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Patentansprüche 1. Verfahren zum Nachbilden einer Stammzellnische eines Organismus, folgende Schritte umfassend: - Erzeugen eines Abbildes eines mindestens eine Stammzellnische umfassenden Gewebes eines Organismus; - Filtern (16, 17) des Abbildes, um ein Strukturbild der abgebildeten Stammzellennische zu erzeugen; - Erzeugen (21) einer lithographischen Maske (19) aus dem Strukturbild; und - Strukturieren (22, 23, 24, 25, 26) eines Ausgangsmaterials eines Substrates durch Anwenden der lithographischen Maske (19), wodurch ein strukturiertes Substrat erhalten wird, welches die Nachbildung der abgebildeten Stammzellnische des Organismus darstellt. 2. Verfahren nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, dass das Strukturbild ein Teilstrukturbild für grobe Strukturen der abgebildeten Stammzellnische und ein Teilstrukturbild für feine Strukturen der abgebildeten Stammzellnische umfasst; wobei die lithographische Maske (19) eine Teilmaske für grobe Strukturen umfasst, die aus dem Teilstrukturbild für grobe Strukturen erzeugt wird; und wobei die lithographische Maske (19) eine Teilmaske für feine Strukturen umfasst, die aus dem Teilstrukturbild für feine Strukturen erzeugt wird. 3. Verfahren nach Anspruch 2, dadurch gekennzeichnet, dass die feinen Strukturen eine maximale Elementgröße zwischen 50 ym und 75 ym aufweisen, und dass die groben Strukturen eine minimale Elementgröße zwischen 50 ym und 75 ym aufweisen. 4. Verfahren nach Anspruch 2 oder 3, dadurch gekennzeichnet, dass das Filtern (16, 17) des Abbildes verschiedene Kantenanalysen umfasst, mit denen das Teilstrukturbild für die groben Strukturen und das Teilstrukturbild für die feinen Strukturen bestimmt werden. 5. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 4, dadurch gekennzeichnet, dass mit der lithographischen Maske (19) zunächst ein Werkzeug zum Verformen des Ausgangsmaterials des Substrates erstellt wird, wobei anschließend das Ausgangsmaterial des Substrates mit dem Werkzeug strukturiert wird. 6. Verfahren nach dem auf Anspruch 2 rückbezogenen Anspruch 5, dadurch gekennzeichnet, dass das Werkzeug zum Verformen des Ausgangsmaterials ein Werkzeug zur Erzeugung grober Strukturen und ein Werkzeug zur Erzeugung feiner Strukturen umfasst, wobei das Werkzeug zur Erzeugung grober Strukturen mit der Teilmaske für grobe Strukturen erstellt wird, und wobei das Werkzeug zur Erzeugung feiner Strukturen mit der Teilmaske für feine Strukturen erstellt wird. 7. Verfahren nach Anspruch 6, dadurch gekennzeichnet, dass das Werkzeug zur Erzeugung feiner Strukturen durch ein Prägewerkzeug zum Heißprägen oder durch ein Prägewerkzeug für eine Nanoprägelithografie gebildet ist, und dass das Werkzeug zur Erzeugung grober Strukturen durch ein Thermoformwerkzeug gebildet ist. 8. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 7, dadurch gekennzeichnet, dass das strukturierte Substrat mit mindestens einer Stammzelle besiedelt wird. 9. Nachbildung einer Stammzellnische eines Organismus, herstellbar durch ein Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 8. 10. Nachbildung einer Stammzellnische eines Organismus, dadurch gekennzeichnet, dass sie geometrische Eigenschaften der Stammzellnische des Organismus aufweist. |
Die vorliegende Erfindung betrifft zunächst ein Verfahren zum
Nachbilden einer Stammzellnische eines Organismus. Im Weiteren betrifft die Erfindung eine Nachbildung einer Stammzellnische eines Organismus. Ein Beispiel für die Aufnahme und Analyse von Stammzell-
Morphologien gemäß dem Stand der Technik ist in dem
wissenschaftlichen Artikel von Celso, C. L . ; Fleming, H. E . ; Wu, J. W. et al . : „Live animal tracking of individual
stem/progenitor cells in their niche" in Nature, Ausgabe 457, Seiten 92-96, Januar 2009 gezeigt.
Der Einsatz von Hydrogelen zur Nachbildung von
Stammzellnischen findet sich in dem Artikel von Gerecht, S. et al . : „Hyaluronic acid hydrogel for controlled self-renewal and differentiation of human embryonic stem cells" in PNAS,
Ausgabe 104, Nr. 27, Seiten 11298-11303, Juli 2007.
Ein weiterer Ansatz stammt von Hashimoto, Y. et al . : „The effect of decellularized bone/bone marrow produced by high- hydrostatic pressurization on the osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells" in Biomaterials, Ausgabe 32, Seiten 7060-7067, 2011. Hier werden Knochen menschlichen Ursprungs eingesetzt . Eine mikrotechnische Lösung sind Kapillarenarrays, wie sie in dem Artikel von Su, W.-T.: „Ex vivo expansion of a
hematopoietic stem cell on a murine stromal cell by 3D micro- pillar device" in Biomed Microdevices, Ausgabe 13, Seiten 11- 17, 2011, aufgeführt sind .
In dem Artikel von Burke, D. P. et al . : „Substrate stiffness and oxygen availability as regulators of mesenchymal stem seil differentiation within a mechanically loaded bone Chamber" in Biomech Model Mechanobiol, Ausgabe 14, Seiten 93-105, 2015, sind Simulationen zum Einfluss mechanischer Faktoren bzw. der Oxigenierung gezeigt.
Der Artikel von Housler, G. J. et al . : „3-D Perfusion
Bioreactor Process Optimization for CD34+ Hematopoietic Stem Cell Culture and Differentiation towards Red Blood Cell
Lineage" in Journal of Bone Marrow Research, Ausgabe 2, Nr. 3, 2014, beschreibt einen bioreaktorbasierten Ansatz, bei dem jedoch Hohlfasern genutzt werden.
Der Artikel von Prendergast, Ä. M. et al . : „Hematopoietic stem cells, infection, and the niche" in Annais of the New York Academy of Sciences, Ausgabe 1310, Seiten 51-57, 2014
beschreibt die Infizierung von Stammzellen in der
Stammzellnische .
Die Aufgabe der vorliegenden Erfindung besteht ausgehend vom Stand der Technik darin, verbesserte Kulturbedingungen für
Stammzellen schaffen zu können.
Die genannte Aufgabe wird gelöst durch ein Verfahren gemäß dem beigefügten Anspruch 1 sowie durch eine Nachbildung einer Stammzellnische gemäß den beigefügten nebengeordneten
Ansprüchen 9 und 10. Das erfindungsgemäße Verfahren dient zum Nachbilden mindestens einer Stammzellnische eines Organismus. Das erfindungsgemäße Verfahren dient insbesondere zum biolithomorphischen
Nachbilden einer Stammzellnische eines Organismus. Bei dem Organismus handelt es sich bevorzugt um einen lebenden
Organismus, in welchem die nachzubildende Stammzellnische ausgebildet ist. Bei dem lebenden Organismus handelt es sich insbesondere um ein Tier oder um einen Menschen. Die Stammzellnische begrenzt einen Raum, in welchem eine
Stammzelle des Gewebes des Organismus leben kann.
Durch das erfindungsgemäße Verfahren wird insbesondere die Morphologie der mindestens einen Stammzellnische nachgebildet. Daher ist die mindestens eine Stammzellnische im Sinne der Erfindung zumindest durch ihre geometrischen Eigenschaften definiert. Diese geometrischen Eigenschaften beschreiben insbesondere die räumliche Anordnung einer Wandung der
Stammzellnische in mindestens zwei Dimensionen. Die Wandung der Stammzellnische umschließt den Raum, in welchem die
Stammzelle des Gewebes des Organismus leben kann, nicht vollständig, damit beispielsweise ein Stoffaustausch der
Stammzelle ermöglicht ist.
In einem Schritt des erfindungsgemäßen Verfahrens wird ein Abbild eines Gewebes des Organismus erzeugt. Das Gewebe, welches insbesondere durch Teile eines Organes oder durch ein vollständiges Organ gebildet sein kann, umfasst mindestens eine Stammzellnische. Zumindest diese eine Stammzellnische, aber bevorzugt mehrere der Stammzellnischen sollen
erfindungsgemäß nachgebildet werden. Das Gewebe ist bevorzugt durch ein Gewebe eines Knochenmarks des Organismus gebildet. Das Abbild ist zumindest zweidimensional. In diesem Abbild sind u. a. die Wandungen der mindestens einen Stammzellnische abgebildet. Zumeist sind aber auch die Stammzellen und andere Strukturen des Gewebes abgebildet. Das Abbild ist bevorzugt durch eine Vielzahl an Bildpunkten gebildet, wobei jeder
Bildpunkt zumindest eine Helligkeitsinformation oder eine Farbinformation besitzt. Das Abbild der der mindestens einen
Stammzellnische wird erzeugt, indem ein abbildendes Verfahren auf das Gewebe angewendet wird. Das Abbild wird vor der weiteren Verarbeitung bevorzugt gespeichert. In einem weiteren Schritt des erfindungsgemäßen Verfahrens wird das Abbild mithilfe von Methoden der Bildverarbeitung gefiltert, um ein Strukturbild der mindestens einen
abgebildeten Stammzellnische zu erhalten. Im Strukturbild sind jedenfalls die Wandungen der mindestens einen Stammzellnische abgebildet. Bevorzugt sind im Strukturbild ausschließlich die
Wandungen der mindestens einen Stammzellnische abgebildet. Das Abbild ist bevorzugt durch eine Vielzahl an Bildpunkten gebildet, wobei jedem Bildpunkt bevorzugt eine logische
Information von einem Bit zugeordnet ist, ob an diesem Ort eine Wandung gegeben ist oder nicht. Insoweit ist das
Strukturbild bevorzugt durch ein Schwarz-Weiß-Bild gebildet. Den Bildpunkten können aber auch einzelne Werte eines eine Vielzahl an Werten umfassenden Wertebereiches zugeordnet sein, um beispielsweise Abstufungen zu repräsentieren. Das
Strukturbild ist zumindest zweidimensional. Bei weiteren bevorzugten Ausführungsformen besitzt das Strukturbild 2,5 oder drei Dimensionen.
In einem weiteren Schritt des erfindungsgemäßen Verfahrens wird aus dem Strukturbild eine lithographische Maske erzeugt.
Die lithographische Maske ist dazu ausgebildet, ein formendes Bearbeitungsverfahren zur Strukturierung unmittelbar oder mittelbar ausführen zu können, um gemäß dem Strukturbild zu formen; nämlich um die im Strukturbild gezeigten Wandungen der Stammzellnische durch das formende Bearbeitungsverfahren nachzubilden. Bei dem formenden Bearbeitungsverfahren handelt es sich bevorzugt um ein photolithographisches Verfahren, um ein Prägeverfahren, um ein nanoprägelithographisches
Verfahren, um ein heißprägendes Verfahren, um ein
thermoformendes Verfahren oder um eine Kombination mehrerer der genannten Verfahren. Entsprechend ist die lithographische Maske beispielsweise dazu ausgebildet, durchleuchtet zu werden oder durch deren Anwendung ein formendes Werkzeug zu
erstellen, welches anschließend zum Formen bzw. Strukturieren genutzt wird.
In einem weiteren Schritt des erfindungsgemäßen Verfahrens wird ein Ausgangsmaterial eines Substrates strukturiert, d. h. geformt, wofür die lithographische Maske mittelbar oder unmittelbar angewendet wird und wodurch mittelbar oder
unmittelbar ein strukturiertes Substrat erhalten wird, welches die Nachbildung der mindestens einen abgebildeten
Stammzellnische darstellt. Das Strukturieren des
Ausgangsmaterials erfolgt mit dem oben beschriebenen formenden Bearbeitungsverfahren. Ist das formende Bearbeitungsverfahren beispielsweise durch ein photolithographisches Verfahren gebildet, so wird die lithographische Maske unmittelbar auf das Ausgangsmaterial angewendet. Ist das formende
Bearbeitungsverfahren beispielsweise durch ein
nanoprägelithographisches Verfahren oder durch ein
heißprägendes Verfahren gebildet, so wird die lithographische Maske mittelbar auf das Ausgangsmaterial angewendet, da mit der lithographischen Maske zunächst ein Werkzeug erstellt wird, welches dann unmittelbar auf das Ausgangsmaterial angewendet wird. Die Nachbildung gleicht der abgebildeten Stammzellnische in ihren geometrischen Eigenschaften, d. h. in ihrer räumlichen Ausdehnung, wobei diese Übereinstimmung in mindestens zwei Dimensionen gegeben ist. Die Nachbildung ist jedoch grundsätzlich dreidimensional ausgebildet, sodass bei einer Übereinstimmung in zwei Dimensionen von einer 2,5- dimensional strukturierten Nachbildung gesprochen werden kann.
Insbesondere weist die Nachbildung eine Wandung auf, die in ihrer Ausdehnung der originalen Wandung der abgebildeten
Stammzellnische zumindest in zwei Dimensionen gleicht. Die Nachbildung ist bevorzugt mindestens 10 mm lang und 10 mm breit. Die Nachbildung ist bevorzugt mindestens 0,5 mm hoch.
Die erfindungsgemäß resultierende Nachbildung der mindestens einen abgebildeten Stammzellnische ist als eine
biolithomorphische Nachbildung anzusehen. Biolithomorphie ist die Übertragung der Fertigungsprinzipien der Mikro- und
Nanotechnologien für die Konstruktion von biologischen
dreidimensionalen Geweben für Anwendungen in den „Life
Sciences". Dabei sind biologische Morphologien multiskalig auf 2D- und 3D-Substrate zur Zellkultivierung zu übertragen.
Bei bevorzugten Ausführungsformen der Erfindung wird das
Gewebe dem Organismus durch Biopsie entnommen. Es werden bevorzugt Schnitte des entnommenen Gewebes angefertigt, die bevorzugt mit verschiedenen Farben eingefärbt werden, um
Strukturen hervorzuheben, insbesondere um die mindestens eine abzubildende Stammzellnische hervorzuheben. Es werden
bevorzugt die Wandungen der mindestens einen abzubildenden Stammzellnische hervorgehoben. Bei bevorzugten Ausführungsformen der Erfindung umfasst das
Strukturbild ein Teilstrukturbild für grobe Strukturen der abgebildeten Stammzellnische und ein Teilstrukturbild für feine Strukturen der abgebildeten Stammzellnische. Die lithographische Maske umfasst dabei eine Teilmaske für grobe Strukturen, die aus dem Teilstrukturbild für grobe Strukturen erzeugt wird. Entsprechend umfasst die lithographische Maske weiterhin eine Teilmaske für feine Strukturen, die aus dem Teilstrukturbild für feine Strukturen erzeugt wird.
Die feinen Strukturen weisen eine maximale Elementgröße auf, die bevorzugt zwischen 10 ym und 200 ym, besonders bevorzugt zwischen 50 ym und 75 ym beträgt. Die maximale Elementgröße beträgt bevorzugt 50 ym oder alternativ 75 ym. Die feinen
Strukturen umfassen ausschließlich Strukturelemente, deren Ausdehnung höchstens so groß wie die maximale Elementgröße ist . Die groben Strukturen weisen eine minimale Elementgröße auf, die bevorzugt zwischen 10 ym und 200 ym, besonders bevorzugt zwischen 50 ym und 75 ym beträgt. Die minimale Elementgröße beträgt bevorzugt 50 ym oder alternativ 75 ym. Die groben Strukturen umfassen ausschließlich Strukturelemente, deren Ausdehnung mindestens so groß wie die minimale Elementgröße ist .
Das Filtern des Abbildes umfasst bevorzugt verschiedene
Kantenanalysen, mit denen das Teilstrukturbild für die groben Strukturen und das Teilstrukturbild für die feinen Strukturen bestimmt werden. Zum Bestimmen des Teilstrukturbildes für die groben Strukturen wird bevorzugt ein Tiefpass angewendet. Zum Bestimmen des Teilstrukturbildes für die feinen Strukturen wird bevorzugt ein Hochpass angewendet.
Bei bevorzugten Ausführungsformen der Erfindung wird mit der lithographischen Maske zunächst ein Werkzeug zum Verformen des Ausgangsmaterials des Substrates erstellt, wobei anschließend das Ausgangsmaterial des Substrates mit dem Werkzeug
strukturiert wird.
Das Werkzeug zum Verformen des Ausgangsmaterials umfasst bevorzugt ein Werkzeug zur Erzeugung grober Strukturen und ein
Werkzeug zur Erzeugung feiner Strukturen, wobei das Werkzeug zur Erzeugung grober Strukturen mit der Teilmaske für grobe Strukturen erstellt wird, und wobei das Werkzeug zur Erzeugung feiner Strukturen mit der Teilmaske für feine Strukturen erstellt wird.
Das Werkzeug zur Erzeugung feiner Strukturen ist bevorzugt durch ein Prägewerkzeug zum Heißprägen, durch ein
Prägewerkzeug für eine Nanoprägelithographie, durch eine Form zum Abgießen oder durch eine Form zum Spritzprägen gebildet.
Das Werkzeug zur Erzeugung grober Strukturen ist bevorzugt durch ein Thermoformwerkzeug gebildet.
Das Ausgangsmaterial ist bevorzugt durch eine Folie gebildet. Die Folie ist bevorzugt porös. Das Ausgangsmaterial ist alternativ durch ein Polymer gebildet, welches durch
thermoplastische Verformung verformt und strukturiert wird.
Das Ausgangsmaterial bzw. das Substrat wird bevorzugt mit Bestandteilen einer extrazellulären Matrix der nachzubildenden
Stammzellnische beschichtet.
Das strukturierte Substrat wird bevorzugt mit mindestens einer Stammzelle besiedelt. Die mindestens eine Stammzelle wird im strukturierten Substrat kultiviert.
Besonders bevorzugt wird ein Schritt durchgeführt, bei welchem die mindestens eine Stammzelle im strukturierten Substrat expandiert. Anschließend wird die mindestens eine expandierte Stammzelle bevorzugt aus dem strukturierten Substrat entnommen und in den individuellen Organismus, dessen Gewebe abgebildet wurde, eingeführt. Insoweit kann diese Ausführungsform der Erfindung auch ein Verfahren zum Expandieren von Stammzellen darstellen .
Bei einer alternativ bevorzugten Ausführungsform wird ein Schritt durchgeführt, bei welchem die mindestens eine
Stammzelle im strukturierten Substrat zu einer Blutzelle ausdifferenziert. Die mindestens eine Blutzelle wird bevorzugt aus dem strukturierten Substrat entnommen und in den
individuellen Organismus, dessen Gewebe abgebildet wurde, eingeführt. Insoweit kann diese Ausführungsform der Erfindung auch ein Verfahren zum Ausdifferenzieren von Stammzellen darstellen .
Die vorliegende Erfindung dient zur organnahen und bevorzugt organgetreuen geometrischen und bevorzugt auch biochemischen Replikation mindestens einer Stammzellnische, die bevorzugt hämatopoetisch ist. Durch die Erfindung kann einer
Blutstammzelle in situ eine organnahe geometrische Umgebung geboten werden, die es ermöglicht, diese Blutstammzellen für therapeutische Zwecke gezielt zu expandieren. Durch die
Erfindung kann eine hohe Expansionsrate erzielt werden. Ohne eine solche Umgebung neigen die Stammzellen zur
Differenzierung und sind für den beabsichtigten
therapeutischen Zweck nicht mehr einsetzbar. Erfindungsgemäß dient das Abbild eines Gewebes eines
Organismus, insbesondere präparierte Schnittbilder vom
Knochenmark gesunder Patienten, als Ausgangsmaterial und
Vorlagen. Diese werden über Bildverarbeitungstechniken (BV-Techniken) gefiltert und in die lithographische Maske übersetzt und bevorzugt durch Mikrostrukturtechnik abgebildet. Die so bevorzugt entstandene Siliziumstruktur wird bevorzugt über einen Abguss oder über eine galvanische Abformung in das polymere bzw. metallische Werkzeug überführt. Dieses dient dann bevorzugt der weiteren Replikation in dickwandige
abgegossene oder in dünnwandige folienbasierte
Kultivierungsstrukturen, die als Scaffolds bezeichnet werden können und durch strukturierte Substrate gebildet sind.
Bei der erfindungsgemäßen Erzeugung des strukturierten
Substrates in einer bevorzugten Form eines folienbasierten Scaffolds werden bevorzugt zwei Verfahrensweisen angewendet, um eine sehr hohe Strukturierungstiefe, ähnlich dem nativen Knochenmark, zu erhalten. Eine Foliendicke liegt hier
bevorzugt bei max . 75 ym. In einem zweigeteilten BV-Prozess können aus einem Knochenmarkschnitt zuerst verschiedene
Strukturgrößen isoliert werden. Dabei wird bevorzugt mit einem Hochpass- und einem Tiefpassfilter gearbeitet. Große
Strukturen werden dabei gesondert in die eigene lithografische
Maske für grobe Strukturen überführt; ebenso verhält es sich mit kleinen Strukturen. Die Grenze liegt bevorzugt bei 50 ym bis 75 ym Elementgröße. Aus der Maske für die kleinen
Strukturen wird ein Prägewerkzeug hergestellt. Dieses
Prägewerkzeug besteht bevorzugt aus Metall, Silizium oder einem sehr steifen organischen Material ( Photoresist/X-PDMS ) . Mit diesem Prägewerkzeug wird bevorzugt mittels Heißprägen oder mithilfe der Nanoprägelithografie eine Feinstruktur auf die Folie aufgeprägt, wodurch sie eine Mikrostruktur erhält. Aus der Maske der großen Strukturen im Knochenmarkschnitt wird bevorzugt ein Thermoformwerkzeug hergestellt. Auch hierbei können für das Werkzeug verschiedenen Materialen eingesetzt werden. Die texturierte Folie wird nun in eine Thermoformanlage eingelegt und die Grobstruktur in die Folie eingeformt, sodass sie eine Mesostruktur erhält. Resultat ist das in zunächst zwei Größenordnungen strukturierte Substrat. Dieses kann durch Verwendung eines geeigneten
Oberflächenbehandlungsprozesses auch noch bevorzugt
nanostrukturiert werden, sodass es eine Nanostruktur erhält. Beispiele hierfür können chemische Ätzung, Plasmamodifikation oder das Aufbringen von Hydrogel- oder anderen organischen Beschichtungen ggf. auch mit Funktionsgruppen sein. Nach erfolgter Oberflächenmodifikation liegt das Substrat mit der
Meso-, der Mikro- und der Nanostruktur vor.
Die Verwendung einer porösen Folie als Halbzeug ermöglicht zudem auch die Herstellung eines durchströmbaren Scaffolds.
Nachfolgend sind weitere bevorzugte Ausführungsformen der Erfindung beschrieben.
Zum Erzeugen des Abbildes eines mindestens eine
Stammzellnische umfassenden Gewebes eines Organismus werden bevorzugt Schnittbilder als das Abbild des Gewebes des
lebenden Organismus hergestellt. Bei dem lebenden Organismus handelt es sich bevorzugt um ein Tier oder um einen Menschen. Hierfür wird bevorzugt zunächst Gewebe in Form von Knochenmark mittels Biopsie gewonnen. Es werden pathologische
Mikroschnitte mit einer Schnittdicke von etwa 10 ym
angefertigt und diese mit Hämatoxylin-Eosin gefärbt. Es erfolgt bevorzugt eine verschiedenartige Färbung von
Knochenmarkstruktur, die weiches Gewebe, mindestens eine extrazelluläre Matrix, und eine Spongiosa-Struktur, d. h.
harte Knochenstruktur umfasst. In einem weiteren bevorzugt durchzuführenden Schritt erfolgt ein Digitalisieren der Schnittbilder in mikroskopische
Aufnahmen. Bevorzugt erfolgt ein Digitalisieren der einzelnen verschiedenen Färbungen, sodass mehrere Bilder entstehen.
Alternativ bevorzugt erfolgen zunächst ein Digitalisieren in einzelnes Bild und ein späteres Erkennen und Trennen der
Strukturen durch Anwenden von Methoden der Bildverarbeitung. Bei der Bildverarbeitung erfolgt bevorzugt zunächst ein
Erzeugen von Graustufenbildern aus den digitalisierten
Schnittbildern. Es werden mindestens ein Hochpass und/oder ein
Tiefpass auf die Graustufenbilder angewendet, um die
Graustufenbilder in eine Grobstruktur und in eine Feinstruktur zu trennen. Bevorzugt erfolgt weiterhin eine Kantendetektion unter Nutzung von Kantenfindungsalgorithmen, wie z. B. der Canny- oder Niblack-Algorithmus , und/oder unter Nutzung einer
Schwellwertbildung. Aus den detektierten Kanten wird bevorzugt jeweils ein Schwarz-Weiß Bild erstellt. Das mindestens eine Schwarz-Weiß-Bild wird bevorzugt vektorisiert . Zum Erzeugen der lithographischen Maske wird das vektorisierte
Bild der detektierten Kanten überführt. Bevorzugt wird das vektorisierte Bild der detektierten Kanten durch ein
mehrfaches Anreihen, Spiegeln oder Rotatieren vergrößert. In einem weiteren bevorzugt durchzuführenden Schritt wird das
Werkzeug zur Abformung erstellt. Hierfür wird die
lithographische Maske bevorzugt prozessiert, z. B. als
Hellfeld oder Dunkelfeld, was in verschiedenen
Materialsystemen, wie Silizium oder Glas und unter Nutzung verschiedener Technologien, wie z. B. nasschemische oder trockenchemische Technologien erfolgen kann. Bevorzugt erfolgt eine Beeinflussung von Ätztiefe, Strukturauflösung und
Kantenverrundung. Das Prozessieren der lithographischen Maske führt beispielsweise zu einem prozessierten Wafer, der
bevorzugt mit einer galvanischen Startschicht für eine
nachfolgende galvanische Abformung oder mit einer Anti- Adhäsionsschicht für einen nachfolgenden Abguss oder für eine nachfolgende Abformung beschichtet wird. Das Werkzeug zur
Abformung ist bevorzugt direkt durch die geätzten Strukturen, durch deren galvanische Abformungen oder durch deren Abgüsse, z. B. aus hartem Silikon oder einem Epoxid-Harz, gebildet. Das strukturierte Substrat, welches auch als Kultursubstrat bezeichnet werden kann, wird durch Nutzung des Werkzeuges zur Abformung erhalten. Dabei erfolgt bevorzugt eine Replikation des Werkzeuges zur Abformung. Diese Replikation erfolgt bevorzugt durch ein Abgießen. Das mindestens eine
Kultursubstrat wird durch einen direkten Abguss repliziert und dann zur Kultivierung verwendet. Das Kultursubstrat ist massiv und weist an der Oberfläche eine Strukturierung auf. Bevorzugt wird durch eine flächige Beschichtung oder durch eine
Schattenmaske ergänzend eine Nanostruktur auf das
Kultursubstrat aufgebracht, was bevorzugt durch eine
physikalische Gasphasenabscheidung erfolgt. Die Replikation erfolgt alternativ bevorzugt durch eine einfache Abformung. Das Werkzeug zur Abformung wird genutzt, um Strukturen durch ein Heißprägen oder durch ein Thermoformen abzuformen. Es entstehen einfach strukturierte Substrate aus massiven Körpern beim Heißprägen bzw. aus dünnen Folien beim Thermoformen. Die Folien sind bevorzugt porös. In einem weiteren bevorzugt durchzuführenden Schritt wird auf das Substrat eine flächige Beschichtung oder mithilfe einer Schattenmaske eine
Nanostruktur aufgebracht. Die Replikation erfolgt alternativ bevorzugt durch eine mehrfache Abformung. Bei dieser
Ausführungsform werden bevorzugt Folien mit einer
Ausgangsdicke von maximal 100 ym verwendet. Diese Folien sind bevorzugt porös. Zunächst wird die Feinstruktur durch
Heißprägen in die Oberfläche der Folie eingeprägt, wofür das Werkzeug zur Erzeugung feiner Strukturen genutzt wird. Dabei beträgt ein Aspektverhältnis bevorzugt maximal 3. Die
feinstrukturierte Folie wird mit ihrer unstrukturierten Seite in eine das Werkzeug zur Erzeugung grober Strukturen bildende Thermoformmaschine eingelegt und durch Aufheizen und durch einen Druckstoß grob strukturiert. In einem weiteren bevorzugt durchzuführenden Schritt wird durch eine flächige Beschichtung oder durch eine Schattenmaske noch eine Nanostruktur auf das strukturierte Substrat aufgebracht.
In einem weiteren bevorzugt durchzuführenden Schritt des erfindungsgemäßen Verfahrens erfolgt eine Kultivierung von Stammzellen in dem strukturierten Substrat. Das strukturierte
Substrat stellt bevorzugt ein statisches System dar. Das strukturierte Substrat, insbesondere wenn es massiv ausgeführt ist, wird in ein einfaches Kulturgefäß eingebracht und mit der Stammzellkultur besiedelt. Dabei wird bevorzugt ein
periodischer Medientausch durchgeführt. Das strukturierte
Substrat stellt bevorzugt ein durchströmtes System dar. Das Substrat, insbesondere wenn es folienbasiert und porös ausgebildet ist, wird bevorzugt in einem Bioreaktorsystem perfundiert betrieben. Dazu werden Zellkulturen auf das
Substrat aufgebracht und nach einer kurzen Adhärenzzeit wird das Substrat in das Bioreaktorsystem eingebracht und mit einer entsprechenden Flussmenge durchströmt. Der Medienaustausch kann hierbei periodisch, kontinuierlich oder periodisch partiell sein. Das Substrat, insbesondere wenn es
folienbasiert, massiv und unporös ausgebildet ist, wird bevorzugt in einer Superfusion betrieben. Dazu werden
Zellkulturen auf das Substrat aufgebracht und nach einer kurzen Adhärenzzeit wird das Substrat in das Bioreaktorsystem eingebracht und mit einer entsprechenden Flussmenge überströmt. Der Medienaustausch kann hierbei periodisch, kontinuierlich oder periodisch partiell sein. Es ist schon lange bekannt, dass die dreidimensionale Struktur des Mikromilieus einer Stammzelle einen wesentlichen Faktor für die Regulation der Hämatopoese darstellt. So konnte gezeigt werden, dass eine Desintegration von
Knochenmarkbröckchen nach einer Collagenasebehandlung zum vollständigen Erlöschen der Hämatopoese in der anschließenden
Kultur führt, während aus intakten Bröckchen selbst ohne externe Wachstumsfaktorgabe schon nach kurzer Zeit Stroma mit hämatopoetischen Inseln auswächst. Ein Defekt nach
Collagenasebehandlung lässt sich nur ansatzweise durch
Wachstumsfaktoren (SCF, IL3, Epo) kompensieren. Überraschend ist daher, dass bereits eine 2,5D-artige Struktur in Form eines erfindungsgemäß strukturierten Substrates eine
wesentlich erhöhte Vitalität und Expansion der Stammzellen ermöglicht .
Wie schon ausgeführt, können beim erfindungsgemäßen Verfahren unterschiedliche Materialien als Ausgangsmaterial für das Substrat eingesetzt werden. Sowohl organische wie auch
anorganische Materialien können dabei über eine geeignete Kopplungschemie mit zellspezifischen Molekülen vorteilhaft beschichtet werden. Eine alternativ bevorzugte Ausführungsform umfasst ein verfahrenstechnisches Auftragen, z. B. über „spin- coating" von zellverträglichen Materialien, vorzugsweise von Bestandteilen der extrazellulären Matrix, wie z. B. Kollagen. Das Auftragen erfolgt vorzugsweise im Falle polymerer
Substrate auf das Ausgangsmaterial. Das Auftragen erfolgt alternativ bevorzugt durch Tauchverfahren, wobei das Auftragen auf das bereits geformte Substrat erfolgt. Besonders bevorzugt erfolgt eine chemische Modifikation des 3D- bzw. 2,5D- strukturierten Substrates mit Zelladhäsionsmolekülen. Die Zelladhäsionsmoleküle sind bevorzugt durch geeignete
Peptidsequenzen, z. B. aus der Familie der RGD Motive
gebildet.
Im lebenden Körper werden aus biologischen Phosphaten, wie z. B. Glucose-6-phosphat, in die umgebende Matrix
kontinuierlich Phosphationen freigesetzt. Durch das
gleichfalls vorliegende Calcium kommt es beim Überschreiten des Löslichkeitsprodukts zur Kristallisation von
Calciumphosphat und Ausbildung einer Knochenstruktur.
Erfindungsgemäß wird bevorzugt ein polymeres Ausgangsmaterial verwendet, welches auch solche kristallinen Materialien enthält, wie sie im Knochen vorliegen.
Bei einer weiteren bevorzugten Ausführungsform erfolgt eine Konfektionierung bzw. Synthese des vorzugsweisen polymeren Substrates für die Stammzellkultivierung derart, dass ein Folie aus einer Kollagenmatrix und Hydroxylapatit
(CastOHl (P0 4 )3]) als Ausgangsmaterial bereitgestellt wird und dann der gezeigten Strukturierung unterworfen wird.
Bei weiteren bevorzugten Ausführungsformen wird ein
synthetisches Material wie z. B. eine synthetische
Nanokompositstruktur, die beispielsweise aus verkieselten Poly (N-isopropylacrylamide) /Hydroxyapatit besteht, als
Ausgangsmaterial für das Substrat genutzt. Die genannten konfektionierten Polymere werden bevorzugt wiederum einer chemischen Modifikation unterzogen;
vorzugsweise durch Zellkontakt vermittelnde Peptide oder durch andere Substanzen. Bei einer weiteren bevorzugten Ausführungsform können
unterschiedliche Ladungen durch Beschichtungen des
Ausgangsmaterials bzw. des Substrates mit vorzugsweise Apatit- analogen Kristallen oder mit Hyaluronsäure-Hydrogelen mit jeweils unterschiedlicher Dotierung erfolgen. Die Vernetzung kann über die Einführung bisfunktioneller organischer Moleküle erfolgen. Dadurch gelingt auch die Kopplung von VLA4/VCAM, betal-Integrin, WNT, IL6, SCF und CXCL12.
Des Weiteren werden bevorzugt durch Modifikationen im Polymer des Ausgangsmaterials bzw. des Substrates Gradienten von biologischen Effektormolekülen vorgelegt. Das erzeugte Substrat wird bei bevorzugten Ausführungsformen der Erfindung in einen Systemaufbau eingebracht, der
unterschiedliche physiologische Bedingungen, vorzugsweise auch die des Knochenmarks, simulieren kann. So besteht auch neben den oben beschriebenen biochemischen Modifikationen des
Substrates hinsichtlich des Ausgangsmaterials, der
Oberflächen, der Wachstumsfaktoren, der Adhäsionsproteine etc. eine vorteilhafte Möglichkeit die Kulturbedingungen, wie normoxische und hypoxische Zustände, durch geeignete
Klimatisierung bzw. Fluidik einzustellen bzw.
Wachstumsfaktoren und chemische/biochemische Effektorstoffe zu applizieren .
Einen weiteren Gegenstand der Erfindung bildet eine
synthetische Nachbildung einer Stammzellnische eines
Organismus, wobei die Nachbildung durch das erfindungsgemäße
Verfahren herstellbar ist. Die Nachbildung ist bevorzugt durch bevorzugte Ausführungsformen des erfindungsgemäßen Verfahrens herstellbar . Einen weiteren Gegenstand der Erfindung bildet eine synthetische Nachbildung mindestens einer Stammzellnische eines Organismus. Diese Nachbildung weist geometrische
Eigenschaften der mindestens einen Stammzellnische des
Organismus auf. Die Nachbildung umfasst zumindest eine
Wandung, welche einer Wandung der Stammzellnische des
Organismus in mindestens zwei Dimensionen nachgebildet ist und dieser gleicht. Diese Nachbildung weist somit die Morphologie der Stammzellnische des Organismus auf. Diese Nachbildung weist bevorzugt eine Mesostruktur als eine grobe Struktur und eine Mikrostruktur als eine feine Struktur sowie weiterhin bevorzugt eine Nanostruktur als eine weitere feine Struktur auf. Die grobe Struktur und die feine Struktur weisen
bevorzugt die im Zusammenhang mit dem erfindungsgemäßen
Verfahren beschriebenen Merkmale auf. Im Übrigen weist die Nachbildung bevorzugt auch solche Merkmale auf, die im
Zusammenhang mit dem erfindungsgemäßen Verfahren beschrieben sind .
Weitere Vorteile, Einzelheiten und Weiterbildungen der
Erfindung ergeben sich aus der nachfolgenden Beschreibung bevorzugter Ausführungsformen der Erfindung, unter Bezugnahme auf die Zeichnung. Es zeigen:
Fig. 1: ein erfindungsgemäß erstelltes strukturiertes
Substrat in einer Querschnittsdarstellung;
Fig. 2: ein erfindungsgemäß erstelltes Originalbild eines
Knochenmarksabschnittes und daraus erfindungsgemäß erzeugte Strukturbilder; Fig. 3: einen Vergleich zwischen dem in Fig. 2 gezeigten Originalbild und einem erfindungsgemäß erstellten Strukturbild; Fig. 4: ein Flussdiagramm einer erfindungsgemäßen Erzeugung lithographischer Masken;
Fig. 5: erfindungsgemäß feinstrukturierte Polycarbonatfolien; Fig. 6: die in Fig. 5 gezeigten Polycarbonatfolien mit
ergänzenden groben Strukturen;
Fig. 7: ein Flussdiagramm einer physikalischen
Oberflächenmodifikation gemäß einer bevorzugten
Ausführungsform der Erfindung;
Fig. 8: eine erste bevorzugte Ausführungsform einer
erfindungsgemäßen Nachbildung von Stammzellnischen eines Knochenmarks;
Fig. 9: eine zweite bevorzugte Ausführungsform der
erfindungsgemäßen Nachbildung von Stammzellnischen eines Knochenmarks; Fig. 10: eine Detaildarstellung der in Fig. 9 gezeigten
Nachbildung;
Fig. 11: eine dritte bevorzugte Ausführungsform der
erfindungsgemäßen Nachbildung von Stammzellnischen eines Knochenmarks; Fig. 12: eine vierte bevorzugte Ausführungsform der erfindungsgemäßen Nachbildung von Stammzellnischen eines Knochenmarks; und Fig. 13: eine fünfte bevorzugte Ausführungsform der
erfindungsgemäßen Nachbildung von Stammzellnischen eines Knochenmarks in einer Anreihung.
Fig. 1 zeigt das Ziel einer bevorzugten Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahrens in einer Querschnittsdarstellung, nämlich der Aufbau einer hierarchischen Struktur in Form eines strukturierten Substrates, welches eine Vielzahl an
Stammzellnischen eines biologischen Gewebes eines Organismus synthetisch nachbildet, bestehend aus einer groben
Mesostruktur Ol, einer feinen Mikrostruktur 02 und einer noch feineren Nanostruktur 03. Hierfür werden bevorzugt
thermoplastische Folien mit unterschiedlichen Methoden
strukturiert. Anschließend erfolgt eine Kultivierung von hämatopoietischen Stammzellen (nicht dargestellt) mit dem Ziel der Aufrechterhaltung ihres undifferenzierten Status.
Fig. 2 zeigt ein erfindungsgemäß erstelltes Originalbild A eines Knochenmarksabschnittes und daraus erfindungsgemäß erzeugte Binärbilder B, C, D, E nach Anwendung von
Kantendetektor-Algorithmen. Die Binärbilder B, C, D, E stellen Strukturbilder dar, welche ausgehend von dem Originalbild A gewonnen wurden. Die Binärbilder B, C, D, E zeigen Kanten, welche Wandungen von Stammzellnischen im Knochenmark
repräsentieren. Die Kanten wurden aus dem Originalbild A, welches ein Grauwert- oder RGB-Bild sein kann, mit
verschiedenen Algorithmen detektiert. Hier gezeigt sind die bevorzugten Kantendetektionsalgorithmen nach Canny B, Sobel C, Prewitt D und Roberts E.
Fig. 3 zeigt einen Vergleich zwischen dem bereits in Fig. 2 gezeigten Originalbild A und einem erfindungsgemäß erstellten
Binärbild nach Anwendung des Canny-Detektors . Es sind das Originalbild des Knochenmarkschnittes A und das Originalbild mit überlagerten, extrahierten Strukturen nach einer
Kantendetektion mit dem Canny-Detektor B dargestellt.
Fig. 4 zeigt ein Flussdiagramm einer Erzeugung
lithographischer Masken aus Daten eines Abbildes eines
mindestens eine Stammzellnische umfassenden Gewebes gemäß einer bevorzugten Ausführungsform der Erfindung. Das
Flussdiagramm beschreibt den Ablauf der Extrahierung von
Strukturen aus einer Bilddatei unter der Verwendung von verschiedenen Algorithmen der Binärbilderstellung und deren Verwendung im Design einer Photomaske. Nach einer Auswahl 11 einer Bilddatei und Einlesen 12 der Daten der Bilddatei in ein Computerprogramm zur Lösung mathematischer Probleme wird die
Bilddatei aus dem RGB-Farbraum bzw. aus einem Grauwertbereich in ein Binärbild 13 umgewandelt. Durch Verwendung eines
Kantendetektionsalgorithmus 14 und einer lokalen
Schwellenwertberechnung 16 werden Strukturbilder gewonnen. Es erfolgt eine Auswahl 17 der geeignetsten Strukturbilder. Die
Strukturbilder werden einer Vektorisierung 18 unterzogen, sodass Vektordaten gewonnen werden. Aus den Vektordaten werden lithographische Masken 19 erstellt. Fig. 5 zeigt Rasterelektronenmikroskopaufnahmen von
erfindungsgemäß heißgeprägten Polycarbonatfolien . Durch
Heißprägen wurden mit einer lithographischen Maske, die aus einer durch Abbilden und Filtern erhaltenen Knochenmarkstruktur erstellt wurde, 50 ym dicke
Polycarbonatfolien mit feinen Strukturen strukturiert.
Fig. 6 zeigt weitere Rasterelektronenmikroskopaufnahmen der in Fig.5 gezeigten Polycarbonatfolien nach einem Thermoformen .
Nach dem Heißprägen mit einer durch Abbilden und Filtern erhaltenen Knochenmarkstruktur wurden die 50 ym dicken Folien in einem Mikrothermoformprozess ergänzend mit einer groben Struktur strukturiert. Dafür wurden Formwerkzeuge mit
Kavitäten verwendet. Die Kavitäten dieser Formwerkzeuge haben einen Durchmesser von 300 ym und eine Tiefe von ebenfalls 300 ym. Damit sind diese Strukturen aufgrund ihrer Größe denen im trabekulären Knochen sehr ähnlich. Dabei kommen die
markierten Ausformungen dem Original am nächsten.
Fig. 7 zeigt ein Flussdiagramm einer physikalischen
Oberflächenmodifikation gemäß einer bevorzugten
Ausführungsform der Erfindung. Das Flussdiagramm zeigt den Ablauf der physikalischen Oberflächenmodifikation zum Aufbau einer hierarchischen Architektur eines erfindungsgemäß
herzustellenden strukturierten Substrates. Nach der in Fig. 4 veranschaulichen Erstellung einer lithographischen Maske 21 und nach einer Prozessierung eines Wafers 22 wird ein
Silikonabguss 23 eines Masters hergestellt, wodurch eine Folie resultiert. Danach erfolgt die Modifikation der Folie in einem
Heißprägeschritt 24 mit einem Werkzeug, welches durch Anwenden einer lithographischen Maske erstellt wurde, die aus einer durch Abbilden und Filtern erhaltenen Struktur eines
Knochenmarks erzeugt wurde. Anschließend werden in einem
Mikrothermoformprozess 25 Strukturen eines trabekulären
Knochens eingeprägt, wofür ein weiteres Werkzeug verwendet wird, welches durch Anwenden der lithographischen Maske erstellt wurde. In einem finalen Prozessschritt erfolgt das Aufbringen einer Nanostruktur 26 durch Dip-Coating und
Inkubieren der Folie in einer Lösung oder Ätzen.
Fig. 8 zeigt eine Rasterelektronenmikroskopaufnahme einer ersten bevorzugten Ausführungsform einer erfindungsgemäßen
Nachbildung von Stammzellnischen eines Knochenmarks. Diese Ausführungsform ist durch ein strukturiertes Substrat aus Polydimethylsiloxan gebildet, welches in einer Form abgegossen wurde .
Fig. 9 zeigt eine Rasterelektronenmikroskopaufnahme einer zweiten bevorzugten Ausführungsform der erfindungsgemäßen Nachbildung von Stammzellnischen eines Knochenmarks. Diese Ausführungsform ist durch ein strukturiertes Substrat aus Silicium gebildet, welches mit einem Prägewerkzeug (nicht gezeigt) strukturiert wurde.
Fig. 10 zeigt eine Detaildarstellung der in Fig. 9 gezeigten Nachbildung .
Fig. 11 zeigt eine Rasterelektronenmikroskopaufnahme einer dritten bevorzugten Ausführungsform der erfindungsgemäßen Nachbildung von Stammzellnischen eines Knochenmarks. Diese Ausführungsform ist durch ein strukturiertes Substrat aus Silicium gebildet, welches durch ein reaktives Ionenätzen strukturiert wurde.
Fig. 12 zeigt eine Rasterelektronenmikroskopaufnahme einer vierten bevorzugten Ausführungsform der erfindungsgemäßen Nachbildung von Stammzellnischen eines Knochenmarks. Diese
Ausführungsform ist durch ein strukturiertes Substrat aus einem Borosilikatglas gebildet, bei welchem zur Strukturierung Kanten verrundet wurden. Fig. 13 zeigt eine Rasterelektronenmikroskopaufnahme einer fünften bevorzugten Ausführungsform der erfindungsgemäßen Nachbildung von Stammzellnischen eines Knochenmarks. Bei dieser Ausführungsform ist eine extrahierte Struktur zur großflächigen Reproduktion mehrfach aneinandergereiht.
Bezugszeichenliste
01 Mesostruktur
02 Mikrostruktur
03 Nanostruktur
04
05
06
07
08
09
10
11 Auswahl einer Bilddatei
12 Einlesen der Daten der Bilddatei
13 Binärbild
14 Kantendetektionsalgorithmus
15
16 lokale Schwellenwertberechnung
17 Auswahl der geeignetsten Strukturbilder
18 Vektorisierung
19 lithographische Masken
20
21 Erstellung einer lithographischen Maske
22 Prozessierung eines Wafers
23 Silikonabguss
24 Heißprägeschritt
25 Mikrothermoformprozess
26 Aufbringen einer Nanostruktur
Next Patent: APPLICATION PEN WITH AN INCLINED TIP END