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Patent Searching and Data


Title:
GENE TSH-SER FOR PREVENTING COLIBACILLOSIS, PROTEIN ENCODED THEREBY AND PREPARATION METHOD THEREOF
Document Type and Number:
WIPO Patent Application WO/2014/183232
Kind Code:
A1
Abstract:
Provided in the present invention are a gene tsh-Ser for preventing colibacillosis, a protein encoded thereby and the preparation method thereof. The method comprises: using 5'-atgaacagaatttatt-3' as an upstream primer zxl, 5'-gaatgaataacgaa-3' as a downstream primer zx2, and the plasmid DNA of a O78 serotype Escherichia coli as a template, and using a PCR amplification method to obtain the gene tsh-Ser for preventing colibacillosis, and then using the gene to obtain the protein encoded thereby.

Inventors:
ZHANG XIN (CN)
MA XINGSHU (CN)
NIU ZHIYONG (CN)
CHEN SHUFANG (CN)
LI DEBIN (CN)
Application Number:
PCT/CN2013/000591
Publication Date:
November 20, 2014
Filing Date:
May 20, 2013
Export Citation:
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Assignee:
HEBEI KEXING PHARMA CO LTD (CN)
International Classes:
C12N15/31; A61K39/108; A61P37/04; C07K14/245; C12R1/19
Foreign References:
CN102580074A2012-07-18
CN102584992A2012-07-18
CN101224300A2008-07-23
CN1379682A2002-11-13
Other References:
DATABASE GENBANK 21 September 2007 (2007-09-21), accession no. P_001481228.1
DATABASE GENBANK 1 December 2011 (2011-12-01), accession no. EU 52070.1
Attorney, Agent or Firm:
SHIJIAZHUANG KECHENG PATENT OFFICE (CN)
石家庄科诚专利事务所 (CN)
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Claims:
权 利 要 求 书

1、 预防大肠杆菌病的基因 tsh-Ser, 其特征在于其 DNA序列为: a tgaacagaatttattctcttc ctacagcgctgtggcccggggctt tat tgccatatctgagttt

ctattctctgcaggaagtcttgcgggaacggtcaataatgaactcgggtatcagttatttcgtgat tttgctgaaaataaggggatgttccgcccgggggcaacgaatatcgctatttataataagcaggga gaatttgtcggtacgctggataaggcagctatgcctgatt tcagtgctgtggattcggaaatcggt gtggcgacactgataaacccgcagt tatcgccagcgtgaaac taacgggggatatacaaacgt t agctttggtgatggtgaaaaccgttacaatatcgtggaccggaataatgcgccgtcactggatt tt catgccccccggctggataaactggtgacagaggttgcccctactgcggtgacggcgcagggggca gtggctggcgcatatctggataaggagcgctatcc gttttttatcgtctggggtctggtactcag tatattaaggacagtaacggacagctgacaaaaatgggaggtgcatattcctggctgaccggcggg actgtcgg tagcctg tea tec tatcagaatggagaaat gat tagcaccagttcaggtctggttt tt gattacaaacttaatggtgcaatgcccatttatggcgaggccggtgacagcggttcgcctttattt gcttttgatactgttcagaataaatgggtgctggtcggtgttcttactgcggggaatggcgcgggg ggcaggggaaataactgggctgttattccactggattttatcgggcagaaatttaatgaagacaat gatgccccggtcacgttcagaacatcggaaggtggtgcactggagtggagctttaacagcagtacc ggagctggtgcgctgacacagggaaccaccacatatgccatgcacgggcagcagggaaatgacctg aatgctggtaagaacctgatatttcaggggcagaatggtcagattaaccttaaggattcggtttct cagggggcgggttccctgacgttccgtgataat tacacagtaacaacctctaacggaagtacctgg gataacctgcataaaattggtgaaggtacgctgacggtacagggtacagg tat taatgaaggtggc ctgaaggtcggggacggaaaggttgtactgaaccagcaggcggacaataaaggacaggtgcaggcg ttcagcagtgttaatattgccagtggccggccgaccgtggtactgactgatgagcggcaggtaaat ccggataccgtctcatggggatatcgtgggggcacactggatgttaatggtaacagtctgacgttt catcagttgaaggcggcagattatggtgccgtgctggcgaataacgt tgataaacgggccactatc acgctggactatgccctgcgggctgacaaagtagcactgaatggctggtcggaatcaggtaaagga aci agtcagggggatgcgcagaaactggtagctgaccgt t tcaatactgcagggt tctgt ttcacgga caact aaaggcaatctgaatgtggacaatcgcctgcctgaaggcgttaccagtgctctggtgatg

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2、 预防大肠杆菌病的基因 tsh-Ser 的制备方法, 其特征在于以 5, - atgaacagaatttatt-3' 为上游引物 zxl, 以 5, -gaatgaataacgaa-3' 为下游 引物 zx2,以 078血清型大肠杆菌的质粒 D 为模板,釆用 PCR扩增方法获得。

3、 根据权利要求 2所述的预防大肠杆菌病的基因 tsh-Ser的制备方法, 其特征在于其工艺条件如下:

A、 活化培养 078血清型大肠杆菌, 并提取质粒 DNA, 以提取的质粒 DNA 作为 PCR反应的模板;

B、 PCR反应体系如下:

反应物 用量

10 X Buffer (含 Mg2+ ) 2.5

2.5mmol/L dNTP 2. OyL

20mmol/L zxl 0.5 μί

20隱 ol/L zx2 0.5μί

DNA模板 2.5 ML

2.5U/mL Taq酶 0.5

ddH20 16.5 μΐ

Ά ^、体积 25. OpL

C、 PCR反应条件: 96°C预变性 5分钟, 94°C变性 1分钟; 50°C退火 30-60 秒, 72°C延伸 1-2分钟, 30个循环; 72°C延伸 10分钟后, 置于 4 'C冰箱保存, 即得扩增后的温度敏感血凝素基因 tsh- Ser。

4、 利用预防大肠杆菌病的基因 tsh-Ser编码的蛋白, 其特征在于其序列 如下:

AlaArgLysCysValHisLysSerValArgArgLeuCysPheProValLeuLeuLeuI leProVal ST

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Description:
预防大肠杆菌病的基因 tsh-Ser、 其编码的蛋白质及其制备方法

技术领域

本发明属于新基因的制备, 特别是指一种预防大肠杆菌病的基因 t sh-Ser及其制备以及利用其编码的蛋白。

背景技术

大肠杆菌病是由大肠杆菌的某些致病性血清型 菌株引起的疾病总称。 禽 大肠杆菌病是指部分或全部由禽致病性大肠杆 菌 (APEC )所引起的局部或全 身性感染的疾病, 包括大肠杆菌性败血症,大肠杆菌性肉芽肿( Hjar re病)、 气囊病(慢性呼吸道疾病即 CRD )、 大肠杆菌性蜂窝织炎(即炎性过程)、 肿 头综合症、 大肠杆菌性腹膜炎、 大肠杆菌性输卵管炎、 大肠杆菌性骨髓炎 / 滑膜炎(即火鸡骨髓炎综合征)、 大肠杆菌性全眼球炎及大肠杆菌性脐炎 /卵 黄囊感染。 大肠杆菌在哺乳动物主要引起肠道疾病, 而当禽类受到高致病性 大肠杆菌感染而使其防御能力不足以抵抗或完 全丧失时, 常会引起典型的继 发性局部或全身性感染。 大肠杆菌病给养禽业造成了严重的损失, 是禽病调 查中最常报道的疾病及酮体废弃的主要原因。 有资料显示: 禽肉加工中 43% 肉鸡酮体的报废与大肠杆菌性败血症有关。

现有技术主要是通过利用抗生素来进行致病性 大肠杆菌的治疗, 但是由 于抗生素的滥用, 随着细菌耐药性的增强, 大肠杆菌病也越来越难以防治。 从食品安全角度考虑, 导致直接食用这些禽畜类产品的人群感染大肠 杆菌病 的几率增加。 抗生素的用量越来越大, 致使农产品药残量增大, 导致人间接 性的食用大量的养殖用药, 这都给人类健康造成隐患。 另外传统疫苗都是通 过改变培养条件, 或在不同寄主动物上传代的办法使致病微生物 的毒性减 弱; 或是通过物理化学的方法将它们灭活。 但这样的疫苗都不理想。 因为弱 化的菌株可能发生回复突变而变成有毒的, 或者失去免疫原性, 灭活不适当 的疫苗还会引起疾病的流行。 因此, 迫切需要发展一种性能更佳的新型预防 大肠杆菌病的广谱菌苗。

有研究表明, 禽大肠杆菌的外膜蛋白在致病性和免疫方面都 起着重要的 作用。 赵香汝和杨汉春的研究(赵香汝, 杨汉春.不同血清型禽大肠杆菌外膜 蛋白免疫原性研究 [J] .张家口农专学报. 1999, 第 15卷第 4期: 4- 6. )表明不 同血清型禽大肠杆菌混合的外膜蛋白免疫, 无论对同型或异型菌株的攻击, 都有一定的保护作用。 李晓霞和邱玉玉的研究(李晓霞, 邱玉玉, 王海蓉.肠 致病性大肠杆菌外膜蛋白免疫保护性研究 [J].中国免疫学杂志.2007, 第 23 卷第 4期: 394- 397.)表明肠致病性大肠杆菌外膜蛋白可以诱导 对大肠杆菌 的特异性体液免疫和细胞免疫应答。

禽致病性大肠杆菌中的 tsh基因在应用中主要是其翻译表达的蛋白将大 肠杆菌粘附于正常的体细胞表面, 在文献 (陈祥, 刘静, 高嵩, 潘志明, 焦 新安, 刘秀梵.禽病原性大肠杆菌 0和 基因缺失的构建 [J].生物工程学 报.2008, 24 ( 3 ) : 401-408.)报道中出现过将 tsh基因敲除后, 大肠杆菌 病的发病率将会降低的说明, 但未见用单一细分的 h基因及其翻译的蛋白 对于对大肠杆菌病预防的报道。

发明内容

本发明的目的在于提供一种预防大肠杆菌病的 基因 tsh-Ser。

本发明的目的之二在于提供一种预防大肠杆菌 病的基因 tsh- Ser 的制备 方法。

本发明的目的之三在于提供一种预防大肠杆菌 病的基因 tsh-Ser 编码的 蛋白。

本发明的整体技术构思是:

预防大肠杆菌病的基因 tsh-Ser, 其 DNA序列为: gctaggaaatgtgttcataagtctgtcagacgtctgtgtttcccggttttattactgatc ccggta ctat tctctgcaggaagtcttgcgggaacggtcaataatgaactcgggtatcagt tat ttcgtgat gaatttgtcggtacgctggataaggcagctatgcctgatttcagtgctgtggattcggaa atcggt gtggcgacactgataaacccgcagtatatcgccagcgtgaaacataacgggggatataca aacgtt agct ttggtgatggtgaaaaccgttacaatatcgtggaccggaataatgcgccgtcactggatt tt catgccccccggctggataaactggtgacagaggttgcccctactgcggtgacggcgcag ggggca gtggctggcgcatatctggataaggagcgctatcctgttttttatcgtctggggtctggt actcag tatattaaggacagtaacggacagctgacaaaaatgggaggtgcatattcctggctgacc ggcggg

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预 防 大 肠 杆 菌 病 的 基 因 tsh-Ser 的 制 备 方 法 , 以 5, -atgaacagaatt tatt-3' 为上游弓 |物 zxl, 以 5, - gaatgaataacgaa-3' 为 下游引物 zx2,以 078血清型大肠杆菌的质粒 DNA为模板,采用 PCR扩增方法获 得。

tsh Ser编码的蛋白, 其氨基酸序列如下:

AlaArgLysCysValHisLysSerValArgArgLeuCysPheProValLeuLeuLeuIle ProVal jQSSiHdsvXlOJaS^IV^lvnsisXqdsvuivIWJdUiOJmusviXxBivsTHoniBAO Jd

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T6SOOO/ClOiN3/X3d ^CZC8l/1-T0i OAV 本发明的具体工艺步骤和工艺条件还有:

制备方法中的步骤 A是选用 OMEGA公司提供的质粒提取试剂盒( P 1 a sm i d Mini Kit I D6943-01*),并按照其说明书进行, 提取出 078 血清型大肠杆 菌的质粒 DNA。

步骤 B是选用全式金公司提供的 PCR试剂盒,并按照其说明书进行; 通过 PCR 扩增来获得目的基因。 设计上游引物为 zxl: 5' -atgaacagaatttatt

-3' ,下游引物为 zx2: 5, -gaatgaataacgaa-3' 为特异引 以 078血清型 大肠杆菌质粒 DNA为模板, 釆用 PCR扩增方法获得。

PCR反应体系如下:

反应物 用量

10 X Buffer (含 Mg 2+ ) 2.5μΙ

2.5mmol/L dNTP 2. Ομί

20mmol/L zxl 0.5μί

20mmol/L zx2 0.5 pL

DNA模板 2.5 M L

2.5U/mL Taq酶 0.5

ddH 2 0 16. 5 L

总体积 25. Ομί

PCR反应条件为: 96°C预变性 5分钟, 94'C变性 1分钟: 50°C退火 30-60 秒, 72°C延伸 1-2分钟, 30个循环; 72°C延伸 10分钟后, 置于 4°C冰箱保 存。

本发明中的引物由申请人自行设计, 主要基于产物的特异性好、 引物精 简不冗长、 不易引起错配等技术考虑。

本发明中的 tsh-Ser基因和大肠杆菌 01血清型的温度敏感血凝素 tsh基 因很相似。 经过序列比对, 该基因与国际基因库上收录的从美国火鸡体内 分 离得到的大肠杆菌 01 血清型基因序列的同源性为 99% , 序列比对表明: 第 1900 位的碱基由 G 突变为 A, 氨基酸国际基因库中的氨基酸序列由甘氨酸 (Gly ) 突变为丝氨酸(Ser) 。 后续的实验表明, 碱基突变之后该基因对大 肠杆菌病产生很好的预防作用。

tsh- Ser基因与 tsh基因同源性、 广谱性及免疫效果比较对照 与 01血清型来源的 能够免疫的致病性

免疫效果 t sh基因的同源性 血清型 (广谱性)

从美国火鸡分离的 01

100% 01 80% 血清型的 t sh基因

01 100%

02 100%

057 100% 从中国鸡分离的 078血

99% 065 100% 清型的 t sh-Ser基因

078 100%

085 100%

092 100% 由上表可知如下结果:

1、 本发明中的 t sh-Ser基因和 01血清型来源的 t sh基因相比具有较高的 同源性 (99% ) 。

2、 本发明中的 t sh-Ser基因和 01血清型来源的 t sh基因相比, 能够对更 多血清型的大肠杆菌 (01、 02、 057、 065、 078、 085、 092 血清型) 产生免 疫。

3、 与 01血清型来源的 t sh基因相比, 本发明中的 t sh- Ser基因对更多血 清型的大肠杆菌(01、 02、 057、 065、 078、 085、 092血清型)的免疫效果均 为 100%。

本发明与现有技术相比所具有的实质性特点和 显著技术进步在于:

1、 通过 PCR方法从致病性大肠杆菌 078血清型上获得了基因 t sh- Ser , 与发致病性大肠杆菌 01血清型上获得的 t sh基因相比, 该基因的一个碱基突 变之后, 其密码子所代表的氨基酸由甘氨酸突变为丝氨 酸。

2、 由于基因 t sh-Ser发生突变导致蛋白结构和功能产生了变化 。 使该基 因对 6种血清型大肠杆菌(01、 02、 057、 065、 078、 085、 092血清型)均能 产生免疫性, 所以具有较高的广谱性。

3、 基因 t sh-Ser 对 6 种血清型大肠杆菌 (01、 02、 057、 065、 078、 085、 092血清型)的免疫效果均为 1 00%, 因此该基因对易感大肠杆菌病的动 物具有更好的免疫效果, 相比现有的 t sh 基因具有更为广阔的工业开发前 景。

附图说明

本发明的附图有:

图 1致病性大肠杆菌 078血清型来源的基因经 PCR后, 该 t sh-Ser基因 的 1%琼脂糖凝胶电泳图。

图 1 中 M 为 DL8000 Marker (指示范围为 8000, 5000, 3000, 1500,

1000, 500 ) ; 扩增得到的 tsh片段长度 4134bp, 与预期大小相符。

图 2 PCR反应两端条件的反应产物经 1%琼脂糖凝胶电泳图。

图 2 中 DL8000 Marker (指示范围为 8000, 5000, 3000, 1500, 1000,

500 ) ; 扩增得到的片段长度 4134bp, 与预期大小相符。

具体实施方式

附图给出了本发明的实施例, 以下结合附图对本发明的实施例作进一步 描述, 但不作为对本发明的限定, 本发明的保护范围以权利要求记载的内容 为准, 任何依据说明书做出的等效技术手段替换, 均不脱离本发明的保护范 围。

实施例 1

A、 用营养肉汤活化培养 078血清型大肠杆菌, rc, 200转 /分钟, 培养

18小时, 获得 078血清型大肠杆菌培养物; 利用 OMEGA试剂盒(Plasmid Mini Kit I D6943-01*)并按照试剂盒中所规定的搡作步骤提 质粒 DNA, 以提取 的质粒 DNA作为 PCR反应的模板;

B、 PCR反应体系如下:

反应物 用量

10 X Buffer (含 Mg 2+ ) 2.5 μΙ

2.5mmol/L dNTP 2. Ομί

20mmol/L zxl 0.5 μί

20mmol/L zx2 0.5 μί

DNA模板 2.5 pL

2.5U/mL Taq畴 0.5 ML

ddH 2 0 16.5 L

总体积 25. Ομί

C、 预防大肠杆菌病的基因 tsh- Ser的制备方法, 以 5, -atgaacagaatt tatt-3' 为上游弓 I物 zxl, 以 5, -gaatgaataacgaa-3' 为下游引物 zx2, 以 078血清型大肠杆菌为模板, 釆用 PCR扩增方法获得。 PCR反应条件为: 96°C 预变性 5分钟, 94°C变性 1分钟; 5(TC退火 30秒, 72°C延伸 1分钟, 30个循 环; 72°C延伸 10分钟后, 置于 4°C冰箱保存。

PCR产物经过 1%琼脂糖凝胶电泳, 电泳图如图 2(左边第一条泳道)所示。 实施例 2

A、 用营养肉汤活化培养 078血清型大肠杆菌, 37°C, 200转 /分钟, 培养 18小时, 获得 078血清型大肠杆菌培养物; 利用 OMEGA试剂盒(Plasmid Mini Kit I D6943-01*) 并按照试剂盒中所规定的搡作步骤提取质粒 DNA, 以提取 的质粒 DNA作为 PCR反应的模板;

B、 PCR反应体系如下:

反应物 用量

10 X Buffer (含 Mg 2+ ) 2.5 μ L

2.5画 ol/L dNTP 2. Ομί

20mmol/L zxl 0.5pL

20mmol/L zx2 0.5 ML

DNA模板 2.5 μ L

2.5U/mL Taq酶 0.5 M L

ddH 2 0 16.5pL

总体积 25. OML

C、 预防大肠杆菌病的基因 tsh-Ser的制备方法, 以 5, -atgaacagaattta tt-3' 为上游引物 zxl, 以 5, -gaatgaataacgaa-3' 为下游引物 zx2, 以 078 血清型大肠杆菌质粒 DNA为模板, 采用 PCR扩增方法获得。 PCR反应条件为: 96°C预变性 5分钟, 94 变性 1分钟; 50°C退火 45秒, 72°C延伸 1.5分钟, 30个循环; 72°C延伸 10分钟后, 置于 4 冰箱保存。

PCR产物经过 1%琼脂糖凝胶电泳, 电泳图如图 1所示。

实施例 3

A、 用营养肉汤活化培养 078血清型大肠杆菌, 37°C, 200转 /分钟, 培养 18小时, 获得 078血清型大肠杆菌培养物; 利用 OMEGA试剂盒(Plasmid Mini Kit I D6943-01*)并按照试剂盒中所规定的操作步骤提 质粒 DNA, 以提取 的质粒 DNA作为 PCR反应的模板;

B、 PCR反应体系如下:

反应物 用量 10 x Buffer (含 Mg 2+ ) 2.5 μΙ

2.5隱 ol/L dNTP 2.0μΙ

20tnmol/L zxl 0.5 M L

20mmol/L zx2 0.5 ί

DNA模板 2.5 M L

2.5U/mL Taq酵 0.5 L

ddH 2 0 16.5μί

总体积 25. Ομί

C、 预防大肠杆菌病的基因 tsh- Ser的制备方法, 以 5, -atgaacagaatt tatt-3' 为上游引物 zxl, 以 5, -gaatgaataacgaa-3' 为下游引物 zx2, 以 078血清型大肠杆菌为模板, 采用 PCR扩增方法获得。 PCR反应条件为: 96°C 预变性 5分钟, 94°C变性 1分钟; 5(TC退火 60秒, 72°C延伸 2分钟, 30个循 环; 72°C延伸 10分钟后, 置于 4'C冰箱保存。

PCR产物经过 1%琼脂糖凝胶电泳, 电泳图如图 2(左边第二条泳道)所示。 实施例 1-3得到的 DNA序列和氨基酸序列如前述。 由实施例 1、 实施例 2 和实施例 3的 PCR产物经过 1%琼脂糖凝胶电泳图可知: 当 PCR的退火温度在 30-60秒、 延伸时间范围分别在 1-2分钟时, 当 PCR的退火温度在 45秒、 延 伸时间范围在 1.5 分钟时, PCR产物的特异性最好, 没有出现拖尾现象; 当 PCR的退火温度范围在 30秒和 60秒、 延伸时间分别在 1.5分钟向 1分钟和 2 分钟延伸时, PCR 产物的特异性降低, 出现拖尾现象。 拖尾现象的出现会使 PCR产物和开环的质粒进行连接时降低形成阳性 重组质粒的成功率。