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Title:
USE OF A NUCLEOTIDE SEQUENCE THAT REGULATES FLOWERING TIME, PLANTS EXPRESSING SAME AND PRODUCTION METHOD THEREOF
Document Type and Number:
WIPO Patent Application WO/2010/094825
Kind Code:
A1
Abstract:
The present invention relates to a nucleotide sequence coding for an amino acid sequence of a unicellular green alga, Chlamydomonas reinhartii, which is expressed in a plant cell from a flowering plant. The expression of the sequence is used to alter the flowering time of a plant that contains the transfected plant cells. In addition, the present invention relates to a method for producing the cells and/or plants of the invention.

Inventors:
VALVERDE ALBACETE FEDERICO (ES)
SERRANO DELGADO AURELIO (ES)
ROMERO RODRIGUEZ JOSE MARIA (ES)
Application Number:
PCT/ES2010/070056
Publication Date:
August 26, 2010
Filing Date:
February 02, 2010
Export Citation:
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Assignee:
CONSEJO SUPERIOR INVESTIGACION (ES)
UNIV SEVILLA (ES)
VALVERDE ALBACETE FEDERICO (ES)
SERRANO DELGADO AURELIO (ES)
ROMERO RODRIGUEZ JOSE MARIA (ES)
International Classes:
C12N15/29; A01H5/00; C12N15/82
Domestic Patent References:
WO1996014414A11996-05-17
Other References:
ROMERO J.M. ET AL.: "Evolutionary conserved photoperiod mechanism in plants", PLANT SIGNALING AND BEHAVIOUR, vol. 4, no. 7, July 2009 (2009-07-01), pages 642 - 644, XP055102854
DATABASE UNIPROT [online] 4 December 2007 (2007-12-04), MERCHANT S.S. ET AL: "The Chlamydomonas Genome reveals the evolution of Key Animal and Plant Functions", XP055027757, accession no. EBI Database accession no. A8J936
KIM S.J. ET AL.: "Molecular cloning and expression analysis of a CONSTANS homologue, Pncoll from Pharbitis nil", JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY, vol. 54, no. 389, August 2003 (2003-08-01), pages 1879 - 1887, XP055102870
YANO M. ET AL.: "Hd1,a Major Photoperiod Sensitivity Quantitative Trait Loocus in Rice, is Closely Related to the Arabidopsis Flowering Time Gene CONSTANS", THE PLANT CELL, vol. 12, December 2000 (2000-12-01), pages 2473 - 2483, XP002941717
BÄURLE ET AL., CELL, vol. 125, 2006, pages 655 - 664
KOBAYASHI, WEIGEL, GENES DEV., vol. 21, 2007, pages 2371 - 2384
SUAREZ-LOPEZ ET AL., NATURE, vol. 410, 2001, pages 116 - 1120
SAWA ET AL., SCIENCE, vol. 318, 2007, pages 261 - 265
VALVERDE ET AL., SCIENCE, vol. 303, 2004, pages 1003 - 1006
JANG ET AL., EMBO J., vol. 27, 2008, pages 1277 - 1288
CORBESIER ET AL., SCIENCE, vol. 316, 2007, pages 1030 - 1033
BOHLENIUS ET AL., SCIENCE, vol. 312, 2006, pages 1040 - 1043
ZOBELL ET AL., PLANT BIOL., vol. 7, 2005, pages 266 - 275
ROBSON ET AL., PLANT J., vol. 28, 2001, pages 619 - 631
LEDGER ET AL., PLANT J., vol. 26, 2001, pages 15 - 22
MERCHANT ET AL., SCIENCE, vol. 318, 2007, pages 245 - 251
MITTAG ET AL., PLANT PHYSIOL., vol. 137, 2005, pages 399 - 409
BIZOVA ET AL., PLANT PHYSIOL., vol. 137, 2005, pages 475 - 491
MATSUO ET AL., GENES DEV., vol. 22, 2008, pages 918 - 930
GOTO, JOHNSON, J. CELL BIOL., vol. 129, 1995, pages 1061 - 1069
MOULAGER ET AL., PLANT PHYSIOL., vol. 144, 2007, pages 1360 - 1369
SUAREZ-L6PEZ ET AL., NATURE, vol. 410, 2001, pages 116 - 1120
Attorney, Agent or Firm:
PONS ARIÑO, Ángel (ES)
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Claims:
REIVINDICACIONES

1. Uso de un ácido nucleico aislado que comprende una secuencia nucleotídica que codifica una secuencia aminoacídica con al menos un 90% de identidad con Ia secuencia SEQ ID NO: 1 , para regular el momento de floración de una planta.

2. Uso de un ácido nucleico según Ia reivindicación 1 que comprende una secuencia nucleotídica que codifica una secuencia aminoacídica de un alga verde con al menos un 50% de identidad con Ia secuencia SEQ ID

NO: 1.

3. Uso de un ácido nucleico según cualquiera de las reivindicaciones 1 ó 2 donde Ia secuencia nucleotídica codifica Ia secuencia aminoacídica SEQ ID NO: !

4. Uso de un vector de expresión que comprende el ácido nucleico según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3.

5. Uso de una célula transfectada con el vector de expresión según Ia reivindicación 4.

6. Uso de Ia célula según Ia reivindicación 5 que comprende cualquier producto de Ia expresión del ácido nucleico aislado.

7. Uso según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6 donde el ácido nucleico aislado está unido funcionalmente a una secuencia reguladora de Ia expresión génica.

8. Uso según Ia reivindicación 7 donde Ia secuencia reguladora de Ia expresión génica es SEQ ID NO: 2 o SEQ ID NO: 3.

9. Uso según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 donde Ia planta pertenece a Ia especie Arabidopsis thaliana.

10. Uso según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 donde Ia planta pertenece a Ia especie Solanum lycopersicum.

11.CeIuIa aislada transfectada con un ácido nucleico aislado que comprende una secuencia nucleotídica que codifica una secuencia aminoacídica con al menos un 90% de identidad con Ia secuencia SEQ ID NO: 1.

12.CeIuIa según Ia reivindicación 11 que comprende una secuencia nucleotídica de un alga verde que codifica una secuencia aminoacídica con al menos un 50% de identidad con Ia secuencia SEQ ID NO: 1.

13.CeIuIa según cualquiera de las reivindicaciones 11 ó 12 que comprende una secuencia nucleotídica que codifica Ia secuencia aminoacídica SEQ ID NO: 1.

14. Planta que comprende Ia célula según cualquiera de las reivindicaciones 11 a 13.

15. Planta según Ia reivindicación 14 que pertenece a Ia especie Arabidopsis thaliana.

16. Planta según Ia reivindicación 14 que pertenece a Ia especie Solanum lycopersicum.

17. Polen, semilla, propágulo, progenie o parte de Ia planta que procede de cualquiera de las plantas según las reivindicaciones 14 a 16.

18. Método para Ia obtención de Ia célula según cualquiera de las reivindicaciones 11 a 13, que comprende: a. insertar Ia secuencia nucleotídica que codifica para SEQ ID NO:

1 en un vector, b. transformar una célula con el vector obtenido según el apartado

(a) y c. seleccionar Ia célula transformada según el apartado (b) que comprende Ia secuencia nucleotídica que codifica para SEQ ID NO: 1.

19. Método para obtener una planta según cualquiera de las reivindicaciones 14 a 16 que comprende: a. regenerar al menos una planta procedente de Ia célula obtenida según el apartado (c) de Ia reivindicación 18, b. seleccionar una o varias plantas regeneradas según el apartado

(d) que expresa, al menos, Ia secuencia nucleotídica que codifica para SEQ ID NO: 1 y c. seleccionar una o varias plantas obtenidas según el apartado (b) que presenta un adelanto de Ia floración respecto de una planta control.

20. Método según cualquiera de las reivindicaciones 18 ó 19 donde Ia secuencia nucleotídica que codifica para SEQ ID NO: 1 está unida funcionalmente a una secuencia reguladora de Ia expresión génica.

Description:
USO DE UNA SECUENCIA NUCLEOTÍDICA QUE REGULA EL

MOMENTO DE LA FLORACIÓN, PLANTAS QUE LA EXPRESAN Y

MÉTODO PARA PRODUCIRLAS

La presente invención se refiere a una secuencia nucleotídica que codifica para una secuencia aminoacídica de un alga verde unicelular, Chlamydomonas reinhartii, que es expresada en una célula vegetal procedente de una planta capaz de producir flores. La expresión de Ia secuencia se utiliza para modificar el momento de Ia floración de una planta que comprende las células vegetales transfectadas. Asimismo, Ia presente invención se refiere a un método para producir las células y/o las plantas de Ia invención.

ESTADO DE LA TÉCNICA ANTERIOR

La transición floral es un proceso de desarrollo crucial para las plantas porque el tiempo en que se reproducen determina el éxito del individuo y su descendencia. Para desencadenar Ia transición floral, las plantas deben coordinar Ia respuesta a diferentes señales externas e internas para poder inducir Ia expresión de los genes que disparan Ia transición del meristemo apical de vegetativo a reproductivo (Báurle et al., 2006. CeII 125: 655-664). El control de CONSTANS [CO) a nivel transcripcional y postraduccional, es central para Ia vía del fotoperiodo, una de las rutas más conservadas para Ia regulación de Ia transición floral (Kobayashi y Weigel. 2007. Genes DeV 1 21 : 2371-2384).

La transcripción de CO en Ia planta modelo Arabidopsis thaliana se controla mediante el reloj circadiano y el fotoperiodo, Io que induce una mayor abundancia del ARN mensajero de CO durante Ia fase diurna en un día largo de verano que en un día corto de invierno (Suárez-López et al., 2001. Nature 410: 116-1120). Estos ritmos estacionales y diarios de los niveles del transcrito de CO se regulan por una ruta genética que incluye a los genes GIGANTEA, FLAVIN-BINDING, KELCH REPEAT, F-BOX 1 y CYCLIN DOF FACTOR 1 (Sawa et al., 2007. Science 318: 261-265). La acumulación diurna de CO está influenciada por Ia luz, bajo el control del sistema de los fitocromos (Valverde et al., 2004. Science 303: 1003-1006) y se degrada por el proteasoma durante Ia noche mediante Ia ubiquitina ligasa CONSTITUTIVE PHOTOMORPHOGENIC 1 (COP1 ), un regulador clave del desarrollo fotomorfogénico de plántulas (Jang et al., 2008. EMBO J. 27: 1277-1288). Estos ciclos diurnos y nocturnos de degradación de CO, junto a Ia regulación circadiana y estacional de Ia expresión del ARN mensajero de CO hacen que CO se active durante Ia tarde de un día largo. CO activo produce Ia expresión del integrador floral FT en el floema foliar y Ia proteína FT se mueve desde las hojas hasta el meristemo apical (Corbesier et al., 2007. Science 316: 1030-1033). Una vez en el meristemo apical, FT, junto al factor de transcripción FD, induce Ia expresión de los integradores florales APETALA1, SUPPRESSOR OF OVEREXPRESSOR OF CONSTANS 1 {SOC1), LEAFY y, eventualmente de los genes homeóticos florales que controlan el desarrollo de los órganos florales.

El módulo CO-FT está ampliamente distribuido en fanerógamas y gimnospermas y constituye uno de los elementos regulatorios más conservados en Ia inducción de Ia floración (Bohlenius et al., 2006. Science 312: 1040-1043). En todas las plantas terrestres, incluyendo el musgo Physcomitrella (Zobell et al., 2005. Plant Biol. 7: 266-275) y Ia licofita Selaginella (este trabajo), existen genes homólogos a CO (CO- li¡kes o COLs), pero no se encuentran en bacterias, hongos, y animales (Robson et al., 2001. Plant J. 28: 619-631 ). Sin embargo, con Ia excepción de algunos genes de plantas superiores como HEADING DATE 1 (HD1) en arroz, (PnCO) en Pharbitis nil o recientemente el de remolacha (BvCOLI), ningún gen COL de Ia línea evolutiva de plantas ha podido complementar Ia mutación co de Arabidopsis y por tanto mostrar una función en Ia transición de fase vegetativa a floral. La proteína COL1 , de Arabidopsis, con un porcentaje de similaridad de un 85 % con respecto a CO, no tiene Ia misma función que CO ya que no consigue complementar al muíante co (Ledger et al., 2001. Plant J. 26: 15-22). Intentos previos han fracasado a Ia hora de demostrar Ia presencia de un ortólogo verdadero de CO en el musgo Physcomitrella (Zobell et al., 2005. Plant Biol. 7: 266-275).

Chlamydomonas reinhardtii es un alga verde unicelular que se usa como organismo modelo dada su facilidad de transformación, su potente genética, su versatilidad metabólica y su genoma haploide, cuya secuencia completa fue recientemente liberada (Merchant et al., 2007. Science 318: 245-251 ). Ciertos procesos como Ia fototaxia, el crecimiento sincrónico y Ia acumulación de almidón se regulan mediante el reloj circadiano en Chlamydomonas (Mittag et al., 2005. Plant Phvsiol. 137: 399-409) En ésta y otras microalgas verdes el crecimiento se sincroniza con el ciclo celular en determinados fotoperiodos, de manera que Ia mayor parte de Ia población de un cultivo se compondrá, en un momento determinado, de células en el mismo estadio de división (Bizova et al., 2005. Plant Phvsiol. 137: 475-491 ). Se conoce un muíante de Chlamydomonas {roc66) que exhibe un periodo algo más amplio en su ritmo de crecimienío que el alga silvesíre (Maísuo et al., 2008. Genes Dev. 22: 918-930). Además, se ha demosírado que el reloj circadiano puede permiíir Ia enírada en ciclo celular en Chlamydomonas (Goío y Johnson, 1995. J. CeII Biol. 129: 1061- 1069) y que el foíoperiodo íiene íambién una enorme influencia en esía señal y en Ia progresión del ciclo celular en Ostreococcus taurí, oíra microalga verde (Moulager et al., 2007. Plañí Phvsiol. 144: 1360-1369). El adelanto de Ia producción de los frutos puede suponer una ventaja comercial. La búsqueda de herramientas genéticas que permitan aproximar Ia floración Io más posible a un determinado tiempo dentro del ciclo de cultivo, que haga coincidir Ia recolección del fruto con Ia época más adecuada de mercado, puede suponer un aumento del rendimiento en Ia producción de los cultivos experimentados.

EXPLICACIÓN DE LA INVENCIÓN

La presente invención se refiere a una secuencia de nucleótidos que codifica para una secuencia de aminoácidos del alga verde unicelular Chlamydomonas reinhardtii que es transfectada en una célula vegetal procedente de una planta capaz de producir flores. La expresión del gen se utiliza para modificar el momento de Ia floración de una planta que comprende las células vegetales que expresan Ia citada secuencia.

La secuencia SEQ ID NO: 1 y Ia secuencia aminoacídica de Ia proteína CONSTANS (CO) de Arabidopsis thaliana tienen una identidad de un 27% y Ia identidad con otras proteínas COL procedentes de plantas es de entre 20 y 30%. La baja identidad no hace pensar a priorí en un posible uso relacionado con Ia función de las proteínas citadas, sobre todo, tendiendo en cuenta que proteínas como COL1 , cuyo gen pertenece al mismo genoma de Arabidopsis thaliana, tiene una identidad de un 85% con Ia proteína CO y sin embargo, no desempeña Ia misma función que CO, ya que parece no conseguir complementar Ia función de esta proteína en plantas de Arabidopsis thaliana mutantes para CO (plantas co).

Por tanto, no se puede deducir, dado el bajo porcentaje de identidad mencionado anteriormente, que Ia secuencia SEQ ID NO: 1 sea funcionalmente equiparable a CO, como demuestra el hecho de que pueda complementar la mutación co e incluso promover floración temprana en Arabidopsis. La planta utilizada para llevar a cabo los experimentos de complementación e inducción de adelanto en Ia floración, Arabidopsis thaliana, se ha venido utilizando como planta modelo en innumerables procesos biotecnológicos demostrando que los resultados obtenidos son extrapolables a cualquier otra especie de planta, especialmente los procesos conservados en el reino vegetal como es el caso de Ia regulación de Ia floración por medio de Ia proteína CO. La transformación de esta planta se ha empleado a modo de ejemplo porque las técnicas de transformación y seguimiento de Ia expresión de los genes recombinantes están optimizadas.

De los resultados obtenidos en Ia presente invención no deben conducir a un análisis ex post-facto, ya que del porcentaje de identidad de un 27% de SEQ ID NO: 1 respecto de CO no se desprende un resultado presumible que haga pensar en un posible uso de SEQ ID NO: 1 para acelerar Ia floración de cualquier planta ya que solamente llevando a cabo Ia transformación de dicha secuencia en el genoma de Ia planta se puede comprobar el resultado en Ia floración. En definitiva, Ia identidad de los genes no hace obvia Ia funcionalidad de SEQ ID NO: 1.

La aplicación del uso de Ia secuencia SEQ ID NO: 1 de Ia presente invención en diferentes plantas cuyo fruto tenga interés comercial, puede suponer un adelanto sustancial de Ia floración y como consecuencia, puede adelantar Ia producción de los frutos, Io que supone una ventaja comercial respecto de los frutos producidos por plantas que no comprendan Ia proteína de Ia presente invención. Por otra parte, Ia estimulación del adelanto de Ia floración en los cultivos de plantas permitiría, en principio, intentar aproximar Ia floración Io más posible a un determinado tiempo dentro del ciclo de cultivo, que haga coincidir Ia posterior recolección del fruto con Ia época más adecuada de mercado, en una zona geográfica concreta. A menudo esto se concreta en el aumento de rendimiento en Ia producción de los cultivos experimentados.

En este sentido, el primer aspecto de Ia presente invención es el uso de un ácido nucleico aislado que comprende una secuencia nucleotídica que codifica una secuencia aminoacídica con al menos un 90% de identidad con Ia secuencia SEQ ID NO: 1 , para regular el momento de floración de una planta.

La secuencia SEQ ID NO: 1 es una secuencia aminoacídica codificada por una secuencia nucleotídica presente en el genoma del alga unicelular Chlamydomonas reinhardtii. El ácido nucleico aislado comprende al menos una secuencia nucleotídica que codifica o bien una secuencia con al menos un 90% de identidad con SEQ ID NO: 1 o bien que codifica para SEQ ID NO: 1. En estos aspectos de Ia presente invención, el ácido nucleico aislado puede ser Ia secuencia nucleotídica codificante (ADNc), como es el caso de SEQ ID NO: 14, o secuencias nucleotídicas con o sin intrones, por tanto queda incluida Ia secuencia de ADN genómico que codifica para SEQ ID NO: 1 (en adelante se harán referencia a las secuencias nucleotídicas como; secuencias nucleotídicas de Ia presente invención o de Ia invención). Es decir, incluyen secuencias de ácido nucleico cuyo producto de Ia transcripción, el ARN mensajero (ARNm) codifica para Ia misma secuencia de aminoácidos (en adelante, secuencia de aminoácidos de Ia presente invención o secuencia de aminoácidos de Ia invención). También se incluyen secuencias variantes degeneradas de las secuencias nucleotídicas de Ia invención, cuyo producto es una proteína con Ia misma función que Ia proteína codificada por Ia secuencia SEQ ID NO: 1. También se incluyen secuencias de aminoácidos que tengan modificaciones en su extremo N-terminal, C-terminal y/o en alguna posición aminoacídica interna de modo que Ia función de Ia proteína sea Ia misma que Ia que resulta de Ia traducción de Ia secuencia de ARNm transcrita a partir de Ia secuencia de nucleótidos de Ia invención. La secuencia de aminoácidos puede estar codificada por cualquier secuencia nucleotídica que de lugar a cualquiera de las secuencias de aminoácidos de Ia invención. Debido a que el código genético es degenerado, un mismo aminoácido puede ser codificado por diferentes codones (tripletes), por ello, Ia misma secuencia de aminoácidos puede ser codificada por distintas secuencias de nucleótidos.

Las secuencias aminoacídicas con, al menos, un 90% de identidad con SEQ ID NO: 1 son secuencias homologas de otros organismos o algas unicelulares donde Ia proteína que codifican tiene una función idéntica a Ia proteína codificada por el citado gen. Las secuencias homologas se refieren a secuencias de especies distintas con expresiones fenotípicas similares que proceden de una secuencia ancestral común. Dentro de Ia homología de secuencia se distinguen dos tipos de homología: Ia ortología y Ia paralogía. Las secuencias ortólogas pertenecen a especies que tienen un antepasado común. Las secuencias parálogas son aquellas que se encuentran en el mismo organismo y una procede de Ia duplicación de Ia otra. En este aspecto de Ia presente invención, se consideran todas las secuencias homologas, tanto ortólogas como parálogas, que tienen, al menos, un 90% de identidad con Ia secuencia aminoacídica SEQ ID NO: 1. Del mismo modo, quedan incluidas todas aquellas secuencias cuyo producto de Ia transcripción es idéntico a Ia secuencia de aminoácidos de Ia presente invención.

Una realización preferida es el uso de un ácido nucleico aislado que comprende una secuencia nucleotídica que codifica una secuencia aminoacídica de un alga verde con al menos un 50% de identidad con Ia secuencia SEQ ID NO: 1.

La identidad de Ia secuencia SEQ ID NO: 1 , procedente de Chlamydomonas reinhardtii con respecto a secuencias aminoacídicas de otras algas verdes, como por ejemplo, pero sin limitarse, Volvox, es de alrededor de un 60%, por tanto, en esta realización de Ia presente invención se incluye cualquier ácido nucleico aislado que comprende una secuencia nucleotídica que codifica para una secuencia aminoacídica, procedente de un alga verde, con al menos un 50% de identidad con respecto a Ia secuencia SEQ ID NO: 1.

Otra realización preferida de Ia presente invención es el uso de un ácido nucleico aislado que comprende una secuencia nucleotídica que codifica Ia secuencia aminoacídica SEQ ID NO: 1 para regular el momento de floración de una planta.

Tal como se describe en el apartado de ejemplos de Ia presente invención, Ia floración de plantas modelo de Arabidopsis thaliana que han sido transformadas con una secuencia nucleotídica que codifica para Ia secuencia de aminoácidos de Ia invención, son capaces de adelantar Ia floración respecto de plantas control que no contienen Ia secuencia SEQ ID NO: 1. Por tanto, Ia secuencia SEQ ID NO: 1 regula el momento de Ia floración de una planta. El término "regulación del momento de floración" se refiere a cambios del instante en el que se produce Ia transformación del meristemo apical vegetativo en meristemo floral, es decir, de Ia floración. Preferiblemente Ia secuencia de ácido nucleico de Ia invención se usa para adelantar el momento de Ia floración de una planta.

Otro aspecto más de Ia presente invención es el uso de un vector de expresión que comprende el ácido nucleico según cualquiera de los aspectos anteriores (en adelante, vector de Ia invención) para regular el momento de floración de una planta. El término "vector" se refiere a un fragmento de ADN que tiene Ia capacidad de replicarse en un determinado huésped y, como el término Io indica, puede servir de vehículo para multiplicar otro fragmento de ADN que haya sido fusionado al mismo (inserto). Inserto se refiere a un fragmento de ADN que se fusiona al vector; en el caso de Ia presente invención, el vector puede comprender cualquiera de las secuencias descritas según los aspectos anteriores que, fusionadas al mismo puede replicarse en el huésped adecuado. Los vectores pueden ser plásmidos, cósmidos, bacteriófagos o vectores virales, sin excluir otro tipo de vectores que se correspondan con Ia definición realizada de vector.

Un aspecto más es el uso de una célula transfectada con el vector de Ia invención que comprende Ia secuencia de nucleótidos que codifica para Ia secuencia aminoacídica SEQ ID NO: 1 (en adelante, célula de Ia invención) para regular el momento de floración de una planta.

El término "célula" tal como se entiende en Ia presente invención hace referencia a una célula procariótica o eucariótica. La célula puede ser una bacteria capaz de replicar un ADN ajeno transformado como por ejemplo cualquiera de las cepas de Ia especie Escheríchia coli o una bacteria capaz de transferir el ADN de interés al interior de una planta como por ejemplo Agrobacterium tumefaciens. Preferiblemente, Ia célula hace referencia a una célula eucariótica vegetal y dentro de este grupo, más preferiblemente, a aquellas células pertenecientes al reino Plantae. Así pues, en el caso de que Ia célula sea vegetal, el término célula comprende, al menos, una célula del parénquima, célula meristemática o de cualquier tipo, diferenciada o indiferenciada. Asimismo, también se incluye en esta definición un protoplasto (célula de una planta que carece de pared celular). El término "transfección" hace referencia a Ia introducción de material genético externo en células mediante plásmidos, vectores víricos (en este caso también se habla de transducción) u otras herramientas para Ia transferencia. El término transformación se prefiere para describir las transferencias no-virales de material genético en bacterias y células eucariotas no animales como hongos, algas o plantas.

Una realización preferida es el uso de Ia célula de Ia invención que comprende cualquier producto de Ia expresión del ácido nucleico aislado que codifica para Ia secuencia aminoacídica SEQ ID NO: 1.

El término "producto de Ia expresión" tal como se entiende en Ia presente invención hace referencia a cualquier producto resultante de Ia expresión de Ia secuencia de nucleótidos según cualquiera de los aspectos anteriores. Así pues, como producto resultante de Ia expresión de Ia secuencia se entiende, por ejemplo, el ARN que se obtiene de Ia transcripción de Ia secuencia, el ARN procesado, Ia proteína resultante de Ia traducción del ARN o posteriores modificaciones de Ia secuencia nucleotídica en el interior de Ia célula siempre que Ia secuencia resultante tenga su origen en Ia secuencia original transferida.

Otra realización preferida es el uso según cualquiera de los aspectos o realizaciones anteriores donde el ácido nucleico aislado está unido funcionalmente a una secuencia reguladora de Ia expresión génica.

El ácido nucleico de Ia presente invención se une por su extremo 3 ' a una secuencia reguladora de Ia expresión génica. En Ia presente invención, el término "secuencia reguladora de Ia expresión génica" hace referencia a una secuencia de ácidos nucleicos que tenga efecto sobre Ia funcionalidad de Ia secuencia de ácido nucleico de Ia invención en Io que se refiere al comienzo de Ia transcripción de Ia secuencia de ADN o al inicio de traducción de Ia secuencia de ARN u otras secuencias no descritas. A modo de ejemplo, entre las secuencias reguladoras de Ia expresión génica contempladas en Ia presente invención están los promotores y otras menos comunes como determinados intrones.

Según una realización preferida, Ia secuencia reguladora de Ia expresión génica es SEQ ID NO: 2 o SEQ ID NO: 3.

La secuencia SEQ ID NO: 2 hace referencia a Ia secuencia del promotor CaMV 35S, que produce una expresión constitutiva del gen al que precede en cualquier tejido de Ia planta. La secuencia SEQ ID NO: 3 hace referencia a parte de Ia secuencia reguladora de Ia expresión génica del gen SUC2, que codifica para una proteína transportadora de sacarosa.

Esta secuencia provoca que el gen que precede sea expresado en las células acompañantes o células de compañía del tejido vascular del floema.

Según otra realización preferida, Ia planta a cuya regulación del momento de Ia floración se hace referencia según cualquiera de los aspectos o realizaciones anteriores, pertenece a Ia especie Arabidopsis thaliana. Según otra realización preferida Ia planta pertenece a Ia especie Solanum lycopersicum.

Otro aspecto de Ia presente invención es una célula aislada transfectada con un ácido nucleico aislado que comprende una secuencia nucleotídica que codifica una secuencia aminoacídica con al menos un 90% de identidad con Ia secuencia SEQ ID NO: 1.

El término "transfección" hace referencia a Ia introducción de material genético externo en células mediante plásmidos, vectores víricos (en este caso también se habla de transducción) u otras herramientas para Ia transferencia. El término transfección para métodos no-virales es usado en referencia a células eucarióticas de mamífero, mientras que el término transformación se prefiere para describir las transferencias no-virales de material genético en bacterias y células eucariotas no animales como hongos, algas o plantas. En el caso de Ia presente invención, el término transfección es equivalente al término transformación.

Según una realización preferida, Ia célula comprende una secuencia nucleotídica de un alga verde que codifica una secuencia aminoacídica con al menos un 50% de identidad con Ia secuencia SEQ ID NO: 1.

Otra realización preferida es una célula aislada transfectada con un ácido nucleico aislado que comprende una secuencia nucleotídica que codifica Ia secuencia aminoacídica SEQ ID NO: 1.

En adelante, se hará referencia a las células anteriores como las células de Ia invención o las células de Ia presente invención.

El término "célula aislada" hace referencia a una célula que se obtiene de cualquier tipo de cultivo microbiológico (por ejemplo, pero sin limitarse, E. coli o Agrobacteríum tumefaciens) o tejido vegetal. Preferiblemente Ia célula es una célula eucariótica procedente de una planta que es capaz de producir flores. Así pues, el término célula comprende, al menos, una célula del parénquima, célula meristemática o de cualquier tipo, diferenciada o indiferenciada. Asimismo, también se incluye en esta definición un protoplasto (célula de una planta que carece de pared celular). La célula vegetal comprende Ia secuencia SEQ ID NO: 1 de forma estable o de forma transitoria.

Otro aspecto más de Ia presente invención es una planta que comprende Ia célula de Ia invención. Según una realización preferida, Ia planta pertenece a Ia especie Arabidopsis thaliana. Según otra realización preferida Ia planta pertenece a Ia especie Solanum lycopersicum. En adelante, haremos referencia a estas plantas mediante el término, las plantas de Ia invención o las plantas de Ia presente invención.

El término "planta" engloba cada una de las partes de Ia misma, que pueden ser conservadas o cultivadas de forma aislada o en combinación, así como el germoplasma. El germoplasma queda definido por aquel material biológico que contiene Ia variabilidad genética intraespecífica o por los materiales genéticos que pueden perpetuar una especie o una población de un organismo (ver más adelante semillas, propágulos o progenie). La planta debe comprender Ia célula de Ia presente invención de forma que se exprese en un tejido específico (en un momento concreto del desarrollo vegetativo o dependiendo de las condiciones ambientales en donde se desarrolla) o de forma constitutiva o de forma ectópica (que se expresa en otras células o tejidos diferentes de las habituales y esperadas).

Teniendo en cuenta que Ia proteína codificada por Ia secuencia de Ia presente invención desempeña de forma sorprendente una función que restituye Ia función del gen CO de plantas de Arabidopsis thaliana cuyo gen CO se ha eliminado de Ia secuencia genómica (muíante co), es de suponer, que Ia transferencia e inserción, en el lugar adecuado, de las secuencias de Ia invención a cualquier especie de planta donde el producto obtenido de las secuencias anteriores tenga Ia misma secuencia aminoacídica, origine como resultado plantas que expresan de forma funcional estas secuencias, que desempeñan Ia misma función que el gen intrínseco CO de dichas plantas. En este sentido, preferiblemente, Ia planta se selecciona de las familias de plantas de Ia lista que comprende, pero sin limitarse, familia Poaceae, Fabaceae, Lauraceae,

Chenopodiaceae, Brassicaceae, Cucurbitaceae, Apiaceae, Solanaceae, Asteraceae, Annonaceae, Ebenaceae, Moraceae, Cactaceae, Cucurbitaceae, Rosaceae, Fabaceae, Rutaceae, Vitaceae, Actinidiaceae, Bromeliaceae, Musaceae, Fagaceae, Betulaceae, Juglandaceae, Anacardiaceae, Asteraceae, Oleaceae o Capparaceae.

Preferiblemente, Ia planta de Ia familia Cucurbitaceae se selecciona, pero sin limitarse, de los géneros Cucúrbita, Cucumis, Citrullus o Lagenaria.

Preferiblemente, Ia planta de Ia familia Solanaceae se selecciona, pero sin limitarse, de los géneros Solanum o Capsicum. Preferiblemente Ia planta del género Solanum se selecciona, pero sin limitarse, de las especies S. tuberosum, S. lycopersicum o S. melongena. Más preferiblemente Ia planta es de Ia especie S. lycopersicum. Preferiblemente Ia planta del género

Capsicum se selecciona, pero sin limitarse, de las especies C. angulosum, C. annuum, C. pendulum o C. mínimum.

Preferiblemente, Ia planta de Ia familia Rosaceae se selecciona, pero sin limitarse, de las subfamilias Rosoideae, Maloideae o Prunoideae.

Preferiblemente, Ia planta de Ia familia Rutaceae se selecciona, pero sin limitarse, del género Citrus. Más preferiblemente Ia planta es C. aurantium, C. nobilis, C. grandis, C. limetta, C. limón, C. medica o C. paradisi.

La planta de Ia invención puede contener cualquiera de las secuencias de Ia invención en homocigosis, heterocigosis o hemicigosis.

La planta de Ia invención puede conseguirse por transformación genética de células vegetales mediada por biolística, Agrobacterium tumefaciens o cualquier otra técnica que permita Ia integración de cualquiera de las secuencias de Ia invención en el ADN de Ia planta, ya sea éste genómico, cloroplástico o mitocondrial seguida de un programa de regeneración in vitro adecuado a las características y necesidades de Ia especie vegetal transformada. Asimismo, Ia planta también puede conseguirse por transferencia de cualquiera de las secuencias de Ia invención por cruzamiento, es decir, empleando polen de Ia planta de Ia invención para polinizar cualquier otra planta que no contenga cualquiera de las secuencias de Ia invención o polinizando los gineceos de plantas que contengan cualquiera de las secuencias de Ia invención con otro polen de plantas que no contengan estas secuencias. Los métodos para conseguir Ia planta de Ia invención no se limitan exclusivamente a los métodos descritos en este párrafo. Asimismo también se incluye Ia planta que comprende Ia célula de Ia presente invención de forma estable o de forma transitoria.

Polen, semilla, propágulo, progenie o parte de Ia planta que procede de cualquiera de las plantas descritas en Ia presente invención.

En Ia presente invención se tiene en cuenta el polen como transmisor de los caracteres genéticos y fenotípicos, que puede llevarse a cabo por Ia polinización de cualquier variedad vegetal compatible con el polen al que se hace referencia. De este modo se consigue una planta que comprende cualquiera de las secuencias de Ia presente invención y, tras los respectivos cruces y/o selecciones, se puede obtener una planta en Ia que Ia secuencia se integra de forma estable (aunque también pueden expresarse de forma transitoria) y en un número de copias adecuado para obtener los mismos caracteres deseables en las posteriores generaciones.

Los propágulos son partes de Ia planta que permiten Ia propagación o reproducción asexual en vegetales, por Ia que se obtienen nuevas plantas u órganos individualizados. Los tejidos de Ia porción separada deben recuperar Ia condición de meristemos para producir todo el conjunto de órganos de Ia planta. El propágulo se selecciona, pero sin excluir, de Ia lista que comprende estolones, rizomas, tubérculos o bulbos.

El término "progenie" hace referencia al resultado de Ia reproducción, es decir, el individuo o individuos producidos mediante Ia intervención de uno o más individuos parentales. Por ejemplo, Ia progenie de las plantas, obtenida mediante reproducción sexual, son las semillas, sin embargo Ia progenie de una planta puede ser cualquier célula resultante de Ia fusión de cualquier contenido celular, plasto, compartimento celular, ADN o cualquiera de sus combinaciones. En los procesos de división celular (como por ejemplo en el cultivo in vitro) Ia progenie son las células resultantes de Ia división.

Otro aspecto de Ia presente invención es un método para Ia obtención de Ia célula de Ia invención, que comprende: a. insertar Ia secuencia nucleotídica que codifica para SEQ ID NO:

1 en un vector, b. transformar una célula con el vector obtenido según el apartado

(a) y c. seleccionar Ia célula transformada según el apartado (b) que comprende Ia secuencia nucleotídica que codifica para SEQ ID

NO: 1.

La inserción de cualquiera de las secuencias de Ia invención en un vector se puede llevar a cabo por medio de los métodos de clonación que forman parte del conocimiento general común, mediante corte de las secuencias y el vector con enzimas de restricción y su posterior ligación, de forma que Ia secuencia del vector integre Ia secuencia de Ia invención seleccionada. El vector ha sido definido en un párrafo anterior.

La selección del vector que comprende Ia secuencia de Ia invención escogida, puede llevarse a cabo mediante técnicas como; - Selección de células que contengan los vectores de Ia invención mediante Ia adición de antibióticos al medio de cultivo. La resistencia de estas células a sustancias como los antibióticos está producida por Ia síntesis de moléculas codificadas por una secuencia contenida en Ia secuencia del vector.

- Digestión con enzimas de restricción mediante las cuales se obtenga un fragmento de alguna de las secuencias de Ia invención insertada en el vector.

- Detección de un gen indicador presente en el vector de transformación, cuya presencia en Ia planta indica Ia presencia de las secuencias de Ia invención.

La célula se obtiene de cualquier tipo de cultivo microbiológico (por ejemplo E. coli o Agrobacterium tumefaciens) o tejido vegetal.

La transformación genética de las células se lleva a cabo por medio de técnicas que forman parte del conocimiento general común, como por ejemplo, electroporación, transformación genética mediada por biolística, Agrobacterium tumefaciens o cualquier otra técnica que permita Ia integración de cualquiera de las secuencias de Ia invención en el ADN de Ia célula. Mediante estas técnicas se consigue introducir, de forma estable, un vector que incluye cualquiera de las secuencias de Ia invención, de forma que, tras sucesivas divisiones de Ia célula, Ia secuencia incorporada sigue expresándose. También se incluyen las células que comprenden cualquiera de las secuencias de Ia invención de forma transitoria.

La célula transformada con un vector que incluye cualquiera de las secuencias de Ia invención puede incorporar Ia secuencia en alguno de los ADN de Ia célula; nuclear, mitocondrial y/o cloroplástico (en este caso se suele insertar una secuencia de ADNt que contiene, entre otras secuencias, cualquiera de las secuencias de Ia invención), o, permanecer como parte de un vector que posee su propia maquinaria para autoreplicarse. La selección de Ia célula que ha incorporado cualquiera de las secuencias de Ia invención se lleva a cabo por medio de Ia adición de antibióticos al medio de cultivo que suministra nutrientes a las mismas. La resistencia de estas células a sustancias como los antibióticos está producida por Ia síntesis de moléculas codificadas por una secuencia contenida en Ia secuencia del vector o del ADNt del vector. También se puede seleccionar Ia célula que comprende SEQ ID NO: 1 mediante cualquier otra técnica que permita discriminar su presencia o ausencia y/o su expresión.

Otro aspecto de Ia presente invención es un método para obtener Ia planta de Ia invención que comprende: a. regenerar al menos una planta procedente de Ia célula obtenida según el apartado (c) del método anterior, b. seleccionar una o varias plantas regeneradas según el apartado (d) que expresa, al menos, Ia secuencia nucleotídica que codifica para SEQ ID NO: 1 y c. seleccionar una o varias plantas obtenidas según el apartado (b) que presenta un adelanto de Ia floración respecto de una planta control.

Las células seleccionadas, si son vegetales, pueden someterse a un programa de organogénesis o embriogénesis somática mediante el cual, tras Ia desdiferenciación de las mismas mediante una combinación adecuada de hormonas vegetales y otros compuestos, se da lugar a una planta completa que contiene el material genético de Ia célula original de Ia que procede. Además son necesarias condiciones de luz y temperatura idóneas para cada especie vegetal. Las células vegetales son totipotentes, es decir, contienen una copia íntegra del material genético de Ia planta a Ia que pertenece sin importar su función o posición en ella, y por Io tanto tiene el potencial para regenerar una nueva planta completa. Una vez que se ha regenerado Ia planta procedente de Ia célula vegetal seleccionada, se lleva a cabo un análisis de Ia presencia y/o de Ia expresión de Ia secuencia nucleotídica que codifica para SEQ ID NO: 1 o de cualquier otra secuencia de Ia presente invención (secuencia promotora, etc .).

El método comprende, además, Ia selección de una planta que presenta un adelanto o retraso de Ia floración respecto de un control. Preferiblemente se seleccionan las plantas que presentan un adelanto de Ia floración respecto de las plantas control. Las plantas control son plantas que no contienen Ia secuencia de Ia invención que codifica para Ia secuencia aminoacídica SEQ ID NO: 1. Preferiblemente las plantas control contienen el resto de Ia secuencia del ADN de transferencia del vector que se ha empleado para insertar Ia secuencia nucleotídica de Ia invención en Ia célula vegetal. El control también puede ser una planta tipo salvaje cuyo material vegetal procede de las plantas transformantes (que comprenden Ia secuencia nucleotídica que codifica para SEQ ID NO: 1 ), antes de ser transformadas, que ha pasado por los mismos pasos de cultivo in vitro que las plantas de Ia invención o que no ha pasado por estos pasos de cultivo.

Según otra realización preferida, Ia secuencia nucleotídica que codifica para Ia secuencia SEQ ID NO: 1 , está unida funcionalmente a una secuencia reguladora de Ia expresión génica. La secuencia reguladora de Ia expresión génica determina, tal como se ha descrito anteriormente, el tejido vegetal en el que se expresan las secuencias de Ia invención y/o el momento en el que se expresan.

A Io largo de Ia descripción y las reivindicaciones Ia palabra "comprende" y sus variantes no pretenden excluir otras características técnicas, aditivos, componentes o pasos. Para los expertos en Ia materia, otros objetos, ventajas y características de Ia invención se desprenderán en parte de Ia descripción y en parte de Ia práctica de Ia invención. Las siguientes figuras y ejemplos se proporcionan a modo de ilustración, y no se pretende que sean limitativos de Ia presente invención.

DESCRIPCIÓN DE LAS FIGURAS

Figura 1. Muestra el fuerte parecido de SEQ ID NO: 1 respecto de las proteínas CO de plantas.

A. La estructura del gen se dedujo de las ESTs y amplificaciones por PCR utilizando ADNc de molde Parte superior y Ia secuencia genómica predecible según Chlamydomonas genome datábase (abajo).

B. Relaciones evolutivas de proteínas CO y COL de Ia rama evolutiva de las plantas. La distancia del árbol está dibujada a escala, con las longitudes de las ramas en las mismas unidades que las distancias evolutivas usadas para inferir el árbol filogenético. Las relaciones evolutivas representan 1000 réplicas. Los principales grupos resultantes están marcados. Loa asteriscos ( * ) indican valores boostrap del 95% de confianza.

Figura 2. Muestra Ia expresión de CrCO bajo el control del promotor 35S.

En adelante, Ia secuencia aminoacídica que codifica para SEQ ID NO: 1 se denominará CrCO y Ia proteína para Ia que codifica se denominará CrCO.

La expresión de CrCO bajo el control del promotor 35S complementa Ia mutación co y acelera Ia floración. A. Detección de ARNm de CrCO mediante RT-PCR en plantas recombinantes 35SwCrCO, en plantas en fondo co-8 (Ler) (35S::CrCO #1 ) o plantas en fondo co-10 (col-0) (35S:: CrCO #2). Plantas WiId type (silvestres) col-0 y Ler, así como los mutantes co-8 fueron utilizados como controles negativos.

B. Plantas co-8 y co-10 mutantes, col-0 y 35SwCrCO #2 crecidas en suelo durante 4 semanas en condiciones de día largo (LD). Las plantas son T3 homocigotas.

C. Detección de los niveles de ARNm de FT por RT-PCR en plantas 35SwCrCO incluyendo controles positivos (SUC2:: CO y 35S:: CO) y negativos (co-8).

Las plantas fueron crecidas en suelo durante 2 semanas en condiciones de día largo y fueron recogidas al mediodía (ZT 4) y por Ia tarde (ZT16).

D. Fenotipo de algunas líneas 35SwCrCO.

Figura 3. Muestra Ia acción de CrCO en Ia floración de Arabidopsis bajo un promotor exclusivo de floema.

A. La expresión de CrCO bajo el control del promotor específico de floema SUC2 (SEQ ID NO: 3) acelera Ia floración en plantas col-0. Si Ia expresión se dirige mediante el promotor específico de meristemo KNATI, Ia floración temprana no ocurre. Las plantas muíante co-10, silvestre col-0 y 35S::CO (en fondo col-0) se utilizaron como control.

B. Expresión de CrCO y FT en las mismas plantas que en A.

C. Inmunodetección de Ia proteína CrCO con anticuerpos específicos para CO en extractos nucleares de plantas col-O, 35SwCO (col-O) y plantas col- 0 transformadas con SUC2:: CrCO o KNAT1 :: CrCO. La detección de H3 se usó como control de carga. La flecha indica Ia banda específica de 45 KDa detectada en plantas 35S:: CrCO y SUC2:: CrCO.

D. Detección de Ia fusión YFP:CrCO en núcleos de células epidérmicas de cebolla mediante microscopía confocal.

EJEMPLOS

A continuación se ilustrará Ia invención mediante unos ensayos que describen Ia obtención de una secuencia nucleotídica que codifica para Ia secuencia aminoacídica SEQ ID NO: 1 , el método para Ia producción de células y plantas que Ia expresan así como el uso de dicha secuencia para regular el momento de Ia floración de las plantas que Io expresan.

EJEMPLO 1. Protocolos experimentales.

1.1 Material experimental de plantas y algas

Para el análisis de Ia expresión génica y producción de proteínas se crecieron las plantas de Arabidopsis thaliana en diferentes fotoperiodos en fitotrones con condiciones controladas de 80% de humedad y 75 μE/m 2 de intensidad de luz. Las plantas de Arabidopsis también se crecieron en medio sólido MS-agar suplementado con 1% (p/v) de sacarosa en diferentes fotoperiodos en un fitotrón SG-1400 (Radiber SA, España) a 65 μE/m 2 de intensidad de luz. Las estirpes silvestre 21 gr, el muíante de pared celular CW15 y las líneas transgénicas de C. reinhardtii se crecieron en recipientes cónicos en agitación o en botellas cilindricas aireadas en medio Sueoka o medio TAP en cámaras de cultivo controladas a 22 0 C. Para Ia inducción del promotor NIA1 se recogieron por centrifugación algas crecidas hasta fase exponencial media en medio Sueoka-amonio, se resuspendieron en medio Sueoka-nitrato y se crecieron en diferentes condiciones de cultivo. Se emplearon diferentes fotoperiodos desde condiciones de LD (16:8) hasta SD (8:16) con condiciones de luz de 30 μE/m 2 (baja intensidad) o 100 μE/m 2 (alta intensidad).

1.2 Clonación y análisis de CrCO (secuencia aminoacídica que codifica para SEQ ID NO: 1).

En adelante, Ia secuencia aminoacídica que codifica para SEQ ID NO: 1 se denominará CrCO y Ia proteína para Ia que codifica se denominará CrCO.

Se analizaron varios clones de Ia colección de ADNc del Centro de ADN de Kazusa para obtener Ia ORF completa de CrCO. La secuenciación de cuatro de estos ADNc (AV628196; Av628285; AV629179; AV638186) mostró una secuencia nucleotídica de ARNm única. La secuencia de aminoácidos deducida de CrCO tiene 410 residuos y posee tres dominios característicos: i) Dos dominios en dedo de zinc en el extremo amino- terminal llamados cajas-b implicados en interacción proteína-proteína; ii) Un dominio intermedio acídico posiblemente implicado en activación transcripcional; y iii) Un dominio carboxilo CCT (CO-COL-TOC1 ) que se ha sugerido su mediación en Ia interacción con el ADN y que está conservado en proteínas de plantas funcionalmente relacionadas con el oscilador central como TOC1 u otros pseudo reguladores de respuesta.

1.3 Análisis del tiempo de floración

El tiempo de floración se analizó en plantas crecidas en tierra en cámaras con condiciones controladas en LD mediante el conteo de las hojas de roseta y caulinas del mismo tallo al menos en 10 individuos. Los datos se expresan como medias +/- error estándar de Ia media (s.e.m.). 1.4 Análisis filogenéticos

Las relaciones evolutivas entre las proteínas CO y CO-like se analizaron empleando las secuencias de aminoácidos deducidas de diferentes bases de datos y alineadas con el programa CLUSTALX. Este alineamiento se utilizó para generar diversos árboles evolutivos empleando diferentes criterios filogenéticos. Como estos árboles mostraban topologías muy similares, sólo se ha mostrado el que se realizó con el criterio de Ia mínima evolución (FIG. 1 B). Se calcularon las relaciones evolutivas empleando el método de Ia Evolución Mínima (ME). El árbol consenso de atrapamiento calculado mediante 1000 réplicas representa Ia historia evolutiva de las proteínas analizadas. El árbol está dibujado a escala, con Ia longitud de las ramas en las mismas unidades que las de las distancias evolutivas usadas para calcular el árbol filogenético. El árbol ME fue rastreado empleando el algoritmo de Neighbourd-joining a nivel de rastreo de 1. El algoritmo de Neighbourd-joining se usó para generar el árbol inicial. Todas las posiciones que contenían huecos de desapareamientos o falta de datos fueron eliminadas sólo en las comparaciones de secuencias de apareamientos (opción de deleción de apareamiento). Hubo en total 669 posiciones en el set de resultados finales. Los análisis filogenéticos se realizaron con el programa MEGA4. Los números de acceso de las secuencias usadas en el alineamiento se muestran en Ia tabla 1.

Tabla 1. Números de acceso de las proteínas COL.

1.5 Análisis de expresión génica El ARN completo procedente de Células de Chlamydomonas o plántulas de Arabidopsis se extrajo mediante el protocolo de TRIZOL (Invitrogen). Se monitorizó Ia expresión génica mediante el análisis Northern blot empleando sondas marcadas radiactivamente o mediante RT-PCR semicuantitativa empleando cebadores específicos para cada gen analizado y ADNc construido con el QIAGEN Quick prime RT Kit. Los niveles de expresión de los genes de a-TUBULINA {TUA1) o UBIQUITINA- 10 [UBQ) se usaron como control en Chlamydomonas y Arabidopsis respectivamente. Para Ia expresión génica circadiana se empleó como control los niveles de expresión del gen CABII, que codifica para Ia proteína de unión a Ia clorofila a/b del fotosistema Il de Chlamydomonas. Los datos se representan como Ia media de al menos tres experimentos diferentes. La lista completa de cebadores usados en este trabajo se muestra en Ia tabla 2.

Tabla 2. Lista de cebadores y condiciones de PCR.

Para el gen CrCO, las condiciones de PCR son 30 ciclos de 30 segundos a 94 0 C, 30 segundos a 65 0 C y 60 segundos a 72 0 C. Para el gen TUA1, las condiciones de PCR son 27 ciclos de 30 segundos a 94 0 C, 30 segundos a 65 0 C y 60 segundos a 72 0 C. Para el gen FT, las condiciones de PCR son 30 ciclos de 30 segundos a 94 0 C, 30 segundos a 60 0 C y 60 segundos a 72 0 C. Para el gen UBQ, las condiciones de PCR son 20 ciclos de 30 segundos a 94 0 C, 30 segundos a 65 0 C y 60 segundos a 72 0 C.

En Ia columna 1 de Ia tabla 2 se muestra el nombre de las proteínas tal y como aparecen en las correspondientes figuras. En Ia columna 2 se muestra el número de acceso para las proteínas en Ia base de datos del National Centre for Biotechnology Information (NCBI), o código de secuencia genómico del DOE Joint Genome lnstitute (JGI) (http://www.jgi.doe.gov/) para SmCOL, VcCOL, OtCOL. La secuencia aminoacídica de GsCOL puede extraerse de Ia página web del proyecto genómico de Galdieria sulphuraria (http//genomics. msu.edu/gladieria/). En Ia columna 3 se muestra para Arabidopsis y arroz el número de acceso del gen del lnstitute for Genomic Research (TIGR).

1.6 Técnicas inmunológicas y de análisis de proteínas

Se extrajeron las proteínas de material de plantas congelado mediante trituración en un mortero en presencia de nitrógeno líquido y un tampón de extracción: tris HCI 50 mM (pH 8.0); EDTA 1 mM (pH 8.0); glicerol 10% (v/v); KCI 50 mM; MgCI 2 10 mM; PMSF 10 mM y una mezcla de inhibidores de proteasas de Ia marca SIGMA. Las algas se rompieron con el mismo tampón mediante sonicación breve (2 veces durante 30 segundos en un sonicador Branson a 10 W de potencia). El extracto crudo de plantas y algas resultante se centrifugó a 16.000 rpm durante 30 minutos a 4 0 C y se recogió el sobrenadante. El precipitado se usó para Ia medida del almidón. Para el análisis por Western blot se emplearon anticuerpos contra CO y anti-H3, disponibles comercialmente (AbCAM), como controles nucleares. 1.7 Transformación de algas y plantas

Las plantas silvestres y mutantes de Arabidopsis se transformaron mediante Ia técnica de inmersión floral mediada por Agrobacteríum. Para Ia expresión de CrCO en Arabidopsis, las plantas se transformaron con el vector alligator 2. Las plantas CrCOox se seleccionaron por Ia presencia de GFP en Ia semilla bajo el microscopio y se analizó su fenotipo floral en

Ia primera generación. Se seleccionaron las plantas homocigotas directamente en esta generación cuando mostraban un 100% de fluorescencia en las silicuas.

Para generar proteínas fluorescentes de fusión para determinar Ia localización nuclear, se empleó el plásmido pENSG-YFP:GW (de Ia Dra Nieves Medina-Escobar, Universidad de Málaga). Este plásmido genera una fusión amino-terminal de Ia proteína YFP a proteínas expresadas por ADNc clonados en un sitio gateway en Ia parte 3' del gen YFP, bajo el control de un promotor 35S y son compatibles con Ia expresión en plantas mediada por Agrobacteríum.

Para Ia construcción del vector inducible por nitrato que expresa CrCO, se introdujo el cassette gateway en pauta C (Invitrogen) en el sitio EcoRV del polilinker del vector pNIA1 según las instrucciones del fabricante, obteniéndose el vector pNlAG. Un fragmento Hind\\\ del vector pHyg3, que incluye el cassette de resistencia a higromicina, se introdujo en el sitio Hind\\\ del vector pBS SK+ y un fragmento kpn\ en el mismo sitio del vector pNÍAG, produciéndose el vector pNlAHG, que se confirmó estaba clonado en antisentido al cassette gateway por secuenciación. La ORF de CrCO se amplificó por PCR y se clonó en el vector pDONR221 mediante recombinación. Los cebadores usados fueron SEQ ID NO: 12 (directo) y SEQ ID NO: 13. Mediante esta amplificación se obtuvo una secuencia de ADNc que se muestra en SEQ ID NO: 14 (CrCO). El vector de entrada de CrCO se usó como sustrato para una reacción L de recombinación en el vector pNlAHG, obteniéndose el vector final pNIAHG::CrCO. Las algas transformadas se seleccionaron mediante resistencia a higromicina en medio Sueoka-amonio y se comprobó Ia expresión del gen en presencia de nitrato.

El vector de producción de GST:CrCO se construyó mediante recombinación molecular del vector de entrada de CrCO y el plásmido pDESR15 (Invitrogen). La clonación y purificación en columnas de glutatión-sephadex (GE Healthcare) se realizó como describe el fabricante.

EJEMPLO 2. Resultados

2.1. Identificación de un homólogo de CONSTANS en C. reinhardtii

En las bases de datos de ESTs (Expression Sequence Tags) pueden encontrarse frecuentemente ESTs de CrCO, pero sólo se pudo identificar un EST para el gen COL {CONSTANS-LIKE) EDP03468. Además, empleando cebadores diseñados para una parte interna del gen y como molde ADNc procedente de diferentes condiciones de crecimiento, no se pudo amplificar mediante PCR reversa (RT-PCR) ninguna señal de EDP03468. Por otro lado, se ha descrito que Ia expresión de ROC66 es pequeña pero detectable y parece regularse por el reloj circadiano. Dada su gran divergencia de secuencia con CO, y su similitud a proteínas de Ia familia COL, ROC66 podría considerarse un gen COL de algas. De manera significativa, en todas las condiciones de crecimiento estudiadas, Ia secuencia completa de CrCO podía ser amplificada mediante ensayos de RT-PCR, generándose un fragmento de unos 1.4 kb, Io que es consistente con el tamaño previsto para el gen en Ia última versión de Ia secuencia genómica de C. reinhardtii (FIG. 1A). La estructura del gen CrCO se generó mediante información recogida de los ESTs, de las amplificaciones de RT-PCR y de Ia secuencia predicha en Ia base de datos del genoma de C. reinhardtii (FIG. 1A). CrCO posee cuatro intrones que están conservados en Ia secuencia del gen de Volvox cartieri pero no en genes de plantas, del musgo Physcomitrella patens o de Ia licofita Selaginella moellendorfi. La secuencia codificante de CrCO (1230 nt) es similar a Ia de CO y su ARNm contiene secuencias cortas en los extremos 5' y 3'. La identidad completa de las secuencias de aminoácidos deducidas de CO y CrCO es de 27% y Ia similitud 37%. En Ia zona conservada de las cajas-b Ia identidad de aminoácidos llega hasta el 43%, mientras que en el dominio CCT Ia identidad llega al 78%. Las identidades con otras secuencias COL de plantas procedentes de bases de datos varía entre el 20 y el 30% (tabla 3). En conjunto, los resultados sugieren fuertemente que CrCO es el único homólogo verdadero de CO que se expresa con normalidad en C. reinhardtii.

Tabla 3. Identidad de secuencia de varios miembros representativos de Ia familia de proteínas COL del árbol evolutivo de las plantas.

Los números indican el porcentaje de identidad de aminoácidos entre cada pareja de proteínas. La identidad de CrCO con las secuencias de plantas es mayor que con las de proteínas COL de otras algas prasinofíceas como Ostreococcus taurí (OtCOL) o con el alga roja Galdiería sulphuraría (GsCOL). PpCOLI : Physcomitrella patens COL1 ; SmCOL: Selaginella moellendorfi COL; VcCO: Volvox cartierí COL.

Se ha empleado Ia secuencia de aminoácidos deducida de CrCO, junto a otras secuencias de COs y COLs del linaje eucariótico fotosintético para generar un alineamiento y un árbol evolutivo (FIG. 1 B). En el árbol de Ia FIG. 1 B, CrCO se agrupa con Volvox-CO (VcCO), otra alga clorofícea que muestra una rudimentaria organización multicelular. La estructura génica y Ia posición de los intrones son similares entre las dos secuencias de algas, como era de esperar de Ia proximidad evolutiva de ambas especies (FIG. 1 B). Esta rama basal está muy cerca del grupo I, que incluye a las proteínas CO y HD1 , de las que se sabe que tienen un papel central en Ia floración por fotoperiodo en Arabidopsis y arroz respectivamente. Por el contrario, los homólogos de CO presentes en los proyectos genoma del alga verde marina unicelular Ostreococcus taurí y el alga roja Galdiería sulphuraría ramificaban lejos de este grupo (96% de atrapamiento) y junto a miembros COL del grupo Il (FIG. 1 B).

No se encontraron genes COL en los proyectos genoma o bases de datos de ETSs de diferentes especies que pertenecen a otros grupos taxonómicos como las Bacilariofitas (Thalassiosira pseudonana y Phaeodactylum tricornutum), Dinofitas (Amphidium operculata), Euglenofitas {Euglena gracilis) o Haptofitas (Emiliana huxley). Por todo ello, probablemente Ia rama evolutiva que finalmente evolucionó en las plantas terrestres incluía homólogos verdaderos de CO, aunque Ia secuenciación de nuevos genomas de algas podría modificar este escenario. 2.2. La expresión de CrCO en Arabidopsis bajo el control de diferentes promotores acelera Ia transición floral

Se clonó el ADNc completo de CrCO bajo el control del promotor 35S en un vector de expresión de plantas (ver métodos). La construcción anterior, que sobreexpersa CrCO se transformó en los mutantes nulos co-8 y co-10, así como en los ecotipos silvestres Ler y Columbia. En las plantas transformantes se midió Ia expresión del gen CrCO mediante RT-PCR (FIG. 2). En todos los casos Ia expresión de CrCO bajo el promotor 35S (plantas 35SwCrCO) complementaba a Ia mutación co (FIG. 2A y FIG. 2B) y todas las plantas mostraban un fenotipo de floración temprana (tabla 4). Por otro lado, en las plantas transformantes de Ler y CoI-O, se observaba una co-segregación directa entre el marcador del vector y el fenotipo de floración temprana, demostrando que CrCO también confería floración temprana en plantas silvestres (tabla 4).

Tabla 4. Tiempo de floración de plantas silvestres, mutantes y transgénicas en condiciones de cultivo de día largo (LD).

En Ia tabla, los datos se muestran como Ia media +/- s.e.m. de 10 plantas contadas para el número total de hojas en condiciones de LD. El fondo genético de cada planta se muestra entre paréntesis al lado de cada genotipo. Las plantas transgénicas descritas en este trabajo son todas plantas T3 (de tercera generación).

También se verificó si las plantas que sobreexpresaban CrCO eran capaces de activar Ia expresión de Ia diana principal de CO, el integrador floral FT. Se crecieron plantas 35SwCrCO homocigotas en medio sólido en LD (16 horas de luz y 8 horas de oscuridad) y se analizó Ia expresión de FT a tiempos ZT 4 y ZT 16 (FIG. 2C). Se usaron plantas silvestres, mutantes co y plantas que sobreexpresaban CO (35S:: CO) como controles. En todos los casos, el fenotipo de floración temprana de 35SwCrCO iba emparejado con niveles altos de expresión de FT, incluso durante Ia mañana, cuando los niveles de FT son bajos en las plantas silvestres (FIG. 2C). Las plantas 35SwCrCO también florecían temprano en condiciones SD no inductivas y esto iba acompañado de altos niveles de expresión de FT. Por ello, el fenotipo de floración temprana de las plantas transgénicas que expresaban CrCO puede probablemente atribuirse al mismo proceso descrito para Ia floración por fotoperiodo y mediado por FT. Las plantas 35S:: CO muestran otros fenotipos pleiotrópicos asociados con Ia floración temprana como silicuas en forma de maza, un aumento de Ia esterilidad masculina y flores terminales. De forma similar, las plantas 35SwCrCO presentaban un tamaño reducido, defectos en Ia formación de silicuas, flores terminales y frecuentemente eran incapaces de producir semillas maduras, con flores que degeneraban en estados de desarrollo tardíos (FIG. 2D, a-d). Estas últimas plantas (FIG. 2D, c-d) mostraron un tamaño extremadamente pequeño, una floración extremadamente temprana, estimada tanto por días de floración como por número total de hojas, y también niveles muy altos de ARNm de CrCO y FT.

CO promueve Ia floración en LD mediante Ia expresión de una señal sistémica en los haces vasculares. Para averiguar si Ia expresión de CrCO específicamente en estos tejidos podía promover también Ia floración, se introdujo CrCO en plantas col-0 de Arabidopsis bajo el control del promotor del transportador de sacarosa SUC2, que se conoce se expresa preferentemente en las células anexas del tejido vascular floemático. La expresión de CrCO bajo el promotor SUC2 (plantas SUC2:: CrCO) indujo floración temprana en las plantas silvestres CoI-O (FIG. 3A y tabla 4) y complementó Ia mutación co. Las plantas transformadas con Ia construcción SUC2::CrCO tenían aproximadamente 8,6 +/- 0,2 hojas en el momento de Ia aparición del primer botón floral en condiciones LD, mientras que CoI-O mostraba 19,9 +/- 0,5 hojas en las mismas condiciones (tabla 4). Sin embargo, cuando el ADNc de CrCO se expresó bajo el control del promotor del gen KNATI, cuya expresión es exclusiva del meristemo apical, y se introdujo en plantas CoI-O, no se alteró Ia floración (FIG. 3A y tabla 4). Las plantas KNATLCrCO florecían con 20,4 +/- 0,7 hojas (tabla 4). Para confirmar que el fenotipo de floración temprana observado en las plantas SUC2:: CrCO se debía a Ia activación de Ia vía del fotoperiodo, se compobó Ia expresión de FT mediante RT-PCR. Efectivamente, si se comparaba con las plantas control, FT se expresaba a altos niveles en estas plantas tanto en LD como en SD y ello era concomitante con altos niveles de expresión de CrCO (FIG. 3B). No obstante, aunque presentaban altos niveles de CrCO, no se observaron mayores niveles de expresión de FT comparado con plantas silvestres, cuando CrCO se expresaba bajo el control del promotor exclusivo de meristemo (FIG. 3B). Mediante inmunoblots se mostró que las plantas que sobreexpresaban CrCO en fondo CoI-O también mostraban altos niveles de producción de Ia proteína CrCO en extractos nucleares (FIG. 3C). Se probó también Ia presencia de Ia proteína CrCO mediante inmunoblots en plantas que expresaban CrCO bajo los promotores SUC2 y KNATI en fondo CoI-O. De manera consistente con los datos de ARNm, Ia proteína podía detectarse en plantas 35SwCrCO y SUC2::CrCO, pero no en el muíante co-10 o en plantas donde Ia expresión de CrCO estaba controlada por el promotor KMA 77 (FIG. 3C).

La transformación de plantas con vectores que contenían fusiones traduccionales de CO a Ia Proteína Fluorescente Verde (GFP) había mostrado Ia presencia nuclear de Ia fusión GFP: CO. Se clonó CrCO en el plásmido pENSG-YFP:GW que produce una fusión amino-terminal con Ia variante amarilla de Ia GFP (YFP). Este vector se introdujo mediante bombardeo de partículas en células de Ia epidermis junto a un vector control que expresaba CO (YFP: CO) en Ia mismas condiciones. Como puede verse en Ia FIG. 3D, YFP: CrCO se detectó mediante microscopía confocal en el núcleo de manera similar a las plantas que sobreexpresaban Ia fusión YFP: CO, sugiriendo que CrCO también se localiza en el núcleo.

EJEMPLO 3. CrCO es un verdadero ortólogo de CO

Aunque Ia proteína CrCO mantiene alrededor de un 27% de identidad con CO, las plantas transformadas con CrCO presentan un fenotipo de floración sorprendentemente temprana. Por el contrario, COL1 , una duplicación en tándem de CO en Arabidopsis, que conserva más del 85% de identidad en aminoácidos con CO no puede complementar Ia mutación co si se expresa bajo un promotor 35S. Esto sugiere que Ia estructura de CrCO se asemeja a Ia de CO y que está involucrada probablemente en los mismos complejos nucleares que se han propuesto median Ia transcripción de FT. El hecho de que pueda complementar tanto a Ia mutación co-8 en fondo Ler y a Ia mutación co-10 en fondo CoI-O indica que CrCO puede reemplazar eficazmente a CO en el complejo supramolecular que supuestamente interviene en Ia modificación de Ia transcripción.

En Ia presente invención también se ha mostrado que al igual que CO, Ia expresión de CrCO bajo el control del promotor del gen específico de floema, SUC2, provoca floración temprana en Arabidopsis. Las plantas SUC2::CrCO mostraban niveles de expresión de FT mayores que las silvestres incluso en condiciones de SD no inductivas y ello podría explicar el fenotipo observado de floración temprana. Por el contrario, Ia expresión de CrCO bajo el promotor específico del gen meristemático KNATI no promueve floración temprana y no se detecta expresión de FT. Este es el caso también de las plantas KNATLCO.

En conclusión, CrCO es funcional cuando se expresa específicamente en el tejido vascular, Io que apoya aún más Ia conservación de Ia función de CO en el gen homólogo de plantas a pesar de Ia gran distancia filogenética que existe entre ellos.

La dependencia fotoperiodíca de Ia expresión y regulación génica supone un proceso fundamental para los organismos fotosintéticos dado que anticiparse a las señales luminosas diurnas y estacionales permite Ia elección del mejor momento del día o del año para realizar las transiciones de fase. En este sentido, las plantas han adaptado una regulación fotoperiódica para varios procesos clave que controlan el desarrollo como Ia dormancia, Ia formación de ramas o Ia transición floral. En esta vía regulatoria, las proteínas COL parecen tener un importante papel, ya que miembros de esta familia se regulan por Ia luz y el reloj circadiano. Al mismo tiempo están implicados en controlar procesos regulados por Ia luz como el control dependiente de PHYB de Ia elongación del hipocotilo, Ia ramificación o el tiempo de floración. Entre los muchos genes que regulan Ia transición floral, el módulo CO-FT parece encontrarse en Ia mayoría de las familias de dicotiledóneas y monocotiledóneas y está implicado en el control de Ia floración desde plantas herbáceas a árboles. A diferencia de otros sistemas de regulación de Ia floración como Ia vía de FLC/vernalización, que parece específica de algunas dicotiledóneas, los genes COL están presentes en los genomas de las briofitas como el musgo Physcomitrella patens, las licofitas como Selaginella moellendorfi y varias microalgas (descrito en Ia presente invención).

La complementación de Ia función de CO por CrCO en Arabidopsis resulta sorprendente porque implica que los genes COL han estado involucrados en Ia regulación circadiana y el control de Ia reproducción desde muy temprano dentro del linaje de las clorofitas y que estas características se han preservado durante su evolución. La mutación co no es letal en Arabidopsis o en otras plantas, aunque probablemente ha supuesto una característica crucial en Ia capacidad de las plantas de adaptarse a nuevos medios. En Chlamydomonas, el ciclo celular y el crecimiento se regulan por el reloj circadiano y el fotoperiodo, como se demuestra por el cambio en el pico de expresión de componentes clave del ciclo celular dependiendo de Ia longitud de noche/día.

A raíz de los resultados presentados en Ia presente invención, se puede deducir que Ia conservación de Ia función de CO puede haber sido crítica para Ia capacidad de las plantas de responder a señales luminosas externas y promover transiciones de desarrollo.