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Title:
SYNTHETIC MULTI-EPITOPE CHIMERA AS A VACCINE AND TREATMENT FOR LEISHMANIASIS IN MAMMALS
Document Type and Number:
WIPO Patent Application WO/2021/250299
Kind Code:
A1
Abstract:
A synthetic multi-epitope chimera as a vaccine and treatment against leishmaniasis in mammals. Synthetic chimera which includes four multi-epitope peptides against Leishmania. Each of the peptides has been selected from a Leishmania infantum protein. These are nucleosomal histones H2A, H2B, H3 and H4. The invention also relates to a pharmaceutical composition which includes the synthetic chimera. It also concerns a prophylactic and/or therapeutic vaccine against Leishmania spp. for use in mammals and especially in humans and dogs.

Inventors:
MARTÍNEZ RODRIGO ABEL (ES)
MAS ZUBIRI ALICIA (ES)
CARRIÓN HERRERO FRANCISCO JAVIER (ES)
ORDEN GUTIÉRREZ JOSÉ ANTONIO (ES)
DE LA FUENTE LÓPEZ RICARDO (ES)
DOMÍNGUEZ BERNAL GUSTAVO (ES)
Application Number:
PCT/ES2021/070377
Publication Date:
December 16, 2021
Filing Date:
May 26, 2021
Export Citation:
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Assignee:
UNIV MADRID COMPLUTENSE (ES)
International Classes:
C07K19/00; A61K39/008; A61P37/02; C12N15/30
Domestic Patent References:
WO2006122382A22006-11-23
WO2009089605A12009-07-23
WO2002078735A22002-10-10
WO2019160971A12019-08-22
WO2014160987A22014-10-02
WO2014102471A12014-07-03
WO2014091463A12014-06-19
WO2013011184A22013-01-24
Foreign References:
ES2681227T32018-09-12
US5733778A1998-03-31
ES2133236B12000-04-16
ES2326174T32009-10-02
ES2415516B22014-01-28
BR102014031331A22018-08-14
Other References:
MARTÍNEZ-RODRIGO ABEL, MAS ALICIA, ÁLVAREZ-CAMPOS DANIEL, ORDEN JOSÉ A., DOMÍNGUEZ-BERNAL GUSTAVO, CARRIÓN JAVIER: "Epitope Selection for Fighting Visceral Leishmaniosis: Not All Peptides Function the Same Way", VACCINES, vol. 8, no. 3, 1 July 2020 (2020-07-01), pages 352, XP055882639, DOI: 10.3390/vaccines8030352
MARTíNEZ-RODRIGO ABEL; MAS ALICIA; FERNáNDEZ-COTRINA JAVIER; BELINCHóN-LORENZO SILVIA; ORDEN JOSé A.; ARIAS PA: "Strength and medium-term impact of HisAK70 immunization in dogs: Vaccine safety and biomarkers of effectiveness for ex vivo Leishmania infantum infection", COMPARATIVE IMMUNOLOGY, MICROBIOLOGY AND INFECTIOUS DISEASES., PERGAMON PRESS, OXFORD., GB, vol. 65, 10 May 2019 (2019-05-10), GB , pages 137 - 143, XP085737556, ISSN: 0147-9571, DOI: 10.1016/j.cimid.2019.05.009
CARRION, J. FOLGUEIRA, C. ALONSO, C.: "Transitory or long-lasting immunity to Leishmania major infection: The result of immunogenicity and multicomponent properties of histone DNA vaccines", VACCINE, ELSEVIER, AMSTERDAM, NL, vol. 26, no. 9, 22 January 2008 (2008-01-22), AMSTERDAM, NL , pages 1155 - 1165, XP022483051, ISSN: 0264-410X, DOI: 10.1016/j.vaccine.2007.12.051
SARRA HAMROUNI, RACHEL BRAS GONçALVES, ABDELHAMID KIDAR, KARIM AOUN, RYM CHAMAKH AYARI, ELODIE PETITDIDIER, YASMINE MESSAOUDI: "Design of multi-epitope peptides containing HLA class-I and class-II-restricted epitopes derived from immunogenic Leishmania proteins, and evaluation of CD4+ and CD8+ T cell responses induced in cured cutaneous leishmaniasis subjects", PLOS NEGLECTED TROPICAL DISEASES, PUBLIC LIBRARY OF SCIENCE, US, vol. 14, no. 3, 16 March 2020 (2020-03-16), US , pages e0008093, XP055769876, ISSN: 1935-2727, DOI: 10.1371/journal.pntd.0008093
CARRION, J. NIETO, A. SOTO, M. ALONSO, C.: "Adoptive transfer of dendritic cells pulsed with Leishmania infantum nucleosomal histones confers protection against cutaneous leishmaniosis in BALB/c mice", MICROBES AND INFECTION, ELSEVIER, PARIS, FR, vol. 9, no. 6, 1 May 2007 (2007-05-01), FR , pages 735 - 743, XP022055509, ISSN: 1286-4579, DOI: 10.1016/j.micinf.2007.02.018
M. SOTO; J. M. REQUENA; L. QUIJADA; M. J. PEREZ; C. G. NIETO; F. GUZMAN; M. E. PATARROYO; C. ALONSO: "Antigenicity of the Leishmania infantum histones H2B and H4 during canine viscerocutaneous leishmaniasis", CLINICAL AND EXPERIMENTAL IMMUNOLOGY, WILEY-BLACKWELL PUBLISHING LTD., GB, vol. 115, no. 2, 24 December 2001 (2001-12-24), GB , pages 342 - 349, XP071079655, ISSN: 0009-9104, DOI: 10.1046/j.1365-2249.1999.00796.x
VELEZ, R.GALLEGO, M: "Commercially approved vaccines for canine leishmaniosis: a review of available data on their safety and efficacy", TROP MED INT HEALTH., vol. 25, no. 5, 2020, pages 540 - 557
ANDREATTA MNIELSEN M: "Gapped sequence alignment using artificial neural networks: application to the MHC class I system", BIOINFORMATICS, vol. 32, no. 4, 2016, pages 511 - 7, XP055566384, DOI: 10.1093/bioinformatics/btv639
NIELSEN M. ET AL.: "Reliable prediction of T-cell epitopes using neural networks with novel sequence representations", PROTEIN SCI., vol. 12, 2003, pages 1007 - 17, XP002582947, DOI: 10.1110/PS.0239403
JENSEN KK ET AL.: "Improved methods for predicting peptide binding affinity to MHC class II molecules", IMMUNOLOGY, vol. 154, no. 3, 2018, pages 394 - 406, XP055921339, DOI: 10.1111/imm.12889
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Claims:
REIVINDICACIONES

1. Quimera sintética multiepitópica que comprende: a.- los péptidos caracterizados por SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEO ID NO: 3 y SEQ ID NO: 4, organizados en cualquier orden y separados por 0-2 aminoácidos, dando lugar a una secuencia de 70-76 aminoácidos; o b.- modificaciones de los péptidos caracterizados por SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3 y SEQ ID NO: 4, organizados en cualquier orden y separados por 0-2 aminoácidos, dando lugar a una secuencia de 70-76 aminoácidos con, al menos, un 95% de identidad con la secuencia definida en a.

2. Quimera según la reivindicación 1 caracterizada por SEQ ID NO: 5 o con, al menos, un 95% de identidad con SEQ ID NO: 5.

3. Composición farmacéutica que comprende una quimera sintética multiepitópica definida en cualquiera de las reivindicaciones 1-2, para su uso en mamíferos. 4. Composición farmacéutica según la reivindicación 3 que comprende un excipiente, un vehículo y/o un adyuvante farmacológicamente aceptables.

5. Composición farmacéutica según la reivindicación 4, en la que el adyuvante es saponina.

6. Composición farmacéutica según cualquiera de las reivindicaciones 3-5 para su uso en la vacunación profiláctica y/o terapéutica frente a Leishmania spp.

7. Vacuna profiláctica y/o terapéutica frente a Leishmania spp. que comprende una quimera sintética multiepitópica según cualquiera de las reivindicaciones 1-2 o una composición farmacéutica según cualquiera de las reivindicaciones 3-6.

8. Vacuna profiláctica y/o terapéutica según la reivindicación 7 para su uso frente a Leishmania infantum.

9. Vacuna profiláctica y/o terapéutica según cualquiera de las reivindicaciones 7-8 para su uso en humana y/o en perros.

REIVINDICACIONES MODIFICADAS recibidas por la oficina Internacional el 14 de septiembre de 2021

1. Quimera sintética multiepitópica que consiste en la SEQ ID NO: 5. 2. Composición farmacéutica que comprende la quimera sintética multiepitópica definida en la reivindicación 1, para su uso en mamíferos.

3. Composición farmacéutica según la reivindicación 2 que comprende un excipiente, un vehículo y/o un adyuvante farmacológicamente aceptables.

4. Composición farmacéutica según la reivindicación 3, en la que el adyuvante es saponina.

5. Composición farmacéutica según cualquiera de las reivindicaciones 2-4 para su uso en la vacunación profiláctica y/o terapéutica frente a Leishmania spp.

6. Vacuna profiláctica y/o terapéutica frente a Leishmania spp. que comprende la quimera sintética multiepitópica según la reivindicación 1 o la composición farmacéutica según cualquiera de las reivindicaciones 2-5.

7. Vacuna profiláctica y/o terapéutica según la reivindicación 6 para su uso frente a Leishmania infantum.

8. Vacuna profiláctica y/o terapéutica según cualquiera de las reivindicaciones 6-7 para su uso en humanos y/o en perros.

HOJA MODIFICADA (ARTICULO 19)

Description:
D E S C R I P C I Ó N

QUIMERA SINTÉTICA MULTIEPITÓPICA COMO VACUNA Y TRATAMIENTO

FRENTE A LEISHMANIOSIS EN MAMÍFEROS

SECTOR DE LA TÉCNICA

La presente invención se encuadra en el sector de la sanidad humana y animal. De forma más concreta, la invención se refiere a una quimera sintética multiepitópica y su uso en la elaboración de una vacuna y un tratamiento inmunoterapéutico frente a la infección por Leishmania spp.

ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN

Las leishmaniosis constituyen un grupo de enfermedades con distribución mundial y están causadas por parásitos protozoos intracelulares del género Leishmania, que son transmitidos por un insecto vector conocido como flebótomo. Esta enfermedad presenta cuadros clínicos y epidemiológicos diversos. Según datos procedentes de la OMS, la prevalencia de la enfermedad es de 12 millones de casos y actualmente amenaza a 350 millones de personas en 88 países diferentes, principalmente en países en vías de desarrollo (Sudán, India, Bangladesh, Nepal y Brasil) de zonas tropicales y subtropicales, aunque también tiene importancia en la cuenca mediterránea.

Atendiendo a los síntomas clínicos de la enfermedad, las leishmaniosis se han clasificado en varios tipos. Por un lado, la leishmaniosis visceral (LV) y, por otro, el resto de leishmaniosis con manifestaciones cutáneas: leishmaniosis cutánea (LC), cutáneo-difusa (LCD) y muco-cutánea (LMC). Leishmania infantum es el principal agente causal de la LV en la región Mediterránea donde, además, el perro doméstico está considerado como el principal reservorio, jugando un papel clave en la aparición de la enfermedad en los seres humanos. Por otro lado, L major es una de las especies con mayor repercusión en la LC en el Viejo Mundo.

A pesar de tener una larga historia, la leishmaniosis continua siendo la cuarta causa más común de muerte y enfermedad, respectivamente, entre las enfermedades tropicales. Además, recientemente se han publicado varios estudios sobre la leishmaniosis que muestran cómo los parásitos se están propagando a nuevas zonas geográficas de todo el mundo adaptándose a entornos cambiantes. En este contexto, la inmunización parece ser el mejor enfoque para controlar la leishmaniosis, ya que los tratamientos actuales son altamente tóxicos y muy costosos, de larga duración. A esto se le suma la posible aparición de resistencias. Curiosamente, mientras que una infección por este parásito genera inmunidad, una inmunización exitosa frente a Leishmania spp. dependerá de la generación de linfocitos T de memoria específicas que puedan mantenerse a lo largo del tiempo. Una vacuna eficaz también debe inducir el desarrollo de una inmunidad antiparasitaria mediada por células CD8+ y CD4+ Th1, que se caracteriza por la producción de interferón-y (IFN-γ) y de IL-12 entre otras citoquinas proinflamatorias. A pesar de las extensas investigaciones para el avance hacia el desarrollo de vacunas y la mayor comprensión de la inmunopatogénesis de la leishmaniosis visceral (VL), no existe ninguna vacuna autorizada para la inmunoprofilaxis o la inmunoterapia contra la VL humana. Sí hay tres vacunas disponibles en el mercado para la inmunización contra la leishmaniosis canina (LeishTec®, CaniLeish® y LetiFend®) y, hasta 2014, hubo otra más que, actualmente, está retirada (Leishmune®).

En WO2006122382A1 se describe la vacuna que se comercializó en Brasil con el nombre de Leishmune® y que, posteriormente, fue retirada debido a que, en los ensayos de la fase III, no se pudo demostrar su eficacia. Se trata de una vacuna de segunda generación, compuesta por el ligando de fucosa-manosa (FML) de L donovani y la saponina como adyuvante.

LeishTec® es la vacuna actualmente autorizada en Brasil para perros. Comprende una proteína recombinante de amastigotes de L. donovani (proteína A2) y saponina como adyuvante. Son varias las patentes y solicitudes de patente que proponen a A2 como proteína de elección para la elaboración de vacunas frente a Leishmania: WO2009089605A1 , WO2002078735A2, US5733778, WO2019160971 A1, entre ellas.

En Europa se comercializa CaniLeish® desde 2011, compuesta por antígenos secretados y excretados de promastigotes de L infantum, también con saponina como adyuvante. En ES2595207T3, se describe un complejo vacunal terapéutico para la prevención o el tratamiento de la leishmaniosis que está compuesto por moléculas de excreción y secreción procedentes de amastigotes y/o de promastigotes de Leishmania spp. producidas en un medio definido.

La cuarta de las vacunas citadas es LetiFend®. Se trata de una vacuna recombinante que contiene una proteína quimérica (proteína Q) formada por cinco fragmentos antigénicos de cuatro proteínas diferentes de L infantum (las proteínas ribosomales LiP2a, LiP2b y LiPO y la histona H2A), descrita en ES2133236B1 y en ES2326174T3.

Sin embargo, después de varios años de comercialización, siguen existiendo dudas sobre la eficacia y la efectividad de estas vacunas, la infecciosidad potencial de los animales vacunados e infectados o la interferencia de los anticuerpos inducidos por la vacuna en el diagnóstico serológico de L. infantum (Velez, R.; Gallego, M. Commercially approved vaccines for canine leishmaniosis: a review of available data on their safety and efficacy. Trop Med Int Health. (2020) 25, 5:540-557.) de manera que el método más utilizado para prevenir la enfermedad en los perros que viven en zonas endémicas sigue siendo la aplicación tópica de tratamientos con repelentes e insecticidas. Sin embargo, incluso cuando se utilizan correctamente, estos productos no pueden proteger completamente a los perros y es imprescindible adoptar más medidas de control. En este sentido, se han descrito otras posibles vacunas buscando una solución a este problema. Se incluyen varios ejemplos a continuación.

En WO2014160987A2, se describe un polipéptido de fusión que comprende una nucleósido hidrolasa no específica (NH), una esteral 24-c-metiltransferasa (SMT) y un polipéptido seleccionado del grupo formado por HSP70, una cisteín polipeptidasa B (CpB), una histona H2BN, un polipéptido A2 y un antígeno p21, o bien un factor 4a de iniciación eucariota (Leif), de Leishmania spp. como inmunoestimulante. WO2014102471A1 propone una vacuna basada en fragmentos antigénicos/peptidicos seleccionados a partir de la proteína de virulencia PSA (de Antígeno de Superficie de Promastigotes) soluble, de Leishmania. En WO2014091463A1 se describe una vacuna frente a Leishmania que comprende al menos una de las proteínas HSP 83-1 , MAPK y MAPK3. En WO2013011184A1 se describe una vacuna basada en una molécula quimérica que comprende la proteína PFR1 de L. infantum o un fragmento de PFR1 con epítopos específicos inmunodominantes, y que puede incluir también HSP70. ES2415516B2 se refiere a una quimera multicomponente para su uso como vacuna frente a la infección por Leishmania spp. en mamíferos, incluida la leishmaniosis cutánea y la leishmaniosis visceral, que comprende 6 genes procedentes de Leishmania infantum. H2A, H2B, H3, H4, A2 y HSP70. BR102014031331A2 propone una proteína inmonogénica recombinante que contiene epítopos inmunogénicos de varias proteínas de Leishmania: cadena alfa de la tubulina, proteínas de choque térmico HSP83.1 y HSP70 y cinesina, para su uso en la producción de vacunas, medicamentos y biofármacos para prevenir y tratar la leishmaniosis.

Se plantea, por lo tanto, la necesidad de nuevas estrategias para el desarrollo de vacunas para uso humano o para prevenir la leishmaniosis canina y nuevas soluciones. .EXPLICACIÓN DE LA INVENCIÓN

Quimera sintética multiepitópica como vacuna y tratamiento frente a leishmaniosis en mamíferos. Un aspecto de la presente invención se refiere a una quimera sintética multiepitópica que incluye múltiples epítopos de cuatro proteínas de Leishmania spp. previamente descritas como inmunogénicas. Más concretamente, se trata de epítopos de cuatro histonas nucleosomales: H2A, H2B, H3 y H4, cuyos números de acceso en GenBank son: XP 003392461, XPO01263598, XPO01463740 y XP001464339, respectivamente. Se ha realizado una selección de epítopos empleando algoritmos de programas de análisis de secuencias disponibles en la red, para elegir epítopos con alta afinidad de unión a complejos mayores de histocompatibilidad (CMH) de clase I y clase II de diferentes especies de mamíferos (epítopos promiscuos). Las moléculas del CMH son proteínas que se codifican en más de 200 genes. En cada especie de mamífero los distintos loci que codifican el CMH son muy pollmórficos; de hecho poseen la mayor variabilidad genética intraespecífica detectada en la Genética de Poblaciones. Es decir, cada locus concreto que participa en la codificación del complejo CMH posee multitud de variantes alélicas dentro de las poblaciones naturales de cada especie. El conjunto de alelos que definen una determinada combinación de CMH en un individuo se denomina haplotipo. En los seres humanos, estos genes se encuentran en distintas regiones o loci según si codifican el CMH de tipo I {loci HLA- A, HLA-B y HLA-C) o de tipo II ( loci HLA-DR, HLA-DP y HLA-DQ). Mientras que en el ratón se encuentran en la región H-2 con los loci (K, D y L) y (l-A e l-E) para clase I y II, respectivamente. El polimorfismo de moléculas de CMH va a determinar diferencias en la capacidad y afinidad para unirse a los diversos epítopos.

En esta memoria descriptiva, por CMH-I se entiende el complejo mayor de histocompatibilidad de clase I; por CMH-II se entiende el complejo mayor de histocompatibilidad de clase II. Por HLA se entiende antígenos leucocitarios humanos (el CMH humano). Por H-2 se entiende el CMH de los ratones.

El amplio abanico de epítopos parasitarios que se hacen visibles al sistema inmunológico del hospedador estimula respuestas inmunitarias leishmanicidas en modelos superiores (como pueden ser perros, ratones y humanos), constituyendo una herramienta esencial en la lucha contra diferentes formas de leishmaniosis. Tras un análisis in silico de las secuencias de las cuatro histonas mencionadas más arriba, no todos los epítopos se comportan, in vivo , tal y como se predice por los algoritmos, por lo que la correcta selección de epítopos es fundamental para obtener una respuesta inmunitaria adecuada para proteger frente a leishmaniosis. Por ello, los péptidos obtenidos como resultado del análisis in silico de las secuencias de las cuatro proteínas seleccionadas se analizaron y modificaron para obtener cuatro péptidos capaces de generar una respuesta inmunológica protectora frente a Leishmania.

Un primer análisis se basó en dos criterios: alta afinidad para el CMH-I y afinidad mantenida para el mayor número posible de alelos diferentes de los loci que codifican el CMH-I humano y murino. Un segundo análisis sirvió para Identificar, para cada una de las cuatro proteínas, epítopos de alta afinidad para los alelos de los loci que codifican el CMH-II humano y murino. En esta memoria descriptiva, por afinidad se entiende la fuerza de interacción entre cada uno de los epítopos con las diferentes alelos de los loci problema y por alta afinidad se entienden los valores de < 0,5% para el CMH-I y de < 2% para el CMH-II, siguiendo los criterios establecidos por los programas empleados en el análisis bioinformático y que comparan esta afinidad con un conjunto de 400.000 péptidos naturales aleatorios.

El siguiente paso fue un estudio pormenorizado de las secuencias preseleccionadas para identificar aquellas que se unían con alta afinidad al mayor número de alelos de los loci que codifican las moléculas del CMH de clase I humano y murino y que englobaban simultáneamente secuencias con alta afinidad de unión a un elevado número de alelos de los toci humanos y murinos que codifican el CMH de clase II.

Para finalizar, los péptidos seleccionados hasta ese momento se modificaron añadiendo aminoácidos en sus extremos hasta obtener 4 péptidos con, al menos, un epítopo de alta afinidad con un elevado número de alelos de los loci que codifican para CMH de clase I y II del hombre y el ratón. Los péptidos seleccionados, uno para cada proteína, se muestran en la Tabla 1 y están caracterizados por SEQ ID NO: 1-4, con una longitud de 15-24 aminoácidos.

Un aspecto de la presente invención se refiere a una quimera sintética multiepitópica que incluye, en una secuencia continua, los péptidos caracterizados por SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3 y SEQ ID NO: 4 organizados en cualquier orden. Por secuencia continua, se entiende que las secuencias de los 4 péptidos se sitúan una detrás de la otra sin separación entre ellas o con una separación máxima de dos aminoácidos que permitan mejorar la configuración espacial de la quimera para su procesamiento y posterior unión a los CMH. La quimera sintética multiepitópica puede tener, por lo tanto, entre 70 y 76 aminoácidos. También se refiere a quimeras sintéticas multiepitópica que presentan un 95% de identidad con cualquiera de las quimeras sintéticas multiepitópicas obtenidas al organizar en cualquier orden, de forma continua, los péptidos caracterizados por SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3 y SEQ ID NO: 4, dando lugar a quimeras de 70-76 aminoácidos. Preferentemente, la quimera sintética multiepitópica incluye los péptidos caracterizados por SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3 y SEQ ID NO: 4 en el orden caracterizado por SEQ ID NO: 5, o bien, en el mismo orden pero incluyendo hasta 2 aminoácidos entre péptidos, o bien una secuencia con un 95% de identidad con SEQ ID NO: 5, o bien una secuencia con un 95% de identidad con la secuencia que incluye los péptidos caracterizados por SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3 y SEQ ID NO: 4 en el mismo orden e incluye hasta 2 aminoácidos entre ellos.

En esta memoria descriptiva, por porcentaje de identidad de una secuencia se entiende el porcentaje de coincidencias de los mismos aminoácidos entre dos secuencias alineadas, a lo largo de toda la longitud de ambas secuencias. Estas quimeras sintéticas multiepitópicas son capaces de proteger a los animales frente a la infección por Leishmania, como muestra el examen de la respuesta inmunológica generada en ratones después de la inmunización con una de las quimeras sintéticas multiepitópicas en cuanto a los principales biomarcadores de protección, como las citoquinas proinflamatorias, la producción de inmunoglobulinas específicas de los isotipos lgG1/lgG2 y las respuestas de las células T CD4+ y CD8+.

La leishmaniosis se produce cuando hay un desequilibrio entre una respuesta inmunológica (inadecuada) y el parásito, lo que favorece la aparición de sintomatología clínica y/o la proliferación del microorganismo. La inducción o la modulación de una respuesta inmunológica adecuada permite la remisión del cuadro clínico y la efectividad del tratamiento frente a la enfermedad.

Por lo tanto, otro aspecto de la invención se refiere a una composición farmacéutica que comprende una quimera sintética multiepitópica de entre las descritas más arriba, para su uso en mamíferos y, más concretamente, para su uso en la vacunación profiláctica y/o terapéutica frente a Leishmania spp., especialmente en humanos y en perros. Además, la composición farmacéutica puede incluir otros elementos como pueden ser excipientes farmacológicamente aceptables, o bien vehículos o adyuvantes que mejoren o potencien su efecto. Entre los adyuvantes, preferentemente se utiliza saponina.

Otro aspecto de la invención se refiere a una vacuna profiláctica y/o terapéutica frente a Leishmania spp. que comprende una quimera sintética multiepitópica o una composición farmacéutica según se han descrito en los párrafos anteriores. Esta vacuna protege frente a leishmaniosis producidas por L. infantum, que origina tanto LV como LC por lo que las quimeras sintéticas multiepitópicas descritas en esta memoria y las composiciones farmacéuticas que las contienen son de interés para su uso en la elaboración de una vacuna profiláctica y/o terapéutica en humana y/o en perros. BREVE DESCRIPCIÓN DE LOS DIBUJOS

Para complementar la descripción que se está realizando y con objeto de ayudar a una mejor comprensión de las características de la invención, se acompaña como parte integrante de dicha descripción un juego de dibujos en donde, con carácter ilustrativo y no limitativo, se ha representado lo siguiente:

Figura 1.- Muestra la producción (pg/ml) de citoquinas específicas proinflamatorias (γ- interferón, IFN-γ; interleuquina-12, IL-12) o antiinflamatorias (IL-10 e IL-4) en animales inmunizados con la quimera sintética multiepitópica caracterizada por SEQ ID NO: 5 (Seq5) o inoculados con los controles Saponin o PBS y reestimulados con la quimera sintética multiepitópica caracterizada por SEQ ID NO: 5, con antígeno soluble de Leishmania (SLA) o con PBS.

Figura 2.- Muestra el porcentaje de células diana infectadas (% BMDC, células dendríticas de médula ósea) y el número de amastigotes de Leishmania presentes por célula (N°/BMDC) en cocultivos de BMDC vírgenes infectadas con L infantum y, posteriormente, cocultivadas con células de bazo de animales inmunizados con la quimera sintética multiepitópica caracterizada por SEQ ID NO: 5 (Seq5), y de animales inoculados con los controles Saponin o PBS.

Figura 3.- Muestra la carga parasitaria (Logio) en animales inmunizados con la quimera sintética multiepitópica caracterizada por SEQ ID NO: 5 (Seq5) y los animales inoculados con los controles Saponin y PBS y, posteriormente, infectados con L infantum, tanto en bazo (B) como en hígado (H).

REALIZACIÓN PREFERENTE DE LA INVENCIÓN

La presente invención se ilustra mediante los siguientes ejemplos que no pretenden ser limitativos de su alcance. Ejemplo 1. Selección de péptidos.

Para obtener la quimera peptídica multiepitópica, en primer lugar, se seleccionaron múltiples epítopos capaces de unirse con alta afinidad a las moléculas del CMH-I y el CMH-II de humanos y ratones. Para ello, se utilizaron redes neuronales artificiales para la predicción de epítopos de alta unión a moléculas del CMH-I y el CMH-II de humanos y ratones y se realizó un análisis in silico a partir de cuatro antígenos de Leishmania, las cuatro histonas: H2A, H2B, H3 y H4.

Dado que la población humana tiene una gran diversidad genética de los loci que codifican los CMH, analizamos las proteínas a estudiar con respecto a todas las variaciones alélicas que codifican los CMH humanos disponibles en las bases de datos de los programas NetMHC (versión 4.0) (Andreatta M, Nielsen M Gapped sequence alignment using artificial neural networks: application to the MHC class I system. Bioinformatics (2016) 15;32(4):511-7; Nielsen M. y col. Reliable prediction of T-cell epitopes using neural networks with novel sequence representations. Protein Sci., (2003) 12:1007-17) y NetMHCII (versión 2.3) (Jensen KK, y col. Improved methods for predicting peptide binding affinity to MHC class II molecules. Immunology (2018) 154(3):394-406) para CMH-I y CMH-II, respectivamente. Se comprobaron los diferentes alelos humanos de los loci HLA (A, B, D y E) para los epítopos de clase I, y los alelos humanos para los loci HLA (DR, DP y DQ) para los epítopos de clase II, así como los alelos de los loci H-2 de ratones para las moléculas de clase I (K, D y L ) y II (l-A, l-E) del CMH.

El análisis se realizó con cada una de las cuatro proteínas utilizadas siguiendo un protocolo semejante, que se resume a continuación. Se analizó, en primer lugar, la totalidad de la secuencia de cada proteína dividida en epítopos con un tamaño de 9 mers (aminoácidos) que cumplieran dos criterios: que presentaran alta afinidad para el CMH-I (entendiendo por afinidad la fuerza de interacción entre cada uno de los epítopos con las diferentes alelos de los loci problema) y que esta afinidad se mantuviera para el mayor número posible de alelos diferentes de los lod que codifican el CMH-I humano y murino. A continuación, se buscaron, a partir de la secuencia de cada proteína, epítopos de 15 mere con alta afinidad para los alelos de los loci que codifican el CMH-II humano y murino. De cada proteína se obtuvieron entre 100 y 133 péptidos diferentes, potencialmente útiles, a partir del programa informático. Posteriormente, se realizó un estudio pormenorizado sobre las secuencias de 15 aminoácidos obtenidas. Se analizó cuáles se unían con alta afinidad al mayor número de alelos de los loci que codifican las moléculas del CMH de clase I humano y murino, considerando alta afinidad los valores <0,5%, siguiendo los criterios establecidos por los programas empleados en el análisis bioinformático y que comparan esta afinidad con un conjunto de 400.000 péptidos naturales aleatorios. Además, se estableció que dichas secuencias tenían que englobar, simultáneamente, secuencias de 9 aminoácidos que también presentaban alta afinidad de unión a un elevado número de alelos de los loci humanos y murinos que codifican el CMH de clase II (valores de < 2% para este caso). Finalmente, algunas secuencias se alargaron añadiendo aminoácidos de forma manual en uno o en los dos extremos, sumando de uno en uno aminoácidos adyacentes a los péptidos preseleccionados de la proteína en un número variable hasta conseguir que en cada péptido existiera, al menos, un epítopo de alta afinidad con un gran número de alelos (Tabla 2) de los loci donde se encuentran todos los genes que codifican CMH de clase I y de clase II del hombre y el ratón.

Tabla 1.

Tabla 2. Número de variantes alélicas de cada loci con los que muestra alta afinidad cada uno de los péptidos.

Como resultado, seleccionamos cuatro péptidos (uno para cada proteína, como se muestra en la Tabla 1), caracterizados por SEQ ID NO: 1-4 y con una longitud de aminoácidos de 15-24, que tienen el mayor número de epítopos de alta afinidad y de unión restringida al CMH-I (entendiendo por restringido que se une esencialmente al CMH-I), así como al menos un epítopo adyacente o solapado de CMH-II restringido también por su alta puntuación, de acuerdo con los valores de afinidad descritos anteriormente, y con valores elevados en cuanto a su afinidad por el mayor número de alelos humanos y murinos en los análisis de los programas bioinformáticos. Estas características se muestran en la Tabla 2. Ejemplo 2. Construcción de una quimera sintética multiepitópica.

Una vez seleccionados los 4 péptidos multiepitópicos según el ejemplo 1, se combinaron en una quimera según el orden: SEQ ID NO: 1 - 2 - 3 - 4, dando lugar a la secuencia aminoacídica TAVLEYLTAELLELSRSLKAINAQMSHRTMKIVNSYVEGL RFQSSAIMALQEITRGCVRRMARRGGVK, caracterizada por SEQ ID NO: 5, que contiene epítopos de alta unión de las cuatro histonas H2A, H2B, H3 y H4.

Utilizando los programas informáticos detallados en el ejemplo 1, se analizó en profundidad la quimera caracterizada por SEQ ID NO: 5, comprobando que conservaba los epítopos de clase I y II del CMH. Además, se analizó empleando un nuevo software de predicción de epítopos con afinidad para unión a linfocitos T y linfocitos B (NetTepi, versión 1.0) (Trolle T, Nielsen M. NetTepi: an integrated method for the prediction of T cell epitopes. Immunogenetics (2014). 66(7-8):449-56). La quimera caracterizada por SEQ ID NO: 5 fue positiva para 9 de los 13 alelos diferentes del CMH humano (HLA) de los supertipos comunes HLA-A y B. Se consideran supertipos comunes aquellas agrupaciones de variaciones alélicas con características estructurales y funcionales comunes que les permiten reconocer epítopos peptídicos muy similares. Esta quimera presentó, además, un epítopo de 9 mers de alta afinidad para, al menos, una variante alélica de los loci que codifican las moléculas del CMH-I de chimpancé, macaco, vaca y cerdo. Finalmente, y para descartar posibles efectos colaterales de autoinmunidad, se hizo un análisis de la quimera multiepitópica utilizando la herramienta BLAST ( Basic Local Alignment Search Tool ) para descartar que existiera una identidad superior al 90% con el proteoma del hombre y del ratón.

Ejemplo 3. Inmunización con la quimera sintética multiepitópica caracterizada por SEQ ID NO: 5.

Para evaluar la inmunogenicidad de la quimera sintética multiepitópica caracterizada por SEQ ID NO: 5, se realizaron inoculaciones por vía subcutánea en tres grupos de ratones (n = 8/grupo). En los animales de un grupo, denominado Seq5, se inocularon 50 μg de la quimera sintética caracterizada por SEQ ID NO: 5 y 25 μg de saponina, como adyuvante; en los animales de otro grupo, grupo control Saponin, se inocularon 25 μg de saponina; en el grupo control PBS, se le inoculó PBS (lampón en el que se vehiculizaron tanto la quimera sintética multiepitópica caracterizada por SEQ ID NO: 5 como el adyuvante). La inoculación se realizó en la almohadilla plantar trasera izquierda los días -60, -45 y -30, con respecto al día cero de infección, con un volumen total de 50 μl.

Ejemplo 4. Evaluación de la inmunogenicidad de la quimera sintética multiepitópica caracterizada por SEQ ID NO: 5.

Los ratones inmunizados con la quimera caracterizada por SEQ ID NO: 5, siguiendo las indicaciones del ejemplo 3, presentaron una respuesta inmunitaria caracterizada por un perfil de respuesta celular Th1 de protección con producción de citoquinas proinflamatorias (IFN-γ, IL-12) frente al perfil presentado por los controles Saponin y PBS que tuvieron una respuesta inmunitaria de tipo Th2 predominantemente, compatible con un perfil de susceptibilidad frente a una infección por Leishmania y caracterizada por la producción de citoquinas antiinflamatorias (IL-4, IL-10). El predominio de la respuesta de tipo Th1 coincide con una reorientación de la respuesta humoral específica frente a la quimera sintética multiepitópica al isotipo lgG2a relacionada con una respuesta Th1. El desplazamiento de la respuesta inmunitaria en el grupo inmunizado con la quimera caracterizada por SEQ ID NO: 5, se correlaciona con una mayor actividad leishmanicida en células diana infectadas con Leishmania.

En la figura 1 se muestra la producción de citoquinas específicas frente a la reestimulación con la quimera caracterizada por SEQ ID NO: 5 (indicada en la figura como Seq5) en animales inmunizados según se describe en el ejemplo 3. Se utilizaron células dendríticas procedentes de médula ósea (BMDC) vírgenes y estimuladas con antígeno soluble de Leishmania (SLA; producido con los sobrenadantes obtenidos después de haber lisado cultivos de promastigotes de Leishmania obtenidos después de la su sonicación y posterior centrifugación), barras grises; o estimuladas con la quimera caracterizada por SEQ ID NO: 5, barras blancas; como control negativo se utilizaron BMDC sin estimular, indicadas como N-E con barras negras. Las BMDC se cocultivaron con células del bazo, esplenocitos, de los animales inmunizados previamente como se indica en el ejemplo 3. La producción de citoquinas (pg/ml) se cuantificó mediante la técnica de ELISA. Los datos se presentan como la media ± desviación estándar (S.D). Las almohadillas indican diferencias estadísticamente significativas (#, P< 0,05; ##, P< 0,001) entre los grupos inmunizados y los dos grupos de control (Saponin y PBS). El asterisco indica diferencias estadísticamente significativas (*, P < 0,05; **, P< 0,001). En la figura 1 se refleja cómo los esplenocitos procedentes del grupo inmunizado con la quimera caracterizada por SEQ ID NO: 5 producen una mayor cantidad de IFN-γ, IL-12 y que esta producción es específica, en respuesta a una estimulación previa con la quimera caracterizada por SEQ ID NO: 5 o con un conjunto de antígenos totales de Leishmania (SLA), pero no ocurre al estimular con PBS. Los esplenocitos procedentes de animales inmunizados con Saponina o PBS no muestran esta producción de citoquinas proinflamatorias ante ninguno de los estímulos (SLA o quimera caracterizada por SEQ ID NO: 5).

En la figura 2, se observa el porcentaje de células diana infectadas (% BMDC) y el número de amastigotes intracelulares detectados por célula (N°/BMDC) a las 24 y 72 horas de incubación postinfección. La actividad leishmanicida de la quimera caracterizada por SEQ ID NO: 5 (indicada en la figura como Seq5) se evaluó en BMDC. Las BMDC vírgenes infectadas con L infantum se cocultivaron con esplenocitos de animales previamente inmunizados con la quimera caracterizada por SEQ ID NO: 5 como se indica en el ejemplo 3, y con esplenocitos de animales previamente inoculados con los dos controles utilizados según el ejemplo 5. Los parámetros de células infectadas y número de amastigotes intracelulares se determinaron por microscopía óptica. Los datos se presentan como la media ± S.D. Las almohadillas indican diferencias estadísticamente significativas (#, P < 0,05; ##, P < 0,001) entre los grupos inmunizados (barras negras) y los dos grupos de control: Saponin (barras grises) y PBS (barras blancas). Como se muestra en la figura 2, se observa un incremento significativo en el potencial leishmanicida que inducen en las BMDC infectadas con L. infantum, de los esplenocitos procedentes de los animales inmunizados con la quimera SEQ ID NO: 5 con respecto a los esplenocitos de los animales de los grupos controles. El incremento de la capacidad leishmanicida se observa con una notable reducción del porcentaje de BMDC infectadas a 24 y 72 horas, así como un menor número de amastigotes intracelulares. Este resultado se correlaciona con la respuesta inmunitaria protectora predominante en el grupo inmunizado con SEQ ID NO: 5 tal y como se describe más arriba en este ejemplo y figura 1.

Ejemplo 5. Protección frente a L Infantum en el modelo murino de leishmaniosis visceral. 30 días después de la última inmunización realizada según se describe en el ejemplo 3, se realizó una infección con 5x10 5 promastigotes infectantes de L infantum, por vía intravenosa, en los 3 grupos de animales (que hemos denominado Seq5, Saponin y PBS). Trascurridas 6 semanas desde la infección, se realizó la eutanasia de los animales y se valoró la carga parasitaria en los órganos diana de la LV. El recuento de parásitos se realizó mediante diluciones decimales de macerados de bazo e hígado, por separado, y su posterior observación al microscopio. Como se puede apreciar en la figura 3, se observó que los animales inmunizados con la quimera caracterizada por SEQ ID NO: 5 (Seq5) presentaron una carga de parásitos menor tanto en el bazo (B) como en el hígado (H), en comparación con los grupos Saponin y PBS. Es decir, la inmunización con SEQ NO: 5 es capaz de disminuir drásticamente la cantidad de Leishmania que está presente en hígado y bazo con respecto a los grupos controles.

Por lo tanto, concluimos que la respuesta inmunológica inducida durante la inmunización con la quimera caracterizada por SEQ ID NO: 5 es capaz de proteger frente a una infección con Leishmania y, más específicamente, con L. infantum.

TEXTO LIBRE DE LA LISTA DE SECUENCIAS SEQ ID NO: 5 Secuencia artificial

Quimera multiepitópica compuesta por SEQ ID NO: 1, 2, 3 y 4 de Leishmania infantum