para la detección de proteínas que comprenden al menos una lisina, mediante espectroscopia infrarroja.

12. Uso según la reivindicación 11 , donde la proteína se selecciona de entre proteína de albúmina de suero bovino, fosfoinositida-3-quinasa, proteína quinasa B, diana de rapamicina en células de mamífero complejo 1 , proteína 9 de unión al retinoblastoma, factor Inducible por Hipoxia-1 , acetilcolinesterasa, receptores de N- metil-D-aspartato, beta-secretasa 1 , y alpha-secretasas.

13. Uso según las reivindicaciones 11 o 12, donde la proteína es la albúmina de suero bovino.

Description:
Proteínas funcionalizadas con el complejo [ReCl(CO)3(pyca)], procedimiento de obtención y su uso en detección por infrarrojo

La presente invención se encuadra dentro del campo de la bioinorgánica y se refiere a un nuevo método de funcionalización de proteínas a través de la incorporación de un fragmento metálico que contiene grupos carbonilos susceptibles de ser observados por espectroscopia de infrarrojo (IR).

ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN

La química bioinorgánica es un campo de la química inorgánica de creciente interés científico, sobre todo en relación al estudio de complejos proteína-fragmento metálico en los que existe al menos un enlace covalente que une la biomolécula y el grupo prostético. Dicho fragmento metálico puede ofrecer información de la proteína (por ejemplo, su ubicación espacial en una muestra biológica) por medio de diversas técnicas espectroscópicas. En este contexto, el metal Renio ocupa un lugar importante, muy probablemente debido a su posible utilidad como radiofármaco o con aplicaciones para bioimagen. Sin embargo, todos los estudios realizados hasta la fecha usan complejos fac- triacuo (o precursores de los mismos) y la carga metálica se obtiene fundamentalmente por coordinación del grupo imidazol de la cadena lateral del aminoácido histidina (ver Ziegler, C. J.; Herrick, R. S.; Rowlett, R. S. Chem. Commun. 2010, 46, 1203-1205) La carga metálica obtenida en los casos expuestos es muy baja. Además, si se desea usar el fragmento metálico como un sensor observable por espectroscopia de emisión UV-Visible, es necesario un paso de post-funcionalización para unir un ligando cromóforo al metal.

Otra posibilidad reside en la funcionalización de la proteína a través de reacciones en los ligandos que forman parte de la primera esfera de coordinación del metal que se encuentren activados por el mismo. Así, un buen ejemplo lo constituye la reacción de Schiff entre una amina primaria y un aldehido coordinado, como puede ser el 2- piridincarboxaldehído. Existen estudios en los que se puede demostrar que es posible unir una biomolécula (péptidos) a un fragmento fac-tricarbonilo de Renio que contiene el ligando 2-piridincarboxaldehído dando lugar a las iminopiridinas correspondientes (ver Álvarez, C. M.; García-Rodríguez, R.; Miguel, D. Inorg. Chem. 2012, 51, 2984- 2996). De los trabajos anteriormente mencionados se puede extraer que el grupo aldehido reacciona exclusivamente con aminas primarias no desactivadas, nunca con aminas secundarias o grupos amida. El único aminoácido cuyo grupo amino terminal cumple estas características, dentro del grupo de los aminoácidos que forman parte de las proteínas naturales, es el de la Lisina.

DESCRIPCIÓN DE LA INVENCIÓN

La presente invención describe dos métodos por los que es posible cargar una proteína (funcionalizarla) con un fragmento de Renio con alto rendimiento, donde la proteína ha de poseer aminoácidos Lisina en su estructura. Ambos métodos mejoran notablemente la capacidad de carga metálica en una proteína frente al estado actual de la técnica. Uno se realiza en condiciones lo suficientemente suaves como para no desnaturalizar la biomolécula, y otro en condiciones más enérgicas para alcanzar un máximo de carga metálica prácticamente completo.

El fragmento de Renio seleccionado es el fragmento metálico fac-tricarbonilo de Renio, ya que la existencia de los ligando CO proporcionan señales claras y definitorias en infrarrojo de la existencia del complejo de coordinación en la proteína. Los ligandos CO anteriormente comentados ofrecen señales muy agudas precisamente en la zona comprendida entre 1800 cm 1 y 2500 cm 1 en un espectro de absorción de infrarrojo (IR), que siempre está vacía en una proteína. Esto constituye un avance notable en la detección de proteínas funcionalizadas por infrarrojo (IR) debido a las ventajas sobre otras técnicas (barata, rápida, fácil disponibilidad, raramente se pierde señal por cambios estructurales en el entorno del complejo de coordinación, etc.). Además, de esta manera se evitan pasos posteriores de post-funcionalización ya que el fragmento metálico incorporado a la proteína ya posee los ligandos adecuados que actúan de sensores.

Estos dos métodos de funcionalización de proteínas con el complejo [ReCI(CO) 3 (pyca)] se realizan a través de la reacción de Schiff entre el ligando 2- piridincarboxaldehído y al menos un grupo amino de los aminoácidos Lisina que se encuentran en la correspondiente proteína, junto con el grupo amino terminal de la misma, proporcionan iminopiridinas de Fórmula I

donde P’ es la proteína modificada como resultado de dicha reacción; y n es un número entero de entre 1 y el número de lisinas contenidas en la proteína de partida.

En un ejemplo de realización, estos métodos se llevan a cabo empleando la proteína de partida es albúmina de suero bovino (BSA). Se ha seleccionado esta proteína por ser de fácil acceso ya que pertenece al grupo más abundante de las proteínas plasmáticas y procede de los desechos de la industria ganadera. Posee en su estructura 60 Lisinas que, añadiendo el grupo amino terminal de la proteína, hacen un total de 61 grupos susceptibles de reaccionar con el complejo [ReCI(CO) 3 (pyca)]. Según ambos modos de realización preferente, se combinan dicho complejo metálico con la proteína en proporción 61 a 1 , respectivamente.

El resultado de la funcionalización de esta proteína con el complejo [ReCI(CO) 3 (pyca)] a través de la reacción de Schiff entre el ligando 2-piridincarboxaldehído coordinado al Renio y al menos un grupo amino de la albúmina de suero bovino (BSA) es un compuesto de fórmula II.

donde n es un valor de entre 1 y 60, y BSA’ es la proteína albúmina de suero bovino modificada tras la reacción de Schiff.

Es interesante destacar la aplicabilidad de esta reacción para otras proteínas de interés desde un punto de vista biomédico, como por ejemplo fosfoinositida-3-quinasa (PI3K), proteína quinasa B (PKB), diana de rapamicina en células de mamífero complejo 1 (mTORCI), proteína 9 de unión al retinoblastoma (RBBP9), factor Inducible por Hipoxia-1 (HIF-1), acetilcolinesterasa (ACHE), receptores de N-metil-D-aspartato (NMDA), beta-secretasa 1 (BACE1), y alpha-secretasas, que participan en procesos cancerígenos y en enfermedades como el Alzheimer.

En un primer aspecto, la presente invención se refiere al compuesto de fórmula I

caracterizado por que P’ es una proteína modificada como resultado de la reacción de Schiff entre al menos un grupo amino de la proteína de partida y el ligando 2- piridincarboxaldehído (pyca) del complejo [ReCI(CO) 3 (pyca)], donde la proteína de partida comprende al menos una Usina; y n es un número entero de entre 1 y el número de Usinas contenidas en la proteína de partida.

En una realización preferida, la proteína de partida se selecciona de entre proteína de albúmina de suero bovino (BSA), fosfoinositida-3-quinasa (PI3K), proteína quinasa B (PKB), diana de rapamicina en células de mamífero complejo 1 (mTORCI), proteína 9 de unión al retinoblastoma (RBBP9), factor Inducible por Hipoxia-1 (HIF-1), acetilcolinesterasa (ACHE), receptores de N-metil-D-aspartato (NMDA), beta- secretasa 1 (BACE1), y alpha-secretasas.

En una realización más preferida, la proteína de partida es la albúmina de suero bovino (BSA).

Otro aspecto de la presente invención se refiere al método de obtención del compuesto de fórmula I, que comprende la reacción de Schiff entre al menos un grupo amino de la proteína de partida y el ligando 2-piridincarboxaldehído (pyca) del complejo [ReCI(CO) 3 (pyca)], donde la proteína de partida comprende al menos una Usina.

En una realización preferida, la reacción se produce en condiciones suaves, de manera que se evita la desnaturalización de la proteína. Así, ambos compuestos se combinan en presencia de tetrahidrofurano (THF) como disolvente en atmósfera inerte. La mezcla resultante se agita a temperatura ambiente protegida de la luz durante un tiempo que puede oscilar entre 1 y 1920 h. Una vez transcurrido el tiempo deseado, el disolvente se evapora y el residuo se lava con diclorometano (DCM) para eliminar el complejo [ReCI(CO) 3 (pyca)j que no haya reaccionado.

En otra realización preferida, la reacción se produce en condiciones más enérgicas, pero relevantes desde el punto de vista fisiológico. Ambos compuestos se mezclan en presencia de Suero Salino Normal (disolución acuosa de cloruro sódico al 0,9% (p/v)). La mezcla se coloca en un baño de ultrasonidos y se sónica con el objetivo de dispersar al máximo las partículas del complejo metálico. Posteriormente se somete a la muestra a radiación de microondas (MW) a una temperatura de entre 35°C-40°C agitando, preferiblemente a una velocidad de unos 1200 rpm, durante un tiempo que puede oscilar entre 1 y 4 h. Un precipitado amarillo aparece. A la mezcla se añade diclorometano (DCM), se agitan ambas fases y se desecha la fase orgánica para eliminar el complejo [ReCI(CO) 3 (pyca)] sobrante. Posteriormente se filtra el sólido, se lava con agua y se seca a vacío.

Un tercer aspecto de la invención se refiere a un método para la detección de proteínas en una muestra que comprenden la obtención del compuesto de fórmula I tal y como se ha descrito anteriormente, y la posterior medición mediante espectroscopia infrarroja.

Por“muestra”, la presente invención se refiere a cualquier muestra susceptible de contener la proteína que se desea detectar, por ejemplo, sin limitarse a una muestra biológica aislada; una muestra de un alimento, elaborado o no; o una muestra medioambiental.

Un cuarto aspecto de la invención es el uso del complejo [ReCI(CO) 3 (pyca)], para la detección de proteínas que comprenden al menos una lisina, mediante espectroscopia infrarroja.

En una realización preferida, la proteína se selecciona de entre proteína de albúmina de suero bovino (BSA), fosfoinositida-3-quinasa (PI3K), proteína quinasa B (PKB), diana de rapamicina en células de mamífero complejo 1 (mTORCI), proteína 9 de unión al retinoblastoma (RBBP9), factor Inducible por Hipoxia-1 (HIF-1), acetilcolinesterasa (ACHE), receptores de N-metil-D-aspartato (NMDA), beta- secretasa 1 (BACE1), y alpha-secretasas.

En una realización más preferida, la proteína es la albúmina de suero bovino (BSA).

En una realización preferida del cuarto aspecto de la invención, la detección se lleva a cabo por la formación previa del compuesto de fórmula (I) de la presente invención. Dicho compuesto de fórmula (I) se puede obtener o forma mediante el método de obtención descrito en la presente invención.

A lo largo de la descripción y las reivindicaciones la palabra "comprende" y sus variantes no pretenden excluir otras características técnicas, aditivos, componentes o pasos. Para los expertos en la materia, otros objetos, ventajas y características de la invención se desprenderán en parte de la descripción y en parte de la práctica de la invención. Los siguientes ejemplos y figuras se proporcionan a modo de ilustración, y no se pretende que sean limitativos de la presente invención.

DESCRIPCIÓN DE LAS FIGURAS

FIG. 1. Espectro de IR en tetrahidrofurano (THF) de las aguas de lavado procedentes del primer modo de preparación preferente (arriba) y en diclorometano (DCM) de las aguas de lavado procedentes del segundo modo de preparación preferente (abajo). Se observan las bandas correspondientes a los grupos carbonilos del complejo [ReCI(CO) 3 (pyca)] de partida asegurando así una eliminación adecuada del reactivo excedente.

FIG. 2. Espectros de IR en estado sólido de la proteína BSA (arriba), del complejo de partida [ReCI(CO) 3 (pyca)j (centro) y de la proteína cargada tras la realización del segundo modo de preparación preferente (abajo). Se muestra la presencia del fragmento metálico unido a la proteína por la aparición de las bandas correspondientes a los carbonilos coordinados en la zona entre 1800 y 2500 cm 1 en contraste con la inexistencia de señales en el espectro de la proteína pura. Además, la frecuencia de las bandas varía ligeramente debido a la formación de la iminopiridina.

FIG. 3. Variación del porcentaje de carga metálica deducido de los análisis por ICP-MS en función del tiempo de reacción para el primer modo de preparación preferente (arriba) y para el segundo modo de preparación preferente (abajo).

EJEMPLOS

A continuación se ilustrará la invención mediante unos ensayos realizados por los inventores, que pone de manifiesto la efectividad del producto de la invención.

Ejemplo 1. Condiciones suaves de reacción

En un matraz de schlenk se mezclan el complejo [ReCI(CO) 3 (pyca)] (20 mg, 0,052 mmol) (preparado según la publicación Alvarez, C. M.; García-Rodríguez, R.; Miguel, D. Inorg. Chem. 2012, 51, 2984-2996), la proteína BSA (56,9 mg, 8,56x10 4 mmol) y se agita con una barra magnética. La mezcla se desoxigena y se pone en atmósfera inerte de nitrógeno gas. Después se añaden 15 mL de THF. El conjunto se desoxigena y se pone en atmósfera inerte de N 2 de nuevo. Por último, se deja agitando a temperatura ambiente protegiendo el matraz de la luz durante un tiempo que puede oscilar entre 1 y 1920 h. Transcurrido el tiempo deseado, se retira la barra magnética y se evapora el disolvente a vacío. El residuo resultante se lava con diclorometano (3 x 10 mL) retirando las aguas de lavado con ayuda de una cánula. En dicho disolvente, el complejo de Renio es soluble y la proteína BSA no, como se puede deducir de la

Figura 1. Por último, el sólido se seca a vacío para dar lugar a una proteína de color amarillo cuya intensidad va a depender de la cantidad de carga metálica que soporte.

La nueva proteína funcionalizada es insoluble en disolventes orgánicos convencionales y en agua. Cualitativamente se puede observar la presencia del fragmento metálico por el espectro de infrarrojo (IR) en el que aparecen claramente las bandas de tensión CO que corresponden con un fragmento fac-tricarbonilo, como se muestra en la Figura 2. Cuantitativamente se puede medir la cantidad de Renio incorporada a la biomolécula por un análisis elemental inorgánico proporcionado por Espectrometría de Masas con Plasma Acoplado Inductivamente (ICP-MS).

Esta reacción se realizó varias veces usando las mismas condiciones iniciales y analizando el resultado a distintos tiempos tras el procedimiento de purificación descrito anteriormente, desde 1 hora hasta 1920 (80 días). El porcentaje máximo alcanzado fue alrededor del 44%, que correspondería con una funcionalización de 26 Lisinas, como se muestra en la Figura 3. El resto de resultados se encuentran recogidos en la Tabla 1.

TABLA 1

Ejemplo 2. Condiciones enérgicas de reacción

En un vial diseñado para un reactor de microondas se colocan el complejo [ReCI(CO) 3 (pyca)] (10 mg, 0,026 mmol), la proteína BSA (28 mg, 4,3x10 4 mmol) y una barra magnética para agitar. Se añaden 5 mL de Suero Salino Normal, la suspensión resultante se tapa y se sónica en el baño de ultrasonidos durante 3 minutos. Tras esto, se ubica el vial en el reactor de microondas y la mezcla se irradia a una temperatura de 37 °C agitando a una velocidad de 1200 rpm durante un tiempo que puede oscilar entre 1 y 4 h. Transcurrido el tiempo deseado, se extrae el vial, que contiene un precipitado en su interior, se destapa y se retira la barra magnética. El contenido se traspasa a un matraz redondo de una boca y se añaden 5 mL de diclorometano. La mezcla bifásica se agita vigorosamente y, tras dejar reposar, se retira la fase orgánica con ayuda de una pipeta Pasteur. Este procedimiento se realiza dos veces más. Por último, el sólido se filtra mediante el uso de una cánula y se lava con agua destilada (3 x 5 mL) para, finalmente, secarlo a vacío.

El sólido resultante tiene las mismas características que las observadas mediante el método descrito en el Ejemplo 1 , y se puede analizar la incorporación del complejo a la proteína mediante espectro infrarrojo (IR) (Figura 2) y gracias a ICP-MS, alcanzándose una carga máxima de alrededor de 92% (Figura 3), que correspondería con 55 Lisinas funcionalizadas (de 60 en total). Con este modo de realización preferente se puede deducir que prácticamente todos los aminoácidos Lisina que conforman la proteína BSA han sido derivatizados, tanto los accesibles en la superficie externa de la misma como los que no. Esto lleva a la conclusión de que probablemente ha habido un cambio en la estructura terciaria de la biomolécula (desnaturalización) que ha permitido al complejo de coordinación acceder a las Lisinas más internas. El resto de resultados se encuentran recogidos en la Tabla 2.

TABLA 2