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Title:
PLASMON-ENHANCED FLUORESCENCE-BASED SENSORS FOR THE DETECTION OF DISEASE-SPECIFIC BIOMARKERS
Document Type and Number:
WIPO Patent Application WO/2021/249910
Kind Code:
A1
Abstract:
The present invention relates to biomarker detection sensors for detecting disease-specific biomarkers, kits based on these sensors, methods for determining disease-specific biomarkers in body fluids, and corresponding uses.

Inventors:
VELOTTA RAFFAELE (IT)
MAYER DIRK (DE)
DELLA VENTURA BARTOLOMEO (IT)
MINOPOLI ANTONIO (IT)
LENYK BOHDAN (DE)
Application Number:
PCT/EP2021/065114
Publication Date:
December 16, 2021
Filing Date:
June 07, 2021
Export Citation:
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Assignee:
FORSCHUNGSZENTRUM JUELICH GMBH (DE)
International Classes:
B82Y5/00; G01N33/543; B82Y15/00; G01N33/569; G01N33/58
Domestic Patent References:
WO2019104319A12019-05-31
Foreign References:
EP0732583A21996-09-18
Other References:
MINOPOLI ANTONIO ET AL: "Abstract", NATURE COMMUNICATIONS, vol. 11, no. 1, 1 December 2020 (2020-12-01), XP055840041, Retrieved from the Internet DOI: 10.1038/s41467-020-19755-0
MINOPOLI ANTONIO ET AL: "Randomly positioned gold nanoparticles as fluorescence enhancers in apta-immunosensor for malaria test", MIKROCHIMICA ACTA, vol. 188, no. 3, 16 February 2021 (2021-02-16) - 16 February 2021 (2021-02-16), XP037408966, ISSN: 0026-3672, DOI: 10.1007/S00604-021-04746-9
BARTOLOMEO DELLA VENTURA ET AL: "Biosensor for Point-of-Care Analysis of Immunoglobulins in Urine by Metal Enhanced Fluorescence from Gold Nanoparticles", APPLIED MATERIALS & INTERFACES, vol. 11, no. 4, 4 January 2019 (2019-01-04), US, pages 3753 - 3762, XP055588413, ISSN: 1944-8244, DOI: 10.1021/acsami.8b20501
LOTFI AREZOO ET AL: "Development of Metal-Enhanced Fluorescence-Based Aptasensor for Thrombin Detection Using Silver Dendritic Nanostructures", PLASMONICS, SPRINGER US, BOSTON, vol. 14, no. 3, 14 September 2018 (2018-09-14), pages 561 - 568, XP037091424, ISSN: 1557-1955, [retrieved on 20180914], DOI: 10.1007/S11468-018-0835-Y
VASCHENKO SVETLANA ET AL: "Enhancement of Labeled Alpha-fetoprotein Antibodies and Antigen-antibody Complexes Fluorescence with Silver Nanocolloids", PROCEDIA ENGINEERING, vol. 140, 31 December 2016 (2016-12-31), pages 57 - 66, XP029456902, ISSN: 1877-7058, DOI: 10.1016/J.PROENG.2015.08.1111
MEI ZHONG ET AL: "Surface-Plasmon-Coupled Fluorescence Enhancement Based on Ordered Gold Nanorod Array Biochip for Ultrasensitive DNA Analysis", ANALYTICAL CHEMISTRY, vol. 89, no. 1, 3 January 2017 (2017-01-03), US, pages 633 - 639, XP055840321, ISSN: 0003-2700, Retrieved from the Internet DOI: 10.1021/acs.analchem.6b02797
SEONGHWAN LEE ET AL: "A highly sensitive aptasensor towards Plasmodium lactate dehydrogenase for the diagnosis of malaria", BIOSENSORS AND BIOELECTRONICS, vol. 35, no. 1, 1 May 2012 (2012-05-01), pages 291 - 296, XP055032995, ISSN: 0956-5663, DOI: 10.1016/j.bios.2012.03.003
CHO SANG-YEON ET AL: "Label-free plasmonic immunosensing for plasmodium in whole blood", 2013 IEEE SENSORS, IEEE, 3 November 2013 (2013-11-03), pages 1 - 4, XP032532593, ISSN: 1930-0395, [retrieved on 20131218], DOI: 10.1109/ICSENS.2013.6688129
ZHOU YANLI ET AL: "Fabrication of an antibody-aptamer sandwich assay for electrochemical evaluation of levels of [beta]-amyloid oligomers", SCIENTIFIC REPORTS, vol. 6, no. 1, 1 December 2016 (2016-12-01), XP055840863, Retrieved from the Internet DOI: 10.1038/srep35186
LOHMÜLLER THEOBALD ET AL: "Nanopatterning by block copolymer micelle nanolithography and bioinspired applications", BIOINTERPHASES, vol. 6, no. 1, 1 March 2011 (2011-03-01), US, pages MR1 - MR12, XP055840017, ISSN: 1934-8630, DOI: 10.1116/1.3536839
RAGAVAN K V ET AL: "Advances in biosensors and optical assays for diagnosis and detection of malaria", BIOSENSORS AND BIOELECTRONICS, ELSEVIER SCIENCE LTD, UK, AMSTERDAM , NL, vol. 105, 2 February 2018 (2018-02-02), pages 188 - 210, XP085343460, ISSN: 0956-5663, DOI: 10.1016/J.BIOS.2018.01.037
LOHMÜLLER, T.AYDIN, D.SCHWIEDER, M. ET AL.: "Nanopatterning by block copolymer micelle nanolithography and bioinspired applications", BIOINTERPHASES, vol. 6, 2011, pages MR1 - MR12, Retrieved from the Internet
Attorney, Agent or Firm:
MEISSNER BOLTE PATENTANWÄLTE RECHTSANWÄLTE PARTNERSCHAFT MBB (DE)
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Claims:
Ansprüche

1. Biomarker-Detektionssensor zur Detektion von krankheitsspezifischen Biomarkern umfassend oder bestehend aus einem Substrat mit darauf gebundenen in verzweigten zweidimensionalen Strukturen und/oder einem zweidimensionalen Gitter angeordneten Metall- Nanopartikeln und an die Metall-Nanopartikel gebundenen Anti-Biomarker- Rezeptoren.

2. Biomarker-Detektionssensor gemäß Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, dass die Metall-Nanopartikel Gold-Nanopartikel sind.

3. Biomarker-Detektionssensor gemäß Anspruch 1 oder 2, dadurch gekennzeichnet, dass es sich bei dem krankheitsspezifischen Biomarker um Pfl_DH handelt und die an die Gold-Nanopartikel gebundenen Anti-Biomarker- Rezeptoren mit UV-Strahlung vorbehandelte anti-pLDH-Antikörper sind.

4. Biomarker-Detektionssensor gemäß einem der vorhergehenden Ansprüche, dadurch gekennzeichnet, dass das Verhältnis R von Durchmesser D der Nanopartikel zum Abstand d zwischen den einzelnen Gold-Nanopartikeln in dem zweidimensionalen Gitter >2,3 beträgt, bevorzugt zwischen 2,3 und 3,5 liegt, insbesondere bevorzugt bei 2,5 oder 3,0 liegt.

5. Biomarker-Detektionssensor gemäß einem der vorhergehenden Ansprüche, dadurch gekennzeichnet, dass a) die Goldpartikel al) hexagonal oder hexagonal dicht gepackt sind, oder a2) in verzweigtem, bandartigen Strukturen angeordnet sind, oder a3) eine kombinierte zweidimensionale Struktur ausbilden, bei der Teile der Struktur hexagonal oder hexagonal dicht angeordnet, und gleichzeitig Teile der Struktur in verzweigten, bandartigen Strukturen angeordnet sind; b) der Durchmesser D der Nanopartikel zwischen 40 und 60 nm, bevorzugt zwischen 44 und 55 nm, besonders bevorzugt zwischen 46 und 52 nm, insbesondere bevorzugt 48 oder 50 nm, beträgt, oder der Durchmesser D der Nanopartikel zwischen 50 und 70 nm, bevorzugt zwischen 55 und 65 nm, besonders bevorzugt 60 nm, beträgt, und c) der Abstand d zwischen den einzelnen Gold-Nanopartikeln zwischen 16 und 24 nm, bevorzugt zwischen 17 und 22 nm, besonders bevorzugt zwischen 18 und 21 nm, insbesondere bevorzugt 19 oder 20 nm, beträgt.

6. Biomarker-Detektionssensor-Kit umfassend oder bestehend aus

A) mindestens einen Biomarker-Detektionssensor gemäß einem der Ansprüche 1 bis 5,

B0) einer Zubereitung umfassend mindestens ein Biomarker-spezifisches Aptamer mit daran gebundenem Fluorophor, optional

Bl) mindestens eine weitere Zubereitung umfassend mindestens ein gleiches Biomarker-spezifisches Aptamer mit anderem daran gebundenem Fluorophor, und/oder

B2) mindestens eine weitere Zubereitung umfassend mindestens ein anderes Biomarker-spezifisches Aptamer mit daran gebundenem anderem Fluorophor,

C) optional weiterem Analysenmaterial, bevorzugt Küvetten, Pipetten, Lichtquelle, Fluoreszenzdetektor, insbesondere

Fluoreszenzspektrometer.

7. Biomarker-Detektionssensor-Kit gemäß Anspruch 6, dadurch gekennzeichnet, dass B2) ausgewählt wird aus

B2i) mindestens einem, bevorzugt genau einem, anderen Biomarker spezifisches Aptamer für den Nachweis des gleichen Biomarkers aber bindend an ein anderes Epitop des Biomarkers mit daran gebundenem anderem Fluorophor, und/oder

B2M) mindestens einem, bevorzugt genau einem, anderen Biomarker spezifischen Aptamer für den Nachweis eines weiteren Biomarkers mit daran gebundenem anderem Fluorophor.

8. Biomarker-Detektionssensor-Kit gemäß Anspruch 6 oder 7, dadurch gekennzeichnet, dass es sich bei B0) bei dem Biomarker-spezifischen Aptamer um Malaria-2008-Aptamer handelt, an das bevorzugt Cyanin 5 als Fluorophor gebunden ist.

9. Biomarker-Detektionssensor-Kit gemäß Anspruch 6, umfassend

B0) eine Zubereitung umfassend mindestens ein Biomarker-spezifisches Aptamer mit daran gebundenem 5-FAM-Fluorophor, und

Bl) mindestens eine weitere Zubereitung umfassend mindestens ein gleiches Biomarker-spezifisches Aptamer mit daran gebundenem Cy5-Fluorophor.

10. Verfahren zur Bestimmung von krankheitsspezifischen Biomarkern in Körperflüssigkeiten umfassend die folgenden Schritte oder bestehend aus den folgenden Schritten i) Bereitstellen eines Biomarker-Detektionssensors gemäß einem der Ansprüche 1 bis 5, ii) Aufbringen auf den Sensor von iial) einer Körperflüssigkeitsprobe, und iia2) mindestens einem Biomarker-spezifischem Aptamer mit daran gekoppeltem Fluorophor entweder nach iial) oder gleichzeitig mit iial), oder iib) einer Mischung aus Körperflüssigkeitsprobe und mindestens einem Biomarker-spezifischem Aptamer mit daran gekoppeltem Fluorophor, iii) Bestrahlen der auf den Sensor aufgebrachten Probe mit Lichtquelle, iv) Detektion der Fluoreszenzemission der Probe, v) optional Analyse der Fluoreszenzemission, bevorzugt mittels Computern, und vi) optional Speichern und/oder Anzeigen der analysierten Fluoreszenzemission.

11. Verfahren nach Anspruch 10, dadurch gekennzeichnet, dass es sich bei der Körperflüssigkeit um Blutproben handelt.

12. Verfahren nach Anspruch 10 oder 11, dadurch gekennzeichnet, dass es sich bei den Anti-Biomarker-Rezeptoren um anti-pLDH-Antikörper und bei dem Biomarker-spezifischen Aptamer um Malaria-2008-Aptamer handelt, an das bevorzugt Cyanin 5 als Fluorophor gebunden ist.

13. Verwendung der Biomarker-Detektionssensoren gemäß einem der Ansprüche 1 bis 5, der Biomarker-Detektionssensor-Kits gemäß einem der Ansprüche 6 bis 9 oder des Verfahrens gemäß einem der Ansprüche 10 bis 12 zur qualitativen oder quantitativen Bestimmung von krankheitsspezifischen Biomarkern, insbesondere Malaria-Biomarkern, bevorzugt in Körperflüssigkeitsproben, insbesondere in Blutproben.

14. Verwendung der Biomarker-Detektionssensoren gemäß einem der Ansprüche 1 bis 5 als Substrat in automatisierten Multititerplatten.

Description:
PLASMONVERSTÄRKTE-FLUORESZENZ-BASIERENDE SENSOR ZUM NACHWEIS KRANKHEITSSPEZIFISCHER BIOMARKER

Die vorliegende Erfindung betrifft Biomarker-Detektionssensoren zur Detektion von krankheitsspezifischen Biomarkern, Kits aufbauend auf diesen Sensoren, Verfahren zur Bestimmung von krankheitsspezifischen Biomarkern in Körperflüssigkeiten und Verwendungen.

Fluoreszenz-basierte Techniken gehören in den Bereichen der Biotechnologie, Life- Sciences und der (bio-)medizinischen Forschung zu den am weitesten verbreiteten Methoden. Fluoreszenzproben und Fluoroeszenz-gelabelte Biorezeptoren werden umfangreich eingesetzt in optogenetischen Studien, bei zytogenetischen Assays, bei Vielfarbfluroreszenz-in situ Hybridisierung (multicolor fluorescent in situ hybridization - mFISFI), bei biobildgebender Analyse, für die Beobachtung von sowohl des Orts als auch der Bewegung von Zellen oder subzellularen Elementen, bei der Erforschung von molekularen Dynamiken, wie auch in Fluoroimmunoassays zur Detektion von molekularen Biomarkern, als Enzyme-Linked Immunosorbet Assay (ELISA). Allerdings wird die Anwendung von Fluoreszenz-Verfahren für das sensorische Verfahren durch die geringen Ausbeuten vieler Fluoreszenzfarbstoffe und das Auftreten von Signalinterferenzen stark eingeschränkt. Insbesondere ist die Detektion von sehr geringen Analytkonzentrationen immer noch eines der Hauptprobleme. Viele Versuche wurden unternommen, die Fluoreszenzsignale zu verstärken, um deren Anwendbarkeit für ultrasensitive Fluoroimmunoassays zu ermöglichen.

Um diese Herausforderung zu meistern - ohne die Verwendung von teurer Ausrüstung, spezifischen oder toxischen Reagenzien oder signifikante Änderungen an gute etablierten fluoreszenzbasierten Assays vornehmen zu müssen - haben in den letzten Jahren plasmonische Nanostrukturen Beachtung gefunden. Dies ist zurückzuführen auf die Fähigkeit von plasmonischen Nanostrukturen die spektralen Eigenschaften von in der Nähe befindlichen Fluoreszenzfarbstoffen zu beeinflussen. Diese Beeinflussung häng stark von der spektralen Überlappung zwischen dem Fluoreszenzfarbstoff und der plasmonischen Absorption ab, sowie von der Distanz z zwischen Fluorophor und Nanostruktur. Insbesondere wird, aufgrund des Förster- Resonanzenergietransfer-Mechanismus (FRET) (d.h. Dipol-Dipol Wechselwirkungen zwischen dem Oberflächenplasmon und dem Fluorophor), eine starke Fluoreszenzverstärkung (FE) für kleine z (<10 nm) erreicht, wenn die plasmonische Absorption den Anregungspeak des Fluorophors überlagert (excitation coupling). Hingegen führt bei großen z die schwache Kopplung zu verschwindend geringer Fluoreszenzverstärkung. Im Gegensatz dazu führt die Überlappung mit dem Fluorophor-Emission-Peak (emission coupling) zu einer starken Fluoreszenzverstärkung bei großen z (>10 nm), aufgrund der Verstärkung der Fluorophor-Strahlungsrate durch den Purcell-Effekt, wohingegen eine fortschreitende Abnahme der Fluoreszenzverstärkung bei kleineren z auftritt aufgrund der steigenden Fluoreszenzlöschung via nicht-strahlender Verluste in der metallischen Nanostruktur. In dem Fall, dass die Plasmonabsorption sowohl den Anregungs- als auch den Emissionspeak des Fluorophors überlagert (kombinierter Modus), entsteht eine sehr große Fluoreszenzverstärkung bei einem optimalen z von ca. 10-15 nm; eine starke Löschung tritt bei kurzen z auf, wohingegen eine Wiederherstellung der normalen Fluoreszenzbedingungen (d.h. in Abwesenheit einer plasmonischen Struktur) bei längeren Distanzen aufgrund der schwächeren Plasmon-Fluorophor-Kopplung auftritt.

Zweidimensionale (2D) Arrays von metallischen Nanostrukturen sind besonders geeignet als plasmonverstärkte Fluoreszenz (PEF - plasmon-enhanced fluorescence)- basierte Biosensing Plattformen. Bisher wurden verschiedene Fluoreszenzverstärker wie Gold-Mikroinseln oder Arrays von metallischen Nanoobjekten (z.B. Nanopartikel, Nanoröhren, Nanotriangeln, Nanokristalle, Nanoantennen und resonante Nanokavitäten) ausprobiert, um das Detektionslimit in Fluoreszenz-basierten Assays weiter nach unten zu verschieben. Trotz der großen Verbesserungen im Hinblick auf die erreichbaren Detektionslimits (LOD - limit of detection), die bis hinunter zum femto-molaren-Level reichen, repräsentieren die Notwendigkeit von geschultem Personal, teure Technologien, zeitaufwändigen Prozeduren, geringe Versatilität, schlechte Skalierbarkeit und niedriges Signal-zu-Rausch-Verhältnis limitierende Faktoren für routinemäßiges Testen, Point-of-Care-Analyse und großflächige Verwendung von PEF-basierenden Fluoroassays.

Die Entwicklung von plasmonischen Biosensoren, die Verlässlichkeit und Einfachheit in der Handhabung kombinieren, ist immer noch eine Herausforderung.

Aufgabe der vorliegenden Erfindung war es, Möglichkeiten für die hochsensitive Bestimmung von krankheitsspezifischen Biomarkern zur Verfügung zu stellen, welche die Probleme des Standes der Technik nicht mehr aufweisen. Weitere Aufgabenstellungen ergeben sich für den Fachmann bei Betrachtung der nachfolgenden Beschreibung und der Ansprüche.

Diese und weitere Aufgaben, die sich dem Fachmann bei Betrachtung der vorliegenden Beschreibung erschließen, werden durch die in den unabhängigen Ansprüchen dargestellten Gegenstände gelöst.

Besonders vorteilhafte und bevorzugte Gegenstände ergeben sich aus den abhängigen Ansprüchen sowie der nachfolgenden Beschreibung.

Im Rahmen der vorliegenden Erfindung wurde gefunden, dass 2D-Gerüste von geordneten und periodischen Gold-Nanopartikeln (AuNPs), hergestellt über selbstorganisierte Diblockcopolymer-Nanolithographie einen effektiven Weg darstellen, die meisten der aufgezeigten Probleme des Standes der Technik zu beseitigen. Die günstige und skalierbare Fierstellung und die einfache Einsteilbarkeit von deren plasmonischen Eigenschaften, durch Anpassen der AuNP-Größe und der Zwischenteilchendistanz durch einfache Variation der Längen von hydrophilem bzw. hydrophobem Teil der Copolymere, sind die wesentlichen Stärken einer solchen PEF- Plattform. Das plasmonische Verhalten eines 2D-Gerüsts aus gut-geordneten AuNPs steht in enger Relation zu dem Verhältnis R zwischen dem Nanopartikeldurchmesser D und der Zwischenteilchendistanz d. Wenn jedes Nanopartikel in enger Nähe zu seinen Nachbarn steht (d.h. wenn R>2/3 wird), wird durch die Wechselwirkung zwischen den lokalisierten Oberflächenplasmonen (LSPs - localized surface plasmons) eine langreichweitige, kollektive Oszillation, delokalisiertes Oberflächenplasmon (DSP - delocalized surface plasmon) genannt, erhalten. Solch ein kollektiver Effekt wird vernachlässigbar je mehr R<2/3 wird; in diesem Fall ist die plasmonische Reaktion des 2D-Gerüsts gut durch ein System von entkoppelten LSPs beschrieben.

Im Rahmen der vorliegenden Erfindung bedeutet Raumtemperatur eine Temperatur von 293,15 Kelvin, d.h. 20°C.

Soweit nicht weiter ausgeführt herrscht bei allen Reaktionen und Vorgehensweisen Atmosphärendruck (1013 mbar ab soi ut ) und Raumtemperatur.

In der vorliegenden Erfindung wird insbesondere ein Plasmon-verstärkter Fluoroszenz-Immunosensor für die Bestimmung und Detektion von Plasmodium falciparum Lactatdehydrogenase (P/LDFI) - einem Malariamarker - in Ganzblutproben beschrieben. Die Analyt-Bestimmung wird im Rahmen der vorliegenden Erfindung erreicht durch orientierte Antikörper, die in einer dichtgepackten Konfiguration mittels photochemischer Immobilisationstechnik (PIT) immobilisiert werden. Die Kombination von BCMN (Block Copolymer Micelle Nanolithography) und PIT ermöglicht maximale Kontrolle über die Nanopartikelgröße und Gitterkonstante, sowie die Distanz des Fluorophors von der Sensoroberfläche. Aufgrund dieser Charakteristiken erreichen die Anordnungen der vorliegenden Erfindung in einigen Ausführungsformen ein Detektionslimit von weniger als 1 pg/ml (<30 fM) mit sehr hoher Spezifizität ohne eine Vorbehandlung der Proben; dies wird erfindungsgemäß insbesondere bei den Ausführungsformen erreicht, bei denen die Gold-Nanopartikel ein zweidimensionales Gitter in Form von Waben ausbilden, d.h. die Gold-Nanopartikel bevorzugt hexagonal oder hexagonal dicht angeordnet sind. Dieses Detektionslimit ist mehrere Größenordnungen niedriger als das, was in Malaria-Schnelltests oder sogar kommerziellen ELISA-Kits erreicht wird.

In anderen Ausführungsformen, die nicht voll auf maximales LOD (Limit Of Detectability) optimiert sind, wenn beispielsweise die Probenkonzentrationen im Bereich von nM oder pM liegen, sind diese Empfindlichkeiten nicht unbedingt erforderlich. In diesen Ausführungsformen, die sich insbesondere durch den Einsatz mehrerer Fluorophore auszeichnen, kann aber die Bestätigung durch redundante, zweite Signale oder den Nachweis eines zweiten Antigens erfolgen und die Detektion beispielsweise bis hinunter zu 50 pM für ein grün fluoreszierendes Fluorophor und bis zu 260 fM für ein rot fluoreszierendes Fluorophor. Durch die Kombination eines Fluorophors, der niedrige LODs ermöglicht mit einem Fluorophor, der über ein hohes LOD verfügt, kann der Konzentrationsbereich, in dem der Biomarker detektiert werden kann, verbreitert werden.

Aufgrund ihrer Gesamtdimensionen, der Einfachheit in der Anwendung und der hohen Analysedurchsätze, können die Anordnungen der vorliegenden Erfindung, d.h. die Biomarker-Detektionssensoren als Substrat in Multititerplatten eingesetzt werden. Die Effizienz ist gegenüber konventionellen Fluoreszenz-Immunoassays erheblich verbessert.

Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist ein Biomarker-Detektionssensor zur Detektion von krankheitsspezifischen Biomarkern umfassend oder bestehend aus einem Substrat mit darauf gebundenen in verzweigten zweidimensionalen Strukturen und/oder einem zweidimensionalen Gitter angeordneten Metall-Nanopartikeln, insbesondere Gold-Nanopartikeln, und an die Metall-Nanopartikel, insbesondere Gold- Nanopartikel, gebundenen Anti-Biomarker-Rezeptoren.

In breiten Ausführungsformen der vorliegenden Erfindung sind verschiedene Möglichkeiten denkbar, mittels derer die Detektion der spezifischen Biomarker angezeigt werden kann. Beispielsweise ist dies möglich durch Ausgestaltung der Detektionssensoren als Mikrowaagen, mittels derer dann spezifisch gebundene Biomarker ausgewogen werden können, d.h. die Detektion erfolgt über eine Gewichtszunahme des Sensors.

In bevorzugten Ausgestaltungen der vorliegenden Erfindung erfolgt die Detektion jedoch über Fluoreszenzanalysen, da diese im kontinuierlichen Betrieb besonders gut zu verwirklichen sind.

Dazu wird im Rahmen der vorliegenden Erfindung in Ausgestaltungsformen die elektronische Struktur der Biomarker-Detektionssensoren durch die Anlagerung der krankheitsspezifischen Biomarker derart geändert, dass diese in ihrem Fluoreszenzemissions- oder -extinktionsspektrum messbar sind.

Im Rahmen der vorliegenden Erfindung können aufbauend auf dem erfindungsgemäßen Prinzip quasi beliebige krankheitsspezifische Biomarker detektiert werden, es ist dafür lediglich notwendig, dass die an die Gold-Nanopartikel gebundenen Antibiomarker-Rezeptoren ausreichend spezifisch für diese entsprechenden Biomarker sind.

Die Substrate der Biomarker-Detektionssensoren gemäß vorliegender Erfindung können beliebige Substrate sein, auf denen sich die Nanopartikel abscheiden lassen. In Ausführungsformen sind dies bekannte Assay-Wells, Oberflächen auf Basis von Polyacrylaten (z.B. Plexiglas®), Polystyren oder Glasoberflächen. Geeignet sind im Übrigen im Prinzip alle Substrate, die unter den experimentellen Bedingungen (unter anderem der Fierstellung) stabil sind, im jeweils untersuchten/angewandten Wellenlängenbereich für Anregung und Fluoreszenz transparent sind und keine Eigenfluoreszenz aufweisen.

Die auf den Substraten abzuscheidenden Metall-Nanopartikel können im Prinzip auf allen unter Flerstellungs- und Untersuchungsbedingungen nicht korrosiven Materialien ausgewählt werden. In Varianten der vorliegenden Erfindung können die Materialien ausgewählt werden aus der Gruppe bestehend aus Edelmetallen, insbesondere Gold, Silber, Platin, Kupfer, Chrom, Legierungen davon und Janus-Partikel dieser Metalle. Besonders vorteilhaft und bevorzugt ist es, wenn die Metall-Nanopartikel Gold- Nanopartikel sind.

Bevorzugt ist es im Rahmen der vorliegenden Erfindung, dass die zu detektierende Krankheit Malaria ist. Insbesondere handelt es sich dann um den bei dem krankheitsspezifischen Biomarker um Plasmodium falciparum L-Laktat Dehydrogenase (PA.DH).

Entsprechend sind die an die Gold-Nanopartikel gebundenen Anti-Biomarker- Rezeptoren in bevorzugten Ausgestaltungsformen der vorliegenden Erfindung anti- pLDH-Antikörper.

Diese anti-pLDH-Antikörper werden erfindungsgemäß auf den Gold-Nanopartikeln fixiert, d.h. daran gebunden. Mithin sind von der vorliegenden Erfindung Biomarker- Detektionssensoren der vorgenannten Art umfasst, bei denen die Anti-Biomarker- Rezeptoren anti-pLDH-Antikörper sind, die über Thiolgruppen an die Gold- Nanopartikel gebunden sind.

In besonderen Ausführungsformen der vorliegenden Erfindung sind diese anti-pLDH- Antikörper mit UV-Strahlung vorbehandelte anti-pLDH-Antikörper.

Mittels einer UV-Strahlung als Vorbehandlung ist es möglich, die anti-pLDH-Antikörper derart zu modifizieren, dass Thiolgruppen verfügbar werden durch Spaltung von Disulfidbrücken.

Im Falle von in anti-pLDH-Antikörpern erfolgt durch die UV-Bestrahlung eine selektive Photoreduktion der Disulfidbrücken in spezifischen Cystein-Cystein/Tryptophan Triaden (bei denen die Gegenwart des Tryptophans die Disulfidbrücke in dieser Triade sozusagen aktiviert). Die Spaltung dieser Cys-Cys-Bindungen in beiden Antikörperfragmenten führt zu insgesamt vier freien Thiolgruppen, von denen zwei mit der Oberfläche der Gold-Nanopartikel interagieren können, um eine kovalente Bindung auszubilden.

Zusätzlich wird durch diese Art der Bindung erreicht, dass das spezifische Gebiet der anti-pLDH-Antikörper, an das das P/LDH bindet, von den Gold-Nanopartikeln weg in den Raum hinein orientiert angeordnet und mithin für die PfLDH gut zugänglich wird. In bevorzugten Ausgestaltungen der vorliegenden Erfindung erfolgt die UV- Behandlung für 30 Sekunden mit einer Strahlungsleistung von 1 Watt/cm 2 und bei einer Wellenlänge von 254 nm oder mit einer Strahlungsleistung von 6 Watt/cm 2 und bei einer Wellenlänge von 254 nm.

Obwohl im Rahmen der vorliegenden Erfindung im Wesentlichen auf Gold- Nanopartikel abgestellt wird, bleibt darauf hinzuweisen, dass die vorliegende Erfindung im Prinzip auch mit anderen Metall-Atomen denkbar ist.

Weiterhin von der vorliegenden Erfindung umfasst sind Biomarker- Detektionssensoren, bei denen das Verhältnis R von Durchmesser D der Nanopartikel zum Abstand d zwischen den einzelnen Gold-Nanopartikeln (Rand-zu-Rand-Abstand) in dem zweidimensionalen Gitter >2,3 beträgt. Bevorzugt liegt dieses Verhältnis zwischen 2,3 und 3,5, und insbesondere bevorzugt bei 2,5 oder 3,0.

Besonders bevorzugt ist es im Rahmen der vorliegenden Erfindung in einer Alternative, wenn die Gold-Nanopartikel ein zweidimensionales Gitter in Form von Waben ausbilden, d.h. die Gold-Nanopartikel sind bevorzugt hexagonal oder hexagonal dicht angeordnet.

Besonders bevorzugt ist es im Rahmen der vorliegenden Erfindung in einer anderen Alternative, wenn die Gold-Nanopartikel eine zweidimensionale verzweigte Struktur ausbilden, d.h. die Gold-Nanopartikel sind bevorzugt in verzweigten, bandartigen Strukturen angeordnet, wobei immer nur wenige Partikel (2-4) eine dichte Packung aufweisen.

Besonders bevorzugt ist im Rahmen der vorliegenden Erfindung eine dritte Alternative, wenn die Gold-Nanopartikel eine kombinierte zweidimensionale Struktur ausbilden, bei dem sowohl Teile der Struktur Gitter in Form von Waben ausbilden, d.h. die Gold-Nanopartikel sind in diesen Teilen bevorzugt hexagonal oder hexagonal dicht angeordnet, und gleichzeitig Teile der Struktur zweidimensionale verzweigte Strukturen ausbilden, d.h. die Gold-Nanopartikel sind in diesen Teilen bevorzugt in verzweigtem, bandartigen Strukturen angeordnet wobei immer nur wenige Partikel (2-4) eine dichte Packung aufweisen und ansonsten zufällig verteilt sind. In dieser Alternative können die dichtgepackten Nanopartikel in den bandartigen Strukturen Absorptionen bei 680 nm erzeugen (delokalisierte Oberflächenplasmonen) und die Partikel, die nur mit wenigen Nachbarn dichte Abstände aufweisen, Absorptionen bei ca. 530nm (lokalisierte Oberflächenplasmonen LSPR). In bevorzugten Ausführungsformen der vorliegenden Erfindung beträgt der Durchmesser D der Nanopartikel der Biomarker-Detektionssensoren zwischen 40 und 60 nm, bevorzugt zwischen 44 und 55 nm, besonders bevorzugt zwischen 46 und 52 nm und insbesondere bevorzugt etwa 48 oder etwa 50 nm. In anderen Ausführungsformen beträgt der Durchmesser D der Nanopartikel der Biomarker- Detektionssensoren zwischen 50 und 70 nm, bevorzugt zwischen 55 und 65 nm besonders bevorzugt 60 nm.

Der Abstand d zwischen den einzelnen Gold-Nanopartikeln (den Rändern der einzelnen Partikel) der Biomarker-Detektionssensoren liegt bevorzugt zwischen 16 und 24 nm, mehr bevorzugt zwischen 17 und 22 nm, besonders bevorzugt zwischen 18 und 21 nm und insbesondere bevorzugt bei 19 oder 20 nm.

Die Größenangaben wurden bestimmt mittels Rasterelektronenmikroskopie. Ein Beispiel für ein verwendbares Mikroskop ist ein Zeiss® Leo 1550 VP.

Im Hinblick auf den Durchmesser D der Nanopartikel ist darauf hinzuweisen, dass mit den entsprechenden Angaben mittlere Durchmesser bezeichnet werden; naturgemäß streuen die effektiven Durchmesser in diesen Größenordnungen ein wenig um den entsprechend genannten spezifischen Wert. Dies wiederum bedeutet auch, dass der Abstand d zwischen den Partikeln um einen zentralwert streut. Dies ist dem Fachmann bekannt.

Bei einem Durchmesser D von 47,67 nm etwa beträgt die Abweichung in Ausführungsformen plus/minus 0,14 nm.

Bei einem Zwischenteilchenabstand (gemessen Mitte bis Mitte) von 68,47 nm etwa beträgt die Abweichung in Ausführungsformen plus/minus 0,19 nm.

Die spezifische Struktur der AuNP auf dem Substrat kann bei der Herstellung der Biomarder-Detektionssensoren der vorliegenden Erfindung gesteuert werden.

Eine einfache Variante, zwischen hexagonalen Strukturen und verzweigten Strukturen zu wechseln ist es, die Abscheidegeschwindigkeit zu regulieren; wenn die Geschwindigkeit über einen gewissen Wert erhöht wird, haben die Partikel nicht mehr ausreichend Zeit sich ideal anzuordnen und die resultierende Struktur entfernt sich von der idealen hexagonalen Anordnung. Ähnlich lässt sich die Abscheidung durch gezielte Modifikation des Substrates, beispielsweise durch aufrauen, hydrophobieren/hydrophilieren, funktionalisieren oder ähnliches beeinflussen.

Weitere Gegenstände der vorliegenden Erfindung sind Biomarker-Detektionssensor- Kits (Sensorkits) umfassend oder bestehend aus

A) mindestens einem Biomarker-Detektionssensor wie oben dargelegt,

B0) einer Zubereitung umfassend mindestens ein Biomarker-spezifisches Aptamer mit daran gebundenem Fluorophor,

C) optional weiterem Analysenmaterial, bevorzugt Küvetten, Pipetten, Lichtquelle(n), Fluoreszenzdetektor, insbesondere Fluoreszenzspektrometer.

Noch weitere Gegenstände der vorliegenden Erfindung sind Biomarker- Detektionssensor-Kits (Sensorkits) umfassend oder bestehend aus A) mindestens einem Biomarker-Detektionssensor wie oben dargelegt,

B0) einer Zubereitung umfassend mindestens ein Biomarker-spezifisches Aptamer mit daran gebundenem Fluorophor, optional

Bl) mindestens eine weitere Zubereitung umfassend mindestens ein gleiches Biomarker-spezifisches Aptamer mit anderem daran gebundenem Fluorophor, und/oder

B2) mindestens eine weitere Zubereitung umfassend mindestens ein anderes Biomarker-spezifisches Aptamer mit daran gebundenem anderem Fluorophor,

C) optional weiterem Analysenmaterial, bevorzugt Küvetten, Pipetten, Lichtquelle(n), Fluoreszenzdetektor, insbesondere Fluoreszenzspektrometer.

Bei der Variante B2) kann zwischen zwei bevorzugten Ausführungsformen unterschieden werden in

B2i) mindestens ein, bevorzugt genau ein, anderes Biomarker-spezifisches Aptamer für den Nachweis des gleichen Biomarkers aber bindend an ein anderes Epitop des Biomarkers mit daran gebundenem anderem Fluorophor, und B2M) mindestens ein, bevorzugt genau ein, anderes Biomarker-spezifisches Aptamer für den Nachweis eines weiteren Biomarkers mit daran gebundenem anderem Fluorophor, und entsprechend ausgewählt werden aus B2i) und/oder B2M).

Die Vorteile von B2) liegen darin, dass B2i) durch das Binden von zwei Aptameren an den gleichen Biomarker die Detektion dieses Biomarkers bestätigt und somit noch zuverlässiger ist als Bl) und dass B2M) einen zweiten Biomarker nachweisen kann.

„Gleich" und „anders" bezieht sich bei Bl), B2) jeweils auf B0).

Sofern im Folgenden eine Einzelvariante beschrieben/diskutiert wird, ist dies, sofern nicht anders angeführt, B0) oder eine beliebige.

Im Zusammenhang mit dem Begriff „Kit" sei drauf hingewiesen, dass dieses Kit nicht zwangsweise für die „Flosentasche" geeignet sein muss. Vielmehr soll dadurch ausgedrückt werden, dass vor der Analyse sowohl der Biomarker-Detektionssensor wie oben beschrieben als auch die Zubereitungen umfassend Biomarker-spezifische Aptamer(e) getrennt voneinander vorliegen, obwohl sie aufeinander abgestimmt und zugehörig sind. Zudem soll das Kit auch mehrere Detektionssensoren und mehrere Aptamerzubereitungen, die auch für verschiedene Biomarker ausgeführt sind, umfassen können.

Dem Fachmann ist in diesem Zusammenhang auch ohne weiteres klar, dass das weitere Analysenmaterial nicht zwangsweise auf die eben genannten Küvetten, Pipetten, Fluoreszenzlichtquelle und Fluoreszenz-Detektor beschränkt ist, sondern im Rahmen des Üblichen weiteres Material umfassen kann.

In Ausgestaltungen der vorliegenden Erfindung ist es möglich, dass das Biomarker- Detektionssensor-Kit als transportables Kit ausgestaltet ist. In diesem Zusammenhang ist dann eine transportable Lichtquelle beispielsweise in Form einer Taschenlampe ausgestaltet und der Fluoreszenzdetektor entsprechend auch in einer vergleichsweise handlichen Form ausgestaltet. Für diesen Zweck kann es in Varianten ausreichend sein, wenn der Fluoreszenzdetektor lediglich ein Fluoreszenzsignal anzeigt, aber nicht zwangsweise dessen Intensität quantitativ darstellen kann. Dies wäre ein Beispiel für einen Schnelltest-Kit. Genauso ist es aber auch möglich, dass im Rahmen der vorliegenden Erfindung das Biomarker-Detektionssensor-Kit im Labormaßstab ausgestaltet ist, d.h. insbesondere sowohl die Fluoreszenzlichtquelle als auch der Fluoreszenzdetektor für dauerhaften Laborbetrieb geeignet und ausgestaltet sind.

Im Rahmen der vorliegenden Erfindung ist es möglich, dass das Biomarker-spezifische Aptamer im Prinzip für beliebige krankheitsspezifische Biomarker passend ausgewählt wird.

Wesentlich ist dabei jedoch, dass das Biomarker-spezifische Aptamer in Übereinstimmung mit dem an die Gold-Nanopartikel gebundenen Anti-Biomarker- Rezeptor übereinstimmend auf den gleichen Biomarker gerichtet ist, wobei Aptamer und Antikörper auf verschiedene Epitope des Biomarkers gerichtet sind (für den Fall, dass Aptamer und Antikörper auf das gleiche Epitop gerichtet wären, würden sie in Konkurrenz zu einander stehen und das Ergebnis verschlechtern).

Im Rahmen der vorliegenden Erfindung ist es bevorzugt, wenn es sich bei dem Biomarker-spezifische Aptamer um ein Malaria-spezifisches Aptamer handelt. Insbesondere bevorzugt ist im Rahmen der vorliegenden Erfindung das Biomarker spezifische Aptamer das Malaria-2008-Aptamer.

Weiterhin ist im Prinzip jedes Fluorophor, das chemisch an diesen Biomarker gebunden werden kann, geeignet. Beispiele für einsetzbare Fluorophore sind 5-FAM (5-Carboxyfluorescein), Cyanin 7, Cyanin 5, Cyanin 3b oder auch Quantenpunkte.

In der Praxis haben sich als Fluorophore für solche oder ähnliche Untersuchungen 5- FAM und Cyanin 5 als Fluorophore gut bewährt.

Entsprechend ist es im Rahmen der vorliegenden Erfindung bevorzugt, wenn 5-FAM und/oder Cyanin 5 als Fluorophor an das Biomarker-spezifische Aptamer gebunden wird.

Das höchst bevorzugte Biomarker-spezifische Aptamer im Rahmen der vorliegenden Erfindung ist mithin das Malaria-2008-Aptamer mit daran gebundenem Cyanin 5, sofern ein einziges Fluorophor eingesetzt wird.

In weiteren bevorzugten Ausgestaltungen der vorliegenden Erfindung ist es bevorzugt, wenn gleichzeitig zwei verschiedene Fluorophore eingesetzt werden.

Dies führt dann zu einer Überlappung der Plasmonresonanzen und kann mithin zu einer weiteren Verstärkung des Signals genutzt werden. Auch in diesen Ausgestaltungen sind im Prinzip alle Fluorophore, die chemisch an die Biomarker gebunden werden können, geeignet.

Besonders bevorzugt ist es, wenn als Fluorophore 5-FAM und Cy5 kombiniert werden. In diesem Fall ist die Plasmonresonanz derart ausgestaltet, dass sie mit dem Emissionspeak des 5-FAM mit sowohl dem Anregungsspeak als auch dem Emissionspeak des Cy5 gekoppelt ist, womit, durch Emissionsratenverbesserung, eine 160-fache Fluoreszenzverstärkung und, durch einen Dualmechanismus (Anregungs und Emissionsraten), eine 5200-fache Signalverstärkung erzielt wird.

Durch die Kombination von beiden Fluoreszenzdetektionen erweitert sich der Erfassungskonzertierungsbereich um zwei Größenordnungen im Vergleich mit einer Detektion nur eines einzelnen Fluorophors in komplexen Matrizen, wie menschlichem Blut. Darüber hinaus verbessert die Bestätigung der Analytbindung durch zwei redundante Fluoreszenzsignale die Zuverlässigkeit des Signals und vermindert falsch positive Signale aufgrund unspezifischer Bindung. Alternativ kann der vorgeschlagene Ansatz auch für die gleichzeitige Überwachung verschiedener Biomarker bei niedrigen Konzentrationen verwendet werden, was den Weg für eine potenzielle Multiplex- und Flochdurchsatzanalyse ebnet.

In diesen Ausgestaltungen können zwei verschiedene Biomarker-spezifische Aptamere eingesetzt werden, oder aber die gleichen.

Mithin lassen sich in diesen Ausgestaltungen verschiedene Biomarker-spezifische Aptamere mit gleichen Fluorophore oder unterschiedlichen Fluorophoren einsetzen, um verschiedene Biomarker gleichzeitig zu detektieren, oder aber das gleiche Biomarker-spezifische Aptamer mit unterschiedlichen Fluorophoren zur Detektion des gleichen Biomarkers aber bei unterschiedlichen Wellenlängen.

Analoge Vorgehensweisen und Ausgestaltungen mit drei oder noch mehr verschiedenen Fluorophoren und/oder Biomarker-spezifischen Aptameren sind ebenfalls von der vorliegenden Erfindung umfasst.

Es lassen sich mithin mit der vorliegenden Erfindung viele verschiedene Varianten abdecken, die eine hohe Flexibilität ermöglichen, insbesondere bei Verwendung in Form von Kits. Es ist bemerkenswert, dass durch die Variante der vorliegenden Erfindung mit zwei verschiedenen Fluorophoren, insbesondere 5-FAM und Cy5, der zugängliche Detektionsbereich durch die Verwendung beider Fluorophore erweitert wird, wobei Cy5 im unteren Konzentrationsbereich (bis zu 0,1 pM) empfindlicher ist, während 5- FAM große Konzentrationen (bis zu 1 pM) abdeckt. Auf diese Weise kann beispielsweise über sieben Größenordnungen gemessen werden, anstatt vier oder fünf für einen Fluorophor allein.

Insofern war es auch Teil der vorliegenden Erfindung, Multiplex-Detektion - unter Beibehaltung hoher Qualitätsleistungen - zu ermöglichen und eine entsprechend entwickelte doppelresonante plasmonische Nanostruktur, die für den gleichzeitigen Nachweis von zwei verschiedenen Analyten in der interessierenden Matrix geeignet ist, ist ebenfalls Teil der vorliegenden Erfindung.

Dazu werden in einer Ausführungsform der vorliegenden Erfindung mittels Block- Copolymer-Mizellen-Nanolithographie (BCMN) Verzweigungsmuster aus plasmonengekoppelten, wabenförmig angeordneten AuNPs, die einen kollektiven Modus erzeugen, dessen Resonanz im fernen roten Bereich liegt, und eingestreuten plasmonenentkoppelten AuNPs, die eine schmale lokalisierte Oberflächenplasmonresonanz (LSPR) bei 524 nm aufweisen, hergestellt.

Die genannte Zubereitung umfassend mindestens ein Biomarker-spezifisches Aptamer mit daran gebundenem Fluorophor kann dieses Aptamer an sich sein, kann aber auch neben dem Aptamer mit daran gebundenem Fluorophor noch weitere Stoffe enthalten, wie diese für die Verwendung von solchen Aptameren mit daran gebundenen Fluorophoren in der Fachwelt bekannt sind. Beispielsweise kann das Fluorophor- gelabelte Aptamer in wässrigen Lösungen vorliegen, wobei diese wässrigen Lösungen beispielsweise noch gepuffert sein können oder auch Konservierungsmittel oder ähnliches enthalten können. In Ausführungsformen der vorliegenden Erfindung gut geeignet sind beispielsweise 10 millimolare phosphatgepufferte Salzlösungen (PBS). Dies gilt sinngemäß entsprechend für alle Varianten B0), Bl) und B2).

Wesentlich ist es bei diesen Biomarker-Detektionssensor-Kits auch, dass die Biomarker-Detektionssensoren wie oben beschrieben ausgestaltet sind. Denn durch die Kombinationen der Biomarker-Detektionssensoren wie oben beschrieben mit den Zubereitungen umfassend mindestens ein Biomarker-spezifisches Aptamer wird eine hohe Selektivität ermöglicht.

Die Selektivität für das erfindungsgemäß bevorzugt zu bestimmende P/LDH wird insbesondere durch die Kombination des anti-pLDH-Antikörpers, der über Thiolgruppen an die Gold-Nanopartikel gebunden ist, und dem Malaria-2008-Aptamer mit daran gebundenem Cyanin 5 als Fluorophor erreicht.

Im Rahmen der vorliegenden Erfindung wurde gefunden, dass für die Ausgestaltung mit einem Fluorophor bei einem Durchmesser D der Nanopartikel von 48 oder 50 nm und einem Zwischenpartikelabstand (Rand-zu-Rand) d in dem zweidimensionalen Gitter von 19 oder 20 nm zwischen den einzelnen Gold-Nanopartikeln, welche über Thiolgruppen daran gebundene anti-pLDFI-Antikörper aufweisen, in Kombination mit dem Malaria-2008-Aptamer mit daran gebundenem Fluorophor Cyanin 5 eine besonders starke Fluoreszenzerhöhung erreicht werden konnte.

Entsprechend kann mit dieser besonders bevorzugten Ausgestaltungsform eine besonders hohe Spezifizität und Empfindlichkeit erreicht werden.

Die Fluoreszenzintensität ist dabei von der Konzentration des Biomarkers abhängig. Die Intensität steigt mit zunehmender Konzentration des Biomarkers an und nähert sich asymptotisch einem Grenzwert an. Dieser Grenzwert wird erreicht, wenn alle Antikörper durch daran gebundene Biomarker belegt sind.

Bis zur Vollbelegung aller Antiköper ist eine quantitative Bestimmung der Biomarkerkonzentration möglich, indem die Fluoreszenzintensität bestimmt wird.

Ab dem Zeitpunkt der vollständigen Belegung aller Antikörper mit Biomarkern erfolgt keine Quantifizierung mehr, sondern lediglich eine qualitative Anzeige (wie vorher natürlich zusätzlich auch schon).

Im Ausführungsformen der vorliegenden Erfindung können Biomarker- Konzentrationen zwischen 0,001 Femtomol und 100 Nanomol, insbesondere zwischen 0,01 Femtomol und 10 Nanomol, quantitativ bestimmt werden. Flöhere Konzentrationen sind Qualitativ bestimmbar.

Qualitative Bestimmung bedeutet dabei, dass die Gegenwart des Biomarkers durch Fluoreszenz angezeigt wird, aber die genaue Menge nicht bestimmt wird oder, für den Fall der vollständigen Belegung aller Antiköper, nicht bestimmt werden kann. Für den Einsatz der vorliegenden Erfindung als Schnelltest bzw. Point-of-Care-Analyse ist die Qualitative Bestimmung in der Regel ausreichend. Die quantitative Bestimmung kommt in der Regel bei genaueren klinischen Untersuchungen zum Einsatz.

Es ist ein großer Vorteil der vorliegenden Erfindung, dass dies beides möglich ist.

In diesem Zusammenhang ist darauf hinzuweisen, dass für andere Fluorophore andere Dimensionen im Hinblick auf die Durchmesser D und Abstand d vorteilhafter sein können. Dies kann im Einzelfall genau abgestimmt werden.

Gleichsam ist darauf hinzuweisen, dass die Ordnungssymmetrie des zweidimensionalen Gitters der Gold-Nanopartikel einen Einfluss auf die Plasmonenresonanz nehmen kann. Im Rahmen der vorliegenden Erfindung wurde mit hexagonal oder hexagonal dicht gepackten Gold-Nanopartikeln eine besonders gute Plasmonenresonanz erzielt; gleichsam sind von der vorliegenden Erfindung aber auch kubisch dicht gepackte, zufällig dicht gepackt oder auch andere, Ordnungssymmetrien umfasst.

Für die besonders bevorzugten Ausgestaltungsformen der vorliegenden Erfindung mit einer hexagonalen oder hexagonal dichten Packung der Gold-Nanopartikel, anti-pLDFI- Antikörpern und Malaria-2008-Aptamer mit daran gebundenem Cyanin 5, für D = 40 bis 60 nm, bevorzugt 44 bis 55 nm, besonders bevorzugt 46 bis 52 nm, insbesondere bevorzugt 48 oder 50 nm und d = 16 bis 24 nm, bevorzugt 17 bis 22 nm, besonders bevorzugt 18 bis 21 nm, insbesondere bevorzugt 19 oder 20 nm, wurde im Rahmen der vorliegenden Erfindung eine besonders hohe Verstärkung der Fluoreszenz beobachtet und gefunden, da sich die erzeugte Plasmonenresonanz mit der Fluorophor-Absorption und Fluorophor-Emission überlagert; dies wird im Rahmen der vorliegenden Erfindung auch als duale Verstärkung bezeichnet, weil beide Prozesse gleichsam verstärkt werden.

In diesem Zusammenhang sei auch darauf hingewiesen, dass die duale Verstärkung für die Variante der hexagonalen Anordnungen und mit einem Biomarker-spezifischen Aptamer und einem daran gebundenen Fluorophor durch die Plasmonenresonanz ihr Maximum bei etwa 10 nm Abstand von der Partikeloberfläche erreicht. Durch die eben beschriebene Kombination von Antikörper/PfLDFI/Aptamer wird im Rahmen dieser Variante der vorliegenden Erfindung genau dieser Abstand erreicht. Entsprechend wird durch diese besonders bevorzugte Ausgestaltung der vorliegenden Erfindung eine besonders starke duale Verstärkung erzielt und besonders hohe Selektivität und Effizienz erreicht.

Dies ist ein großer Vorteil der vorliegenden Erfindung gegenüber einem Sandwich- Assay, wie es aus dem Stand der Technik bekannt ist, da bei solchen Sandwich-Assays zwei Antikörper verwendet werden. Diese zwei Antikörper würden aber dazu führen, dass der Abstand zwischen dem Fluorophor und der Partikeloberfläche zu groß wird und die entsprechende Verstärkung geringer. Dies würde dann zu schlechteren Detektionsgrenzen und geringerer Effizienz führen.

Insofern ist die vorliegende Erfindung im Hinblick auf aus dem Stand der Technik bekannte Sandwich-Assays stark verbessert.

Weiterhin ist Gegenstand der vorliegenden Erfindung ein Verfahren zur Bestimmung von krankheitsspezifischen Biomarkern in Körperflüssigkeiten. Dieses Verfahren umfasst die im Folgenden genannten Schritte oder besteht aus diesen Schritten:

Schritt i) besteht in der Bereitstellung eines Biomarker-Detektionssensors wie oben beschrieben.

Als Schritt ii) wird dann eine Körperflüssigkeitsprobe auf den Sensor aufgebracht und mit mindestens einem Biomarker-spezifischen Aptamer mit daran gekoppeltem Fluorophor versetzt.

Dies kann derart passieren, dass die Körperflüssigkeitsprobe und der mindestens eine Biomarker-spezifische Aptamer mit daran gekoppeltem Fluorophor gleichzeitig auf den Sensor aufgebracht werden, oder dass das mindestens eine Biomarker-spezifische Aptamer mit daran gekoppeltem Fluorophor vorher oder nachher zugefügt wird. Genauso ist es möglich, direkt schon eine vorher angefertigte Mischung aus Körperflüssigkeitsprobe und mindestens einem Biomarker-spezifischem Aptamer mit daran gekoppeltem Fluorophor auf den Sensor aufzubringen.

Die auf den Sensor aufgebrachte Probe wird dann in Schritt iii) mittels einer Lichtquelle bestrahlt. Die Lichtquelle wird dabei derart ausgesucht, dass das verwendete Fluorophor besonders gut angeregt wird. In bevorzugten Ausgestaltungen ist diese Lichtquelle eine Lichtquelle, die im roten Bereich des sichtbaren Spektrums emittiert; besonders vorteilhafte Ergebnisse werden erzielt, wenn die Lichtquelle in einem Wellenlängenbereich zwischen 610 und 670 nm, bevorzugt zwischen 625 und 655 nm, insbesondere, im Fall von Cyanin 5 als Fluorophor, bei 625 nm emittiert. Für den Fall von 5-FAM als Fluorophor werden besonders bevorzugte Ergebnisse erzielt, wenn die Lichtquelle Wellenlängen von 450 nm bis 510 nm, insbesondere 470 nm emittiert.

Als Nächstes wird als Schritt iv) die Fluoreszenzemission der Probe detektiert.

Diese Detektion kann im Prinzip mit allen in der Fachwelt bekannten Methoden erfolgen. Sofern das erfindungsgemäße Verfahren mit einem der erfindungsgemäßen Biomarker-Detektionssensor-Kits ausgeführt wird, kann dies auch eine rein visuelle Erfassung durch die das Verfahren ausführende Person sein, die Detektion würde in diesem Falle einfach über den optischen Eindruck, den der das Verfahren Durchführende erhält, erfolgen.

Bevorzugt erfolgt die Detektion aber mit dedizierten Fluoreszenzspektrometern, beispielsweise solchen basierend auf CMOS oder sCMOS-Photodetektoren.

Bei Anregungen durch eine Lichtquelle mit Wellenlängen von 625 bis 655 nm werden beispielsweise für den Fall anti-pLDFI-Antikörper/Pfl_DFI/Malaria2008-Aptamer-Cy5 Emissionen von 665 bis 715 nm erhalten und für eine Anregung mit Wellenlängen von 450 bis 490 nm für den Fall anti-pLDFI-Antikörper/Pfl_DFI/Malaria2008-Aptamer-5FAM Emissionen von 500 bis 550 nm.

Das mindestens eine mit der Körperflüssigkeitsprobe zu vermischende Biomarker spezifische Aptamer mit daran gekoppeltem Fluorophor ist wie oben beschrieben und kann auch in Form der für das Biomarker-Detektionssensor-Kit beschriebenen Zubereitung vorliegen, die dieses Biomarker-spezifische Aptamer mit daran gebundenem Fluorophor enthält.

Als optionaler Schritt v) kann in dem erfindungsgemäßen Verfahren die Analyse der Fluoreszenzemission erfolgen. Diese Analyse kann sowohl quantitativ als auch qualitativ oder beides sein. Zweckmäßigerweise erfolgt diese Analyse mittels handelsüblicher Computer und dem Fachmann bekannten Fluoreszenz- Datenverarbeitungsprogrammen.

Weiterhin optional als Schritt vi) im Verfahren der vorliegenden Erfindung kann das ermittelte Ergebnis der Fluoreszenzemissionsanalyse gespeichert werden oder angezeigt werden oder beides. Obwohl bei dem Verfahren zur Bestimmung von krankheitsspezifischen Biomarkern gemäß vorliegender Erfindung die Körperflüssigkeit nicht auf eine spezielle Körperflüssigkeit beschränkt ist, ist es für den Fachmann selbstverständlich, dass er die Körperflüssigkeit danach auswählt, ob die von ihm gesuchten krankheitsspezifischen Biomarker in der jeweiligen Körperflüssigkeit Vorkommen.

In bevorzugten Ausführungsformen der vorliegenden Erfindung handelt es sich bei der Körperflüssigkeit um Blutproben.

Die Körperflüssigkeiten können vor Einsatz in dem Verfahren der vorliegenden Erfindung entsprechend den in der Fachwelt üblichen Verfahren aufgearbeitet bzw. vorbereitet werden.

Es sei darauf hingewiesen, dass das Verfahren der vorliegenden Erfindung insbesondere dafür geeignet und dazu gedacht ist, Körperflüssigkeitsproben zu untersuchen, die bereits als solche vorliegen, d.h. die Entnahme von Körperflüssigkeiten ist nicht Teil des Verfahrens der vorliegenden Erfindung.

Bevorzugt bei dem Verfahren der vorliegenden Erfindung ist es im Rahmen der vorliegenden Erfindung, dass es sich bei den Anti-Biomarker-Rezeptoren um anti- pLDFI-Antikörper handelt, und bei den Biomarker-spezifischen Aptameren um Malaria- 2008-Aptamere, an die bevorzugt 5-FAM und/oder Cyanin 5 als Fluorophor gebunden ist/sind; in Übereinstimmung mit der den obigen Ausführungen zum Biomarker Detektionssensor bzw. der Biomarker-Detektionssensor-Kit der vorliegenden Erfindung.

Durch die Vorbehandlung der anti-pLDFI-Antikörper mittels UV-Strahlung werden diese aktiviert. Im Rahmen dieser Aktivierung werden die Antikörper in eine Konformation überführt, so dass sie an die Gold-Nanopartikel in einer Art und Weise binden, welche die Bindungsepitope des Antikörpers leicht zugänglich für den zu untersuchenden Biomarker machen.

Gegenstand der vorliegenden Erfindung sind ebenfalls Verwendungen der Biomarker- Detektionssensoren, der Biomarker-Detektionssensor-Kits oder des erfindungsgemäßen Verfahrens zur Bestimmung von krankheitsspezifischen Biomarkern in Körperflüssigkeiten zur qualitativen oder quantitativen Bestimmung von krankheitsspezifischen Biomarkern.

Insbesondere ist diese Verwendung umfasst für die Bestimmung von Malaria- Biomarkern und insbesondere in Körperflüssigkeitsproben, höchst bevorzugt in Blutproben.

Eine weitere bevorzugte Verwendung gemäß vorliegender Erfindung ist die Verwendung der Biomarker-Detektionssensoren gemäß vorliegender Erfindung als Substrat in automatisierten Multititerplatten.

Die Biomarker-Detektionssensoren gemäß vorliegende Erfindung kann analog zu Lohmüller, T., Aydin, D., Schwieder, M. et al., „Nanopatterning by block copolymer micelle nanolithography and bioinspired applications", Biointerphases 6, MR1-MR12 (2011), https://doi.Org/10.1116/l.3536839 erfolgen.

Im Folgenden wird die Erfindung unter Bezugnahme auf die Figuren näher erläutert. Die Figuren sind dabei nicht unbedingt maßstabsgetreu und vereinfacht. So sind übliche, dem Fachmann geläufige Maßnahmen etc. nicht unbedingt dargestellt (Schrauben, Ventile, Reaktionsgefäße, genaue Molekülstruktur etc.), um die Lesbarkeit der Figuren zu erleichtern.

Figurenbeschreibung:

Figur 1 ist eine schematische Darstellung der Vorgehensweise zur Herstellung eines Biomarker-Detektionssensors gemäß vorliegender Erfindung.

Die Herstellung dieser Arrays von Gold-Nanopartikeln erfolgte dabei, wie in Abschnitt A) illustriert ist, zunächst über Nanolithographie basierend auf der Selbstanordnung von Blockcopolymeren. Dazu werden Blockcopolymere 7 verwendet, die eine hydrophile Kette (dargestellt durch Strich) und eine hydrophobe Kette (dargestellt durch Block) haben. Durch Vermischen mit einem unpolaren Lösungsmittel, insbesondere Toluen T, entstehen inverse Mizellen 8, d.h. Mizellen, bei denen der Kern hydrophil und die äußere Schale hydrophob ist. Zu dieser Mischung enthaltend die inversen Mizellen wird dann ein Gold-Salz Au-S (beispielsweise HAuCU) hinzugegeben, was dazu führt, dass die inversen Mizellen Gold-Precursoren 9 in ihrem Zentrum, dem hydrophilen Kern, aufnehmen. Diese Mizellen können dann auf einem Substrat 1, beispielweise mittels Tauch-Beschichter, abgeschieden werden. Aufgrund ihrer Struktur ordnen sich die Mizellen dann auf der Oberfläche des Substrats in regelmäßigen Strukturen an. Anschließend werden dann die Mizellen um die Gold- Precursoren herum entfernt, beispielsweise mittels Plasmaofenbehandlung. Dabei werden auch die Gold-Precursoren 9 zu den Gold-Nanopartikeln 2 reduziert. Auf der Oberfläche verbleibt dann ein zweidimensionales Gitter von Gold-Nanopartikeln 2 (ungefüllte Kreise).

In Abschnitt B) ist illustriert, wie eine Lösung von anti-pLDH-Antikörpern 10 mittels UV-Strahlung (dargestellt als Blitz) vorbehandelt und dann anschließend diese behandelte wässrige Lösung 10a auf das in Abschnitt A) hergestellte Substrat mit darauf befindlichen Gold-Nanopartikeln gegossen wird, wobei sich die Antikörper an die Gold Nanopartikel binden.

Im Ergebnis erhält man dann das in Abschnitt C) illustrierte Substrat 1 mit darauf befindlichen Gold-Nanopartikeln 2, an die die Anti-Biomarker-Rezeptoren gebunden sind, was hier durch gefüllte Kreise dargestellt wird. Diese Herstellungsweise ist beispielsweise auch in Lohmüller, T., Aydin, D., Schwieder, M. et al., „Nanopatterning by block copolymer micelle nanolithography and bioinspired applications", Biointerphases 6, MR1-MR12 (2011), https://doi.Org/10.1116/l.3536839 beschrieben.

Figur 1 gibt die Anordnung der Teilchen auf dem Substrat nur schematisch-illustrativ wieder und ist nicht auf eine bestimmte Anordnung beschränkt. Die in dieser Figur illustrierte Herstellungsweise kann sowohl für die Herstellung von Substraten mit hexagonal darauf angeordneten Nanopartikeln (wie illustriert), als auch für die Herstellung von verzweigt angeordneten Nanopartikeln oder auch für Mischformen eingesetzt werden.

Figur 2a ist eine Rasterelektronmikroskop-Aufnahme eines mit geordneten Gold- Nanopartikeln versehenen Substrats gemäß einer Variante der vorliegenden Erfindung. Aus dieser Aufnahme ist zu ersehen, dass bei der Herstellung der Sensoren durchaus Fehlstellen Vorkommen können. Allerdings sind diese Fehlstellen für die Gesamt-Performance des Biomarkers-Detektionssensors nicht schädlich, da diese im Rahmen der Plasmonenresonanz bzw. der dualen Verstärkung sozusagen herausgemittelt werden. Figur 2b sind zwei Rasterelektronmikroskop-Aufnahmen eines anderen mit geordneten Gold-Nanopartikeln versehenen Substrats gemäß einer anderen Variante der vorliegenden Erfindung. Aus diesen Aufnahmen ist zu ersehen, dass hierbei in der Nahordnung noch hexagonale Strukturen gegeben sind, die Fernordnung aber im wesentlichen verzweigte Strukturen sowie auch vereinzelte Nanopartikel aufweist. Dabei zeigt das obere Bild eine Struktur vor und das untere Bild eine nach dem AuNP- Wachstum.

Figur 3 ist ein Diagramm, in welchem die beiden schmaleren Kurven das Anregungsspektrum (links, gestrichelte Kurve) und das Emissionsspektrum (rechts, gepunktete Kurve) von Cyanin 5 (Cy5) darstellen und die breite Kurve das experimentell bestimmte Extinktionsspektrum eines Malaria-Biomarker Detektionssensors (gemäß dem nachfolgend beschriebenen Beispiel A) hergestellt). Es ist ersichtlich, dass das breite Extinktionsspektrum die Überlagerung der plasmonischen Resonanz über sowohl Extinktions- als auch Emissionsspektrum von Cyanin 5 erlaubt. Die Wellenlänge in nm ist auf der x-Achse aufgetragen und die Extinktion (links) und die normalisierte Anregung (Excitation) / Emission (rechts) auf der y-Achse.

Figur 3b für ein gemäß dem nachfolgend beschriebenen Beispiel B) hergestelltes Substrat zeigt das experimentelle (durchgezogene Linie) Extinktionsspektrum. Zudem ist die Plasmon-Fluorophor-Überlappung mit 5-FAM- (Emissionsspektrum, klein gestrichelte Linie // Anregungsspektrum, groß gestrichelte Linie) und Cy5- (Emissionsspektrum, Strich-Punkt-Linie // Anregungsspektrum, gepunktete Linie) Farbstoffen gezeigt. Dabei ist zu sehen, dass das experimentelle Extinktionsspektrum zwei plasmonische Resonanzen bei 524 nm und 675 nm zeigt. Isolierte AuNP tragen dabei zu der Resonanz bei kleinerer Wellenlänge bei, wie dies ausgehend von 30 nm Goldnanosphären in Luft zu erwarten war, wohingegen AuNP, die entlang der Zweige angeordnet sind zu einer kollektiven Resonanz bei höherer Wellenlänge führen. Auf der linken Achse ist die Extinktion aufgetragen, auf der rechten Achse Anregung/Emission. Auf der horizontalen Achse ist die Wellenlänge in nm aufgetragen.

Figur 4 ist eine diagrammatische Darstellung der Teilchengrößenverteilung von Goldnanopartikel, die gemäß dem nachfolgend beschriebenen Beispiel A) hergestellt wurden. Der mittlere Durchmesser D der Gold-Nanopartikel bei diesem Beispiel liegt bei etwa 48 nm (47,67 + 0,14 nm).

Figur 5 ist eine diagrammatische Darstellung der Zwischenpartikelabstände in Nanometern bezogen auf die jeweiligen Mitten der Nanometer. Der mittlere Zwischenteilchenabstand, gemessen Mitte zu Mitte, liegt bei etwa 68 nm (68,47 + 0,19 nm)), woraus sich ein Zwischenpartikelabstand, gemessen Teilchenrand zu Teilchenrand, von etwa 20 nm ergibt (gemäß dem nachfolgend beschriebenen Beispiel A) hergestellt).

Figur 6 zeigt schematisch die Funktionsweise der vorliegenden Erfindung an einem einzigen Goldnanoteilchen (AuNP). Basis ist ein auf einem Substrat 1 angeordnetes Goldnanoteilchen 2, an das Antikörper 3 (hier als Y dargestellt) gebunden sind. In dieser Figur wird durch die Darstellungsweise der Antikörper 3 klar, dass diese in einer Konformation an die Gold-Nanopartikel 2 gebunden sind, welche die Bindungsepitope der Antikörper leicht für den jeweiligen Biomarker zugänglich machen. Dies ist dadurch illustriert, dass jeweils ein „Arm" der Antikörper 3 vom Gold- Nanopartikel 2 fort orientiert ist. Ferner ist der zu untersuchende Biomarker 4 (Pfl_DH) dargestellt (nur einer, der Übersichtlichkeit halber, in Form einer Wolke), welcher hier als an das Bindungsepitop des mittleren Antikörpers 3 bindend dargestellt ist. Auf der anderen Seite des Biomarkers 4 ist dann ein Aptamer 5 dargestellt, welches somit den Biomarker 4 zusammen mit dem Antikörper 3 sozusagen in die Zange nimmt (Sandwich). An der dem Biomarker 4 abgewandten Seite des Aptamers 5 ist das Fluorophor 6 als Stern dargestellt, der dessen Fluoreszenz-Emission darstellen soll. Der Abstand zwischen dem Fluorophor 6 und der Oberfläche 1 beträgt hier ungefähr 10 nm, wodurch mit dieser Anordnung sowohl eine hohe Sensitivität als auch eine hohe Selektivität erreicht wird.

Figur 7 zeigt ein Bild der Fluoreszenzpunkte eines Sensoraufbaus mit detektiertem Biomarker gemäß Beispiel B), unten. Das Bild zeigt eine Wiedergabe, bei der die rot- und grün-Kanäle, die aus der Detektion mit zwei Farbkanälen, d.h. zwei verschiedenen Fluorophoren (5-FAM und Cy5) resultieren, vereint dargestellt sind (hier zu Reproduktionszwecken in schwarz-weiß). Man sieht deutlich die Fluoreszenzpunkte und mithin die gute Detektierbarkeit, die mit der vorliegenden Erfindung erreicht werden kann. Eine entsprechende Detektierbarkeit gilt auch für die Variante nach Beispiel A) (nicht gezeigt). Bezugszeichenliste:

In den Figuren bedeuten gleiche Bezugszeichen gleiche Materialien, Stoffe etc.

1 Substrat

2 Gold-Nanopartikel

2a Gold-Nanopartikel mit gebundenen Antikörpern

3 Antikörper

4 Biomarker

5 Aptamer

6 Fluorophor

7 Blockcopolymer

8 inverse Micelle

9 Gold-Nanopartikel-Precursor

10 Lösung von anti-pLDFI-Antikörpern (unbehandelt)

10a Lösung von anti-pLDH-Antikörpern (nach UV-Behandlung)

T Toluen

Au-S Goldsalz, insbesondere HAuCU

Die vorliegende Erfindung wird nun unter Heranziehung der folgenden nicht- limitierenden Beispiele näher erläutert. Die folgenden nicht-limitierenden Beispiele dienen dazu die darin ausgeführten Ausgestaltungen darzulegen. Dem Fachmann ist bekannt, dass Variationen dieser Beispiele im Rahmen der vorliegenden Erfindung möglich sind.

Beispiele:

0. Materialien und Chemikalien

Diblockcopolymere (P18226-S2VP bzw. P3807-S2VP) wurden von Polymer Source Inc. (Dorval, Canada) gekauft und wurden hergestellt aus Polystyren(x)-b-2- polyvi nyl pyrid i n(y) (PS(x)-b-P2VP(y)), worin x = 30000 und y = 8500 bzw. x = 325000 und y = 92000 das jeweilige Molekulargewicht von Polystyren (PS) und Poly(2-vinylpyridin) (P2VP) angeben (Angegeben ist jeweils das Zahlenmittel (MN) der Verteilung. Das Verhältnis von MW: MN liegt für P18226-S2VP bei 1,06 und indiziert eine sehr monodisperse Verteilung). Toluen (99,8%), Gold(III)chlorid-T rihyd rat (HAUCU*3H 2 0), Silbernitrat (AgNCb) und Ascorbinsäure wurden von Sigma-Aldrich gekauft; Aceton (>99,0%), 2-Propanol (>99,5%) und Ethanol (>99,5%) wurden von Merck Millipore gekauft; Hexadecyltrimethylammoniumbromid (CTAB) (>99,0%) wurde von Fluka gekauft; Bovinserumalbumin (BSA) (Fraktion V IgG-frei, arm an Fettsäuren) kam von Gibco. Flochreines entionisiertes Wasser, dass für alle wässrigen Lösungen verwendet wurde, wurde aus einem Milli-Q®-System (18,2 Megaohm spezifischer Widerstand) dosiert.

10 mM Phosphatgepufferte Salzlösung (PBS) (NaCI 10 mM, NaF PO 10 mM, NazFIPO 10 mM, MgCh 1 mM, pH 7,1) und 25 mM Tris-HCl-Puffer (NaCI lOOmM, Imidazol 20 mM, Tris (=Tris(hydroxymethyl)aminomethan) 25 mM, HCl 25 mM, pH 7,5) wurden durch lösen der Reagenzien (gekauft von Sigma-Aldrich) in hochreinem Wasser hergestellt. Pan-Malaria-Antikörper (monoklonaler anti-pLDH Antikörperklon 19g7) wurde von Vista Laboratory Services (Langley, USA) hergestellt. Die rekombinante Plasmodium falciparum- Laktatdehydrogenase (P/LDH) und PvLDH wurden durch bakterielle Expression erhalten. Die Malaria 2008s-Aptamere gelabelt mit 5-FAM bzw. Cyanin-5-Tag (5'-5-FAM(Cy5)-CTG GGC GGT AGA ACC ATA GTG ACC CAG CCG TCT AC-3') wurden durch Friz Biochem GmbH (Neuried, Deutschland) hergestellt. Millex® Spritzenfilter (Porengröße 0,20 pm) mit hydrophober Polytetrafluorethylenmembran wurden von Merck Millipore gekauft; Superslip® Deckgläser (Borosilikatglas, Dicke 0,13 - 0,17 mm) wurde von Thermo Fisher Scientific gekauft und durch einen Glasschneider mit Diamantspitze geschnitten.

Beispiel A):

1. Herstellung eines geordneten Arrays von AuNPs zur Detektion von Pf LDH in Blut

Nanolithographie basierend auf der Selbstanordnung von Blockcopolymeren wurde eingesetzt, um Arrays von geordneten AuNPs mit einstellbarer Dichte, Größe und Zwischenpartikelabstand herzustellen. 29,2 mg der Diblockcopolymere P18226-S2VP wurden unter starkem Rühren und unter kontrollierten Bedingungen (Argoninertgas, O2 < 1 ppm, H 2 q<0,1 ppm) zu 15 ml Toluen gegeben und für 72 Stunden gehalten, um ein homogen dispergierte, umgekehrte Micellen mit hydrophilem Kern und äußerer hydrophober Schale (kugelförmig) zu erhalten. Dann wurden 15,7 mg HAuCU*3H 2 0 während 72 Stunden in die Lösung gegeben, um den Goldprekursor in dem hydrophilen Kern der Micellen aufzunehmen, was zu der Bildung von AuNPs, die von einer hydrophoben Schale umhüllt waren, führte. Nachdem das Goldpulver vollständig dispergiert war, wurde die gelbliche Lösung filtriert, um Micellenaggregate und Verunreinigungen zu entfernen. Unter Beibehaltung des Rührens konnte diese Lösung für mindestens sechs Monate gelagert werden. Bevor die PS-AuNPs auf den Glasdeckgläsern (die eine Größe von 10 x 8 mm 2 hatten) abgeschieden wurden, wurden die Substrate mittels Ultraschall für fünf Minuten nacheinander in Aceton, 2-Propanol und reinem Ethanol gereinigt und in Toluen getaucht werden, um die Oberfläche nicht-polar „zu machen", so dass die hydrophoben Hüllen an dieser anhaften konnten. Anschließend wurden die Substrate mittels eines Tauchbeschichters bei sorgfältiger Einstellung der Eintauchgeschwindigkeit in die PS-AuNPs enthaltende Lösung getaucht. Es stellte sich dabei heraus, dass eine Eintauchgeschwindigkeit von 0,6 mm/s eine besonders gute Beschichtung der Glasoberfläche sowohl im Hinblick auf die Dichte der Anordnung der AuNPs als auch im Hinblick auf die großflächige Gleichmäßigkeit der Abscheidung ermöglichte. Die PS-AuNPs wurden auf der nicht-polaren Glasoberfläche durch hydrophobe Interaktion transferiert, wodurch eine hexagonale Anordnung mittels Selbstorganisation erfolgte. Ein entsprechender Vorgang ist auch in Figur 1 illustriert. Danach wurden die Copolymere mittels Sauerstoffplasmabehandlung geätzt (0,8 mbar Druck, 200 W, 30 Minuten), wodurch die AuNPs an präfixierten Positionen auf der Glasoberfläche immobilisiert wurden.

Weil die plasmonische Resonanz stark von dem Verhältnis R zwischen dem AuNP- Durchmesser D und dem Zwischenpartikelabstand d abhängt, garantieren höhere Werte von R eine größere Kopplung zwischen den AuNPs. Für R> 2/3 wird die plasmonische Resonanz durch das kollektive Verhalten der AuNPs dominiert, und mehrere Vorteile für die Metallverstärkte Fluoreszenz (MEF) resultieren. Um R zu erhöhen, wurden die Substrate für 2 Stunden unter Lichtausschluss mit 2 ml einer Au- Depositionslösung (CTAB 190 mM, HAuCU*3H 2 0 42 mM, AgNC 8 mM, Ascorbinsäure 100 mM) inkubiert. Danach wurden die Substrate reichlich mit hochreinem Wasser gespült und bis zur Verwendung unter Lichtausschluss gelagert. Die Charakterisierung der nanostrukturierten Substrate erfolgte mittels UV-VIS-Spektroskopie und Rasterelektronenmikroskopie (SEM).

Darstellungen der Messergebnisse finden sich in Figuren 2 bis 5.

2. Funktionalisierung

Die Funktionalisierung der AuNPs mit Pan-Malaria-Antikörpern wurde mittels photochemischer Immobilisierungstechnik (PIT) vorgenommen. Dazu wurde 1 ml wässrige Lösung von anti-pLDH (25 pg/ml) mittels einer UV-Lampe für 30 Sekunden bestrahlt und dann auf das Substrat gegossen. Die UV-Quelle bestand aus zwei U- förmigen Niederdruckquecksilberlampen (2 W bei 254 nm) in die eine Standardquarzküvette eingesetzt werden konnte. Unter Berücksichtigung der Geometrie der Lampen und der Nähe zu der Küvette, lag die Strahlungsintensität, die zur Generierung der Thiolgruppen verwendet wurde, bei ungefähr 1 W/cm 2 . Diese Intensität war so schwach, dass eine direkte Photolyse der Disulfidbrücken, die bei 254 nm nur schwach absorbieren, vermieden wird. Lediglich die Disulfidbrücke der Cys-Cys-Trp-Triade (bei der das Tryptophan die Disulfidbrücke „aktiviert") wurde dadurch gespalten. Funktionalisierung mittels PIT stellte sicher, dass die Antikörper (Abs) kovalent auf die Goldoberfläche geknüpft und ihre Bindungsstellen für die Umgebung zugänglich wurden.

3. Waschen

Die Proben wurden mit hochreinem Wasser (dosiert mittels eines Milli-Q®-systems) gespült, um nicht gebundene Antikörper zu entfernen.

4. Blockieren

1 ml Rinderserumalbumin (BSA)-Lösung (50 pg/ml) wurde aufgetragen, um die freie Goldoberfläche zu bedecken und vor nicht-spezifischer Adsorption zu schützen.

5. Waschen

Die Proben wurden reichlich mit hochreinem Wasser gespült. Die Lagerung bis zur Verwendung erfolgte in PBS-Lösung (10 mM) bei Raumtemperatur.

6. Analyt-Detektion (PfLDH-Fixierung durch immobilisierte Abs)

Die gewünschte Menge von Plasmodium falciparum Laktat-Dehydrogenase (Pfl_DH) wurde zu 1 ml einer verdünnten Lösung von nicht infiziertem menschlichen Blut gegeben (Verdünnung 1: 100 in 25 mM Tris-Puffer). Die funktionalisierten Substrate wurden mit 1 ml kontaminierter Blutlösung gleicher Verdünnung für 2 Stunden bei Raumtemperatur inkubiert. Ein Wippschüttler wurde verwendet, um die Bindungskinetik zu beschleunigen und die Analyt-Diffusion zu verbessern. Es wurden Konzentrationen zwischen 0,01 Femtomol und 10 Nanomol gemessen.

7. Waschen

Die Proben wurden reichlich mit Tris-Puffer (25 mM) und mit hochreinem Wasser gespült, um ungebundene Proteine zu entfernen.

8. Fluoreszenz-Aptamer-basierendes Assay Die Proben wurden in 1 ml 10 mM phosphatgepufferte Salzlösung (PBS) überführt, wobei hier die PBS noch 0,1 pM Malaria 2008s-Aptamere gelabelt mit Cy5-Tag (5'- Cy5-CTG GGC GGT AGA ACC ATA GTG ACC CAG CCG TCT AC-3') enthält (d.h. das Malaria2008-Aptamer mit daran gebundenem Fluorophor. Die Lösung wurde unter Lichtausschluss für 2 Stunden mittels eines Wippschüttlers sanft geschüttelt. Als Ergebnis erhielt man eine Sandwich-Anordnung. Eine solche Anordnung ist exemplarisch auch in Figur 6 dargestellt.

9. Waschen

Die Proben wurden reichlich mit PBS und hochreinem Wasser gespült, um ungebundene Aptamere zu entfernen.

10. Messung des Fluoreszenz-Signals

Fluoreszenzbilder wurden mit einem Zeiss Axio Observer ZI phaseninvertiertem Kontrastfluoreszenzmikroskop, ausgerüstet mit Zeiss Colibri.2 LED Lichtquelle (Module 625 nm), Zeiss Plan-Apochromat-Objektiv 10x/0,45 Ph 1 M27

(FWD = 2,1 mm), Kubus 50 Cy5 Filter (Anregung 625 - 655 nm/Emission 665 - 715 nm) und pco.edge 5.5 sCMOS Photodetektor (Skalierung 0,650 pm x 0,650 pm pro Pixel, Bildgröße 2560 x 2160 Pixel, skalierte Bildgröße 1,66 mm x 1,40 mm, 16 Bit Dynamikumfang, 2 Sekunden Belichtungszeit jeweils für jedes Bild). Die aufgezeichneten Fluoreszenzbilder wurden mit ImageJ-Software verarbeitet. Der „rolling ball"-Algorithmus wurde verwendet, um den durch die Optik bedingten Helligkeitsunterschied zwischen Bildzentrum und Bildrand herauszurechnen. Der Flintergrund wurde lokal für jeden Pixel mittels Durchschnittsbildung über einen Kreis um den Pixel herum vermessen. Solch ein Wert wird dann von dem Originalbild abgezogen, wodurch räumliche Variationen des Hintergrunds geglättet werden. Der „rolling ball"-Radius war auf 10 Pixel gesetzt, eine Größe, die ausreichend größer war als die Größe der größten Objekte, die nicht Teil des Hintergrunds waren. Ein Schwellenwert, der geringfügig höher als der geglättete Hintergrund war, wurde eingestellt, um das Bild zu segmentieren, dessen Gesamtintensität durch Aufsummierung der Signalanteile von allen Spots gemessen wurde. Um eine gute und verlässliche Analyse der Fluoreszenzsignale zu erhalten, wurden zehn Bilder zufällig von jeder Probe gemacht und deren Intensitätsdurchschnitt ermittelt.

11. Simulation des E-Felds um die Goldnanopartikel herum Die optische Antwort der 2D-AuNP-Gerüste wurde durch das „FDTD Solutions" -Tool, das in Lumerical Software implementiert war, simuliert. Eine linear polarisierte elektromagnetische Strahlung, die entlang der z-Richtung lief, wurde verwendet, um das System zu untersuchen. Virtuelle (simulierte) Photo -Detektoren (PDs), sinnvoll in dem Arbeitsraum angeordnet, konnten die Intensität des elektromagnetischen Feldes in Abhängigkeit der Zeit messen. Ein Photo -Detektor war dazu bestimmt, das Excitationsspektrum der Nanostruktur zu messen. Symmetrische/antisymmetrische Randbedingungen (BCs - boundary conditions), eingestellt entlang der x- und y- Richtung, erstrecken die plasmonische Anregung über ein unendliches 2D-Gerüst und reduzieren gleichzeitig die Simulationszeit um einen Faktor 8, ohne dabei die Genauigkeit der Resultate zu verschlechtern. Bloch BCs (periodische Randbedingungen) wurden nur für Polarisationsstudien verwendet, um die Phasenverschiebung zu kompensieren, die entsteht, wenn eine elektromagnetische Störung mit einem nicht-Null-Winkel auf der gegenüberliegenden Seite des Arbeitsraums wiedereingeführt. Perfekt eingestellte Schicht-BCs in z-Richtung stellen perfekte Absorption der elektromagnetischen Wellen, die durch die Ebene, enthaltend die Lichtquelle, zurückgestreut werden und durch die gegenüberliegende Seite der Arbeitsumgebung einfallen, sicher. Die Arbeitsumgebung wurde über ein Gitter mit einer räumlichen Auflösung von 0,5 nm aufgelöst, wodurch eine hohe Genauigkeit sichergestellt und gleichzeitig die Simulationszeit innerhalb weniger Stunden gehalten wurde. Die AuNPs wurden als homogene Goldhalbkugeln modelliert, wohingegen das Substrat als dicke dielektrische Schicht von Siliziumdioxid (S1O2) repräsentiert wurde.

Beispiel B):

Im Wesentlichen entsprechend oben bei Beispiel A) wurde wie folgt vorgegangen:

1. Herstellung eines Arrays von AuNPs

24,3 mg der Diblockcopolymere P3807-S2VP wurden unter starkem Rühren zu 15 ml Toluen gegeben und für 72 Stunden gehalten, um eine homogene, monodisperse Lösung umgekehrter Micellen zu erhalten. Dann wurden 13,1 mg FIAuCU*3H 2 0 während 72 Stunden in die Lösung gegeben, um die Bildung von Goldkernen umhüllt von Polystyren-Flüllen (PS-AuNPs) zu ermöglichen. Anschließend wurde die gelbliche Lösung filtriert, um mögliche Copolymeraggregate zu entfernen. Diblockcopolymere und Gold(III)chloridtrihyd rat wurden dabei ein einer Glovebox unter Inertgas (Argon) und kontrollierten Bedingungen (O2 < 1 ppm, FI2O < 0,1 ppm) gehandhabt. Bevor die PS-AuNPs auf den Glasdeckgläsern (10 x 8 mm 2 ) abgeschieden wurden, wurden die Substrate mittels Ultraschall für fünf Minuten nacheinander in Aceton, 2- Propanol und Ethanol gereinigt und dann in ein nichtpolares Lösungsmittel getaucht, um das Anhaften von hydrophoben Polystyren-Hüllen zu ermöglichen. Anschließend wurden die Substrate mittels eines Tauchbeschichters und einer Eintauchgeschwindigkeit von 0,8 mm/s in die PS-AuNPs enthaltende Lösung getaucht. Diese Eintauchgeschwindigkeit ermöglicht eine gute Beschichtung der Substratoberfläche bei gleichzeitiger Verhinderung maximaler Packungsdichte (vgl. Figur 2b, woraus ersichtlich ist, dass in der Nahordnung noch hexagonale Strukturen gegeben sind, die Fernordnung aber verzweigte Strukturen zeigt). Danach wurden die Copolymere mittels Sauerstoffplasmabehandlung geätzt (0,8 mbar Druck, 200 W, 30 Minuten), wodurch die AuNPs an präfixierten Positionen auf der Glasoberfläche immobilisiert wurden. Anschließend wurden die Substrate für 2 Stunden unter Lichtausschluss mit 2 ml einer Au-Depositionslösung (CTAB 190 mM, FIAuCU*3H 2 0 42 mM, AgNÜ3 8 mM, Ascorbinsäure 100 mM) inkubiert.

2. Funktionalisierung

Die Funktionalisierung der AuNPs mit Pan-Malaria-Antikörpern wurde mittels photochemischer Immobilisierungstechnik (PIT) vorgenommen. Dazu wurde 1 ml wässrige Lösung von anti-pLDFI (50 pg/ml) mittels einer UV-Lampe für 30 Sekunden bestrahlt und dann auf das Substrat gegossen. Die UV-Quelle (Trylight, Promete S.r.l) bestand aus zwei U-förmigen Niederdruckquecksilberlampen (6 W bei 254 nm) in die eine 10 mm Standardquarzküvette eingesetzt werden konnte. Unter Berücksichtigung der Geometrie der Lampen und der Nähe zu der Küvette, lag die Strahlungsintensität, die zur Generierung der Thiolgruppen verwendet wurde, bei ungefähr 0,3 W/cm 2 .

3. Waschen wie oben

4. Blockieren wie oben

5. Waschen wie oben

6. Analyt-Detektion (PfLDH-Fixierung durch immobilisierte Abs)

Nicht infiziertes menschliches Blut wurde 1: 100 in 25 mM Tris-Puffer verdünnt, um die Turbidität der Probe zu verringern. Die gewünschte Menge von Plasmodium falciparum Laktat-Dehydrogenase (P/LDFI) wurde zu 1 ml einer verdünnten Lösung der Probe gegeben, um Analytkonzentrationen im Bereich von 1 fM bis 1 pm zu erhalten (bezogen auf das unverdünnte Blut). Die funktionalisierten Substrate wurden mit 1 ml kontaminierter Blutlösung für 2 Stunden bei Raumtemperatur inkubiert.

7. Waschen wie oben

8. Fluoreszenz-Aptamer-basierendes Assay

5-FAM und Cy-5 gelabelte Malaria-Aptamere wurden in einem Verhältnis von 1: 1 in

1 ml 10 mM phosphatgepufferte Salzlösung (PBS) überführt, um eine Aptamerkonzentration von 0,1 pM zu erhalten (d.h. das Malaria2008-Aptamer mit daran gebundenem Fluorophor). Die Lösung wurde unter Lichtausschluss für

2 Stunden mittels eines Wippschüttlers sanft geschüttelt. Als Ergebnis erhielt man eine Sandwich-Anordnung. Eine solche Anordnung ist exemplarisch auch in Figur 6 dargestellt.

9. Waschen wie oben

10. Messung des Fluoreszenz-Signals

Fluoreszenzbilder wurden mit einem Zeiss Axio Observer ZI phaseninvertiertem Kontrastfluoreszenzmikroskop, ausgerüstet mit Zeiss Colibri.2 LED Lichtquelle (Module 470 und 625 nm), Zeiss Plan-Apochromat-Objektiv 10x/0,45 Ph 1 M27 (FWD = 2,1 mm), 38 HE Filter (Excutation 450-490 nm/Emission 500-550 nm) und Kubus 50 Cy5 Filter (Anregung 625 - 655 nm/Emission 665 - 715 nm) und pco.edge 5.5 sCMOS Photodetektor (Skalierung 0,650 pm x 0,650 pm pro Pixel, Bildgröße 2560 x 2160 Pixel, skalierte Bildgröße 1,66 mm x 1,40 mm, 16 Bit Dynamikumfang, 2 Sekunden Belichtungszeit jeweils für jedes Bild). Die aufgezeichneten Fluoreszenzbilder wurden mit ImageJ-Software verarbeitet, um die vollständige von den hellen Punkten ausgehende Intensität zu verarbeiten. Zunächst wurden die RGB- Bilder in zwei die roten und grünen Komponenten enthaltende Kanäle aufgeteilt, um die Anteile der zwei Fluorophore separat zu analysieren. Auch hier wurde der „rolling balT'-Algorithmus verwendet. Figur 7 zeigt das resultierende Bild, bei dem die rot- und grün-Kanäle wieder vereint dargestellt sind (hier zu Reproduktionszwecken in schwarz-weiß).

11. Prüfung der Spezi fizität

Die Spezifität des apta-Immunosensors wurde gegen die Laktatdehydrogenase von Plasmodium vivax (PvLDH) getestet, die zu 90% mit der P/LDH identisch ist. Die Pv DH wurde in nicht infiziertes menschliches Blut gegeben (1: 100 verdünnt in 1 mL 25 mM Tris-Puffer), um die höchste in der Kalibrierungskurve untersuchte Analytkonzentration zu erhalten (1 mM bezogen auf unverdünntes Vollblut). Die Messung der Fluoreszenzintensität ergab, dass, obwohl die untere Biorezeptorschicht - bestehend aus Pan-Malaria-Anti-PLDH - jeden Plasmodium-Malaria-Marker erfassen kann, im Fall von PvLDFI dank der extrem hohen Spezifität der als obere Biorezeptorschicht verwendeten Aptamere keine signifikante Kreuzreaktion festgestellt werden konnte, sondern die Fluoreszenz für das gewünschte Ziel (PfLDFI) um Größenordnungen höher lag, also eine sehr hohe Spezifizität belegt wurde.