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CN1706948A | 2005-12-14 |
DATABASE GENBANK 12 December 2005 (2005-12-12), Database accession no. AY781355
NI Z.Y ET AL: "Isolation and characterization of a transcription factor TaDREB6 gene from Triticum aestivum L", JOURNAL OF TRITICEAE CROPS, vol. 28, no. 3, 2008, pages 357 - 363
XU, Z. S. ET AL.: "Isolation and molecular characterization of the Triticum aestivum L. ethylene-responsive factor 1 (TaERFl) that increases multiple stress tolerance.", PLANT MOL BIOL., vol. 65, no. 6, 15 September 2007 (2007-09-15), pages 719 - 732
北京纪凯知识产权代理有限公司 (CN)
权利要求 1、 一种蛋白质, 是如下 (a) 或 (b) : (a) 由序列表中序列 1所示的氨基酸序列组成的蛋白质; (b)将序列 1的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和 /或缺失和 /或 添加且与植物耐逆性相关的由序列 1衍生的蛋白质。 2、 编码权利要求 1所述蛋白的基因, 优选为如下 1) 或 2) 或 3) 或 4) 或 5) 的 DNA分子: 1) 序列表中序列 2 自 5' 端第 128至 1168位核苷酸所示的 DNA分子; 2) 序列表中序列 2 自 5' 端第 128至 1193位核苷酸所示的 DNA分子; 3) 序列表中序列 2所示的 DNA分子; 4)在严格条件下与 1)或 2)或 3) 限定的 DNA序列杂交且编码耐逆性相关蛋白 的 DNA分子; 5) 与 1) 或 2) 或 3) 限定的 DNA序列具有 90%以上同源性, 且编码耐逆性相关 蛋白的 DNA分子。 3、含有权利要求 2所述基因的重组表达载体、表达盒、转基因细胞系或重组菌。 4、 如权利要求 3 所述的重组表达载体, 其特征在于: 所述重组表达载体为 YEP-GAP- 7¾層 、 ρΒΙ121_7¾層 或 pAHC25_7¾層 ; 所述 YEP-GAP-7¾ZWM 为将权利要求 2所述基因插入 YEP-GAP的多克隆位点得 到的重组质粒, 优选为将序列表的序列 2 自 5'端第 128至 1193位核苷酸所示的 DNA 片段插入 YEP-GAP的 EcoRi和 o\酶切识别位点之间得到的重组质粒; 所述 p B 1121 - TaDREB4B为将权利要求 2所述基因插入 p B 1121的多克隆位点得到 的重组质粒, 优选为将序列表的序列 2 自 5'端第 128至 1193位核苷酸所示的 DNA 片段插入 PBI121的 BamHI和 Xhol酶切识别位点之间得到的重组质粒; 所述 pAHC25-7¾ZWM 为将权利要求 2所述基因插入 pAHC25的多克隆位点得到 的重组质粒, 优选为将序列表的序列 2 自 5'端第 128至 1193位核苷酸所示的 DNA 片段插入 PAHC25的 Smal和 Spel酶切识别位点之间得到的重组质粒。 5、 一种培育转基因植物的方法, 是将权利要求 2所述基因导入目的植物中, 得 到耐逆性高于所述目的植物的转基因植物。 6、 如权利要求 5所述的方法, 其特征在于: 权利要求 2所述基因通过权利要求 3或 4所述重组表达载体导入所述目的植物中; 所述耐逆性为耐非生物胁迫或抗病。 7、 如权利要求 6所述的方法, 其特征在于: 所述耐非生物胁迫为耐旱和 /或耐 盐和 /或耐高温; 所述目的植物为拟南芥, 优选为哥伦比亚生态型拟南芥; 所述方法 为将权利要求 2所述基因通过所述 pBI 121- TaDREB4B导入所述目的植物中。 8、 如权利要求 6所述的方法, 其特征在于: 所述目的植物为小麦, 优选为济麦 19; 所述耐非生物胁迫为耐旱; 所述耐旱体现为如下 ( I ) 和 /或 (Π ) : ( I ) 所述转基因植物的脯氨酸含量和 /或可溶性总糖含量和 /或过氧化物酶活 性和 /或光合速率高于所述目的植物; ( II ) 干旱条件下, 所述转基因植物的株粒重和 /或千粒重高于所述目的植物; 所述方法为将权利要求 2所述基因通过所述 pAHC25- 7¾ZWM 导入所述目的植 物中。 9、 如权利要求 6所述的方法, 其特征在于: 所述目的植物为小麦, 优选为济麦 19 ; 所述抗病为抗白粉病; 所述白粉病是由白粉病病原菌 E09引起的; 所述方法为将权利要求 2所述基因通过所述 pAHC25- 7¾ZWM 导入所述目的植 物中。 10、 权利要求 1所述蛋白作为转录因子的应用。 |
本发明涉及一种植物耐逆性相关蛋白 TaDREB4B及其编码基因和应用。
背景技术
干旱、 高盐及低温等逆境胁迫是影响小麦生长、 发育的障碍因子。 因此, 了解 小麦对逆境条件的应答与信号传导机制, 提高小麦品种的抗逆性, 成为小麦遗传研 究及小麦品种改良的重要任务之一。在逆境胁 迫下植物体内会产生一系列应答反应, 伴随着许多生理生化及发育上的变化。 明确植物对逆境的反应机制, 将为抗逆基因 工程研究和应用提供科学论据。 目前, 植物抗逆性研究已逐渐深入到细胞、 分子水 平, 并与遗传学和遗传工程研究相结合, 探索用生物技术来改进植物生长特性, 其 目的是提高植物对逆境的适应能力。
在干旱、 高盐和低温等环境胁迫的逆境条件下, 植物能够在分子、 细胞和整体 水平上做出相应的调整, 以最大程度上减少环境所造成的伤害并得以生 存。 许多基 因受胁迫诱导表达, 这些基因的产物不仅能够直接参与植物的胁迫 应答, 而且能够 调节其它相关基因的表达或参与信号传导途径 , 从而使植物避免或减少伤害, 增强 对胁迫环境的抗性。 与胁迫相关的基因产物可以分为两大类: 第一类基因编码的产 物包括离子通道蛋白、 水通道蛋白、 渗透调节因子 (蔗糖、 脯氨酸和甜菜碱等) 合 成酶等直接参与植物胁迫应答的基因产物; 第二类基因编码的产物包括参与胁迫相 关的信号传递和基因表达调节的蛋白因子, 如蛋白激酶、 转录因子等。 其中, 转录 因子在植物胁迫应答的基因表达调控中起着重 要作用。
转录因子也称为反式作用因子, 是能够与真核基因启动子区域中顺式作用元件 发生特异性作用的 DNA结合蛋白, 通过它们之间以及与其它相关蛋白之间的相互 作 用, 激活或抑制转录。 转录因子的 DNA结合区决定了它与顺式作用元件结合的特异 性, 而转录调控区决定了它对基因表达起激活或是 抑制作用。 此外, 其自身活性还 受到核定位及寡聚化等作用的影响。
目前已知在植物中与胁迫相关的转录因子主要 有: 具有 AP2 结构域的 AP2 (APETALA2) /EREBP (乙烯应答元件结合蛋白, ethylene responsive element binding protein)转录因子家族、含有碱性区域和亮氨酸 链的 bZIP ( basic region/leucine zipper motif transcription factors ) 类转录因子、 含有保守的 WRKY氨基酸序列 的 WRKY转录因子家族、 含有碱性螺旋-环 -螺旋 (bHLH)和亮氨酸拉链的 MYC家族和 具有色氨酸簇 (Trp cluster) 的 MYB家族。 这五个转录因子家族, 除 WRKY家族不 参与植物的水胁迫反应外, 其它四个家族均参与调节植物对干旱、 高盐和低温等的 逆境胁迫反应。其中, AP2/EREBP类转录因子在高等植物中广泛存在, 它是植物所特 有的一类转录因子, 近年来, 在拟南芥、 烟草、 玉米、 水稻、 大豆和油菜中均有报 道, 这表明 AP2/EREBP类转录因子在高等植物中普遍存在并具 有重要作用。 DREB (脱水应答元件结合蛋白, DRE-binding protein)类转录因子是 AP2家族中 EREBP-l ike亚家族中的一个成员。 DREB和 EREBP类转录因子在氨基酸序列上没有显 著的相同性, 但都含有一段非常保守的由 58 个左右氨基酸组成的 DNA 结合区域 ( EREBP/AP2结构域) 。 蛋白质三维分析表明, 该区域含有 3个 β -折叠, 对识别各 类顺式作用元件起关键作用。 其中位于第二个 β _折叠中的第 14、 19位的两个氨基 酸残基的差异, 决定这类转录因子与不同顺式作用元件的特异 结合。 DREB类转录因 子第 14位氨基酸是缬氨酸 (V14 ) , 第 19位氨基酸是谷氨酸 (E19 ) , 其中第 19位 的氨基酸并不保守, 例如水稻的 OsDREB l 转录因子的第 19 位氨基酸就是缬氨酸 ( D i bonze J G , Sakuma Y, I o Y, Kasu a M, Dubou zet EG, Miura S , Seki M, Shinozaki K , Yamaguchi --Shinozaki K , 2003 ) 。 在 DREB相关蛋白中决定 DNA结合 的特异性方面, V14的作用明显要比 E19重要 ( Sakuma Y, Liu Q, Dubouzet JG, Abe H, Shinozaki K and Yamaguchi-Shinozaki K, 2002 ) ; 而 ERF类转录因子第 14位 氨基酸是甘氨酸, 第 19位是天冬氨酸, 因而 DREB特异结合 DRE/CRT顺式元件, ERF 特异结合 GCC-盒。 AP2/EREBP结构域的 C-端区还包含 1个由 18个氨基酸残基组成的 核心序列,该序列形成双亲性的 α -螺旋,该 α -螺旋可能参与同其它转录因子及 DNA 间的相互作用。
目前, 在许多植物中都发现含有 EREBP/AP2结构域的转录因子, 并分别与抗病、 抗逆等信号传递有关(刘强,赵南明, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K, 2000 )。 刘强等认为, 一个 DREB基因可以调控多个与植物干旱、 高盐及低温耐性有关的功能 基因的表达(刘强, 赵南明, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki Κ, 2000 )。 Kasuga 等的研究证实, 导入到拟南芥的 DREB1A基因可以同时促进与逆境胁迫耐性有关的 基 因 rd29、 rdl7、 kinl、 cor6. 6、 corl5a以及 erdlO的表达, 转基因植株的抗逆性大 大增强 ( Kasuga M, Liu Q, Miura S, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K., 1999 )。 同样, 低温耐性转录因子 CBF1 的转基因植株的耐低温能力有显著提高 ( Jaglo-Ottosen KR, Gi lmour SJ, Zarka DG, Schabenberger 0, Thomashow MF., 1998 ) 。 由于植物的逆境耐性是由多基因调控的复杂性 状, 依靠导入单个功能性蛋 白基因很难实现植物抗逆性的综合提高。 因此, 利用一个关键性转录因子促进多个 功能基因的表达, 从而增强植物的抗逆性, 已经成为植物抗逆基因工程的研究热点。
根据含 DNA结合区的数目, AP2/EREBP转录因子分为 AP2 (APETALA2)和乙烯应答 元件结合蛋白 EREBP ( ethylene-responsive element binding protein ) 以及 RAV 三个大类型。 AP2型转录因子包括拟南芥的 AP2、 ANT, 玉米的 Glossy、 idsl等。 这 种类型的转录因子含有两个 AP2/EREBP结构域, 调节细胞的生长发育, 在拟南芥中 已发现 14个 AP2型转录因子基因; EREBP型转录因子仅含 1个 AP2/EREBP结构域, 调节植物对激素 (乙烯) 、 病原、 低温、 干旱及高盐等地分子应答反应。 EREBP型转 录因子中, 已发现有烟草 EREBPl-4、番茄 Pti4_6、拟南芥 RAV1_2、 AtEBP、 AtERFl_5、 DREB1A-C ( CBF1-3 ) 和 DREB2A-B等许多成员, 分别与细胞发育、 激素、 抗病、 低温 及干旱、 高盐等信号传递有关。 这些 EREBP 型转录因子又可以再分为: EREBP ( ethylene-responsive element binding protein , 即 ERF ) 亚组, 包括烟草 EREBP 1-4 , 番茄 Pti4-6、 拟南芥 AtEBP、 AtERFl_5、 这类转录因子与含核心序列 AGCCGCC的 GCC-盒特异结合, 因此, 它的 DNA结合区又称为 GCC-盒结合域(GCC-box binding domain, GBD ) , 其中第 2个 G、 第 5个 G、 第 7个 C对 ERF蛋白的识别有 重要作用 (Hao D, Ohme-Takagi M, Sarai A, 1998 ) 。 用核磁共振对其三维空间结 构的研究表明, AtERFl的 GBD通过形成 3个反向的 β _片层与其靶序列 GCC-盒的大 沟相结合; DREBP亚组, 包括拟南芥 DREB1A-C ( CBF1-3 ) 和 DREB2A-B, 这类转录因 子在干旱、 高盐、 低温下特异结合干旱应答元件 DRE/CRT, 在拟南芥基因组中发现 124个 DREBP型转录因子基因; RAV型转录因子包括拟南芥 RAV1、 RAV2、含有两个不 同的 DNA结合区一 ERF/AP2和 B3, 在拟南芥中已发现 6个 RAV型转录因子基因。 还 有一类特殊的转录因子 AL079349 , 它与以上的转录因子都不同, 自成一类。
最近发现 EREBPs蛋白参与了干旱、高盐和低温胁迫的信号 传导和基因表达调控。 Mine等人从低温储藏的土豆块茎中分离到了 EREBP转录因子 CIP353 , 受低温胁迫诱 导强烈表达 ( Mine T, Hiyoshi T, Kasaoka K, Ohyama A, 2003 ) , 说明可能有 EREBP 蛋白参与了受低温胁迫的基因表达调控。 Park等利用西红柿为材料,得到了受高盐、 乙烯或茉莉酸诱导表达的 EREBP转录因子 7¾i基因, EMSA( Electrophoretic mobi l ity shift assays ) 试验分析发现, Tsi 蛋白与 GCC-box和 DRE/CRT顺式元件都能结合 ( Park JM, Park CJ, Lee SB , Ham BK, Shin R, Paek KH, 2001 ) , 尽管前者结合 能力大于后者, 但说明, 某些 EREBP蛋白能激活受渗透胁迫诱导表达的基因。 在正 常生长条件下, 7¾i基因的超量表达提高了转基因植株 35S TsU、 的耐盐性、 增 强了抗病性 (Park JM, Park CJ, Lee SB, Ham BK, Shin R, Paek KH, 2001 ) , 以 上说明了 7¾i基因可能参与了生物胁迫和非生物胁迫两 信号传导途径。 由高盐胁 迫激活的一条类 MAPK信号传递模式(包括 SIMKK和 SMK),将胁迫信号传递给 EIN2 (在乙烯信号传递途径的 CTR1下游) (Guo HW and Ecker J, 2004 ) , 最后激活某 些 EREBPs转录因子, 调控渗透胁迫相关基因的表达, 提高植物的耐盐性。 对于是否 存在含 GCC-box元件, 且表达产物直接参与非生物胁迫响应的基因, 还有待作进一 步的证实。
综合目前的研究结果, 植物在逆境胁迫条件下的信号传递途径至少有 以下六条 途径: (1 ) 依赖于 ABA的信号传递途径有三条: 受干旱、 高盐诱导, 激活 MYB、 MYC 类转录因子基因, 调控具有 MYBR或 MYCR顺式作用元件的靶基因; 受干旱、 高盐诱 导, 激活 ABF/AREB类转录因子基因, 调控具有 ABRE顺式作用元件的靶基因; 受干 旱、 高盐诱导, 激活 CBF4, DREB1类转录因子基因, 调控具有 DRE/CRT顺式作用元 件的靶基因。 (2 ) 不依赖于 ABA的信号传递途径有三条: 受干旱、 高盐诱导, 激活 DREB2类转录因子基因, 调控具有 DRE/CRT顺式作用元件的靶基因; 受低温诱导, 激 活 CBF1-3/DREB1A-C类转录因子基因, 调控具有 DRE/CRT顺式作用元件的靶基因; 受干旱、 高盐或乙烯诱导, 激活 ERF类转录因子基因, 调控具有 DRE/CRT或 GCC顺 式作用元件的靶基因。
发明公开
本发明的目的是提供一种植物耐逆性相关蛋白 TaDREB4B及其编码基因和应用。 本发明提供的蛋白质, 为一种脱水应答元件结合蛋白, 来源于小麦属小麦 ( Triticum aestivum L. ) , 是如下 (a) 或 (b) :
(a) 由序列表中序列 1所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(b)将序列 1的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的 代和 /或缺失和 /或 添加且与植物耐逆性相关的由序列 1衍生的蛋白质。
序列 1所示蛋白质由 346个氨基酸残基组成, 自氨基端第 26位 -33位氨基酸残 基序列和第 63位 -67位氨基酸残基序列为两个可能的核定位信号 区, 自氨基端第 89 位 -147位氨基酸残基序列为保守的 AP2/EREBP结构域。
为了使 (a) 中的 TaDREB4B便于纯化, 可在由序列表中序列 1 所示的氨基 酸序列组成的蛋白质的氨基末端或羧基末端连 接上如表 1所示的标签。
表 1 标签的序列
上述 (b) 中的 TaDREB4B可人工合成, 也可先合成其编码基因, 再进行生物表 达得到。 上述 (b) 中的 TaDREB4B的编码基因可通过将序列表中序列 2所示的 DNA 序列中缺失一个或几个氨基酸残基的密码子, 和 /或进行一个或几个碱基对的错义突 变, 和 /或在其 5'端和 /或 3'端连上表 1所示的标签的编码序列得到。
编码所述蛋白的基因也属于本发明的保护范围 。
所述基因可为如下 1) 或 2) 或 3) 或 4) 或 5) 的 DNA分子:
1) 序列表中序列 2 自 5' 端第 128至 1168位核苷酸所示的 DNA分子;
2) 序列表中序列 2 自 5' 端第 128至 1193位核苷酸所示的 DNA分子;
3) 序列表中序列 2所示的 DNA分子;
4)在严格条件下与 1)或 2)或 3) 限定的 DNA序列杂交且编码耐逆性相关蛋白 的 DNA分子;
5) 与 1) 或 2) 或 3) 限定的 DNA序列具有 90%以上同源性, 且编码耐逆性相关 蛋白的 DNA分子。
所述严格条件为在 0.1XSSPE (或 0.1XSSC) 、 0.1% SDS 的溶液中, 65°C条 件下杂交并洗膜。 序列 2所示 cDNA序列由 1494个核苷酸组成, 该基因的开放阅读框架为自 5 ' 端第 128位 -1168位核苷酸。
含有所述基因的重组表达载体、 表达盒、 转基因细胞系或重组菌均属于本发明 的保护范围。
可用现有的植物表达载体构建含有所述基因的 重组表达载体。 所述植物表达载 体包括双元农杆菌载体和可用于植物微弹轰击 的载体等。 所述植物表达载体还可包 含外源基因的 3 ' 端非翻译区域, 即包含聚腺苷酸信号和任何其它参与 mRNA加工或 基因表达的 DNA片段。所述聚腺苷酸信号可引导聚腺苷酸加 入到 mRNA前体的 3 '端, 如农杆菌冠瘿瘤诱导(Ti)质粒基因(如胭脂合 成酶 Nos基因)、 植物基因 (如大豆贮 存蛋白基因) 3 ' 端转录的非翻译区均具有类似功能。 使用所述基因构建重组植物表 达载体时, 在其转录起始核苷酸前可加上任何一种增强型 启动子或组成型启动子, 如花椰菜花叶病毒 (CAMV ) 35S启动子、 玉米的泛素启动子 (Ub i qui t in ) , 它们可 单独使用或与其它的植物启动子结合使用; 此外, 使用本发明的基因构建植物表达 载体时, 还可使用增强子, 包括翻译增强子或转录增强子, 这些增强子区域可以是 ATG起始密码子或邻接区域起始密码子等,但必 需与编码序列的阅读框相同, 以保证 整个序列的正确翻译。 所述翻译控制信号和起始密码子的来源是广泛 的, 可以是天 然的, 也可以是合成的。 翻译起始区域可以来自转录起始区域或结构基 因。 为了便 于对转基因植物细胞或植物进行鉴定及筛选, 可对所用植物表达载体进行加工, 如 加入可在植物中表达的编码可产生颜色变化的 酶或发光化合物的基因(GUS基因、萤 光素酶基因等) 、 具有抗性的抗生素标记物 (庆大霉素标记物、 卡那霉素标记物等) 或是抗化学试剂标记基因 (如抗除莠剂基因) 等。 从转基因植物的安全性考虑, 可 不加任何选择性标记基因, 直接以逆境筛选转化植株。
所述重组表达载体具体可为 ?-Gk?- TaDREB4B、 ^I U I- TaDREB4B 或 pAHC25- 7¾層 ;
所述 YEP-GAP- 7¾ZWM 为将所述基因插入 YEP-GAP的多克隆位点得到的重组质 粒。 所述 YEP-GAP- 7¾ZWM 优选为将序列表的序列 2 自 5'端第 128至 1 193位核苷 酸所示的 DNA片段插入 YEP-GAP的 EcoRl和 ol酶切识别位点之间得到的重组质粒。
所述 pBI 121- 7¾ZWM 为将所述基因插入 pBI 121 的多克隆位点得到的重组质 粒。所述 pBI 121- 7¾ZWM 优选为将序列表的序列 2 自 5'端第 128至 1 193位核苷酸 所示的 DNA片段插入 PBI 121的 BamHI和 Xho l酶切识别位点之间得到的重组质粒。
所述 pAHC25- 7¾ZWM 为将所述基因插入 pAHC25 的多克隆位点得到的重组质 粒。所述 pBI 121- 7¾ZWM 优选为将序列表的序列 2 自 5'端第 128至 1 193位核苷酸 所示的 DNA片段插入 pAHC25的 Smal和 Spe l酶切识别位点之间得到的重组质粒。
本发明还保护一种培育转基因植物的方法, 是将所述基因导入目的植物中, 得 到耐逆性高于所述目的植物的转基因植物。 所述基因具体可通过所述重组表达载体 导入所述目的植物中。 携带有所述基因的表达载体可通过使用 Ti质粒、 Ri质粒、植 物病毒载体、 直接 DNA转化、 显微注射、 电导、 农杆菌介导等常规生物学方法转化 植物细胞或组织, 并将转化的植物组织培育成植株。
所述耐逆性可为耐非生物胁迫或抗病。
所述耐非生物胁迫具体可为耐旱和 /或耐盐和 /或耐高温 (如 43 °C ) 。
所述目的植物既可以是单子叶植物也可以是双 子叶植物, 如拟南芥 (如哥伦比 亚生态型拟南芥) 、 小麦 (如济麦 19 ) 等。
所述耐旱可体现为如下 ( I ) 和 /或 (Π ) :
( I ) 所述转基因植物的脯氨酸含量和 /或可溶性总糖含量和 /或过氧化物酶活 性和 /或光合速率高于所述目的植物;
( II ) 干旱条件下, 所述转基因植物的株粒重和 /或千粒重高于所述目的植物; 所述抗病可为抗白粉病, 具体可为抗由白粉病病原菌 E09引起的白粉病。
本发明还保护所述蛋白作为转录因子的应用。
附图说明
图 1为 TaDREB4B与小麦 TaDREB氨基酸序列的同源性比对结果。
图 2为 7¾ZWM 受胁迫诱导表达的实时荧光定量 PCR图谱; A: 脱落酸处理; B : 乙烯处理; C: 高温处理; D : 茉莉酸甲酯处理; E : 冷害处理; F: 盐渍处理; G: 干 旱处理; H: 水杨酸处理; I: 白粉病病原菌处理。
图 3为酵母单杂交系统证明转录因子体内结合特 性和激活特性的原理示意图。 图 4为野生型和转基因拟南芥的抗旱性比较。
图 5为野生型和转基因拟南芥的耐盐性比较。
图 6为野生型和转基因拟南芥的耐高温性比较。
图 7 为野生型和转基因小麦的抗旱指标比较; A: 脯氨酸含量; B : 可溶性总糖 含量; C: POD酶活性; D : SPAD值。
图 8为野生型和转基因小麦对白粉病病原菌的耐 比较。
实施发明的最佳方式
以下的实施例便于更好地理解本发明, 但并不限定本发明。 下述实施例中的实 验方法, 如无特殊说明, 均为常规方法。 下述实施例中所用的试验材料, 如无特殊 说明, 均为自常规生化试剂商店购买得到的。 下述实施例中的%, 如无特殊说明, 均 为质量百分含量。 实施例 1、 TaDREB4B的克隆
一、 mRNA的分离
将水培的生长 10天左右的小白麦 (国家种质资源库, 编号 ZM242 )三叶期幼苗干 旱处理 2小时,用液氮速冻, -80 °C保存备用。采用 Quikprep Mi cro mRNA Puri fi cat ion Ki t ( Pharmac ia ) 进行 mRNA的分离。
二、 cDNA文库的构建及滴度测定 1 cDNA文库的构建
采用 Timesaver™ cDNA Synthesis Kit (Pharmacia) 将步骤一得到的 mRNA合成 cDNA双链, 并力口 fc。RI/〃。iI adaptor; 采用 ZAP Express® Predigested Gigapack® III Gold Cloning Kit (Stratagene)进行 cDNA文库的构建, 共得到 500ul库液。
2、 滴度的测定
(1) 取 lul库液用 SM Buffer稀释 1000倍;
(2) 分别取 lul 10ul lOOul稀释液至三个 10ml离心管中, 分别加 lOOul感 受态宿主菌 XLl-Blue MRF' (0D 6 。。为 1.0) , 于 37°C温浴 20min;
(3)分别加入 3ml顶胶(50°C)混匀, 立即铺于固体 NZY平板上, 凝固后倒置, 37°C培养过夜;
(4) 根据平板噬菌斑数, 求平均值, 即为库容量。
计算公式: 噬菌斑数 (Pfu) X稀释因子
X 1000ul/ml
噬菌体稀释液的体积 (ul)
经计算, 该 cDNA文库的滴度为 3.0X10 6 个噬菌斑。
三、 cDNA文库的筛选
1、 探针的准备
根据已克隆的 DREB基因的 AP2保守区序列设计引物 WAPF和 WAPR, 以普通小麦 的 cDNA为模板进行 PCR扩增。
WAPF: 5' -ACC GCG GTG TGA GGC AGA GGA - 3'
WAPR: 5' -TGA GAA GTT GAC ACG TGC TTT GGC - 3'
PCR扩增产物进行 1.2 %琼脂糖凝胶电泳。
2、 探针的回收
采用 Agarose Gel DNA Purification Kit Ver.2.0 (TaKaRa公司, Code No. DV805A) 回收纯化 180bp位置的条带 (探针) 。
3、 转膜
(1) 取 lul步骤二的 1的库液, 在培养皿中培养噬菌体, 大概 6.0X10 3 pfu;
(2) 噬菌斑培养好后放在 4°C冷却, 临用时取出置于超净台吹干, 防止转膜时 顶胶被膜粘起;
(3)将 Hybrond-N + 膜剪成圆形, 比直径为 150 的培养皿稍小, 用铅笔在膜上 表明编号及日期 (与培养皿对应) ;
(4)用镊子夹住膜两边, 有字面朝上, 中间先接触平板, 慢慢松开, 不要移动, 不要有气泡, 使膜自然摊平, 完全摊平后, 计时;
(5)用注射器针头在膜上扎三个不对称的孔, 在培养皿背面对应的位置用记号 笔做好标记;
(6) 3min后, 用镊子从一边开始轻轻揭起膜, 不要带起顶胶;
(7) 将膜迅速放入盛有变性液的培养皿中 (放一层滤纸及 15ml变性液) 变性 7min, 有字面朝下, 注意避免溶液到达膜的上表面;
(8) 将膜转移至盛有中和液的培养皿中 (放一层滤纸及 15ml中和液) 中和两 次, 每次 3min;
(9) 然后将膜转入漂洗液中洗 30min, 可轻轻摇动;
(10) 取出膜, 在干净的滤纸上吸干, 有字面朝下;
(11) 用保鲜膜将膜包好, 在紫外交联仪上交联 lmin, 4°C存放备用;
4、 预杂交和杂交反应
65°C预杂交 5-6h (新膜) ; 探针标记完后, 加入 NaOH溶液, 混匀后于室温静置 lOmin使探针变性, 然后 65°C杂交过夜。
5、 洗脱
在 55°C-65°C条件下洗膜。 用滤纸吸干洗好的膜, 保鲜膜包好, 压 X—光片。 6、 阳性克隆的二轮筛选
(1) 将 X光片与膜对齐, 确定位置, 描下膜上的三个不对称点的位置;
(2) 在读片机上放上 X光片及相应的培养皿, 根据不对称点使培养皿定位; (3) 用去头的 lml枪头取出确定的阳性杂交斑, 放在 lml SM 缓冲溶液中, 加 入 50ul氯仿;
(4) 振荡 30秒, 室温放置 1小时, 离心, 取上清;
(5) 取 10-50ul上清再次铺板, 培养噬菌体进行二次筛选;
(6) 二次筛选的步骤同上: 转膜、 预杂交和杂交反应、 洗脱、 压 X—光片, 得 到单个阳性噬菌斑。
四、 得到 TaDREB4B
1、 集群内删除(Mass excision)
(1) 制备 XLl-Blue MRF'和 XL0LR菌; 用液体 LB培养基培养 XLl-Blue MRF'和 XL0LR 菌, 30°C过夜, 培养基中添加 0.2%麦芽糖、 10mM MgS0 4 和抗生素, 分别为 12.5μ g/ml四环素和 50μ g/ml卡那霉素; 第二天, 1000 X g离心 lOmin收集菌体, 用 10mM MgS0 4 重悬, 使 0D 6 。。达到 1.0;
(2) 在一个 10ml的无菌离心管中加入:
Ιμ ΐ库液 (约含 6.0 X10 3 噬菌体颗粒)
XLl-Blue MRF' 200 μ 1 (0D 6 。。为 1·0) ExAssist 助手噬菌体 2μ l lXliTpfu/ml)
(3) 37°C温育 15min;
(4) 加入 20ml液体 NZY培养基, 37 °C振荡培养 2.5_3h;
(5) 65- 70°C加热 20min;
(6) 1000Xg离心 10min, 上清移至一个新管中;
(7) 在一个 1.5ml的离心管中混合 200 μ 1 XL0LR菌和 1 μ 1上清;
(8) 37°C温育 15min; (9) 取 10μ 1、 100 μ 1菌液分别涂于 LB固体培养基(含氨苄 50 μ g/ml)上, °C培养过夜。
2、 cDNA文库插入片段的检查
(1) 随机挑取步骤 1中集群内删除的单菌落, 提取它们的质粒 DNA;
(2) 用限制内切酶 fcoRl (Takara)消化, 反应体系 ΙΟμ Ι:
0.5μ 1
2μ 1
6.5μ 1
(3) 37°C消化 2h, 0.8%琼脂糖凝胶电泳, 发现 95%以上的载体有插入片段, 说明
95%以上的噬菌体含有重组子, 因此文库实际含有的重组子为 2.85X 10 6 (cDNA文库的 滴度为 3.0X10 6 ) 。 50%以上的重组子的插入片段在 800bp— 4Kb之间, 说明构建的文 库较完整。
3、 单克隆内删除(Single-clone excision)
(1)将得到单个阳性噬菌斑从平板上抠下, 放入到一个无菌的、 已加有 500 μ 1
SM缓冲液和 20 μ 1氯仿的离心管中, 漩涡振荡 10sec, 4°C储存;
(2)用液体 LB培养基培养 XLl-BlueMRF'和 XL0LR菌, 30°C过夜, 培养基中添 力口 0.2%(w/v)麦芽糖、 10mM MgS0 4 和抗生素, 分别为 12.5 μ g/ml四环素和 50 μ g/ml 卡那霉素;
(3) 第二天, 1000Xg离心 lOmin收集菌体, 用 10mM MgS0 4 重悬, 使 0D 6 。。达到
1.0;
(4) 在一个 10ml的无菌离心管中加入:
XLl-Blue MRF' 200 μ 1 (0D 6 。。为 1·0)
噬菌体贮存液 250 μ 1 (至少含 1 X 10 5 噬菌体颗粒) ExAssist助手噬菌体 Ιμ ΐ (>1 X 10 10 pfu/ml)
(5) 37°C温育 15min;
(6) 加入 3ml液体 NZY培养基, 37°C振荡培养 2.5_3h;
(7) 于 65-70°C水浴离心管 20min, 然后 1000 X g离心 15min;
(8) 将上清移至一个新的离心管中, 即为噬菌粒悬浮液;
(9)在一个 1.5ml的离心管中加入 200 μ 1步骤 (3) 制备好的 XL0LR菌和步骤
(8) 制备好的噬菌粒悬浮液 100μ 1, 再加入 300μ 1 液体 ΝΖΥ 培养基, 37°C温育 45-60min;
(10) 取 50 μ ΐ菌液涂于 LB固体培养基(含氨苄 50 μ g/ml)上, 37°C培养过夜;
(11) 第二天挑取阳性克隆, 用液体 LB培养基培养过夜, 提取质粒, 用 ¾oRI 酶切, 电泳检测插入片段长度。
( 12)选取插入片段大于 800bp的克隆进行测序, 在 ABI733测序仪(Genecore Biological Company) 上, 采用双脱氧核苷酸链终止法测定序列, 将得到的全序列 与 EMBL Bank以及 GENEBANK等核苷酸数据库比较, 用 DNASIS软件进行分析。 发现 18号克隆有一个保守的 AP2/EREBP结构域。 且基因结构完整。
(13) 分析 18号克隆的核苷酸序列及对应的氨基酸序列, 得到序列表中序列 2 所示的核苷酸序列。
将序列表的序列 1所示的蛋白命名为 TaDREB4B蛋白,由 346个氨基酸残基组成。 序列 1中的自氨基端第 26位 -33位氨基酸残基和第 63位 -67位氨基酸残基为两个可 能的核定位信号区, 自氨基端第 89-147位氨基酸残基为保守的 AP2/EREBP结构域。 TaDREB4B 蛋白的同源序列比对结果如图 1 所示 (黑框表示一致的氨基酸部分) , TaDREB4B与已报道的小麦 TaDREB (AAL01124)只有 34.97%的同源性, 说明 TaDREB4B 是一个新发现的小麦蛋白。 将 TaDREB4B蛋白的编码基因命名为 TaDREB4B繊, 其 开放阅读框架为自序列表的序列 2的 5' 端第 128位 -1168位核苷酸。 实施例 2、 实时荧光定量 PCR分析 TaDREB4B的表达特性
一、 进行各种胁迫处理
苗龄为 10天的小白麦幼苗, 进行以下处理
(1) 干旱处理: 将水培的小麦幼苗取出吸干根上的水分, 置于干燥的滤纸上, 干旱培养 30分钟、 1小时、 2小时、 4小时、 8小时、 12小时、 24小时后取出材料, 用 液氮速冻, -80°C保存备用。
(2) 盐渍处理: 将小麦幼苗置于 2%的由 NaCl和 Na 2 S0 4 组成的钠盐溶液中 (NaCl 与 Na 2 SC 质量百分比为 3: 2) 中, 光照培养 30分钟、 1小时、 2小时、 4小时、 8小时、 12小时、 24小时后分别取出材料, 用液氮速冻, -80°C保存备用。
(3) 脱落酸处理: 将小麦幼苗置于 200 μ Μ的脱落酸 (ABA) 水溶液中, 光照培 养 30分钟、 1小时、 2小时、 4小时、 8小时、 12小时、 24小时后分别取出并用液氮速 冻, -80°C保存备用。
(4) 白粉病病原菌处理: 将小麦幼苗接种白粉病菌株, 光照培养 3小时、 6小时、 12小时、 2天、 3天、 4天、 5天后, 取出并用液氮速冻, -80°C保存备用。
(5) 冷害处理: 将小麦幼苗置于 4°C培养箱, 光照培养 30分钟、 1小时、 2小时、 4小时、 8小时、 12小时、 24小时后取出并用液氮速冻, -80°C保存备用。
(6) 茉莉酸甲酯处理: 将小麦幼苗置于 50μ Μ的茉莉酸甲酯(JA)溶液中, 光照 培养 30分钟、 1小时、 2小时、 4小时、 8小时、 12小时、 24小时后分别取出并用液氮 速冻, -80°C保存备用。
(7) 乙烯处理: 小麦幼苗置于含有乙烯的塑料袋中, 光照培养 30分钟、 1小时、
2小时、 4小时、 8小时、 12小时、 24小时后分别取出并用液氮速冻, -80°C保存备用。
(8) 水杨酸处理: 将小麦幼苗置于 50μ Μ的水杨酸(SA)溶液中, 光照培养 30分 钟、 1小时、 2小时、 4小时、 8小时、 12小时、 24小时后分别取出并用液氮速冻, -80 °c保存备用。
( 9 ) 高温处理: 将小麦幼苗置于 42 °C下, 光照培养 30分钟、 1小时、 2小时、 4 小时、 8小时、 12小时、 24小时后分别取出并用液氮速冻, -80°C保存备用。
( 10 ) 对照的处理: 直接取未经任何处理的小麦幼苗 -80°C冻存作为对照 (0小 时) 。
二、 mRNA的分离
采用 Quikprep Micro mRNA Purification Kit ( Pharmacia) 进行 mRNA的分离。 三、反转录为 cDNA
¾ffi R103-Quant_Reverse_Transcriptase ( TIANGEN ) 将纯化的 mRNA反转录为 cDNA。
四、 实时荧光定量 PCR
根据 7¾ZWM^9序列, 在其可变区设计特异引物 TaDREB4BRTF和 TaDREB4BRTR。 以 actin为内参基因, 弓 I物为 actin_2F禾口 actin_2R。
TaDREB4BRTF : 5, - GATGTGTTCGAGCCATTGGAG- 3,;
TaDREB4BRTR : 5, - TGGTCCAAGCCATCCAGGTAG- 3, 。
actin-2F : 5, -CTCCCTCACAACAACCGC- 3,;
actin-2R: 5' -TACCAGGAACTTCCATACCAAC-3' 。
7¾ZWM 对各个胁迫及激素表现出响应, 见图 2。 实施例 3、 TaDREB4B的激活特性
用酵母单杂交系统证明转录因子的激活特性的 主要原理如图 3所示, 将 DRE顺式 作用元件和突变体 DRE顺式作用元件分别构建到 pHISi-1载体和 pLacZi载体的基本启 动子 Pmin ( minimal promoter) 上游, Pmin启动子下游连接报道基因 (His3、 LacZ 和 URA3 ) 。 当连接有编码转录因子的目的基因的表达载体 YEP-GAP (不含激活功能) 分别转化到连有 DRE顺式作用元件和突变体 DRE顺式作用元件的酵母细胞后, 如果连 有突变体 DRE顺式作用元件的酵母细胞中的报道基因不能 表达, 而连有特定的 DRE顺 式作用元件的酵母细胞中的报道基因能够表达 , 说明该转录因子能与 DRE顺式作用元 件结合, 且具有激活功能, 激活了 Pmin启动子, 促使报道基因表达。 从而证明目的 转录因子的体内结合特异性和激活功能。
YEP-GAP : 中国农业科学院作物科学研究保证向公众提供 ; 参考文献 Liu Q, Kasuga
M, Sakuma Y, Abe H, Miura S, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K. Two transcription factors, DREB1 and DREB2, with an EREBP/AP2 DNA binding domain separate two cellular signal transduction pathways in drought- and
low-temperature-responsive gene expression, respectively, in Arabidopsis, Plant Cell 1998 Aug ; 10 (8) : 1391-1406。
YPD液体培养基: 细菌培养用酵母抽提物 (Bacto-Yeast Extract ) 10g/L, 细菌 培养用胰化蛋白胨 (Bacto-Peptone) 20g/L, 调节 pH至 5.8, 12rC/15min灭菌, 降 至 60°C以后加入 40%的 Glucose, 使其终浓度为 20g/L。
SD/His—/Ura—/Trp—选择性培养基:不含氨基酸 酵母氮源(Yeast nitrogen base) 6· 7g/L, 营养缺陷型混合物 (drop-out media without His/Ura/Trp) 100ml, 琼脂 粉 (Bacteriological agar) 20g/L, 调节 pH至 5· 8, 121°C/15min灭菌, 降至 60°C后 加入 40%Glucose, 使其终浓度为 20g/L。
营养缺陷型混合物 (Drop-out mix) : (10X ) : L-Isoleucine (异亮氨酸) 300mg/L, L-Valine (缬氨酸) 1500mg/L, L-Adenine (腺嘌吟) 200mg/L, L-Arginine (精氨酸) 200mg/L, L_Histidine Hcl monohydrate (组氨酸) 200mg/L, L-Leucine (亮氨酸) 1000mg/L, L-Lysine Hcl (赖氨酸) 300mg/L, L-Methionine (甲硫氨酸) 200mg/L, L-Phenylalanine (苯丙氨酸) 500mg/L, L-Threonine (苏氨酸) 2000mg/L, L-Tyrosine (酪氨酸) 300mg/l。
lXPEG/LiAc: 50%PEG3350 8ml, 10XTE buffer 1ml, lOXLiAc 1ml。
10 XTE Buffer: lOOmM Tr is-He 1, lOmM EDTA、 pH=7.5, 121°C高压灭菌, 室温 保存。
ΙΧΤΕ/LiAc: 10 XTE buffer 1ml, lOXLiAc 1ml, dd¾0 8ml。
Z Buffer: N¾HP0 4 · 7H 2 016. lg/L, NaH 2 P0 4 · H 2 05.5g/L, KC10.75g/L, MgS0 4 · 7H 2 0 0.246g/L, 调节 pH至 7.0, 121°C/15min灭菌, 4°C保存。
X_gal储存液 (X-gal Stock Solution) : 用 N, N_dimethyl_formamide (DMF) 溶解 X-gal, 使其终浓度为 20mg/ml, _20°C贮存。
含有 X-gal的 Z buffer缓冲液 100ml (Z buffer with X-gal),现用现配: Z buffer 98ml, β -巯基乙醇 ( β -mercaptoethanol) 0.27ml, X_gal储存液 (X-gal stock solution) 1.67ml。
lOXLiAc: Clontech公司。
一、 重组表达载体的构建
1、 获得 7¾ZWM 基因的获得
根据 TaDREB4B基因的序列设计引物 TaDREB4B_EI和 TaDREB4B_XI, 引物末端分 别引入 EcoRV和 ¾oI酶切位点, 以小白麦的 cDNA为模板, PCR扩增获得 TaDREB4B 基因。
TaDREB4B-EI : 5, - GGGGAATTCATGACGGTAGATCGGAAGGAC- 3,;
TaDREB4B-XI : 5, -GGGCTCGAGATGGTTTGGCCGCCGCAAAG- 3,。
PCR扩增产物进行 1.2%琼脂糖凝胶电泳检测。
采用 Agarose Gel DNA Purification Kit Ver.2.0 (TaKaRa公司, Code No.: DV807A) 回收纯化 1.1Kb左右的 PCR产物。
2、 重组表达载体的构建
①用限制性内切酶^ 和 X oI酶切步骤 1回收纯化的 PCR产物, 回收酶切产物; ②用限制性内切酶^ 和 X oI酶切表达载体 YEP-GAP, 回收载体骨架;
③将步骤①的酶切产物和步骤②的载体骨架 连接;
④将步骤③的连接产物电击转化 JM109菌株 (Clontech公司购买) , 37°C过夜培 养, 挑取阳性克隆进行测序; 测序结果表明, 得到了重组质粒 YEP-GAP-7¾ZWM (在 YEP-GAP的 EcoRl和 ol酶切位点之间插入了序列表的序列 2自 5'端第 128- 1193位核 苷酸所示的 DNA片段) 。
二、 TaDREB4B的体内结合特异性和激活特性的验证
1、 酵母报道子的构建
(1) 正常双重酵母报道子的构建
DNA片段 A (含 4个 DRE元件): 5, - GAATTC- DRE- DRE- DRE- DRE- GTCGAC- 3, (DRE的核 心序列: TACCGACAT) 。 DNA片段 A的核苷酸序列见序列表的序列 3。
将 DNA片段 A构建到 pHis-1载体(MATCHMAKER One-Hybrid System, Clontech公司) 的 Pmin HIS3 启动子上游, 得到重组载体 pHis-1-DRE, 用 ¾o I 和 Nco I 内切酶将 pHis-1-DRE载体切成线状。
将 DNA片段 A构建到 pLacZi载体(MATCHMAKER One-Hybrid System, Clontech公司)
PCYCI启动子上游, 得到重组载体 pLacZi-DRE, 用 ¾o I 和 Nco I 内切酶分别将 pLacZi-DRE载体切成线状。
先将线状 pHis-1-DRE载体转化到酵母细胞(YM4271株系, MATCHMAKER One-Hybrid
System, Clontech公司)内,获得能在 SD/His—培养基上正常生长的酵母转化子(Yeast transformant) 。 接着以这种酵母转化子为寄主细胞, 继续转化含线状 pLacZi-DRE 载体。 这样在同时缺乏组氨酸和尿嘧啶的 SD/His7Ur a —培养基上, 选择获得含有 pHis-1-DRE和 pLacZi-DRE的正常双重酵母报道子。
(2) 突变体双重酵母报道子的构建
醒片段 B (含 4个 MDRE元件): 5, -GAATTC-MDRE-MDRE-MDRE-MDRE- GTCGAC- 3, (MDRE: 将 4个 DRE元件的核心序列 CCGAC突变成 TTTTT ) 。 DNA片段 Β的核苷酸序列见 序列表的序列 4。
用 DNA片段 B代替 DNA片段 A,方法同步骤(1),得到突变体双重酵母报道 子。
2、 PEG/LiAc法转化酵母及结果分析
(1)接种酵母菌株 (YM4271株系) 到 lml YPD液体培养基中, 剧烈震荡 2分钟, 分 散团块后将悬浮液转至含有 50ml YPD液体培养基的三角瓶中, 30°C/250rpm摇过夜, 测 0D600=1.7-1· 8 (计数约 4X 10 7 个 /mL) ;
(2)取 30ml步骤 (1) 过夜培养物接到 300ml新鲜的 YPD培养基中, 30°C/250rpm培 养, 约 3小时 (至 0D600=0.5±0.1) , 室温 1000g离心 5min, 收集菌体,弃上清, 用 1/2 体积 IX TE悬浮, 1000g/5min离心;
(3)吸弃上清,用 1.5ml新鲜配制的 ΙΧΤΕ/LiAc溶液悬浮, 振荡混匀备用;
(4)取出 0. lml酵母感受态进行转化,依次加下列溶液: 0. ΐμ δ YEP ~G ΑΡ - TaDREB4B, 0· lmg ssDNA (鲑鱼精 DNA, Sigma) 、 0.6mlPEG/LiAc, 高速振荡 1分钟, 30°C/200rpm 振荡培养 30分钟;
(5)加入 70ul DMSO (sigma#D8779) , 轻轻倒置混匀, 42°C热激 30分钟, 其间轻 轻振荡, 冰浴 2分钟, 室温 1000g离心 5min;
(6)吸弃上清, 加入 0.5ml 1XTE buffer悬浮细胞;
(7)用接种环蘸取悬浮液, 分别在含有 0、 15mmol/L 3-AT的 SD/His—/Ura7Trp—选 择性培养基上画线培养。
(8)平板的一半培养正常双重酵母报道子, 另一半培养突变体双重酵母报道子, 以便做对照分析。
(9)颠倒放置于培养箱中, 30°C培养 3— 4天。
(10)结果发现在 Ommol/L 3-AT的 SD/ His—/Ura7Trp—的培养基平板上正常的酵母报 道子和突变的酵母报道子都有生长, 但突变的酵母报道子的直径明显小; 而在 15mmol/L 3-AT的 SD/ His—/Ura7Trp—的培养基平板上正常的酵母报道 能正常生长, 但突变的酵母报道子被抑止没有生长。
3、 半乳糖苷酶活性检测
(1)从 Ommol/L 3-AT的 SD/ His—/Ura7Trp—的培养基平板上分别挑取正常的 母报 道子和突变的酵母报道子菌落。 转至 YPD液体培养基中, 于 30°C振荡培养, 待长至对 数生长后期, 取 1.5ml菌液, 3000rpm离心 30s;
(2)弃上清, 控干管中液体, 将离心管置于液氮中速冻 10min, 取出使其自然融 解, 加 50ul Z/X-gal溶液, 30°C温育, 结果发现正常的酵母报道子在 6_8h内变蓝, 而突变的酵母报道子在 12h内没有变化, 仍为白色。 说明转录因子 TaDREB4B能与 DRE 顺式作用元件结合, 且具有激活功能, 激活了 Pmin启动子, 促使报道基因表达。 从 而证明了 TaDREB4B的体内结合特异性和激活功能。 实施例 4、 TaDREB4B提高了拟南芥的抗旱、 耐盐、 耐高温性
一、 重组表达载体的构建
1、 raZWM 基因的克隆
根据 raZWM 基因的序列设计引物对 (TaDREB4B-121F和 TaDREB4B- 121R) , 引物末端分别引入 BamHI和 Xhol酶切识别位点, 以小白麦的 cDNA为模板, PCR扩增 TaDREB4B。
TaDREB4B-121F : 5' - GGGGGATCCATGACGGTAGATCGGAAGGAC- 3,;
TaDREB4B-121R : 5, -GGGCTCGAGATGGTTTGGCCGCCGCAAAG- 3,。
PCR扩增产物进行 1.2%琼脂糖凝胶电泳, 采用 Agarose Gel DNA Purification Kit Ver.2.0(TaKaRa公司, Code No.: DV807A)回收纯化 1.1Kb左右的条带。
2、 重组表达载体的构建
①用限制性内切酶 BamHI和 Xhol酶切步骤 1回收纯化的 PCR产物, 回收酶切产物; ②用限制性内切酶 BamHI和 Xhol酶切 pBI121 ( Clontech公司购买) , 回收载体骨 架;
③将步骤①的酶切产物和步骤②的载体骨架连 接;
④将步骤③的连接产物电击转化 T0P10菌株 (天根生化科技 (北京)有限公司购 买) , 37°C过夜培养, 挑取阳性克隆进行测序; 测序结果表明, 得到了重组质粒 p B 1121 - TaDREB4B (在 p B 1121的 B amH I和 Xh o I酶切位点之间插入了序列表的序列 2自 5 ' 端第 128-1193位核苷酸所示的 DNA片段) 。
二、 转基因植物的获得
1、 用重组质粒 ρΒΙ121-7¾Ζν?Μ 化农杆菌 C58 (Clontech公司购买) , 得到重 组农杆菌。
2、 将重组农杆菌接种于 YEP液体培养基中, 28°C、 3000rpm培养约 30小时;
3、 将步骤 2的菌液转至 YEP液体培养基(含 50 μ g/L卡那霉素和 50 μ g/L利福 平) 中, 28°C、 300rpm培养约 14小时 (菌液 0D600达到 1· 5-3· 0) ;
4、收集菌体, 4°C、4000g离心 lOmin,用 10%蔗糖(含 0.02%silwet)稀释至 0D600 约为 0.8-1.0;
5、 将拟南芥 (哥伦比亚生态型 Col-0, SALK公司购买) 整株与花盆一起倒扣在 盛有步骤 4的菌液的容器中, 使花浸泡 50s左右, 浸泡完毕后, 取出花盆, 侧放于 托盘中, 盖上黑色塑料布, 24hr后揭开塑料布, 直立放置花盆, 进行正常的光照培 养, 收获 1\代种子, 卡那霉素筛选 (浓度为 50 μ g/L卡那霉素) 阳性植株。 将阳性 植株进行 PCR鉴定, 鉴定结果表明, 得到的转基因植株 (转 7¾ZWM 基因植株) 。
τ 2 代表示 1\代自交产生的种子及由它所长成的植株, Τ 3 代表示 1~ 2 代自交产生的种 子及由它所长成的植株。
三、 转空载体对照植物的获得
用质粒 PBI121转化农杆菌, 得到重组农杆菌, 用重组农杆菌转化拟南芥 Col-0, 得到转空载体对照植株, 方法同步骤二。
四、 转基因植物的耐逆性鉴定
分别将 1~ 3 代转基因植株、 1~ 3 代转空载体对照植株和拟南芥 Col-0 (各 60株) 进行 耐旱性鉴定、 耐盐性鉴定和耐高温鉴定。 均设置三次重复实验, 结果取平均值。
1、 耐旱性
将正常生长 3周的幼苗, 连续 27不浇水, 第 28天统计成活率。 拟南芥 Col-0全部 死亡, 但 90%转基因植株存活且能正常生长 (见图 4, A: 拟南芥 Col-0; B: 转基因植 株) 。 转空载体对照植株的表型与拟南芥 Col-0—致, 存活率与拟南芥 Col-0没有显 著差异。
2、 耐盐性
将正常生长 3周的幼苗, 用 400mMNaCl浇灌, 然后转移到正常花盆中进行正常管 理, 2周后统计成活率。 拟南芥 Col-0几乎全部死亡, 但 55%转基因植株仍然能存活且 正常生长 (见图 5, A: 转基因植株; B: 拟南芥 Col-0) 。 转空载体对照植株的表型 与拟南芥 Col-0—致, 存活率与拟南芥 Col-0没有显著差异。
3、 耐高温
将正常生长 2周的幼苗, 进行高温处理(43°C), 分别处理 2小时、 4小时、 8小时, 然后常温恢复生长 1周, 计算成活率。 高温处理 2小时, 拟南芥 Col-0和转基因植株的 存活率都为 100%; 高温处理 4小时, 拟南芥 Col-0的存活率为 50%, 100%转基因植株存 活且能正常生长; 高温处理 8小时, 拟南芥 Col-0的存活率为 30%, 55%转基因植株存 活且能正常生长 (见图 6) 。 转空载体对照植株的表型与拟南芥 Col-0—致, 存活率 与拟南芥 Col-0没有显著差异。 实施例 5、 TaDREB4B提高了小麦的抗旱性和对病原菌的耐逆
一、 重组表达载体的构建
1、 raZW 基因的获得
根据 raZWM 基因的序列设计引物对 (TaDREB4B-121F和 TaDREB4B- 121R) , 引物末端分别引入 Smal 和 e>I 酶切位点, 以小白麦的 cDNA 为模板, PCR 扩增 7¾層 基因。
TaDREB4B-121F : 5' - TTTCCCGGGATGACGGTAGATCGGAAGGAC- 3,;
TaDREB4B- 121R: 5, - GGGACTAGTATGGTTTGGCCGCCGCAAAG- 3,。
PCR扩增产物进行 1.2%琼脂糖凝胶电泳检测。
采用 Agarose Gel DNA Purification Kit Ver.2.0 (TaKaRa公司, Code No.: DV807A) 回收纯化 1.1Kb左右的 PCR产物。
2、 重组表达载体的构建
①用限制性内切酶 和 e>I酶切步骤 1回收纯化的 PCR产物, 回收酶切产物;
②用限制性内切酶 5¾al和 5^e>I酶切 pAHC25 (购自北京拜尔迪生物技术公司) , 回收载体骨架;
③将步骤①的酶切产物和步骤②的载体骨架连 接;
④将步骤③的连接产物电击转化 T0P10菌株 (购自天根生化科技 (北京)有限公 司) , 37°C过夜培养, 挑取阳性克隆进行测序; 测序结果表明, 得到了重组质粒 PAHC25- TaDREB4B (在 pAHC25的 Smal和 ¾?e>I酶切位点之间插入了序列表的序列 2自 5 ' 端第 128-1193位核苷酸所示的 DNA片段) 。
二、 转基因植物的获得
1、 基因枪法转化转化小麦愈伤组织
取大田小麦(济麦 19; 购自山东农业科学院)授粉后 14天的未成熟胚, 接种于 SD2培养基上, 26°C黑暗条件下诱导愈伤组织, 7-10d后准备基因枪轰击。
取适量金粉 ( 1.0 μ m) 悬浮液(60 μ g/枪), 将金粉和 TaDREB4B的混合 液在 4°C振荡 10min, OOOrpm离心 5min去上清, 加入无水乙醇( 10 μ 1/枪加乙醇) 准备用于基因枪轰击。
采用 PDS-1000/He 基因枪(Bia-Rod 公司生产)轰击小麦幼胚诱导的愈伤组织。 选择 1100 Psi的可裂膜, 对材料进行轰击。 轰击后的愈伤组织继续在原渗透压培养 基上培养 16-18h, 然后转入不加筛选剂的 SD2培养基 (MM培养基也可) 中暗条件下 ( 26°C )恢复培养 2周。 2周后, 将愈伤组织转入第一次筛选培养基上(1/2MS+玉 米 素 0. 5mg/L+2%蔗糖 +双丙氨膦钠 3mg/L; 或 1/2 MS+ a_萘乙酸 lmg/L+ 6-糠氨基嘌吟 0. 5mg/L+2%蔗糖 +双丙氨膦钠 3mg/L也可) 在 24°C (每天光照 10h) 条件下筛选分化 培养 4周。待到愈伤组织分化出绿芽以后, 将分化的绿芽转入无激素培养基(1/2MS+ 双丙氨膦钠 4mg/L)上直到小苗伸长(光照与温度同前), 待到小苗伸长到 l-2cm 时 (大概需要 4 周) , 将抗双丙氨膦钠的再生植株移入壮苗培养基 (1/2MS+生长素 0. 5mg/L+多效唑 0. 5mg/L) 上壮苗, 再生植株生长到适宜大小 (苗高 6-8cm,根系较 好) 时移入营养钵中, 在 15°C左右光照培养, 待苗壮后置于温室。
将得到的阳性苗进行分子鉴定, 结果表明得到了转基因植株 (T。代) 。 1\代表示 T。代自交产生的种子及由它所长成的植株, T 2 代表示 1\代自交产生的种子及由它所长 成的植株, Τ 3 代表示 Τ 2 代自交产生的种子及由它所长成的植株, Τ 4 代表示 1~ 3 代自交产 生的种子及由它所长成的植株, Τ 5 代表示 Τ 4 代自交产生的种子及由它所长成的植株, Τ 6 代表示 Τ 5 代自交产生的种子及由它所长成的植株。
三、 转空载体对照植物的获得
用 PAHC25代替 pAHC25- 7¾ZWM , 制备转空载体对照植株, 方法同步骤二。
四、 转基因植物的抗旱性
2008年 10月将转基因植株中的五个株系(08X10、 08X11、 08X24、 08X27、 08X51 ) 的 T 6 代植株、 转空载体对照植株的 Τ 6 代植株和济麦 19 (各 30株) 种植于大田, 2009年 测定抗旱指标。 脯氨酸含量的测定方法见文献: 张殿忠 汪沛洪 赵会贤, 测定小麦 叶片游离脯氨酸含量的方法 1990 (4) : 62〜65。 可溶性总糖含量的测定方法见文献: 邹 琦. 植物生理生化实验指导. 北京: 中国农业出版社, 1995。 过氧化物酶活性 ( POD酶活性)的测定方法见文献: 徐朗莱, 叶茂炳过氧化物酶活力连续记录测定法. 南京农业大学学报, 1989, 12 (3) : 82— 83. Chedf M, Aseel in A, Belenger R R. Defense response induced by soluble si l icon in cucumber roots infected by Pyshium spp. phytopathology, 1994, 84 : 236— 275。 光合速率 (SPAD值) 用 LI-6400便携式 光合作用测定仪测定。 设置三次重复实验, 结果取平均值。
结果见图 7。结果表明: 转基因植株的脯氨酸含量(图 7A)、可溶性总糖含量(图 7B) 、 过氧化物酶活性 (图 7C) 和光合速率 (图 7D) 均比济麦 19明显提高。 转空载 体对照植株的脯氨酸含量、 可溶性总糖含量、 过氧化物酶活性和光合速率与济麦 19 没有显著差异。
2008年 10月将转基因植株中的八个株系(08X6、 08X10、 08X11、 08X18、 08X24、
08X27、 08X28、 08X36 ) 的 ^代植株、 转空载体对照植株的 T 6 代植株和济麦 19 (各 30株) 种植于旱地。 2009年测定株高、 穗数、 株粒数、 株粒重、 千粒重等指标。 设 置三次重复实验, 结果取平均值。 结果见表 2。 结果表明: 与济麦 19相比, 转基因 植株的株粒重和千粒重明显提高; 转空载体对照植株的各个指标与济麦 19没有显著 差异。
表 2 转 DREB4基因小麦各品系主要性状值
五、 转基因小麦的耐病实例
2008年 10月将转基因植株株系 08X18的 代植株、 转空载体对照植株的 T 6 代植株 和济麦 19 (各 30株) 种植于大田, 2009年 2月移栽于温室、 3月底接种白粉病病原菌 Ε09 (北京地区流行的 15号小种, 其毒性谱: Virl, 3a, 3b, 3c, 3e, 5, 6, 7, 8, 17, 19; 购 自中国农业科学院植物保护研究所) 。 两周后观察并拍照, 同时进行抗病鉴定, 鉴 定方法见文献: 谢皓,陈孝,盛宝钦,辛志勇,孔凡晶,林志 珊,马有志,小麦新种质 YW243白粉病抗性鉴定和遗传分析,作物学报, 2001 27 (6), 715-721。
结果见图 8。抗病性鉴定结果表明, 转基因植株叶片中, 单位面积的发病病斑数 明显小于济麦 19和转空载体对照植株,即转基因植株对白粉 病原菌的耐性增强了; 空载体对照植株的表型与野生型植株一致, 对白粉病病原菌的耐性没有显著差异。 工业应用
本发明的 7¾ZWM 在干旱、 高盐、 高温、 低温、 病原菌、 ABA、 乙烯、 JA、 SA 的诱导下表达, 并且可以特异的调控含有 DRE/CRT顺式元件 (核心序列: CCGAC) 的 基因的转录表达; 提高植物的抗旱性、 耐盐性、 耐高温性, 以及对白粉病病原菌的 抗性。 本发明的 7¾ZWM 为人为控制抗逆和耐逆相关基因的表达提供了 基础, 将在 培育抗逆性和耐逆性增强的植物中发挥重要的 作用。