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Patent Searching and Data


Title:
BLOCKCHAIN-BASED PHARMACEUTICAL CRYSTAL LIBRARY AND CONSTRUCTION METHOD THEREFOR
Document Type and Number:
WIPO Patent Application WO/2021/003831
Kind Code:
A1
Abstract:
A blockchain-based pharmaceutical crystal library and a construction method therefor, comprising: a first layer, which is a crystal source data layer for acquiring crystal information, and stores raw data of pharmaceutical crystals, security and privacy being ensured by a data owner; a second layer, which is a crystal representation layer for adding the crystal information to a chain, stores crystal information documents generated according to corresponding standards, and ensures a unique identifier per one crystal form; and a third layer, which is a crystal index layer for querying crystal-related information, is implemented by means of blockchain nodes, and stores index information and query information for shared documents. The present invention is suitable for the construction of a pharmaceutical molecular crystal library. A blockchain is used to manage pharmaceutical molecular crystal form information, and in combination with software, such functions as adding, searching for, and comparing pharmaceutical molecular crystal forms are implemented, and such goals as protection and authorization for molecular crystal forms are achieved.

Inventors:
LI HE (CN)
WU CHUNAN (CN)
LIU YANG (CN)
MA JIAN (CN)
LAI LIPENG (CN)
WEN SHUHAO (CN)
Application Number:
PCT/CN2019/104023
Publication Date:
January 14, 2021
Filing Date:
September 02, 2019
Export Citation:
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Assignee:
SHENZHEN JINGTAI TECH CO LTD (CN)
International Classes:
G06F16/11; G06F21/64
Foreign References:
CN106682530A2017-05-17
CN109347941A2019-02-15
CN107292181A2017-10-24
CN109299217A2019-02-01
US20160283920A12016-09-29
Attorney, Agent or Firm:
SZ KINDWALF INTELLECTUAL PROPERTY FIRM (CN)
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Claims:
权利要求书

[权利要求 i] 基于区块链的药物晶体库, 其特征在于, 包括三层数据存储架构: 第一层为晶体源数据层, 用于晶体信息获取, 存放药物晶体原始数据 , 安全及隐私由数据持有者保证;

第二层为晶体表示层, 用于晶体信息上链, 存储了按照各标准生成的 晶体信息文档, 一份文档唯一标识了一种晶型; 第三层为晶体索引层, 用于查询晶体信息, 通过区块链节点实现, 存 储了共享文档索引信息, 及查询信息。

[权利要求 2] 根据权利要求 1所述的基于区块链的药物晶体库的构建方法, 其特征 在于, 包括以下步骤:

( 1) 晶体信息获取

使用晶体库的组织或个人, 通过客户端提供的 ECDS A椭圆曲线算法 生成各自的公钥及私钥地址, 记录基本信息用于验证身份, 经过脱敏 处理后将信息写入身份数据库, 完成使用者的身份注册; 完成注册后 , 晶体库使用者通过客户端主动推送晶体信息, 或者通过约定的可访 问地址定期更新晶体原始信息;

晶体原始信息构成了晶体库中的源数据层;

(2) 晶体信息上链

晶体库收到提供者的推送或检测到晶体数据更新后, 对提供的晶体信 息进行完备性、 有效性特性的验证, 之后依照晶体表示的标准方法, 通过提取非关键信息形成加密文档, 加密文档数据构成了晶体库的晶 体表示层;

生成文档后, 使用晶体信息提供者的私钥地址对文档数据进行数字签 名, 存储到可信的脱链数据库中;

存储库在检查完数字签名的合法性后, 进行晶体相似性验证, 将文档 信息与在链晶体数据进行相似性匹配; 发送的验证请求提交到区块链 上, 每个区块链节点收到请求后, 通过请求中的签名及公钥核验请求 的有效性, 对于有效请求, 进一步计算与已有晶体的相似度, 通过公 钥加密计算结果并返回;

(3) 晶体信息索引

当所有节点相似性验证通过后, 新的晶体信息文档建立索引信息, 提 取后使用双 SHA256哈希算法对共享文档提取的信息形成数字指纹, 再将该数字指纹连同索引信息一起形成区块并写入到区块链中, 完成 文档索引区块的构建和注册, 构成了晶体库的晶体索引层。

[权利要求 3] 根据权利要求 2所述的基于区块链的药物晶体库的构建方法, 其特征 在于, 步骤 (1) 中晶体信息获取包含多个来源: 1.来自现有的标准 晶体库或药典收录; 2.来自个人、 组织贡献的实验结果; 3.来自药物 晶型专利; 4.量化计算结果晶体。

[权利要求 4] 根据权利要求 2所述的基于区块链的药物晶体库的构建方法, 其特征 在于, 步骤 (3) 中新的晶体信息文档建立索引信息, 包括文档创建 者、 创建时间、 保密级别、 文档唯一标识、 格式、 hash值、 通用命名 、 别名、 针对病症。

Description:
基于区块链的药物晶体库及其构建方法 技术领域

[0001] 本发明属于药物分子晶体数据库的构建领域, 具体涉及一种基于区块链的药物 晶体库及其构建方法。

背景技术

[0002] 常用药物晶体数据库为 CCDC (the Cambridge Crystallo Crystallographic Data

Centre) 提供的离线查询 (同名) 软件, 里面内置了部分药物分子晶体, 可通过 缩写进行搜索, 以及基于空间群、 自由度等参数的搜索, 并将结果进行 3D展示, 或指定格式的文件保存。

[0003] CCDC提供的软件, 必须在 PC端下载安装后才能使用, 更新频率慢 (一年一次

) , 价格较高, 且只能由 cede相关机构添加数据。 软件数据库离线保存, 数据损 坏后需要重新安装恢复, 数据也可能被拷贝传播, 没有安全保证。 药物分子晶 体与结晶无法进行结构比对。

发明概述

技术问题

问题的解决方案

技术解决方案

[0004] 本发明提出了基于区块链的药物晶体库及其构 建方法, 适用于药物晶体数据库 的构建, 利用区块链对药物分子晶型信息进行管理, 结合客户端软件, 实现对 于药物分子晶型的新增、 查找、 对比等功能, 达到对分子晶型的保护、 快速授 权等目的。

[0005] 具体技术方案为:

[0006] 基于区块链的药物晶体库, 包括三层数据存储架构:

[0007] 第一层为晶体源数据层, 用于晶体信息获取, 存放药物晶体原始数据, 安全及 隐私由数据持有者提供;

[0008] 第二层为晶体表示层, 用于晶体信息上链, 存储了按照各标准生成的晶体信息 文档, 可唯一标识一种晶型;

[0009] 第三层为晶体索引层, 用于查询晶体信息, 通过区块链节点实现, 存储了共享 文档索引信息, 及查询信息。

[0010] 基于区块链的药物晶体库构建方法, 包括以下步骤:

[0011] ( 1) 晶体信息获取

[0012] 晶体信息获取包含多个来源: 1.来自已有的标准晶体库或药典收录; 2.来自个 人、 组织贡献的实验结果; 3.来自药物晶型专利; 4.量化计算结果晶体。

[0013] 晶体信息提供的组织或个人, 通过 ECDSA椭圆曲线算法生成各自的公钥及私 钥地址, 记录基本信息用于验证身份, 经过脱敏处理后将信息写入身份数据库 , 完成提供者的注册。

[0014] 完成注册后, 晶体信息提供者通过客户端主动推送晶体信息 , 或者通过约定的 互联网地址 (包括但不限于 ftp、 网盘、 云存储等) 定期更新晶体原始信息。 晶 体原始信息构成了晶体库中的源数据层。 但受到源数据来源广泛等因素影响, 不对源数据进行统一存储, 仍然由数据持有者维护。

[0015] (2) 晶体信息上链

[0016] 晶体库收到提供者的推送或检测到更新后, 会对提供的晶体信息进行完备性、 有效性等特性的验证, 之后依照晶体表示的标准方法, 通过提取非关键信息形 成加密文档, 默认情况下会采集晶体的分子信息、 空间群信息, 键连接等。 文 档数据构成了晶体库的晶体表示层。

[0017] 生成文档后, 使用晶体信息提供者的私钥地址对文档数据进 行数字签名, 存储 到可信的脱链数据库中。

[0018] 存储库在检查完数字签名的合法性后, 需要进行晶体相似性验证; 也就是将文 档信息与在链晶体数据进行相似性匹配; 发送的验证请求提交到区块链上, 每 个区块链节点收到请求后, 通过请求中的签名及公钥核验请求的有效性, 对于 有效请求, 进一步计算与已有晶体的相似度, 通过公钥加密计算结果并返回;

[0019] (3) 晶体信息索引

[0020] 当所有节点相似性验证通过后, 新的晶体信息文档建立索引信息, 包括文档创 建者、 创建时间、 保密级别、 文档唯一标识、 格式、 hash值、 通用命名、 别名、 针对病症等, 提取后使用双 SHA256哈希算法对共享文档提取的信息形成数字 指 纹, 再将该数字指纹连同索引信息一起形成区块并 写入到区块链中, 完成文档 索引区块的构建和注册。 这个过程构成了晶体库的晶体索引层。

[0021] 本发明提供基于区块链的药物晶体库及其构建 方法, 通过区块链技术、 智能合 约、 在链晶体索引结合脱链晶体表示等方法实现了 对药物晶体信息的共享, 解 决了药物晶型查询困难及授权隐私保护等问题 , 提供了药物研究可追溯查询方 法。

[0022] 本发明提供的基于区块链的药物晶体库及其构 建方法, 具有以下技术优势:

[0023] ( 1) 能够显著降低药物晶体的查询、 获取及维护难度, 使晶体信息的分享更 为快捷透明, 同时能够提供某类晶体在探索过程中的演化历 史, 为药物研究提 供指导。

[0024] (2) 更加精准快捷的保护药物晶型的归属权利, 保证数据不被篡改或盗取。

[0025] (3) 利用不同来源的晶体做研究也能充分发挥大数 据的效用, 打破以往数据 只在企业内使用的壁垒, 提供更好的研究环境。

[0026] (4) 基于智能合约的授权方式能够保证每次授权都 是可追溯且不能篡改的, 对晶型授权及保护提供了更加完备的选项。

发明的有益效果

对附图的简要说明

附图说明

[0027] 图 1为本发明的流程图 发明实施例

本发明的实施方式

[0028] 结合实施例说明本发明的具体技术方案。

[0029] 基于区块链的药物晶体库构建分为三个部分, 分别为: 晶体信息获取、 晶体信 息上链、 查询晶体信息, 如图 1所示, 对应着晶体库三层结构, 即晶体源数据层 、 晶体表示层、 晶体索引层。

[0030] 第一层为晶体源数据层, 用于晶体信息获取, 存放药物晶体原始数据, 安全及 隐私由数据持有者提供;

[0031] 第二层为晶体表示层, 用于晶体信息上链, 存储了按照各标准生成的晶体信息 文档, 可唯一标识一种晶型;

[0032] 第三层为晶体索引层, 用于查询晶体信息, 通过区块链节点实现, 存储了共享 文档索引信息, 及查询信息。

[0033] 基于区块链的药物晶体库的构建过程为:

[0034] 步骤 1 : 注册及身份认证。

[0035] 药物晶体库的使用者, 需要提供可查验的身份信息, 如果是个人, 注册时需要 提供姓名、 性别、 职业、 常驻地、 身份证号等, 如果是单位或科研机构, 需要 提供机构名称、 联系电话、 企业编号等信息。

[0036] 注册模块根据信息向相关机构进行核验, 通过后会依照注册信息及 ECDSA椭 圆曲线算法为使用者生成唯一的公钥及私钥, 公钥及私钥一经生成不能变更, 由晶体库维护。

[0037] 步骤 2: 晶体源数据层构建。

[0038] 通过晶体信息来源获得存有晶体信息的文档, 晶体信息来源包括但不限于晶体 专利, 实验获取, 中国药典收录, 计算得出等;

[0039] 根据 《中国药典》 (9015药品晶型研究及晶型质量控制指导原则) 中对药物多 晶型的定义标准, 提取文档中药物晶体相关参数, 包括分子名称、 相关疾病、 空间群信息、 晶胞参数、 分子对称性、 分子作用力、 分子构象、 结晶水、 结晶 溶剂、 XRD衍射图像等生成文档。 药物晶体相关参数根据公开等级可以适当增 减参数项。

[0040] 步骤 3: 晶体表示层构建。

[0041] 文档生成后, 利用步骤 1中使用者的私钥地址对步骤 2生成的文档签名, 存储到 受信的存储库中, 存储库首先检查文档签名的有效性, 通过使用者的公钥即可 获取数字签名, 经过签名有效性验证后, 进一步验证其多方相似性。

[0042] 包括:

[0043] ( 1) 存储库检查信息文档的公开等级, 根据公开等级屏蔽掉文档中敏感的信 息, 然后对链上所有提供过晶体信息文档的节点发 送验证请求; [0044] (2) 各节点收到请求后, 根据请求中的签名及公钥信息, 验证请求有效性, 通过验证后, 针对文档信息核验其是否符合上链条件及与所 存晶体信息的相似 度, 具体相似度计算可参考 《中国药典》 中提到的方法 (单晶 X射线衍射法得到 的衍射图像, 当满足衍射峰相同, 二者 20值衍射峰位置误差范围在 ±0.2°内、 相同位置衍射峰的相对峰强度误差在 ±5%内, 衍射峰的强弱顺序应一致) 。

[0045] 公开程度较低的晶型, 可降低相似度判定条件。 节点验证通过后, 通过请求中 的公钥加密计算结果并返回。

[0046] 步骤 4: 晶体索引层构建。

[0047] 当所有请求都返回了并验证通过后, 新的晶体信息文档建立索引信息, 包括文 档创建者、 创建时间、 保密级别、 文档唯一标识、 格式、 通用命名、 别名、 针 对病症等, 提取后使用双 SHA256哈希算法对共享文档提取的信息形成数字 指纹 , 再将该数字指纹连同索引信息一起形成区块并 写入到区块链中, 完成文档索 引区块的构建和注册。

[0048] 步骤 5: 查询药物晶体信息。

[0049] 药物晶体库使用者如果需要获取相关药物晶体 信息时, 通过查询模块可以得到 相关的索引信息。

[0050] 具体来说, 可以通过疾病名称、 药物名称、 分子片段等信息搜索到相同或相近 的晶体文档索引。 以搜索疾病“高尿酸血症”为例, 查询模块通过疾病名称加使用 者公钥提交到区块链中, 区块链收到查询请求后, 验证查询者签名的有效性, 验证通过后将查询结果用使用者公钥加密后返 回给查询者。

[0051] 查询者通过私钥解密查询结果, 即可得到返回的索引 +脱链文档的查询结果。

搜索结果里包含了与痛风相关的非布司他、 秋水仙碱等相关药物晶型, 而非布 司他的不同药物晶型有几十种, 分别对应了 A、 B、 C、 H、 I、 J、 K等晶型及水 合物、 甲醇溶剂合物等多种溶剂合物, 由于大多数相关晶型都已申请专利, 可 以通过结果直接查到专利号、 专利作者等信息。

[0052] 步骤 6: 获取晶体源数据。

[0053] 对于查询结果里部分公开或非公开类型的晶型 文档, 能够从区块链上获取的信 息是有限的, 如果需要进一步查看原始文档等信息, 则需要通过加密数据通道 发送请求到存有原始文档的组织机构或个人。 请求同样通过区块链发送, 相关 机构或个人收到请求后, 通过电子签名验证请求有效性, 并进一步评估是否通 过请求。 通过后, 自行发送原始文档给请求者。

[0054] 本方法构建的晶体库提供了多样化的晶体信息 查询方式:

[0055] ( 1) 针对已经公开或者专利中的晶体信息, 可通过名称直接查询, 这种方式 针对的是保密级别为公开的晶体;

[0056] (2) 针对部分加密或完全加密的晶体, 查询方式受限于分子匹配或分子片段 匹配、 贡献者匹配等; 结合查询的参数, 生成文档查询的请求, 使用查询者的 证书签名带上公钥发送到区块链中;

[0057] (3) 区块链在收到查询请求后, 首先验证查询的真实性和有效性, 然后将请 求发送给脱链数据库, 脱链数据库在验证查询有效性后, 将查询文档加密后返 回;

[0058] (4) 当查询者需要进一步查看晶体原始数据时, 通过区块链再次发送查询请 求给数据持有者, 持有者对请求者的签名进行解析认证, 确认有效性后根据实 际情况决定是否将相应晶体信息公开给请求者 , 确认发送后, 使用查询者提供 的公钥对信息加密, 发送给查询者;

[0059] (5) 查询完成后, 查询者数字签名、 查询时间、 查询完成实际、 文档唯一标 识等信息形成区块写入区块链。