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Title:
PREPARATION METHOD FOR 3α-HYDROXY-7-OXO-5β-CHOLANOIC ACID AND ENZYME 2 FOR PREPARATION THEREOF
Document Type and Number:
WIPO Patent Application WO/2018/126467
Kind Code:
A1
Abstract:
A method which uses biological enzyme catalysis to prepare 3α-hydroxy-7-oxo-5β-cholanoic acid and 7α-steroid dehydrogenase for the preparation thereof. The method uses chenodeoxycholic acid as a substrate; in the presence of NAD, lactate dehydrogenase, sodium pyruvate and a buffer solution, the 7α-steroid dehydrogenase is used to catalyze the chenodeoxycholic acid to prepare the 3α-hydroxy-7-oxo-5β-cholanoic acid, wherein the 7α-steroid dehydrogenase is derived from Cyanothece sp. ATCC 29155.

Inventors:
FU RONGZHAO (CN)
LIU LIHUI (CN)
CAO LEI (CN)
LIU TAOTAO (CN)
PENG TING (CN)
Application Number:
PCT/CN2017/070603
Publication Date:
July 12, 2018
Filing Date:
January 09, 2017
Export Citation:
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Assignee:
BONTAC INST OF GREEN BIOCATALYSIS (CN)
International Classes:
C12P33/02; C12N9/04
Foreign References:
CN105368828A2016-03-02
CN103097400A2013-05-08
CN106086149A2016-11-09
CN105669815A2016-06-15
JPS59120097A1984-07-11
Other References:
DATABASE Protein [O] 23 April 2014 (2014-04-23), LUCAS: "short-chain dehydrogenase/reductase SDR [Cyanothece sp. PCC 7424]", XP055514531, retrieved from NCBI Database accession no. ACK68692.1.
DATABASE Protein [O] 17 May 2013 (2013-05-17), ANONYMOUS: "7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase [Cyanothece sp. PCC 7424", XP055514542, retrieved from NCBI Database accession no. WP_012597642.1
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Claims:
权利要求书

[权利要求 1] 一种 3d-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的制备方法, 其特征在于: 以鹅去氧胆 酸为底物, 在 NAD、 乳酸脱氢酶、 丙酮酸钠以及缓冲溶液存在的条 件下, 用 7α-类固醇脱氢酶催化鹅去氧胆酸制备 3α-羟基 -7氧代 -5β胆烷 酸, 所述 7α-类固醇脱氢酶来源于蓝杆藻 Cyanothece sp.ATCC 29155 , 所述乳酸脱氢酶的核苷酸序列如 SEQ ID NO: 3所示, 在整个催化 反应体系中, 所述底物的浓度为 50〜100mg/mL, 所述 NAD的浓度为 0.01〜0.25mg/mL, 所述丙酮酸钠的浓度为 10〜30mg/mL。

[权利要求 2] 根据权利要求 1所述的 3d-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的制备方法, 其特征 在于: 控制所述催化过程在温度为 25〜35°C, pH值为 7.5〜8.5的条件 下进行。

[权利要求 3] 根据权利要求 1所述的 3d-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的制备方法, 其特征 在于: 所述缓冲溶液为 50〜100mM磷酸钾缓冲液。

[权利要求 4] 根据权利要求 1所述的 3d-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的制备方法, 其特征 在于, 所述制备方法还包括如下提纯步骤: 待所述催化过程反应结束 后, 调节 pH值为 1.0〜2.0, 搅拌 20〜30min, 待冷却后再经过滤水洗 干燥后即得 3α-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸成品。

[权利要求 5] 根据权利要求 1至 4任一项所述的 3d-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的制备方法

, 其特征在于所述 7α-类固醇脱氢酶为如下 (a) 或 (b) 的蛋白质:

(a) 其氨基酸序列如 SEQ ID NO: 2所示的蛋白质,

(b) 在 (a) 限定的氨基酸序列中经过取代、 缺失或添加一个或几个 氨基酸并且在 NAD存在下以鹅去氧胆酸为底物具有比氨基酸序列如 S EQ ID NO: 2所示的亲本高的 7α-类固醇脱氢酶催化活性的由 (a) 衍 生的蛋白质。

[权利要求 6] 根据权利要求 5所述的 3d-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的制备方法, 其特征 在于所述 7ot-类固醇脱氢酶与如 SEQ ID NO: 2所示的氨基酸序列相比 在选自至少一个下述位点处具有至少一个突变: 第 42位、 第 44位、 第 97位、 第 99位、 第 117位、 第 159位、 第 192位以及第 195位。 [权利要求 7] 根据权利要求 6所述的 3α-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的制备方法, 其特征 在于所述 7ot-类固醇脱氢酶具有至少一个下述突变: D42N、 D44A、 G 97D、 G99A、 L117E、 Y159F、 I192K以及 D195N。

[权利要求 8] —种 7α-类固醇脱氢酶, 其特征在于: 所述 7α-类固醇脱氢酶来源于蓝 杆藻 Cyanothece sp. ATCC

29155, 用于催化鹅去氧胆酸制备 3α-羟基 -7氧代 -5β胆烷酸, 所述 7oc- 类固醇脱氢酶为如下 ) 或 (b) 的蛋白质:

(a) 其氨基酸序列如 SEQ ID NO: 2所示的蛋白质,

(b) 在 (a) 限定的氨基酸序列中经过取代、 缺失或添加一个或几个 氨基酸并且在 NAD存在下以鹅去氧胆酸为底物具有比氨基酸序列如 S EQ ID NO: 2所示的亲本高的 7α-类固醇脱氢酶催化活性的由 (a) 衍 生的蛋白质。

[权利要求 9] 根据权利要求 8所述的 7α-类固醇脱氢酶, 其特征在于所述 7α-类固醇 脱氢酶与如 SEQ ID NO: 2所示的氨基酸序列相比在选自至少一个下 述位点处具有至少一个突变: 第 42位、 第 44位、 第 97位、 第 99位、 第 117位、 第 159位、 第 192位以及第 195位。

[权利要求 10] 根据权利要求 9所述的 7α-类固醇脱氢酶, 其特征在于所述 7α-类固醇 脱氢酶具有至少一个下述突变: D42N、 D44A、 G97D、 G99A、 L117 E、 Y159F、 I192K以及 D195N。

Description:
一种 3(x-羟基 -7氧代 -5β-胆垸酸的制备方法及其制备用酶 2 技术领域

[0001] 本发明涉及分子生物学与生物技术领域, 特别涉及一种利用生物酶催化技术制 备 3d-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的方法及其制备用 7α-类固醇脱氢酶。

背景技术

[0002] 3d-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸又名 7-酮石胆酸, 是制备熊去氧胆酸的重要中间体。

而熊去氧胆酸是名贵中药熊胆的主要有效成分 , 具有增加胆汁酸分泌、 并使胆 汁成分改变、 降低胆汁中胆固醇及胆固醇脂等功效, 主要用于治疗胆石疾病。 众所周知, 熊胆是一种非常稀缺的资源, 原因在于其获取的传统途径主要是依 赖于人工养殖活熊取胆的方法。 目前, 这种周期长、 收率低且不人道的传统途 径逐渐被人工合成方法所取代, 而现知的人工合成熊去氧胆酸的方法中, 3d-羟 基 -7氧代 -5β-胆烷酸都是极为重要的中间体。

[0003] 目前 3ot-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的工业化生产多采用化学法, 但是存在操作条件 苛刻、 选择性低、 污染环境、 使用大量有机溶剂、 存在有机溶剂残留、 有毒有 害等缺点。 为了解决化学法存在的诸多缺点, 人们另辟蹊径, 寻找更好的生产 途径。 中国发明专利 CN1912192B公幵了一种采用电化学合成制备 3d-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的方法, 但是此种方法依然需要使用有机溶剂, 并且成本较高。 中国 发明专利申请 CN105368828A公幵了一种采用全细胞催化制备 3ot-羟基 -7氧代 -5β- 胆烷酸的方法, 但是此种方法需进行细胞发酵培养, 存在反应吋间长、 操作繁 琐、 产物复杂等缺点。

技术问题

[0004] 本发明的目的在于提供一种 30C-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的新的制备方法, 以解决 上述背景技术中提到的现有制备方法所存在的 有机溶剂残留、 条件苛刻、 反应 吋间长、 操作繁琐、 成本较高、 污染环境等缺点, 本发明同吋提供了该新制备 方法适用的生物酶。

问题的解决方案 技术解决方案

[0005] 为实现上述目的, 发明人经过长期大量的实验摸索, 在经历上百次的失败尝试 之后, 终于筛选出适用于细胞外生物催化制备 3d-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的生物酶 , 并在此序列基础上进行优化, 获得了活性提高和去除底物抑制的突变体酶, 从而幵发出一种新的制备 3α-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的方法, 其特征在于: 以鹅去 氧胆酸为底物, 在 NAD、 乳酸脱氢酶、 丙酮酸钠以及缓冲溶液存在的条件下, 用 7α-类固醇脱氢酶催化鹅去氧胆酸制备 3d-羟基 -7氧代 -5β胆烷酸, 所述 7oc-类固 醇脱氢酶来源于蓝杆藻 Cymwthece sp. ATCC 29155, 所述乳酸脱氢酶的核苷酸 序列如 SEQ ID

NO : 3所示, 在整个催化反应体系中, 所述底物的浓度为 50〜100mg/mL, 所述 NAD的浓度为 0.01〜0.25mg/mL, 所述丙酮酸钠的浓度为 10〜30mg/mL。

[0006] 上述方法中所使用的两种酶的具体存在形式包 括液态酶、 固态酶以及各种固定 化酶, 可以是未经纯化的粗酶形式, 也可以是经部分纯化或完全纯化的形式。

[0007] 优选地, 控制所述催化过程在温度为 25〜35°C, pH值为 7.5〜8.5的条件下进行

[0008] 优选地, 所述缓冲溶液为 50〜100mM磷酸钾缓冲液。

[0009] 优选地, 上述制备方法还包括如下提纯步骤: 待所述催化过程反应结束后, 调 节 pH值为 1.0〜2.0, 搅拌 20〜30min, 待冷却后再经过滤水洗干燥后即得 3oc-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸成品。

[0010] 更优选地, 上述制备方法还包括如下精制步骤: 将获得的 3α-羟基 -7氧代 -5β-胆 烷酸成品用 8- 15倍无水乙醇 50-60。C水浴条件下搅拌回流 0.5-lh, 过滤, 取滤液进 行真空减压浓缩至 1/4- 1/5体积, 再加入 4-5倍纯水搅拌 lh, 过滤, 将滤饼真空干 燥过夜, 即得 3α-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸精制品。

[0011] 优选地, 上述制备方法中所使用的 7α-类固醇脱氢酶为如下 (a) 或 (b) 的蛋 白质:

[0012] (a) 其氨基酸序列如 SEQ ID NO: 2所示的蛋白质,

[0013] (b) 在 (a) 限定的氨基酸序列中经过取代、 缺失或添加一个或几个氨基酸并 且在 NAD存在下以鹅去氧胆酸为底物具有比氨基酸序 列如 SEQ ID NO: 2所示的 亲本高的 7α-类固醇脱氢酶催化活性的由 (a) 衍生的蛋白质。

[0014] 更优选地, 所述 7ot-类固醇脱氢酶与如 SEQ ID NO: 2所示的氨基酸序列相比在 选自至少一个下述位点处具有至少一个突变: 第 42位、 第 44位、 第 97位、 第 99 位、 第 117位、 第 159位、 第 192位以及第 195位。

[0015] 更优选地, 所述 7ot-类固醇脱氢酶具有至少一个下述突变: D42N、 D44A、 G97

D、 G99A、 L117E、 Y159F、 I192K以及 D195N。

[0016] 本发明还提供了一种 7oc-类固醇脱氢酶, 所述 7α-类固醇脱氢酶来源于蓝杆藻

Cyanothece sp. ATCC 29155, 用于催化鹅去氧胆酸制备 3α-羟基 -7氧代 -5β胆烷酸

, 所述 7ot-类固醇脱氢酶为如下 (a) 或 (b) 的蛋白质:

[0017] (a) 其氨基酸序列如 SEQ ID NO: 2所示的蛋白质,

[0018] (b) 在 (a) 限定的氨基酸序列中经过取代、 缺失或添加一个或几个氨基酸并 且在 NAD存在下以鹅去氧胆酸为底物具有比氨基酸序 列如 SEQ ID NO: 2所示的 亲本高的 7α-类固醇脱氢酶催化活性的由 (a) 衍生的蛋白质。

[0019] 优选地, 所述 7ot-类固醇脱氢酶与如 SEQ ID NO: 2所示的氨基酸序列相比在选 自至少一个下述位点处具有至少一个突变: 第 42 位、 第 44 位、 第 97 位、 第 99

、 第 117位、 第 159位、 第 192位以及第 195位。

[0020] 优选地, 所述 7α-类固醇脱氢酶具有至少一个下述突变: D42N、 D44A、 G97D 、 G99A、 L117E、 Y159F、 I192K以及 D195N。

发明的有益效果

有益效果

[0021] 1、 与现有的 3α-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的制备方法相比, 本发明提供的方法具 有操作简单、 反应条件温和易控、 反应吋间短、 不使用有机溶剂、 无毒无污染 且成本低廉的优点, 经实践证明, 本发明提供的方法的反应吋长仅需 4〜12小吋 , 其对底物的转化率高达 99.8%以上, 所获得的产品的含量在 96.8%以上。

[0022] 2、 本发明筛选出了适用于细胞外生物催化制备 3ot-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的 7ot- 类固醇脱氢酶基因, 并在此序列基础上进行优化, 获得了活性提高和去除底物 抑制的突变体酶, 这些突变体酶表现出高的选择性使得该方法不 会形成副产物 , 这些突变体酶的高催化活性和高专一性使得 3α-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸酶法大规 本发明的实施方式

[0023] 下面结合具体实施例对本发明做进一步的详细 说明, 以下实施例是对本发明的 解释, 本发明并不局限于以下实施例, 实施例中未注明具体条件者, 按常规条 件或者制造商建议的条件进行。

[0024] 本发明提供的 3α-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的制备方法的具体实施过程如下:

[0025] 将鹅去氧胆酸悬浮于 50〜100mM磷酸钾缓冲液 (pH8.0) 中, 用 10M的 NaOH调 节 pH到 8.0, 再加入终浓度为 10〜30mg/mL的丙酮酸钠并用 10M的 NaOH调节 pH 到 8.0, 加入 7α-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶, 最后加入终浓度为 0.01〜0.25mg/m L的 NAD, 底物终浓度为 50〜100mg/mL, 反应在温度 25〜35°C、 200〜400rpm和 pH7.5〜8.5进行, 反应吋间为 41!〜 12h。 每隔一定吋间取反应液用流动相稀释 50 〜100倍, 微孔过滤后进样进行液相分析。 液相检测使用 Phenomenx Gemini 110Α 250x4.6mm为分析柱, 流动相为乙腈:缓冲溶液 (取磷酸二氢 钠 0.78g,溶解 1L水中, 用磷酸调 pH值为 3, 即可) :甲醇 =30:37:40, 用 0.45醒滤 膜过滤后备用。 柱温为 40°C, 示差检测器 (RID) , 流速为 0.8mIJmin。 待催化 过程反应结束后, 在快速搅拌的情况下加入盐酸至 pH为 1.0〜2.0, 继续搅拌 20〜 30min , 待冷却后过滤、 经水洗三次后真空干燥后即得 3d-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸 成品。 成品再用 8- 15倍无水乙醇 50-60°C水浴条件下搅拌回流 0.5-lh, 过滤, 取滤 液进行真空减压浓缩至 1/4- 1/5体积, 再加入 4-5倍纯水搅拌 lh, 过滤, 将滤饼真 空干燥过夜, 即得 3α-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸精制品。

[0026] 上述方法中所使用的两种酶的具体存在形式包 括液态酶、 固态酶以及各种固定 化酶, 可以是未经纯化的粗酶形式, 也可以是经部分纯化或完全纯化的形式。

[0027] 实施例 1

[0028] 含有亲本基因的共表达重组质粒 pET22b-AHSDH4-LDH的制备

[0029] 将来源于蓝杆藻 ( Cyanothece sp. ATCC

29155) 的 7α-类固醇脱氢酶基因 AHSDH4和来源于魏斯氏菌 ( W ^e/to sp) 的 乳酸脱氢酶基因 LDH分别利用引物对 5'CGCCATATGATGTTCAACAGCGATAC CTT3'和 5'CCGGAATTCTTAGTCCAGTTCTTGAACGC3'

GTA3'和 5'CCGCTCGAGTTAATATTCCACCGCAATGC3'通过 PCR扩增技术获得

PCR产物后经过酶切处理, 同吋插入到表达载体 pET22b (+) 的 fe l和 EcoR I 位点以及 EcoR I位点和 Xho I位点, 得到共表达重组质粒 pET22b-AHSDH4-LDH 。 经 DNA测序, 确定该被克隆的亲本 7ot-类固醇脱氢酶的核苷酸序列如 SEQ ID NO : 1所示, 其氨基酸序列如 SEQ ID NO: 2所示; 确定该被克隆的亲本乳酸脱 氢酶的核苷酸序列如 SEQ ID NO: 3所示, 其氨基酸序列如 SEQ ID NO : 4所示。

[0030] 实施例 2

[0031] 含有 7α-类固醇脱氢酶突变体的共表达重组质粒的 备

[0032] 通过反向 PCR技术对 7ot-类固醇脱氢酶亲本进行定点突变, 在突变位置通过设 计反向引物, 利用上下游突变引物扩增目的片段, 并在引物上引入相应突变, 以重组质粒 pET22b-AHSDH4-LDH作为模板进行反向 PCR, PCR产物经 Dpn I酶 消化模板处理后转化到大肠杆菌 R OSe tt a (de3), 经过 Amp的筛选后挑取菌落送测 序。 突变位点及引物设计如表 1所示。

[0033] PCR体系为: TaKaRa EX Taq HS 0.25ul; ΙΟχΕχ Taq Buffer

5ul; 模板质粒 lul; dNTP (2.5mM each) 4ul; 上游引物 lul;下游引物 lul; 无菌 水 up to 50 ul。

[0034] PCR程序为: 首先 98。C2min; 然后 98。C10s, 55-56°C30s , 72。C7min, 30个循环

; 最后 72°C10min。

[0035] 表 1

[表 1]

[0036] 实施例 3

[0037] 酶液的制备

[0038] 将实施例 1和实施例 2制备的亲本和突变体共表达重组质粒分别转 大肠杆菌 Ro setta(de3), 再将获得的重组大肠杆菌接种在小体积的 LB培养基 (含有 10(Vg/mL 的 Amp) , 30〜37°C过夜培养后, 以 1〜5<¾的接种量转接到一定体积的 LB培养 基中 (含有 10(Vg/mL的 Amp) , 在 30〜37°C继续培养 OD 600 达到 0.6〜1.0加入终 浓度为 0.1mM〜lmM的异丙基 -β-D-硫代半乳糖苷 (IPTG), 在 20〜37°C诱导表达 1 0〜20h后离心收集菌体。 发酵菌体悬浮于一定体积的 50〜100mM的磷酸钾缓冲 液 (pH8.0) 中并超声波破胞, 离心即得含有乳酸脱氢酶与 7α-类固醇脱氢酶亲本 或者与 -类固醇脱氢酶突变体的粗酶液, 可用于酶活力的测定以及 3d-羟基 -7氧 代 -5β-胆烷酸的生物催化制备。

[0039] 实施例 4

[0040] 酶活力的测定

[0041] 7ot-类固醇脱氢酶的酶活测定方法: 以鹅去氧胆酸为底物, 在一个 3mL的反应 体系中加入 lOuL的 150mM鹅去氧胆酸, lOOuL的稀释酶液, NAD+终浓度为 0.2m

M, 在 pH8.0和 25°C反应一定吋间, 在 340nm处测定吸光值增加。

[0042] 乳酸脱氢酶的酶活测定方法: 以丙酮酸钠为底物, 在一个 3mL的反应体系中加 入 lOOuL的 50mM丙酮酸钠, lOOuL的稀释酶液, NADH终浓度为 0.2mM, 在 pH8.

0和 25°C反应一定吋间, 在 340nm处测定吸光值减少。

[0043] 酶活力的测定结果如表 2所示, 其中 LDH为乳酸脱氢酶, 7ot-HSDH为 7ot-类固醇 脱氢酶。

[0044] 表 2

[] [表 2]

[0045] 实施例 5

[0046] 3ot-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的制备

[0047] 参照前述 3α-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的制备方法的具体实施过程, 使用实施例 3 制备的粗酶液, 酶液的投入量以酶液的重量占整个反应体系的 体积计, 控制底 物鹅去氧胆酸的终浓度为 100mg/mL, 其余各具体参数如表 3所示。 反应 41!〜 12h 后测得, 底物转化率在 99.8%以上, 成品含量在 96.8%以上, 收率为 90〜95%。

[0048] 表 3

[] [表 3]

[0049] 实施例 6

[0050] 3ot-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸的制备

[0051] 总体系 1L, 取 50g含量为 99%的鹅去氧胆酸, 悬浮于 lOOmM的磷酸钾缓冲液 (p H8.0) ,用 lO M NaOH的调节 pH到 8.0后加入终浓度 20g/L的丙酮酸钠, 并依次加 入 0.09g7ot-类固醇脱氢酶冻干粉 (Y159F突变体酶) 和 0.07g乳酸脱氢酶冻干粉, 最后加入终浓度为 O.lg/L的 NAD, 底物终浓度为 50g/L。 在 25°C 250rpm和 pH8.0 左右进行反应 4h, 转化率达 99.8%。 反应结束后, 反应液滴加盐酸溶液至 pH为 1. 2, 继续搅拌 30min后待冷却过滤、 经水洗三次后真空干燥得到 3oc-羟基 -7氧代 -5β -胆烷酸成品 60g。 成品用 1080ml无水乙醇 60°C水浴条件下搅拌回流 lh, 过滤取滤 液进行真空减压浓缩至 250ml体积, 再加入 1L纯水搅拌 lh, 过滤, 将滤饼真空干 燥过夜即得 3α-羟基 -7氧代 -5β-胆烷酸精制品 54g