WO2012104226A1 | 2012-08-09 |
RU2184146C1 | 2002-06-27 | |||
RU2261908C1 | 2005-10-10 | |||
BY19430C1 | ||||
CN106834187A | 2017-06-13 |
ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ 1. Штамм Bifidobacterium bifidum 8, коллекционный номер ВКПМ АС-2136 используемый в качестве пробиотика. |
Область техники, к которой относится изобретение.
Изобретение относится к биотехнологии, медицинской микробиологии, фармацевтической и пищевой промышленности и представляет собой штамм бифидобактерий вида Bifidobacterium bifidum , который может быть использован в лекарственных средствах, функциональных и специализированных пищевых продуктах, в том числе, биологически активных добавках к пище.
Уровень техники.
Бифидобактерии являются основными представителями индигенной микрофлоры человека. Описаны следующие основные функции бифидобактерий в организме человека: бифидобактерии образуют основу микрофлоры, в результате высокой адгезивности к слизистой оболочке кишечника и определяют основные ниши сосуществования для других микроорганизмов, стабилизируют биопленку кишечника; укрепляют эпителиальный барьер кишечника, необходимы для созревания эпителиоцитов; белок клеток бифидобактерий содержит все незаменимые аминокислоты, включая триптофан (Терешкова Е.А. и др., 2020; Иванова Е.В., 2018).
Вид Bifidobacterium bifidum согласно современным исследованиям преобладает в кишечном микробиоценозе и необходим для нормального функционирования организма человека (Иванова Е.В., 2018; Turroni F. et al., 2019). Вид Bifidobacterium bifidum является доминирующим видом у лиц с нормальным составом микрофлоры и с начальными степенями дисбиоза 1 - 2 степени. При глубоких нарушениях в микросимбиоценозе (3 степень дисбиоза) выявляемость вида Bifidobacterium bifidum снижается (Иванова Е.В., 2018).
В литературе имеется много данных, свидетельствующих о том, что Bifidobacterium bifidum может взаимодействовать с человеком и с микроорганизмами микрофлоры кишечника с помощью различных механизмов, в частности, активировать иммунитет человека, адгезировать на слизистую оболочку кишечника и метаболизировать гликаны, такие как муцин (Turroni F. et al., 2019). Примечательно, что вид Bifidobacterium bifidum является единственным представителем среди всех признанных видов бифидобактерий, способным к росту посредством метаболизма муцина (Ruas-Madiedo Р. et al., 2008, Turroni F. et al., 2011). Причем метаболизм муцина, осуществляемый Bifidobacterium bifidum, может активировать выработку муцина, тем самым увеличивая глубину слоя слизи, обволакивающей слизистую оболочку, и, таким образом, усиливая функцию эпителиального барьера (Rokhsefat S. et al., 2016). Данные свойства позволяют отнести представителей данного вида бифидобактерий к пробиотическим микроорганизмам.
Штамм Bifidobacterium bifidum 1 и Bifidobacterium bifidum 791 в составе отечественных препаратов-пробиотиков применяется в широком масштабе во всех возрастных группах с 1972 года по настоящее время (Терешкова Е.А. и др., 2020).
В современной концепции функционального питания существенным весом обладают пребиотики и синбиотики. Согласно общепринятому в научной литературе определению, пребиотики - это пищевые ингредиенты, сочетающие следующие признаки: 1) устойчивые к желудочному соку, гидролизу пищеварительными ферментами человека, и не всасывающиеся в тонком кишечнике, 2) ферментируемые кишечной микрофлорой 3) избирательно стимулируют рост и/или активность одной или ограниченного числа групп бактерий микробиоты кишечника, которые положительно влияют на здоровье хозяина. Смесь синергетически взаимодействующих пробиотиков и пребиотиков, в которой они взаимно усиливают эффективность друг друга, называют синбиотиками (Gibson G.R., Roberfroid М.В., 1995). Также пребиотики часто связывают с так называемым бифидогенным эффектом (Roberfroid М. et al., 2010).
Известен штамм Bifidobacterium bifidum 792 (патент RU 2215028), который выделен из содержимого кишечника здорового грудного ребенка, активно размножающийся в питательной среде с накоплением производственной биомассы в короткие сроки культивирования с высокой концентрацией бифидобактерий. Обладает кислотообразующими и ингибирующими свойствами в отношении патогенной и гнилостной микрофлоры. Это позволяет получить кисломолочные, ферментированные и неферментированные пищевые продукты, закваски, гигиенические и косметические средства, биологически активные добавки и бактерийные препараты, обеспечивающие нормализацию микробиоценозов организма человека. Известны штаммы Bifidobacterium bifidum 79-32 (патент RU 2314340) и Bifidobacterium bifidum B-UH ВКПМ Ас-1875 (патент RU 2453592), выделенные из содержимого кишечника здорового ребенка грудного возраста, которые, кроме указанных выше свойств, заквашивают, либо сквашивают молоко.
Однако, для указанных штаммов не приведена информация об устойчивости к антибактериальным веществам, что осложняет возможность их применения в качестве активного компонента лекарственных препаратов в комплексной терапии ряда заболеваний. Также, для всех указанных штаммов видовая принадлежность не подтверждена современными молекулярно-генетическими методами, что для выделенных из природных источников микроорганизмов в настоящее время является обязательным (Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Volume 5).
Известен штамм Bifidobacterium bifidum 791/БАГ (патент RU 2165454), полученный селекцией штамма Bifidobacterium bifidum 791. Штамм более устойчив к повреждающим факторам сред культивирования и агрессивных сред гастроинтестинального тракта человека, обеспечивает утилизацию более широкого спектра аминокислот, т. е. обладает более высокой жизнеспособностью и колонизирующими свойствами, что обеспечивает получение препаратов и продуктов на его основе с более длительными сроками хранения и более высокими лечебно-профилактическими свойствами. Однако, для указанного штамма также не приведена информация об устойчивости к антибактериальным веществам, что осложняет возможность его применения как активного компонента лекарственных препаратов в комплексной терапии ряда заболеваний.
Известен штамм Bifidobacterium bifidum OV-19 (патент RU 2375444), выделенный из содержимого кишечника здорового грудного ребенка, который, кроме указанных выше свойств, устойчив к широкому спектру антибиотиков, а также сквашивает молоко с образованием ровного сгустка.
Недостатком всех указанных выше штаммов является то, что ни на уровне генотипа, ни на уровне фенотипа не определено отношение к муцину и желчным солям, что, как указывалось выше, является важными особенностями, влияющими на эффективность штамма, как пробиотика.
Наиболее близким к заявляемому изобретению является штамм Bifidobacterium IATA-ES2 WO2010007198 А1, выделенный из фекалий здорового ребенка на грудном вскармливании и идентифицированный секвенированием 16S рРНК как представитель вида Bifidobacterium bifidum. Штамм предложено применять с целью улучшения защитных функций и снижения риска заболеваний. Показаны следующие механизмы его действия: 1) регуляция гликозилирования кишечника, благоприятствующую таковому у здоровых людей, 2) модуляция взаимодействия между эпителиальными клетками и микробиотой кишечника, способствующую адгезии полезных бифидобактерий, и 3) регуляцию иммунологического ответа. Однако, для указанного штамма не приведена информация об устойчивости к антибактериальным веществам.
Для всех указанных выше штаммов не приведена оценка способности ферментировать селективно стимулирующие рост бифидобактерий углеводные субстраты - пребиотики, что ограничивает возможность их применения в сии биотических функциональных и специализированных продуктах питания. Данная особенность, как указывалось выше, является основным критерием для разработки на основании штамма синбиотических продуктов. Изучение эффективности in vivo либо не проводилось, либо проводилось на животных моделях, т.е. полученные результаты не могут в полной мере быть перенесены на человека.
Раскрытие сущности изобретения.
Задачей настоящего изобретения является получение штамма микроорганизмов, с подтвержденной молекулярно-генетическими методами исследования принадлежностью к виду Bifidobacterium bifidum , охарактеризованного по показателям необходимым для включения в состав пробиотических лекарственных средств, функциональных и специализированных пищевых продуктов, в том числе, биологически активных добавок к пище.
При решении поставленной задачи достигаются следующие технические результаты: штамм является антагонистом патогенных и условно-патогенных микроорганизмов, сбраживает молоко с образованием сгустка, отличается активным ростом и образованием органических кислот в средах, содержащих селективно стимулирующие рост бифидобактерий углеводные субстраты - пребиотики, что обусловливает усиление антагонизма против условно-патогенных микроорганизмов. Штамм устойчив к антимикробным веществам канамицину, гентамицину, амикацину. В результате полногеномного исследования показано, что штамм характеризуется наличием генов, кодирующих пептиды, которые отвечают за адгезию к муцину и слизистой кишечника, а также генов, кодирующих ферменты, осуществляющие гидролиз муцина. В результате полногеномного исследования показано, что штамм характеризуется наличием генов, отвечающих за гидролиз желчных солей, что указывает на устойчивость к желчи и участие в регулировании трансформации указанной группы веществ в цикле печень-кишечник-печень, способствуя пищеварению. Применение ферментированных продуктов и бактерийных препаратов на основе заявляемого штамма приводит к исчезновению клинических проявлений дисбактериоза (дисбиоза) кишечника, боли в желудке, улучшению функции иммунной системы, улучшению общего состояния, повышению работоспособности.
Осуществление изобретения
Указанный технический результат достигнут получением нового штамма бактерий Bifidobacterium bifidum 8, который выделен из содержимого кишечника здорового человека, идентифицирован по 16S рРНК, и депонирован в Национальном биоресурсном центре Всероссийская коллекция промышленных микроорганизмов НИЦ «Курчатовский институт» - ГосНИИгенетика, коллекционный номер АС-2136.
Заявляемый штамм обладает следующими свойствами.
Полноразмерная последовательность гена, кодирующего 16S рибосомальную РНК, SEQ ID NO 1 на 100 % гомологична типовому штамму вида Bifidobacterium bifidum DSM 20456 (АТСС 29521).
Культурально-морфологические свойства.
Облигатный анаэроб, оптимальная температура роста 36 - 38 °С.
Грамположительные, неподвижные, неспорообразующие прямые или слегка изогнутые палочки с утолщением или бифуркацией на одном или обоих концах. Располагаются по одной, чаще по 2 или скоплениями. Характерной особенностью является расположение парных клеток под углом 90° друг к другу на поздних фазах роста.
При культивировании в среде Блаурокка в модификации Г. И. Гончаровой при температуре 37 - 38 °С в течение 36 - 48 часов образует колонии белого цвета в виде слаборасширяющихся конусов длиной до 10 мм. При культивировании на поверхности агаризованной (плотной) среды Bifidobacterium Broth фирмы Himedia в анаэробных условиях (bioMerieux GENbox anaer, температура 37 - 38 °С, продолжительность 72 часа) образует плоские сероватые колонии R-формы, диаметром до 5 мм.
Физиолого-биохимические свойства штамма
Штамм желатин не разжижает, каталазу не продуцирует, молоко сквашивает с образованием сгустка. Утилизирует глюкозу без образования газа, с образованием молочной и уксусной кислот, снижая pH среды до 3,8 - 4,2. Утилизирует сахарозу, лактозу, маннозу, целлобиозу. Не утилизирует: арабинозу, ксилозу, инулин (высокой степени очистки), салицин, сорбит.
Штамм устойчив к канамицину, гентамицину, амикацину. Штамм чувствителен к азитромицину, амоксицилину, кларитромицину, доксициклину, тетрациклину, цефтриаксону, ванкомицину, цефепиму, линкомицину, имипенему. В отношении, левофлоксацина, метронидазола, триметоприма, ципрофлоксацина, офлоксацина является промежуточным с учетом концентрации, минимально подавляющей рост (см. примеры). Штамм является активным антагонистом патогенных микроорганизмов. В присутствии пребиотиков фрутоолигосахаридов (ФОС), либо лактулозы в качестве единственного углевода в питательной среде отличается наибольшей степенью подавления микробных контаминантов пищи и возбудителей инфекционных заболеваний на примере тестовых штаммов Bacillus cereus и Staphylococcus aureus.
Установлена безвредность штамма на белых беспородных мышах массой 14-16 г. Суспензию лиофилизированного штамма вводили из расчета примерно 1x10 9 КОЕ. В течение 5 суток все мыши остались живы и не потеряли в весе.
Штамм хранится в лиофлизированном виде в сахарозо-желатиновой среде высушивания не менее 5 лет в герметично укупоренных флаконах без потери указанных свойств.
Пример 1
Для подтверждения антагонистической активности штамма суспензию лиофилизата, восстановленного в физиологическом растворе, высевали на чашки Петри со средой МРС-5 штрихом по диаметру. Инкубировали культуру в анаэробных условиях (bioMerieux GENbox anaer) при 37 °С в течение 48 часов. После этого перпендикулярно зоне роста штамма, но не касаясь ее, высевали тестовые штаммы, используя для каждого отдельную чашку. Через 20 часов определяли зону отсутствия роста (табл. 1). Штамм Bifidobacterium bifidum 8 показал высокую антагонистическую активность в отношении тест-штаммов патогенных и условно-патогенных микроорганизмов.
Таблица 1 - Антагонистическая активность штамма Bifidobacterium bifidum 8
Пример 2 Лиофилизированную культуру штамма Bifidobacterium bifidum 8 ресуспендировали в физиологическом растворе и инокулировали предварительно подвергнутую пастеризации 10% суспензию обрата молока из расчета примерно 2х 10 6 КОЕ/мл. Инкубацию проводили при 37 °С в течение 48 часов. Результаты представлены в таблице 2. Штамм Bifidobacterium bifidum 8 сквашивает молоко с образованием сгустка.
Таблица 2 - Показатели сквашивания молока штаммом Bifidobacterium bifidum 8
Пример 3
Подтверждение активного роста штамма Bifidobacterium bifidum 8 и образованием органических кислот в средах, содержащих селективно стимулирующие рост бифидобактерий углеводные субстраты - пребиотики, а также их синергетического эффекта против условно-патогенных микроорганизмов проводили по описанному ранее методу (Karetkin В.А. et al., 2019). Представители вида В. cereus являются контаминатами пищевых продуктов и возбудителями кишечных инфекций. В качестве тестового использовали штамм В. cereus АТСС 9634. Ферментацию смешанной культуры бифидобактерий и тест- штамма проводили при температуре 37 °С в анаэробных условиях (2% углекислого газа, 98% азота) при постоянном перемешивании в жидкой среде, содержащей в качестве единственного углевода 1 % одного из известных коммерческих пребиотиков: фруктоолигосахариды (ФОС, Orafti ® Р95, BENEO ORAFTI, Бельгия), изомальтулоза (Palatinose™, BENEO Palatinit GmbH, Германия), лактулоза сухая Лактусан (ООО Фелицата Холдинг, РФ) и D-раффиноза (ООО ДиаМ, РФ). В начальный момент эксперимента и после 9 ч роста оценивали численность обоих микроорганизмов высевом на селективные среды. Определение кислот проводили методом высокоэффективной жидкостной хроматографии на хроматографе Agilent 1220 с рефрактометрическим детектором и колонкой Hi-Plex Н (4.6 х 250 мм). Заявляемый штамм Bifidobacterium bifidum 8 характеризуется активным ростом и наибольшим подавлением тест-штамм в синбиотической композиции с ФОС и лактулозой (Таблица 3).
Таблица 3 - Влияние коммерческих пребиотиков на активность штамма Bifidobacterium bifidum 8 против В. cereus АТСС 9634
Staphylococcus aureus считается одной из основных причин энтероколита и диареи у пациентов, прошедших курс лечения антибиотиками в госпитальных условиях (Lo T.S., Borchardt S.M., 2009). Исследования проводили по аналогичной методике. Заявляемый штамм Bifidobacterium bifidum 8 характеризуется активным ростом и наибольшим подавлением тест- штамм S. aureus АТСС 43300 в синбиотической композиции с ФОС и лактулозой (Таблица 4).
Таблица 4 - Влияние коммерческих пребиотиков на активность штамма Bifidobacterium bifidum 8 против S. aureus АТСС 43300
Пример 4 Определяли чувствительность заявляемого штамма к антимикробным веществам диско-диффузионным методом и методом серийных разведений в жидкой питательной среде по МУК 4.2.1890-04.
Суточную культуру штамма, полученную инкубированием в среде Блаурокка при температуре 37 °С, стандартизовали стерильным забуференным физиологическим раствором до OD560 = 2,1 и высевали по 0,1 мл полученной суспензии на чашки со средой Bifidobacterium Broth фирмы Himedia. На поверхность среды помещали диски с антибиотиками (см. табл. 5). Инкубацию проводили в анаэробных условиях (bioMerieux GENbox anaer) при температуре 37 °С в течение 3 суток, после чего определяли диаметр зоны угнетения роста (табл. 5).
Таблица 5 - Исследования чувствительности штамма Bifidobacterium bifidum 8 к антимикробным веществам диско-диффузионным методом
Для метода серийных разведений использовали жидкую питательную среду MRS с цистеином и аскорбиновой кислотой и антимикробные вещества (см. табл. 6) для биохимических исследований. Лекарственные препараты на основе данных веществ наиболее часто применяются в современной терапии. Для каждого вещества готовили серию последовательных двукратных разведений в стерильной среде от 512 до 0,125 мкг/мл. Инокулировали 10 % суточной культурой штамма, предварительно стандартизованной по OD560 = 1,5. Через 10 часов инкубирования при температуре 37 °С в анаэробных условиях (2% углекислого газа, 98% азота) и при постоянном перемешивании измеряли мутность суспензии, кривые зависимости данной величины от концентрации антимикробного вещества носили сигмоидальный характер. Из зависимостей определяли минимальную подавляющую концентрацию (МПК) и минимальную концентрация антимикробного вещества, при которой начинается наблюдаемое подавление роста (табл. 6). Определение данной величины связано со следующими соображениями. Для достижения лечебного действия необходимо попадание в кишечник человека или животного определенного количества живых клеток бифидобактерий, что может быть обеспечено только при минимальном воздействии антибактериальных веществ. Поэтому устойчивость определяли с учетом указанной величины, а не только с учетом МПК, как это принято для патогенных микроорганизмов, когда выживание доже небольшого количества клеток может привести к заболеванию.
Таблица 6 - Исследование чувствительности штамма к антимикробным веществам методом серийных разведений в жидкой питательной среде
Штамм устойчив (У) к канамицину, гентамицину, амикацину. Чувствителен (Ч) к амоксицилину, цефтриаксону, цефепиму, имипенему, тетрациклину, доксициклину, азитромицину, кларитромицину, линкомицину, ванкомицину. В отношении офлоксацина, ципрофлоксацина, левофлоксацина, метронидазола, нифуроксазида, триметоприма является промежуточным (П) с учетом минимальной концентрации начала наблюдаемого подавления роста.
Результаты полногеномного исследования показали отсутствие генов с маркерами устойчивости к тетрациклину tet(W) (SEQ ID NO: 2) и trp-tet(W) (SEQ ID NO: 3), что также подтверждено фенотипически.
Пример 5
Молекулярно-биологические признаки штамма определяли на основании полногеномного исследования.
Анализ полученного генома показал, что штамм Bifidobacterium bifidum 8 не содержит плазмид.
Анализ полученного генома показал наличие генов, кодирующих пептиды клеточной стенки, отвечающие за специфическую адгезию. Коллаген связывающий протеин участвует в адгезии к эпителию. Гомологичность обнаруженной структуры (SEQ ID NO: 4) с пептидом фимбринального пили Bifidobacterium bifidum (NCBI GenBank SEQ ID NO: BBA48285.1) составляет 99 %.
Протеин, кодируемый геном ОррА, отвечает за связывание с клетками эпителия кишечника Сасо-2 (Guglielmetti S. ety al., 2008). Гомологичность обнаруженной структуры (SEQ ID NO: 5) с олигопептид связывающим протеином ОррА Bifidobacterium bifidum (NCBI GenBank SEQ ID NO: KLN80891.1) составляет 100 %.
Образование трансальдолазы значительно увеличивает степень связывания клеток бактерий - представителей кишечной микробиоты с муцином (Gonzalez-Rodriguez I. et al., 2012). Гомологичность обнаруженной структуры (SEQ ID NO: 6) с трансальдолазой Bifidobacterium bifidum (NCBI GenBank SEQ ID NO: WP 003813255.1) составляет 100 %.
Эндо альфа-^ацетилгалактозаминидаза участвует в гидролитическом разложении муцина (отщеплении от пептидной цепи углеводных остатков). Гомологичность обнаруженной структуры (SEQ ID NO: 7) с эндо альфа-^ацетилгалактозаминидазой Bifidobacterium bifidum АТСС 29521 (NCBI GenBank SEQ ID NO: BAQ97477.1) составляет 99 %.
Одним из основных механизмов, обуславливающих устойчивость бактерий кишечника к солям желчи, секретируемым печенью, является их расщепление ферментами (Ruiz L. et al., 2013). Гомологичность обнаруженной структуры (SEQ ID NO: 8) с гидролазой солей желчи Bifidobacterium bifidum (NCBI GenBank SEQ ID NO: AAR39435.1) составляет 99 %. Фосфопируват гидролаза также участвует в расщеплении желчных солей. Гомологичность обнаруженной структуры (SEQ ID NO: 9) с фосфопируват гидролазой Bifidobacterium bifidum (NCBI GenBank SEQ ID NO: WP 003812660.1) составляет 100 %.
Пример 6.
Использование штамма Bifidobacterium bifidum 8 в лекарственных средствах. На основе штамма Bifidobacterium bifidum 8 получали лиофилизированную биомассу бифидобактерий. Из чистой культуры путем проведения 2-3 пассажей получали маточную культуру (инокулят) в среде Блаурокка по одному из известных способов. Инкубирование проводили при 37 °С. Далее проводили культивирование с поддержанием pH в интервале 5,5 - 7,0. Полученную культуру, содержащую не менее 2х 10 9 КОЕ/мл, отделяли от среды культивирования с применением центрифугирования, сепарирования, либо других способов, применяемых для суспензий бактериальных клеток. К полученному концентрату добавляли сахарозо-желатиновую среду высушивания, замораживали во флаконах или на поддонах для сушки из пищевой легированной стали до температуры не выше минус 40 - 45 °С и подвергали лиофильному высушиванию. Остаточная влажность составляла не более 5 %. Полученную лиофилизированную биомассу, содержащую не менее 5 c 10 10 КОЕ/г, используют в качестве активного компонента лекарственных средств, стандартизуя наполнителем из расчета разовой дозы (5- 10) c 10 8 КОЕ.
Пример 7.
Использование штамма Bifidobacterium bifidum 8 в функциональных и специализированных пищевых продуктах, в том числе, биологически активных добавках к пище. Полученную аналогично описанному в примере 6 методу лиофилизированную биомассу применяют в качестве основного ингредиента пробиотических биологически активных добавок к пище в различных товарных формах (порошки, капсулы и т.п.) из расчета 1x10 8 - П10 9 КОЕ в разовой дозе. Лиофилизированную биомассу бифидобактерий штамма Bifidobacterium bifidum 8 вносят в жидкие ферментированные продукты для заквашивания и сквашивания, либо для обогащения в ферментированные или не ферментированные продукты из расчета 10 6 - 10 7 КОЕ в 1 г готового продукта. Благодаря этому получаемые продукты могут быть отнесены к функциональным продуктам питания.
Пример 8. Полученную, как описано в примере 6, суспензию клеток штамма Bifidobacterium bifidum 8 в среде высушивания дозировали в пенициллиновые флаконы из расчета разовой дозы (5-10)х10 8 КОЕ и лиофилизировали. Применение лиофилизированной биомассы в указанной разовой дозе 4 раза в день внутрь курсами от 8 до 32 дней у добровольцев мужчин и женщин в возрасте 45 лет, 61 год, 66 лет, 72 года, 93 года приводило к исчезновению выраженных болей в желудке, развившихся на фоне обострения хронического гастрита (без приема лекарственных препаратов); исчезновению проявлений дисбактериоза (дисбиоза) кишечника (метеоризм, боли в животе, нерегулярный стул, разжиженный стул, задержка стула); быстрому купированию симптомов ОРВИ (в течение 1 - 3 дней), особенно при приеме в ранние сроки заболевания; исчезновению лабиального герпеса; улучшению общего состояния, повышению физической, умственной активности, работоспособности, улучшению эмоционального состояния (исчезновение пониженного настроения, раздражительности, эмоциональной лабильности).
Пример 9.
Женщина, 57 лет. Многократные курсы химиотерапии в связи с раком яичников. На этом фоне выраженный дисбактериоз (дисбиоз) кишечника, боли в животе, прием любых продуктов сопровождается метеоризмом, диарейный синдром с водянистым стулом. Употребляла кефир, обогащенный бифидобактерими штамма Bifidobacterium bifidum 8 в количестве 10 6 КОЕ в 1 мл в течение 4 дней, первые два дня по 300 мл в день, последующее дни по 200 мл в день. Общий объем кефира 1 литр. Диарея полностью исчезла на второй день приема кефира, на четвертый день стул приобрел оформленную консистенцию, исчезли боли в животе, значительно уменьшился метеоризм, улучшилось общее состояние.
Библиография:
1. Терешкова Е.А., Кареткин Б. А., Дорошенко Е.О., Ланских А.Г. Сорбированные пробиотики. Механизм действия. - М.: ТД ДеЛи, 2020 - 36 с.
2. Иванова Е.В. Роль бифидофлоры в ассоциативном симбиозе кишечной миробиоты человека. Дисс. д.м.н. Оренбург. 2018:295.
3. Turroni F., Duranti S., Milani C., Lugli G.A., van Sinderen D., Ventura M. Bifidobacterium bifidum: A Key Member of the Early Human Gut Microbiota. //Microorganisms. 2019, 9; 7(11).
4. Ruas-Madiedo P., Gueimonde M., Femandez-Garcia M., de los Reyes-Gavilan C.G., Margolles A. Mucin degradation by Bifidobacterium strains isolated from the human intestinal microbiota. //Appl. Environ. Microbiol. 2008, 74, 1936-1940. Turroni F., Milani C., van Sinderen, D., Ventura, M. Genetic strategies for mucin metabolism in Bifidobacterium bifidum PRL2010: An example of possible human-microbe co-evolution. Gut Microbes 2011, 2, 183-189. Rokhsefat S., Lin A.F., Comelli E.M. Mucin-Microbiota Interaction During Postnatal Maturation of the Intestinal Ecosystem: Clinical Implications. Dig. Dis. Sci. 2016, 61, 1473- 1486. Gibson G.R., Roberfroid M.B. Dietary modulation of the human colonic microbiota: introducing the concept of prebiotics // The Journal of Nutrition. 1995, Vol. 125, p. 1401— 1412 Roberfroid M., Gibson G.R., Hoyles L., et al. Prebiotic effects: metabolic and health benefits. //Br J Nutr. 2010, Vol. 104, S. 2, S1-S63 Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Volume 5: The Actinobacteria Editors: Whitman, W., Goodfellow, M., Kampfer, P., Busse, H.-J., Trujillo, M., Ludwig, W., Suzuki, K.-L, Parte, A. (Eds.) 2012 Karetkin B. A., Guseva E. V., Evdokimova S. A. et al. A quantitative model of Bacillus cereus ATCC 9634 growth inhibition by bifidobacteria for synbiotic effect evaluation // World Journal of Microbiology and Biotechnology. 2019. Vol. 35. P. 89 Lo T.S., Borchardt S.M. Antibiotic-associated diarrhea due to methicillin-resistant Staphylococcus aureus // Diagnostic microbiology and infectious disease. 2009. Vol.63 (4), P. 388-389 Guglielmetti S., Tamagnini L, Mora D., Minuzzo M., Scarafoni A., Arioli S., Heilman J., Karp M., Parini C. Implication of an outer surface lipoprotein in adhesion of Bifidobacterium bifidum to Caco-2 cells. Applied and environmental microbiology, 2008, 74(15), 4695-4702 Gonzalez-Rodriguez I., Sanchez B., Ruiz L., Turroni F., Ventura M., Ruas-Madiedo P., Gueimonde M., Margolles A. Role of extracellular transaldolase from Bifidobacterium bifidum in mucin adhesion and aggregation. Applied and environmental microbiology, 2012, 78(ll), 3992-3998. Ruiz L., Margolles A., Sanchez B. Bile resistance mechanisms in Lactobacillus and Bifidobacterium. //Frontiers in microbiology, 2013, 4, 396 Перечень последовательностей <160> 9
<210> 1
<211 > 1534
<212> DNA
<213 > Bifidobacterium bifidum
<400> 1 ttttttgtgg agggttcgat tctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg 60 caagtcgaac gggatccatc aagcttgctt ggtggtgaga gtggcgaacg ggtgagtaat 120 gcgtgaccga cctgccccat gctccggaat agctcctgga aacgggtggt aatgccggat 180 gttccacatg atcgcatgtg attgtgggaa agattctatc ggcgtgggat ggggtcgcgt 240 cctatcagct tgttggtgag gtaacggctc accaaggctt cgacgggtag ccggcctgag 300 agggcgaccg gccacattgg gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg 360 gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgagg gatggaggcc 420 ttcgggttgt aaacctcttt tgtttgggag caagccttcg ggtgagtgta cctttcgaat 480 aagcgccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggcgcaa gcgttatccg 540 gatttattgg gcgtaaaggg ctcgtaggcg gctcgtcgcg tccggtgtga aagtccatcg 600 cttaacggtg gatctgcgcc gggtacgggc gggctggagt gcggtagggg agactggaat 660 tcccggtgta acggtggaat gtgtagatat cgggaagaac accgatggcg aaggcaggtc 720 tctgggccgt cactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc 780 tggtagtcca cgccgtaaac ggtggacgct ggatgtgggg cacgttccac gtgttccgtg 840 tcggagctaa cgcgttaagc gtcccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa 900 gaaattgacg ggggcccgca caagcggcgg agcatgcgga ttaattcgat gcaacgcgaa 960 gaaccttacc tgggcttgac atgttcccga cgacgccaga gatggcgttt cccttcgggg 1020 cgggttcaca ggtggtgcat ggtcgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc 1080 ccgcaacgag cgcaaccctc gccccgtgtt gccagcacgt tatggtggga actcacgggg 1140 gaccgccggg gttaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc agatcatcat gccccttacg 1200 tccagggctt cacgcatgct acaatggccg gtacagcggg atgcgacatg gcgacatgga 1260 gcggatccct gaaaaccggt ctcagttcgg atcggagcct gcaacccggc tccgtgaagg 1320 cggagtcgct agtaatcgcg gatcagcaac gccgcggtga atgcgttccc gggccttgta 1380 cacaccgccc gtcaagtcat gaaagtgggc agcacccgaa gccggtggcc taaccccttg 1440 tgggatggag ccgtctaagg tgaggctcgt gattgggact aagtcgtaac aaggtagccg 1500 taccggaagg tgcggctgga tcacctcctt tcta 1534 <210> 2 <211> 23 <212> DNA
<213 > Artificial Sequence <400> 2 tggaattctt gcccatgtag acg 23
<210> 3 <211> 22 <212> DNA
<213 > Artificial Sequence <400> 3 attcagcgac gaactggcac ag 22
<210> 4 <211> 534 <212> PRT
<213 > Bifidobacterium bifidum <400> 4
Met Lys Phe Lys Lys Leu Phe Ala Gly Val Ala Ala Ala Ala Thr Leu 1 5 10 15
Leu Ala Gly Met Ala Phe Gly Thr Gly Ala Ala Asn Ala Ala Glu Thr 20 2 5 30
Thr Val Asp Thr Ala Ala Thr Val Thr Phe Lys Ala Ser Lys Glu Lys
35 40 45
Gin Leu Thr Ser Ala Gin Leu Ser Ala Tyr Lys lie Ala Asp Tyr Val
50 55 60
Asn Tyr Gly Thr Ala Lys Thr Pro Val Tyr Gly Val Lys Thr Ala Ala 65 70 75 80
Gly Ala Asn Arg Thr Lys Leu Ala Ala Ala Leu Thr Ala Ala Gly Phe
85 90 95
Gin Asn Val Pro lie Asp Gly Thr Thr Asp Leu Met Ala Trp Ala Met
100 105 110
Asn Gin Lys Thr Thr Thr Asp Thr Asp Gly Thr Val Thr Gin Val Gin
115 120 1 25 Phe Asp Gin Ser Glu Thr Arg Pro Trp Asn Asn Pro Ser Val Thr Arg
130 135 140
Lys Phe Ala Asp Ala Leu Gin Ala Gly Asn Pro Phe Thr Ala Thr Ala
145 150 155 160
Asp Pro Phe Val Leu Asn Lys Ala Thr Gly Asn Asp Thr Asp Gly Trp
165 170 175
Thr Ala Thr Asn Lys Thr Ala Leu Thr Ala Gly Val Tyr Leu Phe Leu
180 185 190
Asp Gly Asn Ala Ser Thr Asp Thr Leu Thr Gin Ala Val Pro Met lie
195 200 205
Val Ser Thr Gly Ser Val Asp Ala Glu Gly Val Leu Ser Leu Gly Asp
210 215 220
Ser Thr Ala Glu Val Asp Met Lys Ser Thr Val Ser Gly Thr Gin Thr
225 230 235 240
Lys Ser Thr Thr Ser Lys Ser Ala Ser Val Gly Glu Thr Val Pro Phe
245 250 255
Glu Leu Gly Tyr Thr lie Pro Asn Pro Val Pro Thr Asp Phe Thr Leu
260 265 270
Gin Phe Lys Asp Val Pro Ser Lys Gly Leu Thr Val Asn Phe Ala Ser
275 280 285
Leu Thr Val Lys Ala Gly Asp Lys Val Leu Thr Asp Thr Asp Tyr Thr
290 295 300
Val Glu Asn Asn Leu Thr Asp Asn Lys Gly Asp Gly Thr Asn Thr Phe
305 310 315 320
Val Val Lys He Thr Asp Pro Ala Lys Tyr Ala Gly Lys Gin He Thr
325 330 335
He Thr Tyr Asn Ala Thr Val Asn Asp Glu Ala Glu Thr Val Glu Gly
340 345 350
Gin Asp Tyr His Ala Val Thr Asn Lys Leu Val Gly Asn Asp Gly Thr
355 360 365
Pro He Pro Gly Thr Glu Thr Leu Thr Lys He Phe Gly Phe Lys Phe
370 375 380
Thr Lys Val Asn Ala Gin Gly Glu Ala Val Glu Gly Ala Lys Phe Thr
385 390 395 400 Leu Ser Val Ala Lys Asp Gin Asn Gly Val Leu Pro Asn Ser Asp Lys
405 410 415
Tyr Pro Leu Glu Val Thr Ser Gly Ala Asn Gly Val Val Lys Phe Asp 420 425 430
Gly Leu Lys Ala Gly Ser Tyr Thr Val Thr Glu Thr Ala Val Ala Asp 435 440 445
Gly Tyr Gin Asp Phe Lys Ala Ser Phe Thr Val Ala lie Asp Glu Asn 450 455 460
Gly Lys Val Thr Phe Ala Gly Thr Asp Ser Trp Gly Leu Ala Pro Lys 465 470 475 480
Gly Ser Ala Asp Asp Tyr Lys Val Thr Asn Val Lys Ser Val Phe Glu
485 490 495
Leu Pro Lys Thr Gly Ala Ala Gly lie Ala Leu Phe Val Val He Ala 500 505 510
Ala Leu Leu Gly Gly Ala Ala Ala Thr Val Tyr Ala Lys Ser Arg Arg 515 520 525
Thr Ser Arg Ala Leu Arg 53 0
<210> 5 <211> 596 <212> PRT
<213 > Bifidobacterium bifidum <400> 5
Met Gin Ser Met Ser Phe Ala Ser Thr Ala Arg Lys Val Thr Ala Phe
1 5 10 15
Ala Ala Ala Ala Ala Thr Leu Leu Ala Leu Gly Ala Cys Gly Asn Ser
20 25 30
Asn Asn Gly Ser Ala Gly Asn Asn Gly Ala Lys Ser Thr Ser Glu Pro
35 40 45
Gin Glu Gly Val Pro Thr Asn Tyr Thr Gly Ser Phe Pro Met Pro Asp 50 5 5 60
Pro Gly Lys Ala Tyr Asn Asn Pro Lys Asp Arg Gly Glu Leu Lys Gin 65 70 75 80 Gly Gly Thr Leu Thr Leu Pro lie Thr Glu lie Gly Pro Asn Trp Asn
85 90 95
Ala He Asp Val Asn Gly Asn Thr Val Tyr Met Ser Gly Leu Trp Arg
100 105 110
Phe Tyr Met Pro Cys He Trp Glu Tyr Pro Ala Asp Gly Ser Leu Glu
115 12 0 125
Asn He Lys Pro Asn Thr Asn Tyr Val Thr Lys Val Glu Gin Thr Ser
130 135 140
Asp Ser Pro Glu Thr Val Val Phe Thr He Asn Asp Lys Ala Ser Trp
145 150 155 160
Asn Asp Gly Thr Pro He Thr Trp Lys Asp Phe Glu Ser Thr Trp Lys
165 170 175
Val Gin Ser Gly Lys Ser Asp Lys Phe Thr Pro Ala Leu Thr Thr Gly
180 185 190
Tyr Asp Gin He Lys Ser Val Thr Lys Gly Asp Thr Asp Lys Gin Ala
195 200 205
Val Val Thr Phe Glu Lys Asp Phe Tyr Pro Tyr Gin Ser Leu Phe Asn
210 215 220
Leu Leu Tyr Pro Ser Glu Ala Leu Thr Gly Asp Asp Thr Lys Asp Gly
225 230 235 240
Asp Thr Phe Ser Lys Gly Trp Ser Asn Asp Ser His Ser Asp Lys Trp
245 250 255
Gly Ala Gly Pro Phe Val Val Ser Lys Ser Ser Asp Ser Glu Val Thr
260 265 270
Phe Thr Pro Asn Pro Lys Trp Trp Gly Asp Lys Pro Leu Leu Asp Lys
275 280 285
Val Val Leu Lys Gin Met Glu Pro Ser Ala Ala Met Asn Ala Phe Lys
290 295 300
Asn Gly Glu He Asp Ala Val Gly Ala Ser Asp Ala Glu Ser Met Thr
305 310 315 320
Ser Ala Lys Thr Val Lys Asp Ala Tyr Leu Arg Arg Ser Tyr Asp Ser
325 330 335
Gly Val Tyr Thr Leu Thr He Asn Thr Lys Asn He Pro Leu Glu Val
340 34 5 3 50 Arg Lys Ala Phe Val Gin Gly Val Asp Arg Ser Gin Leu Gin Lys lie 355 360 365
Asp Phe Gin Gly lie Glu Trp Thr Glu Lys Thr Pro Gly Ser Leu He 370 375 380
Leu Pro Gin Phe Gin Asp Gly Tyr Glu Asp Asn Met Pro Ala Glu Ser 385 390 395 400
Lys Tyr Ser Thr Ala Asn Ala Thr Lys Thr Leu Glu Asp Ala Gly Tyr
405 410 415
Lys Lys Asn Ser Asp Gly Tyr Tyr Glu Lys Gly Gly Lys Val Ala Ala 420 425 430
He Thr Tyr Thr Thr Phe Ser Asp Ser Ala Ser Thr Lys Ala Lys Ala 435 440 445
Thr Ala He Gin Lys Met Ala Lys Thr Val Gly He Lys Val Ser He 450 455 460
Asp He Lys Ala Ser Asn Thr Phe Ser Asp Thr Val Ser Ser Gly Asn 465 470 475 480
Trp Asp Met He Gly Leu Gly Trp Ser Ala Ser Asp Pro Phe Gly Tyr
485 490 495
Ala Ser Ser Ala Tyr Gin Leu Tyr Gly Ser Lys Ser Glu Ser Asn Phe 500 505 510
Ser Phe Thr Gly Thr Asp Glu He Asp Lys Glu Leu Glu Ser He Pro 515 520 525
Gly He Lys Asp Ser Thr Lys Ala He Ala Gin Phe Asn Lys Ala Glu 530 535 540
Lys Glu Ala Gin Lys Leu Tyr Ala Gin He Pro Phe Glu Asn Gly Gin 545 550 555 560
He Thr Val Ala Val Lys Lys Gly Leu Ala Asn Tyr Gly Pro Ala Gly
565 570 575
Tyr Ser Ser Gly Ala Arg Val Met Val Thr Val His Pro Glu Asn Leu 580 585 590
Gly Trp Glu Lys 595
<210> 6 <211 > 367 <212> PRT
< 213 > Bifidobacterium bifidum <400> 6
Met Thr Glu Ala Thr Gin Arg Thr Ser Asp Asn Gly Val Ser lie Trp
1 5 10 15
Leu Asp Asp Leu Ser Arg Thr Arg lie Glu Ser Gly Ser Leu Gin Glu 20 25 30
Leu He Lys Asp Lys Asn Val Val Gly Val Thr Thr Asn Pro Ser He 35 40 45
Phe Gin Lys Ala Leu Ser Gin Val Gly Pro Tyr Asp Ala Gin Leu Lys 50 55 60
Glu Leu Gly Lys Val Asp Val Glu Thr Ala Val Arg Glu Leu Thr Thr 65 70 75 80
Thr Asp Val Arg Asn Ala Thr Asp He Phe Arg Glu He Ala Glu Ala
85 90 95
Thr Asp Phe Val Asp Gly Arg Val Ser He Glu Val Asp Pro Arg Leu
100 105 110
Ala His Asp Thr Glu Asn Thr Glu Lys Gin Ala Val Glu Leu Trp Glu
115 120 125
Lys Val Asn Arg Pro Asn Ala Met He Lys He Pro Ala Thr Leu Glu
130 135 140
Gly Leu Pro Ala He Thr Ala Thr Leu Ala Lys Gly He Ser Val Asn 145 150 155 160
Val Thr Leu He Phe Ser Leu Glu Arg Tyr Glu Gin Val He Asp Ala
165 170 175
Tyr He Glu Gly He Ala Gin Ala Ala Ala Asn Gly His Asp Leu Lys
180 185 190
His He Gly Ser Val Ala Ser Phe Phe Val Ser Arg Val Asp Thr Ala 195 200 205
Val Asp Lys Leu Leu Glu Ala Asn Gly Ser Asp Glu Ala Lys Ala Leu
210 215 220
Glu Gly Lys Ala Ala Val Ala Asn Ala Arg Leu Ala Tyr Glu Leu Phe
225 230 235 240
Glu Lys Lys Phe Ala Ala Asp Pro Arg Trp Ala Asp Leu Ala Ala Lys
245 250 255 Gly Ala Lys Val Gin Arg Pro Leu Trp Ala Ser Thr Gly Thr Lys Asn 260 265 270
Ala Ala Tyr Ser Asp Cys Lys Tyr Val Asp Glu Leu Val Ala Lys His 275 280 285 lie Val Asn Thr Met Pro Glu Lys Thr Leu Asn Ala Leu Ala Asp His 290 295 300
Gly Asn Gly Ala Pro Ser lie Glu Gly Thr Tyr Glu Glu Ser His Ala 305 310 315 320
Val He Asp Lys Leu Ala Glu Leu Gly He Asn Leu Lys Asp Val Thr
325 330 335
Asp Lys Leu Glu Ala Asp Gly Val Ala Ala Phe He Lys Ser Trp Asp 340 345 350
Ser Val Leu Ala Asp Val Gin Ser Gly He Asp Arg Val Asn Ala 355 360 365
<210> 7 <211 > 1931 <212> PRT
< 213 > Bifidobacterium bifidum <400> 7
Met Arg Lys Arg Val Val Ser Val Ala Leu Ala Val Ala Leu Ala Val 1 5 10 15
Ala Pro Leu Gly Val Gly Ser Thr Ala Ser Ala Ala Pro Leu Ser Ala
20 25 30
Ser Asp Leu Gin Thr Leu Ala Leu Arg Ser Ala Ala Ser Ser Asn Asp 35 40 45
Ala Asn Ala Asn Asp Val Ala Thr Val Ala Asp Asp Ala Ala Val Asn
50 55 60
Gly Trp Thr He Asp Arg Asn Thr Ala Lys Gly Gly Glu He Leu Ala 65 70 75 80
Ala Gly Thr Gly Asp Tyr Ala Gly Trp Thr His Phe Lys Ser Thr Ser
85 90 95
Ala Asn Gly Asn Ala Thr Ser Ser Ser Gly Tyr Pro Ala Val Ala He
100 105 110 Ser Gly Lys Thr lie Asp Leu Thr Arg Ala Gly Glu Phe Ser lie Lys 115 120 125
Val Lys Ser Pro Gin Ala Gly Ser Ala Asn Arg Phe Gly Phe Tyr Leu 130 135 140
Gly Tyr Lys Asp Pro Gly Asn Ala Leu Phe Leu Gly Tyr Asp Lys Gly
145 150 155 160
Gly Trp Phe Trp Gin Lys Tyr Val Asp Gly Asn Gly Asp Trp Tyr Asn
165 170 175
Gly Thr Arg Val Ala Ala Pro Ala Ala Asn Ala Glu He Thr Val Asn 180 185 190
Val Ser Trp Thr Ala Ala Lys Val Ala Thr Leu Thr He Asp Gly Gin 195 200 205
Lys Ala Phe Asp Val Asp Tyr Ser Ser Met Thr Ala Leu Thr Asn Lys 210 215 220
Leu Ala Met Lys Ala Gly Ser Tyr Ser Gly Thr Ser Glu Val Thr Asp 225 230 235 240
Val Tyr Phe Lys Asn Phe Thr Val Gly Glu Val Ala Lys His Asn Val
245 250 255
Thr Gly Lys Val Val Asp Ala Ser Gly Ala Ala He Ala Gly Ala Glu 260 265 270
Val Val Thr Gly Lys Asn Ser Ala Thr Thr Ala Ala Asp Gly Thr Phe 275 280 285
Thr Leu Thr Gly Leu Ala Ala Gly Asp Tyr Thr Leu Thr Val Ser Ala
290 295 300
Glu Gly Tyr Asp Asp Ala Thr Lys Thr Val Thr Val Ala Asp Gly Asn
305 310 315 320
Ala Ser Val Gly Asn He Thr Leu Asn Lys Ser Ala Glu Val Ala Thr
325 330 335
Glu Thr Leu Ser Thr Ala Ala Met Asp Val Arg Val Lys Lys Asn Phe 340 345 350
Pro Ser Val Tyr Asp Tyr Thr Met Lys Lys Phe Gly Gly Lys He Met 355 360 365
Tyr Gly Gin Pro Lys Asp Val Arg Val He Thr He Asn Gly Thr Asp 370 375 380 Val Thr Leu Lys Asp Ser Asp Val Thr Phe Lys Lys Val Ser Ala Thr
385 390 395 400
Glu Ala Gin Tyr Thr Leu Asn Val Lys Ser Gly Asn Lys lie Asn Ala
405 410 415
Val Val Thr Val Gin lie Lys Val Val Asp Asn Thr Leu Lys Leu Asn
420 425 430
Val Thr Lys He Val Asn Lys Ala Asp Asp Ala Lys Thr Glu Ala Glu
435 440 445
Glu Asn Pro Val Gin Thr He Ala Phe Pro Asn Gin Ser Leu He Ser
450 455 460
Val Arg Ser Gly Gin Asp Gly Ala Gin Phe Thr Gly Ala Arg Met Ser
465 470 475 480
Ser Asp Thr Ala Arg Pro Gly Asp Thr Asn Phe Gly He Thr Ala Asp
485 490 495
Thr Thr Val Gly Asn Ala Asn Asp Tyr Thr Tyr Gly Phe Val Ser Gly
500 505 510
Asn Gly Leu Ser Ala Gly Leu Trp Ser Asn Ser Glu His Asp Gly Thr
515 520 525
Thr Val Gly Asn Thr Val Ala Gly Gly Ala Arg Asn Thr Arg Val Leu
530 535 540
Thr Ser Thr Gin Lys Val Gly Lys Ala Thr Ser Phe Gly Leu Gly Thr
545 550 555 560
Ala Pro Trp Tyr Tyr His Arg Val Val Thr Asp Thr Lys Lys Arg Thr
565 570 575
Tyr Thr Val Glu Glu Thr Asp Met Pro Lys Met Ala Val Ala He Ala
580 585 590
Gly Asp Glu Asn Glu Asp Gly Thr Val Asn Trp Glu Asp Gly Ala He
595 600 605
Ala Tyr Arg Asp He Met Asn Asn Pro Tyr Lys Ser Glu Glu Val Pro
610 615 620
Glu Leu Val Ala Trp Arg He Ala Met Asn Phe Gly Ser Gin Ala Gin
625 630 635 640
Asn Pro Phe Leu Thr Thr Leu Asp Asn Val Lys Lys Val Ala Leu Asn
645 650 655 Thr Asp Gly Leu Gly Gin Ser Val Leu Leu Lys Gly Tyr Gly Asn Glu
660 665 670
Gly His Asp Ser Gly His Pro Asp Tyr Gly Asp lie Asn Thr Arg Ala
675 680 685
Gly Gly Ala Ala Asp Met Asn Thr Leu Met Glu Lys Gly Thr Glu Tyr
690 695 700
Gly Ala Arg Phe Gly Val His Val Asn Ala Ser Glu Met Tyr Pro Glu
705 710 715 720
Ala Lys Ala Phe Ser Glu Asp Met Val Arg Arg Asn Ser Ser Gly Gly
725 730 735
Leu Ser Tyr Gly Trp Asn Trp Leu Asp Gin Gly lie Gly He Asp Gly
740 745 750
He Tyr Asp Leu Ala Ser Gly Met Arg Lys Ser Arg Phe Ala Asp Leu
755 760 765
Lys Ser Lys Val Gly Asp Asn Met Asp Phe He Tyr Leu Asp Val Trp
770 775 780
Gly Asn Asn Thr Ser Gly Ala Glu Asp Ser Trp Glu Thr Arg Lys Met
785 790 795 800
Ser Gin Met He Asn Gin Asn Gly Trp Arg Met Thr Thr Glu Trp Gly
805 810 815
Ala Gly Asn Glu Tyr Asp Ala Thr Phe Gin His Trp Ala Ala Asp Leu
820 825 830
Thr Tyr Gly Gly Ser Gly Met Lys Gly Glu Asn Ser Gin Val Met Arg
835 840 845
Phe Leu Arg Asn His Gin Lys Asp Ser Trp Val Gly Asp Tyr Pro Ser
850 855 860
Tyr Gly Gin Ala Ala Asn Ala Pro Leu Leu Gly Gly Tyr Ser Met Lys
865 870 875 880
Asp Phe Glu Gly Trp Gin Gly Arg Asn Asp Tyr Ala Ala Tyr He Arg
885 890 895
Asn Leu Tyr Thr His Asp Val Ser Thr Lys Phe He Gin His Phe Lys
900 905 910
Val Val Arg Trp Val Asn Ser Pro Leu Asp Ala Thr Ser Val Lys Asp
915 92 0 9 25 Ala Ser Val Asn Asn Gly Asn Glu Gin lie Thr Leu Lys Asp Asp His
930 935 940
Gly Asn Val Val Val Leu Ser Arg Gly Ser Asn Asp Thr Asn Asn Gly
945 950 955 960
Ala Tyr Arg Asn Arg Thr lie Thr Leu Asn Gly He Thr Val Ala Ser
965 970 975
Gly Ala Val Ser Pro Gly Asn Ser Asn Thr Val Lys Gly Thr Glu Ser
980 985 990
Tyr Leu Leu Pro Trp Leu Trp Asp Val Asn Thr Gly Lys Leu Val Lys
995 1000 1005
Ser Ser Asp Glu Lys Leu Tyr His Trp Asn Thr Gin Gly Gly Thr Thr
1010 1015 1020
Glu Trp Thr Leu Pro Lys Asp Trp Gin Asn Leu Ala Ser Val Lys Val
1025 1030 1035 1040
Tyr Gin Leu Thr Asp Gin Gly Lys Thr Asn Glu Lys Thr Val Ala Val
1045 1050 1055
Ser Gly Gly Lys He Ser Leu Thr Ala Glu Ala Glu Thr Pro Tyr Val
1060 1065 1070
Val Thr Lys Gly Ser Glu Lys Gin He Ser Val Lys Trp Ser Glu Gly
1075 1080 1085
Met His Val Val Asp Ala Gly Phe Asn Gly Gly Gin Asn Thr Leu Lys
1090 1095 1100
Asp Asn Trp Ala Val Ser Gly Thr Gly Lys Ala Glu Val Glu Gly Thr
1105 1110 1115 1120
Asn Asn Ala Met Leu Arg Leu Thr Gly Asp Val Lys Val Ser Gin Lys
1125 1130 1135
Leu Thr Asp Leu Thr Ala Gly Lys Arg Tyr Ala He Tyr Val Gly Val
1140 1145 1150
Asp Asn Arg Thr Asn Ser Pro Ala Lys He Thr Val Thr Asn Gly Thr
1155 1160 1165
Lys Val Leu Ala Thr Asn Glu Thr Gly Lys Ser He Ala Lys Asn Tyr
1170 1175 1180
He Lys Ala Tyr Gly His Asn Thr Tyr Ser Asn Thr Glu Gly Gly Ser
1185 1190 119 5 1200 Ser Туг Phe Gin Asn Met Tyr Val Trp Phe Val Ala Pro Glu Ser Gly 1205 1210 1215
Asp Val Lys Val Thr Leu Ser His Ser Gly Ala Cys Asp Asn Thr Asp 1220 1225 1230
His Val Tyr Phe Asp Asp Val Arg Val Leu Glu Asn Gly Tyr Lys Gly 1235 1240 1245
Leu Thr Leu Asn Ala Asp Gly Thr Leu Lys Thr Leu Thr Asn Asp Phe 1250 1255 1260
Glu Asp Asn Ala Gin Gly lie Trp Pro Phe Val Val Ser Gly Ser Glu 1265 1270 1275 1280
Gly Val Glu Asp Asn Arg lie His Leu Ser Glu Leu His Ala Pro Phe 1285 1290 1295
Thr Gin Ala Gly Trp Asp Val Lys Lys Met Asp Asp Val Leu Asp Gly 1300 1305 1310
Lys Trp Ser Val Lys Ala Asn Gly Leu He Gin Lys Gly Thr Leu He 1315 1320 1325
Tyr Gin Thr He Pro Gin Asn Val Lys Leu Glu Pro Gly Glu Thr Tyr 1330 1335 1340
Lys Val Ser Phe Lys Tyr Gin Ser Gly Ser Asp Asp He Tyr Ala He 1345 1350 1355 1360
Ala Thr Gly Asp Gly Glu Tyr Asn Ala Ser Thr Val Lys Leu Thr Asn 1365 1370 1375
Leu Lys Lys Ala Leu Gly Glu Asp Gly Thr Ala Glu Phe Glu He Thr 1380 1385 1390
Gly Ser He Thr Gly Asp Ser Trp Phe Gly He Tyr Ser Thr Ser Thr 1395 1400 1405
Ala Pro Asp Leu Gin Asn Thr Ser Asp Ser Ala Ala Ala Phe Gly Gly 1410 1415 1420
Tyr Lys Asp Phe Val Leu Asp Asp Leu Lys Val Glu His Val Ala Ser 1425 1430 1435 1440
Ala Glu Arg Thr Lys Ala Asp Ala Glu Ala Lys Leu Lys Glu Val Lys 1445 1450 1455
Asp Thr Tyr Asn Gly Lys Ser Gly Asp Tyr Ser Ala Glu Val Trp Thr 1460 1465 1470 Thr Туг Val Asn Thr Val Ala Glu lie Glu Ala Leu lie Ala Lys Asp
1475 1480 1485
Lys Pro Asp Tyr Thr Thr Ala Tyr Asn Lys Ala Val Ala Leu Ala Glu
1490 1495 1500
Tyr Met Lys Asn Ala Pro Gly Asp Asp Ser Asn Asp Ala Tyr Asp Val
1505 1510 1515 1520
Ala Thr Asp Ala Tyr Thr Val Glu Ala Gly Ser Gin Gin Ala Leu Ser
1525 1530 1535
Gly Gly Asn Glu Gly Pro Ala Ser Leu Ala Gin Asp Gly Asn Ala Gly
1540 1545 1550
Thr His Trp His Thr Ser Trp Ser Ala Asn Ala Val Ser Ala Gly Thr
1555 1560 1565
Ala Trp Tyr Gin Phe Asn Leu Asn Glu Pro Thr Thr He Asp Gly Leu
1570 1575 1580
Arg Tyr Met Ala Arg Ser Gly Ser Ala Asn Ala Asn Gly Lys He Lys
1585 1590 1595 1600
Lys Tyr Lys He Thr Leu Thr Leu Ser Asp Gly Thr Thr Lys Asp Val
1605 1610 1615
Val Thr Asn Gly Thr Phe Thr Thr Thr Ser Gly Val Trp Gin Lys Val
1620 1625 1630
Lys Phe Asp Ala Val Lys Asn Val Thr Lys Val Arg He Thr Ala Leu
1635 1640 1645
Glu Thr Ala Gly Gin Ser Ala Gly Glu Val Asn Thr Tyr Ala Ser Ala
1650 1655 1660
Ala Glu Leu Arg Val Thr Thr Val Arg Asp Val Pro Ser Thr Glu Val
1665 1670 1675 1680
Lys Val Asn Lys Cys Asp Leu Gin Asn Leu Tyr Asp Asp Ala Ser Ala
1685 1690 1695
Leu Thr Glu Ala Thr Tyr Thr Ala Asp Thr Trp Lys Val Leu Val Ala
1700 1705 1710
Lys Arg Asp Ala Ala Lys Lys Val Leu Asp Asp Glu Asn Ala Thr Ala
1715 1720 1725
Tyr Asp Val Ala Leu Ala Tyr Gin Asn Leu Lys Asp Ala He Ala Ala
1730 1735 1740 Leu Glu Glu Arg Val Asp Thr Ser Lys Leu Ala Gly Leu Val Ala Asp 1745 1750 1755 1760
Ala Glu Lys Leu Lys Glu Ser Ala Tyr Thr Lys Asp Ser Trp Ala Ala 1765 1770 1775
Phe Lys Lys Ala Leu Asp Ala Ala Lys Ala Val Leu Asn Asn Ala Asn 1780 1785 1790
Ala Thr Lys Ala Asp Val Asp Ala Ala Tyr Asn Ala Leu Asn Ala Ala 1795 1800 1805
Met Lys Ala Leu Lys Pro Ala Ser Ser Lys Pro Thr Pro Asn Pro Glu 1810 1815 1820
Thr Thr Asp Lys Ser Lys Leu Gin Ala Thr lie Asp Gin Ala Lys Ala 1825 1830 1835 1840
Leu Asp Leu Ser Gly Tyr Thr Lys Lys Ser Val Gin Ala Val Arg Asp 1845 1850 1855
Ala Leu Ala Lys Ala Gin Ser Val Leu Ala Asp Asp Asn Ala Thr Gin 1860 1865 1870
Ala Asp lie Asp Ala Ala Gin Lys Ala Leu Ala Asp Ala He Ala Ala 1875 1880 1885
Leu Glu Lys Ala Asp Ala Asn Gly Asn Ala He Ser Lys Thr Gly Ala 189 0 189 5 1900
Asn Val Ala Val He Gly Met Ala Gly Met Met Leu Val Ala Ala Ala 1905 1910 1915 1920
Gly Ala Val Phe He Ala Arg Lys Arg Ala Glu
1925 1930
<210> 8 <211 > 316 <212> PRT
< 213 > Bifidobacterium bifidum <400> 8
Met Cys Thr Gly Val Arg Phe Ser Asp Asp Glu Gly Asn Met Tyr Phe 1 5 10 15
Gly Arg Asn Leu Asp Trp Ser Phe Ser Tyr Gly Glu Thr He Leu Val
20 25 30
Thr Pro Arg Gly Tyr Gin Tyr Asp Tyr Val Tyr Gly Ala Glu Gly Lys 35 4 0 45
Ser Glu Pro Asn Ala Val lie Gly Val Gly Val Val Met Val Asp Arg
50 55 60
Pro Met Tyr Phe Asp Cys Ala Asn Glu His Gly Leu Ala lie Ala Gly
65 70 75 80
Leu Asn Phe Pro Gly Tyr Ala Ser Phe Ala His Glu Pro Val Glu Gly
85 90 95
Thr Glu Asn Val Ala Thr Phe Glu Phe Pro Leu Trp Val Ala Arg Asn
100 105 110
Phe Asp Ser Val Asp Glu Val Glu Glu Ala Leu Lys Asn Val Thr Leu
115 120 125
Val Ser Gin Val Val Pro Gly Gin Gin Glu Ser Leu Leu His Trp Phe
130 135 140
He Gly Asp Gly Thr Arg Ser He Val Val Glu Gin Met Ala Asp Gly
145 150 155 160
Met His Val His His Asp Asp Val Asp Val Leu Thr Asn Gin Pro Thr
165 170 175
Phe Asp Phe His Met Glu Asn Leu Arg Asn Tyr Met Cys Val Ser Asn
180 185 190
Glu Met Ala Glu Pro Thr Thr Trp Gly Lys Ala Glu Leu Ser Ala Trp
195 200 205
Gly Ala Gly Val Ser Met His Gly He Pro Gly Asp Val Ser Ser Pro
210 215 220
Ser Arg Phe Val Arg Val Ala Tyr Thr Asn Thr His Tyr Pro Gin Gin
225 230 235 240
Asn Asn Glu Ala Ala Asn Val Ser Arg Leu Phe His Thr Leu Val Ser
245 250 255
Val Gin Met Val Asp Gly Met Ser Lys Met Gly Asn Gly Gin Phe Glu
260 265 270
Arg Thr Leu Phe Thr Ser Gly Tyr Ser Gly Lys Thr Asn Thr Tyr Tyr
275 280 285
Met Asn Thr Tyr Glu Asp Pro Ala He Arg Ser Phe Ala Met Ser Asp
290 295 300
Phe Asp Met Asp Ser Ser Glu Leu He Thr Ala Asp
305 310 315 <210> 9 <211 > 432 <212> PRT
< 213 > Bifidobacterium bifidum
< 400 > 9
Met Ala Ala lie Glu Ser Val Tyr Ala Arg Gin lie Leu Asp Ser Arg
1 5 10 15
Gly Asn Pro Thr Val Glu Val He Leu Asp Thr Glu Asp Gly Ala Glu 20 25 30
Gly Arg Gly Leu Val Pro Ser Gly Ala Ser Thr Gly Glu Ala Glu Ala 35 40 45
Trp Glu Arg Arg Asp Gly Asp Lys Ser Val Tyr Gly Gly Lys Gly Val 50 5 5 60
Leu Asn Ala Val Lys Ala Val Asn Glu Val He Ala Pro Lys Val He 65 70 75 80
Gly Met Asp Ala Thr Asp Gin Arg Ala Leu Asp Asp Leu Met He Glu
85 90 95
Leu Asp Gly Thr Pro Asn Lys Gly Lys Leu Gly Ala Asn Ala He Leu
100 105 110
Gly Val Ser Leu Ala Ala Leu Tyr Ala Ser Ala Glu Ser Ala Glu Leu
115 120 125
Pro Leu Tyr Arg Tyr He Gly Gly Thr Asn Gly His He Leu Pro Val
130 135 140
Pro Asn Met Asn He Met Asn Gly Gly Ala His Ala Asp Phe Ala Thr 145 150 155 160
Asp He Gin Glu Tyr Met He Ser Pro Tyr Gly Phe Asp Thr Tyr Ser
165 170 175
Glu Ala Leu Arg Ala Gly Val Glu Val Tyr His Thr Leu Lys Asn Val
180 185 190
Leu Lys Lys Glu Gly Leu Asn Thr Gly Leu Gly Asp Glu Gly Gly Phe 195 200 205
Ala Pro Lys Met Lys Ser Asn Glu Asp Ser Leu Lys Tyr He Met Asp
210 215 220
Ala He Ser Ala Ala Gly Tyr Glu Pro Gly Lys Gin He Gly He Cys
22 5 2 30 235 24 0 Leu Asp Val Ala Ser Ser Glu Phe Tyr Asn Lys Glu Thr Gly Lys Tyr
245 250 255
Arg Phe Asp Gly Glu Glu Arg Asp Ser Ala Tyr Met Leu Asp Tyr Tyr
260 265 270
Glu Asn Leu lie Asn Glu Tyr Pro lie Val Ser He Glu Asp Pro Phe
275 280 285
Asn Glu Glu Gly Trp Glu Asp Trp Ala Glu He Thr Arg Arg Leu Gly
290 295 300
Asp Arg Leu Gin Phe Val Gly Asp Asp Leu Leu Val Thr Asn Pro Ala
305 310 315 320
Arg Leu Arg Lys Ala He Asp Met Gly Ala Ala Asn Ser Leu Leu Val
325 330 335
Lys Leu Asn Gin He Gly Ser Val Thr Glu Thr Leu Asp Ala He Glu
340 345 350
Leu Ala Thr Glu Asn Gly Tyr Thr Ser Met Val Ser His Arg Ser Gly
355 360 365
Glu Thr Pro Asp Thr Thr He Ser Asp Leu Ala Val Ala Lys Asn Thr
370 375 380
Arg Gin He Lys Thr Gly Ala Pro Ala Arg Gly Glu Arg Val Ala Lys
385 390 395 400
Tyr Asn Arg Leu Leu Glu He Glu Glu Glu Leu Gly Ser Thr Ala Gin
405 410 415
Tyr Ala Gly Tyr Ser Ala Phe Lys Ala Cys Lys Lys Tyr He Ala Lys 420 425 4 30