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Title:
DEVELOPMENT OF RICE LINEAGES (ORYZA SATIVA L.) THAT ARE RESISTANT TO HERBICIDES THAT INHIBIT THE ACETYL COENZYME A CARBOXYLASE ENZYME (ACCASE), AND THAT ARE OBTAINED BY GAMMA RADIATION-INDUCED MUTATION
Document Type and Number:
WIPO Patent Application WO/2017/008134
Kind Code:
A1
Abstract:
The present invention discloses the development of rice lineages (Oryza sativa L.) that are resistant to herbicides that inhibit the acetyl coenzyme A carboxylase enzyme (ACCase) by applying gamma radiation to produce the species of Oryza sativa L. modified with the described sequence of SEQ ID. No. 1. The rice lineages comprise the substitution mutation of the nitrogenous base guanine by thymine in the position corresponding to the codon which gives rise to the 2027 amino acid in the carboxyl-transferase site of the ACCase enzyme. The rice plants exhibit a variation in the gene that codes for the acetyl coenzyme A carboxylase enzyme, promoting resistance to ACCase-inhibiting herbicide, in comparison with wild plant varieties.

Inventors:
ANDRADE ALEXANDER DE (BR)
SCHIOCCHET MOACIR ANTÔNIO (BR)
TCACENCO FERNANDO ADAMI (BR)
PEREIRA ADRIANA (BR)
MARSCHALEK RUBENS (BR)
EBERHARDT DOMINGOS SAVIO (BR)
TULMANN NETO AUGUSTO (BR)
NOLDIN JOSÉ ALBERTO (BR)
Application Number:
PCT/BR2016/050137
Publication Date:
January 19, 2017
Filing Date:
June 16, 2016
Export Citation:
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Assignee:
EPAGRI - EMPRESA DE PESQUISA AGROPECUÁRIA E EXTENSÃO RURAL DE SANTA CATARINA (BR)
International Classes:
A01H5/00; A01H1/06; A01N43/40; A01N43/60; A01P13/00; C12N15/52
Domestic Patent References:
WO2013074524A12013-05-23
Foreign References:
US20140045686A12014-02-13
US20130023416A12013-01-24
US20150106970A12015-04-16
Other References:
LI, L. ET AL.: "Target-site mechanism of ACCase-inhibitors resistance in American sloughgrass (Beckmannia syzigaclme Steud.) from China .", PESTICID BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY., vol. 110, 2014, pages 57 - 62, XP055347931
DELYE, C ET AL.: "Molecular bases for sensitivily to acetyl-coenzyme A carboxylase infoibitors in black-grass.", PLANT PHYSIOL., vol. 137, no. 3, 2005, pages 794 - 806, XP002688872
LIU, W ET AL.: "Single-site muíations in the carboxyltransferase domain of plastid acetyl-CoA carboxylase confer resistance to grass specific herbicides.", PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES, vol. 104, no. 9, 2007, pages 3627 - 3632, XP002697538
SCHIOCCHET, M. A. ET AL.: "SCSI 18 Marques - New rice cultivar obtained through induced mutation.", CROP BREEDING AND APPLIED BIOÍECIMOLOGY., vol. 14, no. 1, 2014, pages 68 - 70., XP055347935, ISSN: 1984-7033
Attorney, Agent or Firm:
ANTONINI, Edemar Soares (BR)
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Claims:
REIVINDICAÇÕES

1 - Desenvolvimento de linhagens de arroz (Oryza sativa L.) com resistência a herbicidas inibidores da enzima acetyl coenzima A carboxiiase (ACCase) caracterizado por compreender a aplicação de raios gama para a produção da espécie Oryza sativa L. modificada com a sequência descrita em SEQ ID NO: 1

2- Linhagens de arroz (Oryza sativa L.) com resistência a herbicidas inibidores da enzima acetyl coenzima A carboxiiase (ACCase) obtidas por processo descrito na reivindicação 1 , caracterizado pelas linhagens do arroz compreender mutação de substituição da base nitrogenada Guanina por Timina na posição correspondente ao códon que dá origem ao aminoácido 2027 no sítio carboxil-transferase da enzima da ACCase.

3- Linhagens de arroz (Oryza sativa L.) com resistência a herbicidas inibidores da enzima acetyl coenzima A carboxiiase (ACCase) obtidas por processo descrito na reivindicação 1 , caracterizada por compreender uma enzima codificada por uma molécula de ácido nucleico com a sequência de nucleotídeos descrita em SEQ ID NO: 1 .

Description:
Desenvolvimento de linhagens de arroz {Oryza sativa L.) com resistência a herbicidas inibidores da enzima acetyl coenzima A carboxilase (ACCase) obtidas por mutação induzida com raios gama.

[001 ] A invenção, descrita neste relatório, consiste no desenvolvimento de linhagens de arroz (Oryza sativa L.) com resistência a herbicidas inibidores da enzima acetyl coenzima A carboxilase (ACCase) obtido por mutação induzida com raios gama.

[002] Os documentos US2013/0023416A1 e US 2014/0045686 revelam plantas de arroz com resistência a herbicidas inibidores da ACCase. A diferença entre as patentes está na posição do nucleotídeo alterado do gene responsável por codificar a enzima da ACCase. O documento US20150106970 descreve a aplicação de raios gama para a mutação da subespécie de arroz, japonica , numa dosagem de raios de 280 Gy.

[003] O processo de obtenção da linhagem com tolerância a inibidores da ACCase, descrito neste relatório, é distinto das referidas patentes. Nas patentes citadas, a obtenção das linhagens é por mutação química enquanto que no processo descrito neste relatório é por mutação física através de raios gama.

[004] As linhagens, no processo descrito neste relatório, apresentam uma mutação de substituição G>T na posição correspondente ao códon que dá origem ao aminoácido 2027 (referente ao padrão Alopecurus myosuroides, accession number AJ632096, GenBank CAC84161 .1 ) no sítio carboxil- transferase da enzima da ACCase.

[005] O invento, revelado neste relatório, inclui plantas que apresentam uma mutação no ácido núcleico do gene responsável pela codificação da enzima ACCase. As plantas com mutação apresentam uma resposta diferencial a herbicidas quando comparadas a plantas de arroz sem a mutação. As plantas apresentam a mutação G2027T (nomenclatura referente à gramínea Alopecurus myosuroides, accession number AJ632096, Gen Bank CAC84161 .1 ) no sitio carboxil-transferase da enzima acetyl coenzima A carboxilase, que confere resistência a ação de herbicidas inibidores da ACCase. A presente invenção também inclui sementes produzidas por estas plantas e os métodos de controle de plantas daninhas nas lavouras de arroz.

[006] A presente invenção descreve plantas de arroz, que apresentam uma variação no gene que codifica para a enzima Acetil-coenzima A carboxilase, promovendo resistência a herbicidas inibidores da ACCase, em comparação com uma variedade selvagem da planta.

[007] O desenvolvimento de cultivares de arroz resistentes aos herbicidas inibidores da ACCase pode ser uma opção estratégica para o manejo de plantas daninhas beneficiando toda a cadeia produtiva (produtor, indústria e consumidor) com o aumento da qualidade e da produtividade deste cereal.

[008] A Figura 1 representa a sequência SEQ ID NO: 1 da linhagem de arroz modificada geneticamente.

[009] A Figura 2 mostra o efeito do herbicida inibidor da enzima ACCase (haloxyfop-p-methyl (Verdict R, 2 L/ha), 30 dias após a aplicação, em plantas da linhagem SCM 268 (A), da linhagem SC 155 (B) e da linhagem SCM 269 (C).

[0010] A Figura 3 mostra o efeito do herbicida inibidor da ACCase (quizalofop-p-ethyl -Targa 50 CE, 2 L/ha), aos 30 dias após a aplicação, em plantas da linhagem SCM 268 (A), da linhagem SC 155 (B) e da linhagem SCM 269 (C).

[001 1 ] A Figura 4 mostra o efeito do herbicida inibidor da ACCase (haloxyfop-p-methyl -Verdict, 2 L/ha), 15 dias após a aplicação, em plantas da linhagem SCM 268 (A), da linhagem SC 155 (B) e da linhagem SCM 269 (C).

[0012] O processo para a geração de mutantes através de indução de mutação com raios gama para desenvolver linhagens de arroz com resistência a herbicidas inibidores da ACCase, compreende as etapas de a) Formação de linhagens mutantes. b) Seleção de plantas resistentes a herbicidas, c) Alteração da sequência de aminoácidos das linhagens promoveu resistência a herbicidas inibidores da ACCase. d) Seleção das plantas resistentes.

[0013] Formação de linhagens mutantes

[0014] As sementes (300 g) da linhagem de arroz SC 155 foram irradiadas com 25 krad de raios gama no Cena/USP, Piracicaba, São Paulo. Após a irradiação, as sementes foram semeadas em caixas com solo arenoso na Epagri/Estação Experimental de Itajaí. No estádio de duas a três folhas, as mudas foram transplantadas individualmente a campo, formando a população (Mi) com aproximadamente 25.000 plantas. Na maturação, foram colhidas três panículas de cada planta, formando as sementes da geração M2.

[0015] Seleção de plantas resistentes a herbicidas

[0016] As sementes da geração M2 das populações oriundas da mutação foram semeadas a campo, totalizando uma população estimada de 5 milhões de plantas. As plantas, ao atingirem o estádio de três a quatro folhas, foram aspergidas com 1 ,5 L/ha do herbicida haloxyfop-p-methyl. As avaliações e seleção das plantas sobreviventes foram realizadas 15 dias após o tratamento com o herbicida. Durante as avaliações e seleção, foram encontradas duas plantas que apresentaram resistência ao herbicida.

[0017] A alteração da sequência de aminoácidos das linhagens promoveu resistência a herbicidas inibidores da ACCase.

[0018] Nas plantas que apresentaram resistência ao herbicida haloxyfop- p-methyl, foi realizado o sequenciamento da região carboxil-transferase do gene que codifica para a proteína ACCase plastidial. As plantas da linhagem SCM 268 e SCM 269 apresentaram uma mutação de substituição no gene responsável por codificar a enzima ACCase. A mutação encontrada nas linhagens de arroz com resistência a aplicação de haloxyfop-p-methyl apresentou uma alteração na posição 2027 (referente ao padrão Alopecurus myosuroides, accession number AJ632096, Gen Bank CAC84161 .1 . Essa alteração está caracterizada pela substituição do nucleotídeo "G" pelo nucleotídeo "T" na sequência de DNA, resultando na substituição do aminoácido triptofano (W) pelo aminoácido cisteina (C) na proteína ACCase, substituição essa doravante referida como W20207C. A resistência foi confirmada através de bioensaio onde foi aplicado o herbicida haloxyfop-p-methyl em progénies das linhagens SCM 268 e SCM 269.

[0019] Plantas resistentes

[0020] a. Após o tratamento com o herbicida, apenas duas plantas de arroz (SCM 268 e SCM 269) sobreviveram à ação do produto, permanecendo verdes e saudáveis, enquanto todas as outras apresentaram sintomas de fitoxicidade e alteração do desenvolvimento, com posterior morte. As plantas sobreviventes foram transplantadas e suas sementes colhidas. As avaliações das progénies SCM 268 e SCM 269 demonstraram que a característica de resistência a herbicidas inibidores da ACCase é transferida, não ocorrendo alteração no desenvolvimento e na reprodução das plantas. A aplicação dos herbicidas haloxyfop-p-methyl e quizalofop-p-ethyl em progénies das linhagens SCM 268 e SCM 269 confirmaram a característica de resistência aos herbicidas inibidores da ACCase. A avaliação de plantas heterozigotas com a resistência demonstrou que o gene é dominante para a característica resistência, tornando as plantas ideais para serem retrocruzadas com cultivares comerciais. As fotos das figuras 2, 3 e 4 mostram essa evolução.

[0021 ] b. As progénies foram selecionadas e conduzidas como linhagens, e a avaliação do potencial produtivo e agronómico foi realizado sob condições de cultivo. Qualquer uma das linhagens de arroz poderá dar origem a uma cultivar com alto potencial produtivo e características agronómicas adequadas, representando uma tecnologia alternativa para o controle do arroz-daninho e outras plantas daninhas poáceas infestantes de lavouras de arroz.

[0022] As cultivares resistentes aos herbicidas inibidores da ACCase poderão ser rastreadas através da aplicação de herbicidas ou por meio de técnicas moleculares. Marcadores moleculares poderão ser utilizados na seleção de plantas que apresentam resistência aos herbicidas inibidores da ACCase. As técnicas moleculares e os bioensaios com herbicidas podem facilitar o desenvolvimento de novas variedades de arroz que apresentam resistência aos inibidores da ACCase. A figura 1 mostra a listagens de sequência de linhagens de arroz (Oryza sativa L), modificada geneticamente com resistência a herbicidas inibidores da enzima acetyl coenzima A carboxilase (ACCase) obtidas por mutação induzida com raios gama, nominada SEQ ID NO: 1 .

[0023] Em um programa de melhoramento genético de arroz, a seleção de linhagens com resistência a herbicida é realizada através de um ensaio biológico com a aplicação do produto nas linhagens de interesse. As plantas que apresentarem a característica de resistência podem ser selecionadas e avaliadas agronomicamente. Alternativamente, as linhagens SCM 268 e SCM 269 podem ser selecionadas através da detecção com um marcador polimórfico ou por sequenciamento da região do gene que apresenta a mutação. Arquivo em anexo mostra listagens de sequencias de linhagens de arroz (Oryza sativa

L.)