CN101948859A | 2011-01-19 |
权利要求书 一种分离的多核苷酸, 其特征在于, 其核苷酸序列如 SEQ ID NO: 1所 示。 一种载体, 其特征在于, 它含有权利要求 1所述的多核苷酸。 一种重组载体, 含有如 SEQ ID NO:2所示的序列, 所述重组载体是以 pLVX-shRNAl为骨架载体, 在 重组位点处插入顺序连接的由 Bam HI酶切位点 +靶核苷酸序歹 ij+茎环 结构序列 +靶核苷酸序列互补序列 +终止位点序列 +EcoR I酶切位点组 成的 shRNA寡核苷酸序列。 一种权利要求 3所述的 TNLG5A基因的 RNAi表达载体的制备方法, 其 特征在于, 包括如下步骤: A) shRNA寡核苷酸序列的设计: 根据 TNLG5A的 mRNA全序列, 经 BLAST同源性比对证实特异性后应用 RNA Stmcture4.4软件对靶 mRNA序列的二级结构进行评估得到靶核苷酸序 列, 设计并合成靶向 TNLG5 A基因的 shRNA寡核苷酸序列; B) TNLG5A基因的 RNAi表达载体的构建和鉴定: 将合成的 shRNA寡 核苷酸单链按等摩尔比混合, 退火形成双链的 shRNA, 提取质粒 pLV X-shRNAl , 用限制性内切酶 Bam HI、 EcoR I双酶切, 电泳、 切胶回 收载体, 再用 T4 DNA Ligase分别将双链 shRNA连接 SJpLVX-shRNA 1 表达载体中, 得到连接产物; 将连接产物转化到感受态大肠杆菌 Stbl 3中, 均匀涂布到含氨苄青霉素 LB培养基平板上, 挑取阳性单克隆菌 落培养保存并进行 PCR鉴定, 将初步鉴定结果说明 shRNA寡核苷酸序 列插入成功的菌液进行测序鉴定; C) TNLG5A基因的 RNAi表达载体的抽提: 将测序结果证实 shRNA寡 核苷酸序列插入成功的菌液扩增培养, 进行大量抽提重组质粒, 得到 TNLG5A基因的 RNAi表达载体。 一种权利要求 1所述的多核苷酸或权利要求 2所述的重组载体或权利要 求 3所述的 TNLG5 A基因的 RNAi表达载体在治疗 TNLG5 A基因表达异 常相关疾病的应用。 |
[0001] 本发明属于基因工程领域, 涉及一种 RNAi表达载体及其构建方法和应用, 尤 其涉及一种 TNLG5 A基因的 RNAi表达载体、 构建方法及其应用。
背景技术
[0002] ILA属于 TNFR超家族, 主要表达于活化的 T细胞中, 是一种可诱导的 T细胞表 面受体; TNLG5A属于 TNF超家族, 主要表达在集中抗原呈递细胞 (APC) 。 IL A/TNLG5A是 CD28/B7之外的另一重要的共刺激分子, 可依赖或不依赖于 CD28/
B7途径而介导产生协同刺激信号, 诱导 T细胞的活化、 增殖与细胞因子的分泌。 技术问题
[0003] ILA及其配体系统存在双向信号传导, 既可通过 TNLG5A向 T细胞传递细胞, 又 可将信号传向表达配体的细胞, 其在肿瘤的免疫治疗中起重要的作用, 需做大 量研究方可实现临床转化, 但现有技术中缺乏特异抑制 TNLG5A基因表达的 RN Ai表达载体使得相关研究无法很好地幵展。
问题的解决方案
技术解决方案
[0004] 本发明的目的是 TNLG5A基因的 RNAi表达载体、 构建方法及其应用。
[0005] 在本发明的第一方面, 提供一种分离的多核苷酸, 其核苷酸序列如 SEQ ID ΝΟ:1所示。
[0006] 在本发明的另一方面, 提供一种重组载体, 含有如 SEQ ID NO:2所示的核苷酸 序列, 所述重组载体是以 pLVX-shRNAl载体为骨架载体, 在多克隆酶切位点处 插入顺序连接的由 Bam HI酶切位点 +靶核苷酸序列 +茎环结构序列 +靶核苷酸序列 互补序列 +终止位点序列 +EcoR I酶切位点组成的 shRNA寡核苷酸序列。
[0007] 在本发明的另一方面, 提供一种前述的 TNLG5 A基因的 RNAi表达载体的制备 方法, 包括如下步骤:
[0008] A) shRNA寡核苷酸序列的设计: 根据 TNLG5A的 mRNA全序列, 经 BLAST同 源性比对证实特异性后应用 RNA structure 软件对靶 mRNA序列的二级结构进 行评估得到靶核苷酸序列, 设计并合成靶向 TNLG5A基因的 shRNA寡核苷酸序列
[0009] B) TNLG5A基因的 RNAi表达载体的构建和鉴定: 将合成的 shRNA寡核苷酸单 链按等摩尔比混合, 退火形成双链的 shRNA, 提取质粒 pLVX-shRNAl, 用限制 性内切酶 Bam HI、 EcoR I双酶切, 电泳、 切胶回收载体, 再用 T4 DNA Ligase分 别将双链 shRNA连接到 pLVX-shRNAl表达载体中, 得到连接产物; 将连接产物 转化到感受态大肠杆菌 Stbl3中, 均匀涂布到含氨苄青霉素 LB培养基平板上, 挑 取阳性单克隆菌落培养保存并进行 PCR鉴定, 将初步鉴定结果说明 shRNA寡核苷 酸序列插入成功的菌液进行测序鉴定;
[0010] C) TNLG5 A基因的 RNAi表达载体的抽提: 将测序结果证实 shRNA寡核苷酸序 列插入成功的菌液扩增培养, 进行大量抽提重组质粒, 得到 TNLG5A基因的 RN Ai表达载体。
[0011] 本发明利用 RNAi技术构建靶向 TNLG5A基因表达的 RNAi表达载体, 经鉴定构 建成功后, 电转 Jurkat细胞, 使用实吋荧光定量 PCR技术从 mRNA水平验证 TNLG 5A基因表达的抑制效果, 实验结果证明本发明提供的 shRNA寡核苷酸成功插入 至 pLVX-shRNAl表达载体中, 且对 TNLG5A基因表达的抑制效果显著。
[0012] 在本发明的另一方面, 提供一种 SEQ ID ΝΟ:1所示的多核苷酸或含有 SEQ ID ΝΟ:1所示的多核苷酸的载体或前述 TNLG5A基因的 RNAi表达载体在 TNLG5A基 因表达异常相关疾病的药物中的用途。
发明的有益效果
有益效果
[0013] 本发明提供的 TNLG5 A基因的 RNAi表达载体具有转染效率高, 用量少, 可高 效、 特异地抑制 Jurkat细胞 TNLG5A基因表达的优点, 可作为有力工具应用于制 备治疗 TNLG5A基因表达异常相关疾病的药物。
对附图的简要说明
附图说明
[0014] 图 1为转染 TNLG5A基因的 RNAi表达载体细胞的荧光定量 PCR检测结果示意图 实施该发明的最佳实施例
本发明的最佳实施方式
[0015] 下面结合附图与具体实施例对本发明做进一步 的说明。
[0016] Jurkat细胞购自上海生命科学院细胞资源中心, RNAi载体 pLVX-shRNAl购自 C1 ontech公司, RNeasyMiniKit购自 Qiagen公司, 无内毒素质粒提取试剂盒购自 Ome ga bio-tek公司。 下文所述完全培养基为加入了 10%胎牛血清的细胞培养基。
[0017] 实施例一靶向 TNLG5A基因的 shRNA寡核苷酸序列的设计
[0018] 在 GenBank査找 SJTNLG5A的 mRNA全序列, 经 BLAST同源性比对证实特异性 后应用 RNAstmcture 4.4软件对靶 mRNA序列的二级结构进行评估, 最后获得靶 核苷酸序列。
[0019] 根据靶核苷酸序列设计合成 shRNA。 设计如下: B a m HI酶切位点+19 n t靶核苷 酸序列 +茎环结构 (TTCAAGAGA) +靶序列互补序列 +RNAPolym聚合酶转录中 止位点 (TTTTTT) +EcoR I酶切位点六个区域, 其序列如 SEQ ID NO: 1所示。 设 计的 shRNA寡核苷酸链由上海生工生物工程技术服务 限公司合成。
[0020] 实施例二 TNLG5A基因的 RNAi表达载体的构建。
[0021] 将合成的 shRNA寡核苷酸单链等量混合, 退火形成双链的 shRNA, 提取质粒 pL VX-shRNAl , 用限制性内切酶 Bam HI、 EcoR I双酶切, 电泳、 切胶回收载体, 再用 T4 DNA Ligase将双链 shRNA连接到载体 pLVX-shRNAl中, 形成 TNLG5A基 因的 RNAi表达载体。 将连接产物转化到感受态大肠杆菌 Stbl3中, 涂布到含氨苄 青霉素 LB培养基的平板上, 于 37°C培养 14 h。 挑取长出的菌落, 送至上海生工 测序。 测序结果与所设计的序列完全相符, 可用于后续实验。
[0022] 实施例三 Jurkat细胞的电转
[0023] 培养 Jurkat细胞, 取生长状态良好的细胞 5000000个, 离心收集细胞, 然后重悬 于 500 μL PBS中, 与 20 μ β TNLG5 Α基因的 RNAi表达载体混匀后加入电击杯, 应 用 BTX ECM830电转仪进行电转, 电转程序: 2.5 KV, 25 FD, 脉冲电击一次; 将细胞转移至含 5 mL DMEM完全培养基的 6
cm皿中, 轻轻晃动皿使细胞混匀, 48 h后检测 TNLG5A基因表达情况。 [0024] 实施例四荧光定量 PCR检测 TNLG5A基因表达量
[0025] 分别培养正常 Jurkat细胞和电转 TNLG5A基因的 RNAi表达载体的 Jurkat细胞 48 h , 用 RNeasy Mini Kit提取各组细胞的总 RNA, 利用 PrimeScript RT reagent Kit将 mRNA逆转录为 cDNA, 逆转录条件: 37°C, 15min; 85°C, 5s; 4°C, ∞。 反转录结束后, 加入 90μ1的 RNase-Free dH20稀释 cDNA, -20°C保存, 以便后面 检测使用。 取各组细胞的 cDNA 1
为模板, 以 GAPDH为内参, 实吋荧光定量 PCR (QPCR) 检测 TNLG5A相对表 达量, 设置反应条件: 95°C 10s, 1个循环; 95°C 5s, 54°C 30s, 共 40个循环, 利用 SYBR PrimeScript RT-PCR Kit检测各组细胞 TNLG5 A基因相对表达量, 结果 如图 1所示。 结果显示转染 TNLG5 A基因的 RNAi表达载体的 Jurkat细胞, TNLG5 A基因表达明显受到抑制, shRNA片段对目的基因的抑制效率达 77.1%±6.8<¾, 从 而证明本实验中采用的 TNLG5A基因的 RNAi表达载体能特异抑制 TNLG5A基因 的表达, 且抑制效果非常显著。
[0026] 以上内容是结合具体的优选实施方式对本发明 所作的进一步详细说明, 不能认 定本发明的具体实施只局限于这些说明。 对于本发明所属技术领域的普通技术 人员来说, 在不脱离本发明构思的前提下, 还可以做出若干简单推演或替换, 都应当视为属于本发明的保护范围。
工业实用性
[0027] 本发明提供的 TNLG5 A基因的 RNAi表达载体具有转染效率高, 用量少, 可高 效、 特异地抑制 Jurkat细胞 TNLG5A基因表达的优点, 可作为有力工具应用于制 备治疗 TNLG5A基因表达异常相关疾病的药物。