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Title:
USE OF URIC ACID FOR A CELL CULTURE IN AN AEROBIC ATMOSPHERE NOT SUPPLEMENTED WITH CO2
Document Type and Number:
WIPO Patent Application WO/2018/193186
Kind Code:
A1
Abstract:
The present invention relates to a method for in vitro culture of a line of eukaryotic cells of a multicellular organism, characterised in that uric acid is added to the cell culture medium and the culture is carried out in an aerobic atmosphere not supplemented with CO2, the multiplication of said cells being capable of being improved by culture in an atmosphere supplemented with CO2, in the absence of uric acid in said culture medium. In particular, an intracellular culture of microorganisms is produced in said cells in a cell culture medium.

Inventors:
RAOULT DIDIER (FR)
LA SCOLA BERNARD (FR)
Application Number:
PCT/FR2018/050914
Publication Date:
October 25, 2018
Filing Date:
April 11, 2018
Export Citation:
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Assignee:
FOND MEDITERRANEE INFECTION (FR)
UNIV AIX MARSEILLE (FR)
ASSIST PUBLIQUE HOPITAUX DE MARSEILLE (FR)
CENTRE NAT RECH SCIENT (FR)
INST NAT SANTE RECH MED (FR)
International Classes:
C12N5/00
Domestic Patent References:
WO2015162377A12015-10-29
WO2015162366A12015-10-29
WO2014064359A12014-05-01
WO2015162377A12015-10-29
WO2014064259A12014-05-01
Foreign References:
FR3020378A12015-10-30
Other References:
ANONYMOUS: "Uric Acid in Cell Culture", 4 June 2013 (2013-06-04), XP055177496, Retrieved from the Internet [retrieved on 20150318]
N. DIONE ET AL: "A quasi-universal medium to break the aerobic/anaerobic bacterial culture dichotomy in clinical microbiology", CLINICAL MICROBIOLOGY AND INFECTION., vol. 22, no. 1, 1 January 2016 (2016-01-01), United Kingdom, Switzerland, pages 53 - 58, XP055361668, ISSN: 1198-743X, DOI: 10.1016/j.cmi.2015.10.032
VILCHÈZE CATHERINE; TRAVIS HARTMAN; BRIAN WEINRICK, AND WILLIAM R. JACOBS JR, NAT COMMUN, vol. 4, 2013, pages 1881
YURI Y. SAUTIN; RICHARD J. JOHNSON, NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES NUCLEIC ACIDS, vol. 27, no. 6, June 2008 (2008-06-01), pages 608 - 619
FENOLLAR, F.; FOURNIER, P.E.; RAOULT, D.: "Molecular détection of Coxiella burnetii in the sera of patients with Q fever endocarditis or vascular infection", J. CLIN. MICROBIOL., vol. 42, no. 11, 2004, pages 4919 - 24
HARRUS, S.; PERLMAN-AVRAHAMI, A.; MUMCUOGLU, K.Y.; MORICK, D.; BANETH, G.: "Molecular détection of Rickettsia massiliae, Rickettsia sibirica mongolitimonae and Rickettsia conorii israelensis in ticks from Israel", CLIN MICROBIOL INFECT, vol. 17, no. 2, 2011, pages 176 - 80
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STAGGEMEIER, R.; BORTOLUZZI, M.; HECK, T.M.D.S.; SPILKI, F.R.; ALMEIDA, S.E. DE M.: "quantitative vs. conventional pcr for détection of human adenoviruses in water and sediment samples", REV. INST. MED. TROP. SAO PAULO, vol. 57, no. 4, 2015, pages 299 - 303
Attorney, Agent or Firm:
DOMANGE, Maxime et al. (FR)
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Claims:
REVENDICATIONS

1. Procédé de culture in vitro de lignée de cellules eucaryotes d'organisme pluricellulaire caractérisé en ce que l'on ajoute dans le milieu de culture cellulaire de l'acide urique et on réalise la culture sous une atmosphère d'air ambiant non supplémentée en C02, la multiplication des dites cellules étant apte à être améliorée par culture sous atmosphère supplémentée en C02 en l'absence d'acide urique dans le dit milieu de culture.

2. Procédé de culture cellulaire in vitro selon la revendication 1 caractérisé en ce qu'on réalise une culture intracellulaire de microorganismes dans des dites cellules en milieu de culture cellulaire contenant de l'acide urique sous une atmosphère d'air ambiant non supplémentée en C02.

3. Procédé selon la revendication 1 ou 2, caractérisé en ce que l'acide urique est mis en œuvre à une concentration d'au moins 0,4 g/L, de préférence encore de 0,4 à 1 g/L.

4. Procédé selon l'une des revendications 1 à 3, caractérisé en ce qu'on réalise une culture intracellulaire d'un microorganisme choisi parmi les bactéries intracellulaires strictes, les virus et les parasites. 5. Procédé selon l'une des revendications 2 à 4, caractérisé en ce qu'on réalise une culture intracellulaire d'un dit microorganisme dans un récipient ouvert sous une atmosphère d'air ambiant non supplémenté en C02 et on ferme le récipient après 24heures de culture. 6. Procédé selon l'une des revendications 2 à 5, caractérisé en ce on réalise une culture intracellulaire d'une bactérie intracellulaire stricte choisie parmi les genres Rickettsia, Orientia, Lawsonia, Coxiella, Ehrlichia, Chlamydia, Chlamydiophila, Anaplasma et Neorickettsia.

7. Procédé selon la revendication 6, caractérisé en ce qu'on réalise une culture intracellulaire d'une bactérie intracellulaire stricte choisie parmi Coxiella burnetii et une espèce Rickettsia sp.

8. Procédé selon l'une des revendications 2 à 5, caractérisé en ce qu'on réalise une culture intracellulaire d'un virus choisi parmi les familles Poxviridae, Herpesviridae, Adenoviridae,Papillomaviridae, Polyomaviridae, Parvoviridae, Picornaviridae, Caliciviridae, Astroviridae, Flaviviridae, Togaviridae, Coronaviridae, Paramyxoviridae, Rhabdo viridae, Filo viridae, Orthom yxo viridae, A rena viridae, Bunyaviridae, Reoviridae, Hepadnaviridae et Retroviridae.

9. Procédé selon la revendication 8, caractérisé en ce que le virus est un adénovirus.

10. Procédé selon l'une des revendications 2 à 5, caractérisé en ce qu'on réalise une culture intracellulaire d'un parasite choisi parmi Plasmodium, Apicomplexa et Leishmania.

11. Procédé selon la revendication 10, caractérisé en ce que le dit parasite est Plasmodium falciparum.

12. Procédé selon l'une des revendications 1 à 9, caractérisé en ce qu'on réalise une culture de cellules choisies parmi les lignées 3T6, 3T3, BA886, BHK21, Caco-2, CE, CLC, CRL1439, CRL1442, DF1, DH82, EC2, EC53, HEL, Hela, Hep2, HL60, HT29, J774, Jurkat, L929, Mac Coy, MRC5, MSDHP, P388, Raw264, Tatoo, TF1, THP1, U937, VERO, MDCK, BGM, MA104, ViroE6 et CLNhll.4

13. Procédé selon la revendication 12, caractérisé en ce que les cellules sont choisies parmi les cellules de fibroblastes humains de la lignée HEL, les cellules fibroblastiques de souris de la lignée L929, les cellules de reins de singe de la lignée Vero et les cellules de type fibroblastes de la lignée MRC5.

14. Procédé de culture selon l'une des revendications 10 ou 11 caractérisé en ce que les dites cellules sont des érythrocytes humains et on réalise une culture intracellulaire d'un parasite du genre Plasmodium, de préférence Plasmodium falciparum, dans un milieu de culture contenant de l'acide urique sous une atmosphère non supplémentée en C02 et non diminuée en 02.

15. Milieu de culture utile pour un procédé selon l'une des revendications 1 à 14 caractérisé en ce qu'il comprend un milieu de culture de base pour culture cellulaire, le dit milieu de culture de base étant enrichi en acide urique à une concentration d'acide urique d'au moins 0,1 g/L, le dit milieu de culture de base étant apte à permettre la culture des dites cellules eucaryotes par culture sous atmosphère supplémentée en C02 en l'absence d'acide urique dans le dit milieu de culture de base. 16. Milieu de culture selon la revendication 15 caractérisé en ce qu'il comprend une concentration d'acide urique de 0,4 à 1 g/L.

17. Milieu de culture selon la revendication 15 ou 16 caractérisé en ce que le dit milieu de culture de base est un milieu de culture cellulaire comprenant au moins les composants suivants : - une pluralité des sels inorganiques choisis notamment parmi les chlorure de calcium, nitrate de calcium, nitrate ferrique, sulfate de magnésium, chlorure de potassium, bicarbonate de sodium, chlorure de sodium et phosphate de sodium, de préférence au moins 4 dits sels inorganiques; - une pluralité d'acides aminés choisis notamment parmi les arginine, cystine, glycine, histidine, isoleucine, leucine, lysine, méthionine, phénylalanine, thréonine, tryptophane, tyrosine, valine, asparagine, aspartate, glutamine, acide glutamique, proline, sérine et valine, de préférence l'ensemble des dits acides aminés; - une pluralité de vitamines choisies notamment parmi les choline, acide folique, inositol, niacinamide, nicotinamide (acide pantothénique, pyridoxal, pyridoxine, riboflavine, thiamine, biotine, acide aminobenzoique et cobalamine, de préférence au moins 3 dites vitamines; et

- une source d'hydrate de carbone, de préférence un sucre, notamment du glucose.

18. Milieu de culture selon la revendication 17 caractérisé en ce que le dit milieu de culture de base est choisi parmi les milieux MEM, DMEM, RPMI et IMDM.

19. Milieu de culture selon l'une des revendications 15 à 18 caractérisé en ce qu'il ne contient pas de composé antioxydant additionnel dans le dit milieu de culture.

REVENDICATIONS MODIFIÉES

reçues par le Bureau international le 08 Août 2018 (08.08.2018)

1. Procédé de culture in vitro de lignée de cellules eucaryotes d'organisme pluricellulaire caractérisé en ce que l'on ajoute dans le milieu de culture cellulaire de l'acide urique à une concentration d'au moins 0.1 g/L et on réalise la culture sous une atmosphère d'air ambiant non supplémentée en C02, la multiplication des dites cellules étant apte à être améliorée par culture sous atmosphère supplémentée en C02 en l'absence d'acide urique dans le dit milieu de culture.

2. Procédé de culture cellulaire in vitro selon la revendication 1 caractérisé en ce qu'on réalise une culture intracellulaire de microorganismes dans des dites cellules en milieu de culture cellulaire contenant de l'acide urique sous une atmosphère d'air ambiant non supplémentée en C02.

3. Procédé selon la revendication 1 ou 2, caractérisé en ce que l'acide urique est mis en œuvre à une concentration d'au moins 0,4 g/L, de préférence encore de 0,4 à 1 g/L.

4. Procédé selon l'une des revendications 1 à 3, caractérisé en ce qu'on réalise une culture intracellulaire d'un microorganisme choisi parmi les bactéries intracellulaires strictes, les virus et les parasites. 5. Procédé selon l'une des revendications 2 à 4, caractérisé en ce qu'on réalise une culture intracell ulaire d'un dit microorganisme dans un récipient ouvert sous une atmosphère d'air ambiant non supplémenté en C02 et on ferme le récipient après 24heures de culture. 6. Procédé selon l'une des revendications 2 à 5, caractérisé en ce on réalise une culture intracellulaire d'une bactérie intracellulaire stricte choisie parmi les genres Rickettsia, Orientia, Lawsonia, Coxiella, Ehrlichia, Chlamydia, Chlamydiophila, Anaplasma et Neorickettsia.

7. Procédé selon la revendication 6, caractérisé en ce qu'on réalise une culture intracellulaire d'une bactérie intracellulaire stricte choisie parmi Coxiella burnetii et une espèce Rickettsia sp.

8. Procédé selon l'une des revendications 2 à 5, caractérisé en ce qu'on réalise une culture intracellulaire d'un virus choisi parmi les familles Poxviridae, Herpesviridae, Adenoviridae,Papillomaviridae, Polyomaviridae, Parvoviridae, Picornaviridae, Caliciviridae, Astroviridae, Flaviviridae, Togaviridae, Coronaviridae, Paramyxoviridae, Rhabdoviridae, Filoviridae, Orthomyxoviridae, Arenaviridae, Bunyaviridae, Reoviridae, Hepadnaviridae et Retroviridae.

9. Procédé selon la revendication 8, caractérisé en ce que le virus est un adénovirus.

10. Procédé selon l'une des revendications 2 à 5, caractérisé en ce qu'on réalise une culture intracellulaire d'un parasite choisi parmi Plasmodium, Apicomplexa et Leishmania.

11. Procédé selon la revendication 10, caractérisé en ce que le dit parasite est Plasmodium falciparum.

12. Procédé selon l'une des revendications 1 à 9, caractérisé en ce qu'on réalise une culture de cellules choisies parmi les lignées 3T6, 3T3, BA886, BHK21, Caco-2, CE, CLC, CRL1439, CRL1442, DF1, DH82, EC2, EC53, HEL, Hela, Hep2, H L60, HT29, J774, Jurkat, L929, Mac Coy, M RC5, MSDH P, P388, Raw264, Tatoo, TF1, THP1, U937, VERO, MDCK, BGM, MA104, ViroE6 et CLNh l l .4

13. Procédé selon la revendication 12, caractérisé en ce que les cellules sont choisies parmi les cellules de fibroblastes humains de la lignée HEL, les cell ules fibroblastiques de souris de la lignée L929, les cellules de reins de singe de la lignée Vero et les cellules de type fibroblastes de la lignée MRC5.

14. Procédé de culture selon l'une des revendications 10 ou 11 caractérisé en ce que les dites cellules sont des érythrocytes humains et on réalise une culture intracellulaire d'un parasite du genre Plasmodium, de préférence Plasmodium falciparum, dans un milieu de culture contenant de l'acide urique sous une atmosphère non supplémentée en C02 et non diminuée en 02.

15. Milieu de culture utile pour un procédé selon l'une des revendications 1 à 14 caractérisé en ce qu'il comprend un milieu de culture de base pour culture cellulaire, le dit milieu de culture de base étant enrichi en acide urique à une concentration d'acide urique d'au moins 0, 1 g/L, le dit milieu de culture de base étant apte à permettre la culture des dites cellules eucaryotes par culture sous atmosphère supplémentée en C02 en l'absence d'acide urique dans le dit milieu de culture de base.

16. Milieu de culture selon la revendication 15 caractérisé en ce qu'il comprend une concentration d'acide urique de 0,4 à 1 g/L.

17. Milieu de culture selon la revendication 15 ou 16 caractérisé en ce que le dit milieu de culture de base est un milieu de culture cellulaire comprenant au moins les composants suivants :

- une pluralité des sels inorganiques choisis notamment parmi les chlorure de calcium, nitrate de calcium, nitrate ferrique, sulfate de magnésium, chlorure de potassium, bicarbonate de sodium, chlorure de sodium et phosphate de sodium, de préférence au moins 4 dits sels inorganiques;

- une pluralité d'acides aminés choisis notamment parmi les arginine, cystine, glycine, histidine, isoleucine, leucine, lysine, méthionine, phénylalanine, thréonine, tryptophane, tyrosine, valine, asparagine, aspartate, glutamine, acide glutamique, proline, sérine et valine, de préférence l'ensemble des dits acides aminés; - une pluralité de vitamines choisies notamment parmi les choline, acide folique, inositol, niacinamide, nicotinamide (acide pantothénique, pyridoxal, pyridoxine, riboflavine, thiamine, biotine, acide aminobenzoique et cobalamine, de préférence au moins 3 dites vitamines; et

- une source d'hydrate de carbone, de préférence un sucre, notamment du gl ucose.

18. Milieu de culture selon la revendication 17 caractérisé en ce que le dit milieu de culture de base est choisi parmi les milieux MEM, DMEM, RPMI et IMDM .

19. Milieu de culture selon l'une des revendications 15 à 18 caractérisé en ce qu'il ne contient pas de composé antioxydant additionnel dans le dit milieu de culture.

Description:
Utilisation d'acide urique pour une culture cellulaire sous atmosphère aérobie non supplémentée en C0 2

La présente invention concerne des milieux et procédés de culture cellulaire ou de culture intracellulaire de microorganismes et notamment la supplémentation des milieux de culture cellulaire classiques pour la culture cellulaire ou la culture intracellulaire de microorganismes permettant de mettre en œuvre une culture sous atmosphère non supplémentée en C0 2 .

La présente invention concerne plus particulièrement des milieux et procédés de culture autorisant la culture de lignée de cellules eucaryotes d'organisme pluricellulaire et la propagation intracellulaire de microorganismes dans des dites cellules eucaryotes d'organisme pluricellulaire, notamment de bactéries intracellulaires, de virus ou parasites qui s'y multiplient en l'absence de C0 2 . Les cultures cellulaires, que cela soit pour la culture de cellules eucaryotes seules ou utilisées comme support pour la culture et l'isolement de microorganismes, notamment de bactéries intracellulaires strictes et de virus, nécessitent souvent l'utilisation d'une atmosphère contenant du C0 2 , notamment dans de l'air contenant 5% de C0 2 . L'objectif est, par la présence de C0 2 dans l'atmosphère de culture, de tamponner le milieu et équilibrer le pH en compensant l'augmentation de l'acidité dans le milieu de culture (production de H + ) résultant du métabolisme cellulaire avec la production de HC03 " . Cette augmentation d'acidité conduit autrement (en absence de C0 2 ) à une mortalité des cellules. Cette supplémentation en C0 2 est surtout nécessaire les 24 premières heures. Ensuite si la boite de culture est fermée hermétiquement ce besoin disparait.

La culture de certains microorganismes tels que parasites tel que du genre Plasmodium nécessite en sus du C0 2 l'utilisation d'azote ou autre gaz inerte visant à abaisser davantage encore le taux d'oxygène à 10% ce qui nécessite par exemple l'utilisation d'étuves trigaz (N 2 85%, 0 2 10%, C0 2 5%).

La mise en œuvre de C0 2 pour ce type de culture cellulaire présente les inconvénients suivants. Tout d'abord, cela requière une installation coûteuse en termes de dispositifs divers à utiliser (tuyaux, manodétendeurs, alarmes, enceintes d'incubateur spéciales, voire une étuve trigaz) ainsi que la consommation de fluide gazeux, le C0 2 en bouteille représentant un coût consommable non négligeable. De surcroit, lorsque cette production de cellules est utilisée pour l'isolement et la propagation de microorganismes dangereux exigeant des niveaux de sécurité élevés, notamment pour des bactéries intracellulaires et virus de classe 3, se pose le problème de l'utilisation du C0 2 dans un laboratoire de classe NSB3. Dans ces laboratoires, il n'est pas possible de faire entrer les fûts de C0 2 et donc il est nécessaire de déployer un système de canalisations amenant le C0 2 à l'intérieur depuis l'extérieur. Par ailleurs, une fuite de C0 2 dans un laboratoire confiné présente des risques. En cas de fuite, le taux d'oxygène diminue avec risque d'asphyxie pour le personnel. Dans tous les cas, cela justifie l'installation de détecteurs de C0 2 branchés sur alarmes.

Enfin, dans des zones mal équipées comme des laboratoires de campagne en expédition de terrain, l'utilisation de C0 2 est impossible tout autant que les matériels tels qu'étuves trigaz. Le but de la présente invention est de fournir des conditions améliorées alternatives de culture cellulaire permettant de se passer de la mise en œuvre d'une culture cellulaire sous atmosphère C0 2 et ainsi éviter toutes les contraintes de matériels mentionnées ci-dessus pour cultiver des cellules et des microorganismes tel que bactéries intracellulaires, virus et parasites qui se multiplient à l'intérieur des dites cellules le cas échéant.

On a décrit dans WO 2014/064359 d'améliorer et faciliter les conditions de croissance en culture acellulaire des bactéries dont la croissance est sensible à la tension en oxygène et notamment des bactéries qui tolèrent mal des tensions élevées d'oxygène et pour lesquelles une croissance optimale de la dite bactérie requière une atmosphère d'incubation à teneur en oxygène relativement réduite par rapport à la teneur en oxygène de l'air, lesdites bactéries étant choisies parmi les bactéries anaérobies, y compris les bactéries anaérobies strictes, et les bactéries microaérophiles qui ne sont capables de cultiver que sous une atmosphère comprenant une concentration d'oxygène diminuée, le plus communément à environ 2- 2,5%. Dans WO 2014/064359, on a proposé d'ajouter certains composés antioxydants à savoir l'acide ascorbique, le glutathion et l'hydrosulfure de sodium dans un milieu de culture acellulaire pouvait permettre d'améliorer la croissance des dites bactéries et/ou de cultiver des dites bactéries en présence de quantités plus élevées d'oxygène. Dans WO 2014/ 064359, on fournit donc un procédé de culture in vitro de bactéries en milieu de culture acellulaire, de telles bactéries anaérobies ou microaérophiles intracellulaires, caractérisé en ce que l'on ajoute dans le dit milieu de culture acellulaire un composé antioxydant choisi parmi l'acide ascorbique, le glutathion et l'hydrosulfure de sodium, et l'on cultive la dite bactérie dans ledit milieu de culture en présence d'oxygène.

Dans certaines conditions l'acide ascorbique apparaît toxique et/ou trop acide vis à vis de certaines bactéries et/ou pour certain milieux de culture à fortes doses. Ceci a été mis en évidence notamment pour Mycobacterium tuberculosis (1). D'autre part, le glutathion est très onéreux. Dans WO 2015/162377, il a été décrit qu'un effet équivalent sur la croissance des dites bactéries anaérobies ou bactéries microaérophiles sensibles à l'oxygène pouvait également être obtenu en ajoutant dans le dit milieu de culture de l'acide urique (7,9-dihydro- lH-purine-2,6,8(3H)-trione ou 2,6,8-trioxypurine) à la place des composés antioxydants décrits dans WO 2014/064259.

L'acide urique, bien qu'ayant dans certaines conditions des propriétés antioxydantes, n'est pas classiquement utilisé en microbiologie à titre de composé antioxydant car dans certaines conditions il présente au contraire des propriétés oxydantes (2).

Selon la présente invention, on a découvert que l'ajout d'acide urique à forte dose dans un milieu de culture cellulaire permet d'éviter la mise en œuvre d'une atmosphère de culture contenant du C0 2 . L'acide urique a des capacités de type anti-oxydantes mais on ne pouvait prévoir qu'il pourrait jouer le rôle de tampon du milieu de culture cellulaire généralement dévolu au C0 2 . Il est possible qu'il protège les cellules d'un effet délétère de dérivés de l'oxygène, le temps que par leur activité propre de détoxification les cellules tamponnent elle-même le milieu. Cet effet non totalement élucidé ne pouvait pas être déduit de l'état de l'Art.

Plus précisément, la présente invention fournit un procédé de culture de lignée de cellules eucaryotes d'organisme pluricellulaire in vitro caractérisé en ce que l'on ajoute dans le milieu de culture cellulaire de l'acide urique et on réalise la culture sous une atmosphère d'air ambiant non supplémentée en C0 2 , la multiplication des dites cellules étant apte à être améliorée par culture sous atmosphère supplémentée en C0 2 , notamment dans de l'air enrichi à 5% de C0 2 notamment au moins dans les premières 24 heures, en l'absence d'acide urique dans le dit milieu de culture. Plus particulièrement, on réalise une culture intracellulaire de microorganismes dans des dites cellules en dit milieu de culture cellulaire contenant de l'acide urique sous une atmosphère d'air ambiant non supplémentée en C0 2 .

De préférence, l'acide urique est mis en œuvre à une concentration d'au moins 0,1 g/L, de préférence encore de 0,4 à 1 g/L. Plus particulièrement, on réalise une culture intracellulaire d'un microorganisme choisi parmi les bactéries intracellulaires strictes, les virus et les parasites.

Plus particulièrement, on réalise une culture intracellulaire d'un dit microorganisme dans un récipient ouvert sous une atmosphère d'air ambiant non supplémenté en C0 2 et on ferme le récipient après 24h de culture.

Dans un mode de réalisation, on réalise une culture intracellulaire d'une bactérie intracellulaire stricte choisie parmi les genres Rickettsia, Orientia, Lawsonia, Coxiella, Ehrlichia, Chlamydia, Chlamydiophila, Anaplasma et Neorickettsia. Il s'agit là de bactéries intracellulaires strictes d'intérêt médical et vétérinaire.

Plus particulièrement encore, on réalise une culture intracellulaire d'une bactérie intracellulaire stricte choisie parmi Coxiella burnetii et une espèce Rickettsia sp. Dans un autre mode de réalisation, on réalise une culture intracellulaire d'un virus choisi parmi les familles Poxviridae, Herpès viridae, A deno viridae, Papilloma viridae, Polyoma viridae, Parvo viridae, Picornaviridae, Caliciviridae, Astroviridae, Fia vi viridae, Toga viridae, Corona viridae, Paramyxoviridae, Rhabdoviridae, Filoviridae, Orthomyxoviridae, Arenaviridae, Bunyaviridae, Reoviridae, Hepadnaviridae et Retroviridae. Il s'agit là de virus d'intérêt médical et vétérinaire.

Plus particulièrement encore, le virus est un adénovirus. Dans un autre mode de réalisation, on réalise une culture d'un parasite choisi parmi Plasmodium, Apicomplexa et Leishmania. P\us particulièrement encore, le dit parasite est Plasmodium falciparum.

Plus particulièrement encore, on réalise une culture de cellules choisies parmi les lignées 3T6, 3T3, BA886, BHK21, Caco-2, CE, CLC, CRL1439, CRL1442, DF1, DH82, EC2, EC53, HEL, Hela, Hep2, HL60, HT29, J774, Jurkat, L929, Mac Coy, MRC5, MSDHP, P388, Raw264, Tatoo, TF1, THP1, U937, VERO, MDCK, BGM, MA104, ViroE6 et CLNhll.

Ces cellules sont appropriées pour la culture intracellulaire des dits microorganismes excepté les parasites du genre Plasmodium pour lesquels on utilise des érythrocytes humains.

Plus particulièrement encore, les cellules sont choisies parmi les cellules de fibroblastes humains de la lignée HEL, les cellules fibroblastiques de souris de la lignée L929, des cellules de reins de singe de la lignée VERO et les cellules de type fibroblastes de la lignée MRC5, notamment pour réaliser la culture d'une bactérie intracellulaire ou un virus.

Plus particulièrement encore, les dites cellules sont des érythrocytes humains (globules rouges) pour réaliser la culture intracellulaire d'un parasite du genre Plasmodium, notamment Plasmodium falciparum dans un milieu de culture contenant de l'acide urique sous une atmosphère non supplémentée en C0 2 et non diminuée en 0 2 . En revanche, en l'absence d'acide urique, la multiplication de Plasmodium falciparum requiert une atmosphère supplémentée en C0 2 et diminuée en oxygène, notamment une atmopshère trigaz 10%O 2 , 85%N 2 et 5%C0 2 , en l'absence d'acide urique dans le dit milieu de culture.

La présente invention fournir également un milieu de culture utile pour un procédé selon l'invention caractérisé en ce qu'il comprend un milieu de culture de base pour culture cellulaire, le dit milieu de culture de base étant enrichi en acide urique, le dit milieu de culture de base étant apte à permettre la culture des dites cellules eucaryotes par culture sous atmosphère supplémentée en C0 2 , de préférence dans de l'air enrichi à 5% de C0 2 , en l'absence d'acide urique dans le dit milieu de culture de base. Plus particulièrement, le milieu de culture selon l'invention comprend une concentration d'acide urique d'au moins 0,1 g/L, de préférence encore de 0,4 à 1 g/L.

Dans un mode de réalisation, le dit milieu de culture de base est un milieu de culture cellulaire comprenant au moins les composants suivants :

- une pluralité des sels inorganiques choisis notamment parmi les chlorure de calcium, nitrate de calcium, nitrate ferrique, sulfate de magnésium, chlorure de potassium, bicarbonate de sodium, chlorure de sodium et phosphate de sodium, de préférence au moins 4 dits sels inorganiques;

- une pluralité d'acides aminés choisis notamment parmi les arginine, cystine, glycine, histidine, isoleucine, leucine, lysine, méthionine, phénylalanine, serine, thréonine, tryptophane, tyrosine, valine, asparagine, aspartate, glutamine, acide glutamique, proline, sérine et valine, de préférence l'ensemble des dits acides aminés;

- une pluralité de vitamines choisies notamment parmi les choline, acide folique, inositol, niacinamide, nicotinamide), acide pantothénique, pyridoxal, pyridoxine, riboflavine, thiamine, biotine, acide aminobenzoique et cobalamine, de préférence au moins 3 dites vitamines ; et

- une source d'hydrate de carbone, de préférence un sucre, notamment du glucose.

Plus particulièrement encore, le dit milieu de culture de base est choisi parmi les milieux MEM (« Eagles Minimal Essential Médium »), DMEM (« Dubelcco Modified Eagle Médium » ), RPMI (« Roswell Park Mémorial Institute médium ») ou IMDM (« Iscove's Modified Dulbecco's Media ») ainsi que toutes leurs variantes

Plus particulièrement, l'acide urique est mis en œuvre sans composé antioxydant additionnel dans le dit milieu de culture.

D'autre caractéristiques et avantages de l'invention apparaîtront à la lumière de la description détaillée des exemples de réalisations suivants se référant aux figures suivantes dans lesquelles :

- les Figures 1A et 1B représentent la quantification par cytométrie de flux avec le fenêtrage utilisé pour les cellules L929 et les billes fluorescentes (« B »). (Nombre de cellules /nombre de billes) x concentration de billes (1053 billes/μΙ) x facteur de dilution. La figure 1A représente les éléments comptés en taille structure (1 nuage billes et 1 nuage cellules) et la figure 1B représente la fluorescence des éléments comptés (billes en P5 et cellules en P4) ;

- les figures 2A, 2B et 2C représentent le comptage de cellules en ordonnée vs la durée de culture en abscisses (en jours) pour la culture des cellules L929 (figure 2A), MRC5 (figure 2B), ou HeL (figure 2C) dans différentes conditions de culture A à E explicitées ci-après ; - les figure 3A et 3B représentent les croissances de Coxiella burnetii sur cellules HeL (figure 3A) et Rickettsia conorii sur la lignée cellulaire L929 (figure 3B) dans deux conditions : « UA »= présence d'acide urique dans le milieu sans C0 2 dans l'atmosphère et « C0 2 » = absence de d'acide urique dans le milieu et présence de C0 2 dans l'atmosphère;

- la figure 4 représente la croissance de Plasmodium falciparum sur les globules rouges A + dans deux conditions, avec de l'acide urique dans des flacons fermés (courbe « B2 (UA) ») et sans acide urique dans des conditions de croissance standard (10% 0 2 , 5% C0 2 et 85% N 2 ) (courbe « A2 (C0 2 ) »); et - les figures 5A et 5B représentent les croissances d'Adenovirus sur des cellules MRC5 (figure 5A) et HeL (figure 5B) dans deux conditions, avec de l'acide urique dans des flasques fermées (courbe « B2 (UA) ») et sans acide urique dans des conditions de croissance standard avec 5% de C0 2 (courbe « A2 (C0 2 ) »), la valeur p >0,05.

Des lignées cellulaires de fibroblaste murin L929 et de fibroblastes humains HEL et MRC5 ont été utilisées. Ce sont les supports d'hôtes cellulaires nécessitant du C0 2 .

L'étude a été menée en utilisant deux conditions de culture suivantes.

1) Premièrement, des conditions de routine avec 5% de C0 2 dans de l'air où toutes les lignées cellulaires ont été maintenues dans des flasques de culture cellulaire de 75 cm2 à 37°C dans du milieu DMEM (# 11960-069, Invitrogen Carisbad, CA) supplémenté avec 10% de sérum bovin fœtal inactivé par la chaleur (à 56°C pendant 30 minutes) sous 5% de C0 2 avant fermeture du flacon au bout de 24h.

2) La seconde condition comprenait le même milieu de base mais supplémenté par l'acide urique, préparé comme suit.

L'acide urique (SIGMA-AIdrich, Life Science U2625-100G, St. Quentin Fallavier Cedex 38297 France), à une concentration de 10 g dans 1 L de solution tampon PBS filtrée à 0,22 μιτι, pH ajusté à 7.

La concentration d'acide urique dans le milieu final était de 2393,6 μΜ (403,2 mg/L), contrôlée et quantifiée en utilisant la technique enzymatique de l'uricase sur un analyseur modulaire Cobas 8000 (Roche diagnostics Indianapolis, USA).

Dans le milieu complémenté en acide urique, les flacons ont été incubés à 37°C sans C0 2 , flacon fermé. Pour les microorganismes, on a utilisé Coxiella burnetii (souche Nine mile II) pour infecter des cellules HEL et Rickettsia conorii (souche Seven) pour infecter des cellules L929.

Pour les virus, on a utilisé un adénovirus de type C (souche MRS20081365148) qui infecte les cellules HEL et MRC5.

On a infecté chaque cellule avec son microorganisme correspondant à une multiplicité d'infection (MOI) définie dans les deux conditions de culture précédemment citées.

Avec les parasites, on a maintenu des parasites de Plasmodium falciparum (clone W2 résistant à la chloroquine d'Indochine, BEI Resources, NIAID, NIH, Virginie, USA, Réf. MRA-157) en culture continue dans du milieu RPMI 1640 (Invitrogen, Carlsbad, CA), supplémenté avec 10% de sérum humain (Abcys SA Paris, France) et tamponné avec du HEPES 25 mM et du NaHC0325 mM. Les parasites ont été cultivés dans des globules rouges humains de type A + dans des conditions atmosphériques contrôlées qui consistaient en 10% d'0 2 , 5% de C0 2 et 85% de N2 à 37°C. Le milieu a été changé tous les jours et la parasitémie a été contrôlée par examen au microscope des frottis sanguins avec un kit RAL® 555 (RAL Diagnostics, Martillac, France). Lorsque les parasites atteignent les stades d'anneau, la parasitémie est ajustée à 2% et deux conditions sont testées: le milieu habituel dans des flasques de culture cellulaire de 25 cm2 et l'acide urique ajouté au milieu à la même concentration dans 25 cm2 de culture cellulaire Standard fermé. Les essais ont été effectués en triplicat. On a surveillé l'absence de contamination chaque semaine en contrôlant tous les milieux de culture utilisés pour toute croissance bactérienne sur des milieux de culture gélosés.

A) Quantification, collecte de données et mesure de la croissance cellulaire. Les taux de croissance et les densités cellulaires finales ont été quantifiés par cytométrie de flux en utilisant une suspension de billes fluorescentes (Cytocount TM) comme population de référence. Le nombre absolu de cellules (cellules/μΙ) dans chaque condition de culture a été calculé en utilisant l'équation suivante: (Nombre de cellules comptées/Nombre de billes comptées)x concentration en billes (1054 billes/μΙ) x Facteur de dilution (Les billes dont on connaît la concentration servent d'étalons pour le comptage absolu des cellules) [5]. Les paramètres ont été ajustés en utilisant des concentrations diluées des différents types cellulaires avec et sans billes. L'acquisition des données a été réalisée en fonction des paramètres de taille et de structure (FSC (diffusion directe) et SSC (dispersion latérale) afin de définir un portage fixe spécifique à chaque type de cellule.

On a également utilisé le fluorochrome Sytox Dead Cell Stain TM qui ne marque et ne colore que les cellules mortes, pour la cytométrie en flux (Molecular probes, life technologies USA) pour évaluer la viabilité des cellules. Après une période d'incubation appropriée, les cellules ont été décollées en utilisant 3 ml de trypsine pendant 5 minutes à 37°C puis remises en suspension dans leur milieu, le Sytox a été ajouté et les échantillons ont été incubés pendant 10 minutes à température ambiante dans l'obscurité. Puis 25 μΙ de billes ont été ajoutées avant le passage des échantillons sur le cytomètre. Le nombre total d'événements enregistrés était de 20 000 pour le comptage cellulaire en utilisant un analyseur BD LSR Fortessa ™ Cell Analyser (Société BD Bioscience). Les données ont été analysées à l'aide du logiciel BD FACSDiva 6.2 (Société BD Bioscience).

Le nombre d'événements a été calculé, et on a calculé le nombre de cellules dans 1 ml d'échantillon en suivant l'équation détaillée ci- dessus et ci-après. Des quantifications ont été effectuées aux jours J = 0, 7 et 14, après inoculation.

La Figure 1 représente la quantification par cytométrie de flux avec le gating utilisé pour les cellules L929 et les billes fluorescentes. (Nombre de cellules /nombre de billes) x concentration de billes (1053 billes/μΙ) x facteur de dilution. Sur les figures lAet 1B, les valeurs sont pour un tube fermé avec de l'acide urique (« UA ») à J = 7 jours.

Sur la figure 1A, l'abscisse représente les propriétés optiques reflétant la taille des cellules, P3 représente les débris cellulaires à exclure du comptage et l'ordonnée représente les propriétés reflétant la structure et la granulométrie des cellules, P4 représente l'auto fluorescence des cellules et P5 représente le pic de fluorescence des billes. On voit que l'on peut discriminer billes et cellules permettant d'avoir un compte absolu de chaque population (billes et cellules).

B) Quantification, collecte de données et mesure des bactéries intracellulaires et croissance de virus.

On a répété les mêmes tests décrits ci-dessus après avoir infecté les cellules avec deux bactéries intracellulaires différentes: Coxiella burnetii (souche Nine mile II) pour une culture avec les cellules HEL, Rickettsia conorii (souche Seven) pour une culture avec les cellules L929 et Adenovirus pour une culture avec les cellules HEL ou MRC5.

Dans ces tests, la croissance bactérienne a été quantifiée en utilisant qPCR ciblant des gènes spécifiques: IS11 pour C. burnetii, R.co7 gen hypothical protein pour R. conorii (3,4,6) et le gène VTB2 pour l'adénovirus (7).

Les valeurs de Ct de la PCR ont été corrélées à la charge bactérienne quantifiée par cytométrie de flux dans les conditions de C0 2 et d'acide urique et par la technique de dilution de point final TCID50 pour l'adénovirus. Les quantifications ont été effectuées au jour 0, 7, 14 et 21 post-inoculation.

C) Quantification de la croissance des parasites La croissance des parasites a été estimée par examen microscopique des frottis sanguins après coloration avec le kit RAL® 555. L'évolution de la croissance parasitaire a été surveillée pendant 5 jours après le début des dosages dans les deux conditions. Aux jours 2 et 4, les parasites ont été dilués à 1/10 et 1/5 respectivement pour prévenir la mort du parasite due à une parasitémie élevée.

D) Analyses statistiques

D'abord, des tests statistiques ont été effectués afin de montrer le besoin critique des cellules en C0 2 pour la croissance. On a utilisé un test de Mann-Whitney pour comparer le nombre moyen de cellules pour chaque lignée cellulaire de l'état de contrôle négatif (sans C0 2 et sans acide urique) et la condition de routine avec 5% de C0 2 . Un autre essai a été effectué en comparant le nombre moyen de cellules entre la condition avec du C0 2 à 5% et le C0 2 dans un ballon ouvert. (Une valeur p <0,05 représente une différence significative).

Pour la comparaison entre l'acide urique et le C0 2 , on a utilisé le nombre moyen de cellules et la croissance bactérienne / virale / parasitaire dans les deux conditions de culture en utilisant un test de Mann-Whitney (le nombre de cellules obtenu avec les deux conditions de culture était considéré comme significativement différent si la valeur p <0,05).

E) Résultats

On a comparé la culture couramment utilisée dans les conditions atmosphériques de C0 2 aux nouvelles conditions de culture avec de l'acide urique.

Plus précisément, sur les figures 2A-2C :

- A correspond à une culture en présence d'acide urique sous atmosphère aérobie et sans C0 2 en flacon fermé ; - B correspond à une culture en absence d'acide urique sous atmosphère d'air contenant 5% de C0 2 en flacon fermé après 24h ;

- C correspond à une culture en absence d'acide urique sous atmosphère aérobie et sans C0 2 en flacon fermé après 24h ; - D correspond à une culture en absence d'acide urique sous atmosphère d'air contenant 5% de C0 2 en flacon ouvert ;

- E correspond à une culture en présence d'acide urique sous atmosphère aérobie en flacon ouvert.

La quantification cellulaire a été effectuée par cytométrie de flux. Au jour 0, la comparaison moyenne du nombre de cellules entre la condition habituelle de 5% de C0 2 (courbe B) et le témoin négatif (sans C0 2 et sans acide urique courbe C pour les trois lignées cellulaires L929, HEL et MRC5 n'a montré aucune différence significative. Aux jours 7 et 14, seules les conditions avec 5% de C0 2 (cellules exposées à 5% de C0 2 pendant 24h puis flasque fermée) (courbe B) montrent une meilleure croissance cellulaire par rapport aux conditions sans C0 2 ou 5% de C0 2 flasque ouverte en continu (courbe D), sans C0 2 et sans acide urique flasque fermée (courbe C) (p <0,05), ce qui confirme que le C0 2 est essentiel à la croissance cellulaire normale. L'acide urique était efficace pour maintenir les lignées cellulaires testées dans de bonnes conditions de culture avec une croissance correcte et de bonnes capacités de multiplication par rapport à la croissance obtenue dans des conditions de routine exposées au C0 2 (courbe B) à condition de garder les flasques fermées car si elles sont ouvertes l'effet est perdu.

Le taux de croissance pour les lignées cellulaires L929, HEL et MRC5 était similaire dans les deux conditions de culture, sans différence significative (p-valeur = 0,709).

Sur les figures 2A, 2B et 2C, on ne relève aucune différence significative de croissance détectée (p-value > 0.05) entre la culture des cellules L929 (figure 2A), MRC5 (figure 2B), ou HeL (figure 2C) pour les deux conditions de culture : seules les cellules cultivées avec 5% de C0 2 flasque fermée après 24h et acide urique flasque fermée arrivent à croître (respectivement courbes B et A). Pour toutes les autres conditions testées (C0 2 flasque ouverte en continu, sans C0 2 flasque fermée, acide urique flasque ouverte respectivement courbes D, C et E), aucune croissance cellulaire n'est observée.

On peut observer la croissance continue des lignées cellulaires confirmée par les valeurs aux jours 7 et 14. Toutes les lignées cellulaires testées ont été suivies par des observations microscopiques avant quantification. Aucune modification ou anomalie de la forme ou de l'adhérence des cellules n'a été détectée dans les conditions de culture en présence d'acide urique pendant toute la période d'essai (courbes A) La sub-culture des cellules a été maintenue en routine dans le laboratoire. Aucune contamination n'a été détectée dans aucun des tests. Pour les cultures en flacons ouverts (courbes D et E), plusieurs agrégats ont été détectés par cytométrie de flux ou sous microscope optique et les cellules étaient presque mortes et incapables de croître. En outre, aucune anomalie de la forme cellulaire ou de l'adhérence n'a été observée et on a seulement détecté une croissance limitée des cellules dans des conditions dépourvues de C0 2 et d'acide urique (courbes C).

La croissance des microorganismes a été contrôlée par qPCR. La croissance de C. burnetii sur cellules HEL, R. conorii sur la lignée cellulaire L929 et de P. falciparum sur les érythrocytes était presque aux mêmes niveaux dans les deux conditions de culture et aucune différence significative n'a été observée entre les deux (respectivement p-valeur = 0,861, 0,683, 0,731) (Figures 3A-3B et 4A-4B).

Les figure 3A et 3B représente la croissance de Coxiella burnetii sur cellules HeL (figure 3A) cultivée dans les deux conditions, et la croissance de Rickettsia conorii sur la lignée cellulaire L929 (figure 3B) en présence d'acide urique en culture et en culture de routine avec C0 2 , avec la valeur p >0,05 (courbe «Al( UA) »= présence d'acide urique dans le milieu sans C0 2 dans l'atmosphère et courbe « Bl (C0 2 ) » = absence d'acide urique dans le milieu et présence de C0 2 dans l'atmosphère). L'axe X correspond aux temps de quantification en jours. L'axe Y correspond au log de la charge bactérienne (les valeurs logarithmiques sont obtenues après conversion des valeurs du seuil de Cycle (Ct.) Sur la base des courbes standards réalisées avec dilution sérielle 1: 10).

Les figures 4A et 4B représente la croissance de Plasmodium falciparum sur les globules rouges A + («parasitémie en axe Y) dans les deux conditions, avec de l'acide urique dans des flacons fermés (courbe « B2 (UA) ») et sans acide urique dans des conditions de croissance standard (10% 0 2 , 5% C0 2 et 85% N2) (courbe « A2 (C0 2 ) ») avec une valeur p >0,05. La diminution après chaque point de temps (en jours sur l'axe des ordonnées) est due à la dilution du parasite avant de procéder à l'infection suivante.

En ce qui concerne C. burnetii et R. conorii, tous les titrages bactériens étaient normaux et les bactéries pouvaient se multiplier normalement dans les deux conditions. Comme on l'a observé sur les courbes de multiplication des bactéries testées sur les figures 3A-3B, les courbes en augmentation continue à chaque instant de l'infection attestent les taux de multiplication bactérienne.

Pour les parasites, les courbes figure 4 montrent une croissance continue pendant 48 heures après l'infection. La diminution après ce temps est due à la dilution du parasite avant de procéder à la prochaine infection. Après la dilution, la croissance du parasite redémarre et augmente normalement.

Sur les figures 5A et 5B, la croissance de l'adénovirus était similaire dans les deux conditions sur les deux lignées cellulaires, et aucune altération du cycle n'a pu être détectée. Les figures 5A et 5B représentent les croissances d'Adenovirus sur des cellules MRC5 (figure 5A) et HeL (figure 5B) dans deux conditions, avec de l'acide urique dans des flasques fermées (courbe « B2 (UA) ») et sans acide urique dans des conditions de croissance standard 5% de C0 2 (courbe « A2 (C0 2 ) »), la valeur p >0,05. L'axe X correspond aux temps de quantification en jours. L'axe Y correspond au logarithme de la charge virale (les valeurs logarithmiques sont obtenues après conversion des valeurs du seuil Cycle (Ct.) sur la base des courbes standards réalisées avec dilution série 1: 10).

Toutes les PCR effectuées trois fois ont montré une aptitude virale optimale dans les deux conditions de culture. Les courbes virales de multiplication ont montré des augmentations typiques de la charge virale à partir du jour 0, atteignant leur valeur maximale au jour 7. Les titres viraux ont commencé une augmentation lente après le jour 7, tendant vers un plateau entre le jour 7 et le jour 14 et atteignant la valeur la plus faible au jour 21.

F) Conclusion.

Pour toutes les lignées cellulaires testées, une incubation initiale sous 5% C0 2 a pu être remplacée par l'ajout d'acide urique dans le milieu de culture à une concentration d'au moins 0.4 g/L en air ambiant. Les cellules et microorganismes se sont multipliés sans altération physiologique de forme ou d'adhésion.

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